lundi 28 décembre 2020

 

Les rats ne seraient pas responsables de la peste noire

L’épidémie qui s’est propagée dans l'Europe et l'Asie médiévales aurait été véhiculée par des puces et des poux, selon une nouvelle étude.

Un rat des champs (Rattus rattus) photographié au centre de recherche George M. Sutton Avian.
Un rat des champs (Rattus rattus) photographié au centre de recherche George M. Sutton Avian.
Photographie de

dimanche 27 décembre 2020

À Pompéi, des archéologues découvrent un magasin de street food
Pompéi, ensevelie par l’éruption du Vésuve en 79 après JC, reste le deuxième site le plus visité d’Italie après le Colisée de Rome.
POMPÉI - Un thermopolium, sorte de “fast-food” de rue dans la Rome antique, a été mis au jour le 26 décembre à Pompéi, orné de motifs polychromes et dans un état de conservation exceptionnel, comme le montre la vidéo en tête d’article.

Le comptoir figé par la cendre volcanique avait été en partie exhumé en 2019 mais les travaux ont été étendus pour préserver au mieux l’intégralité de l’emplacement, situé dans un quartier qui était très fréquenté au croisement de la rue des Noces d’argent et de la rue des Balcons.

Outre une fresque déjà connue représentant une Néréide (nymphe marine) sur un cheval, les chercheurs ont retrouvé, peints dans des couleurs vives, des animaux, en particulier de la volaille et des canards colverts qui devaient être consommés avec du vin ou des boissons chaudes.

Et surtout, les scientifiques ont retrouvé dans les creusements de la table des reliefs alimentaires qui pourraient apporter de précieuses informations sur les habitudes gastronomiques à Pompéi au moment de l’éruption du Vésuve en 79 après JC.

Un fragment d’os de canard, mais aussi des restes de porc, de chèvre, de poisson et d’escargots ont été récupérés dans les pots en terre cuite. Plusieurs ingrédients étaient cuisinés ensemble, un peu comme une paella. Au fond d’une jarre ont été trouvées des fèves pilées, lesquelles servaient à modifier le goût du vin.

“Un environnement entier”
“En plus d’être un témoignage sur la vie quotidienne à Pompéi, les possibilités d’analyse de ce thermopolium sont exceptionnelles, parce que pour la première fois on a exhumé un environnement entier”, s’est réjoui Massimo Osanna, directeur général du parc archéologique de Pompéi, cité dans un communiqué.

Des amphores, une citerne et une fontaine, ainsi que des ossements humains, ont été découverts à proximité, notamment ceux d’un homme d’une cinquantaine d’années près d’un lit d’enfant.

“L’échoppe semble avoir été fermée à toute hâte et abandonnée par ses propriétaires, mais il est possible que quelqu’un, peut-être l’homme le plus âgé, soit resté et ait péri au cours de la première phase de l’éruption, dans l’effondrement du grenier”, a expliqué Massimo Osanna dans un entretien à l’agence Ansa.

L’autre corps pourrait être celui d’un voleur ou d’un fugitif affamé “surpris par les vapeurs ardentes avec à la main le couvercle du pot qu’il venait d’ouvrir”, a-t-il ajouté.

Les thermopolium (du grec “thermos” qui signifie chaud, et “pôléô” qui signifie vendre) étaient très populaires dans le monde romain. Pompéi en comptait 80 à elle seule.

Pompéi, ensevelie par l’éruption du Vésuve en 79 après JC, est le deuxième site le plus visité d’Italie après le Colisée de Rome, avec près de quatre millions de visiteurs en 2019. Seul un tiers du site, qui s’étend actuellement sur 44 hectares non loin de Naples, a été mis au jour par les archéologues.

À voir également sur Le HuffPost: À Pompéi, des archéologues ont découvert un vrai trésor

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vendredi 18 décembre 2020

peste!

 

La peste noire aurait modifié notre génome

En analysant l'ADN des Roms qui ont émigré en Roumanie il y a plus de mille ans, des chercheurs expliquent comment les Européens ont survécu au bacille de la peste.

Par Franck Daninos

Publié

peste

Human estrus: implications for relationship science : https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352250X14000189

Human oestrus : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2394562/

modalités d'examen pour les sections européennes (SELO) et DNL Hors SELO:
Arrêté du 20 Décembre 2018
https://www.legifrance.gouv.fr/jorf/id/JORFTEXT000037846249/
BO spécial n°6 du 31 juillet juillet 2020, diverses notes de service
Modalités d'organisation du contrôle continu :
https://www.education.gouv.fr/bo/20/Special7/MENE2019442N.htm
Evaluation spécifique de contrôle continu SELO et DNL Hors SELO
https://www.education.gouv.fr/bo/20/Special7/MENE2019306N.htm
Choix et évaluation des langues vivantes étrangères
https://www.education.gouv.fr/bo/20/Special7/MENE2019479N.htm

http://dosequis.colorado.edu/Courses/MethodsLogic/papers/WatsonCrick1953.pdf 

mardi 15 décembre 2020

2,2,2/ l’énergie cellulaire

3/ métabolisme avec oxygène

A quoi sert le dioxygène utilisé lors de la respiration ?

expériences ExAO sur fractions mitochondriales

composés réduits NADH2

réoxydation des composés réduits

réduction de dioxygène en eau

Glucose, pyruvate, ATP, O2

Oxydation

glycolyse dans le hyaloplasme = cytosol

chaîne respiratoire mitochondriale, enzymes

cycle de Krebs (dans la mitochondrie)

O2

CO2

Réaliser des expérimentations assistées par ordinateur (ExAO) : respiration cellulaire et/ou fermentation.

Extraire et organiser des informations pour identifier les différentes voies métaboliques.

Localiser les réactions métaboliques nécessaires à la contraction musculaire dans une cellule.

respiration cellulaire, glycolyse, cycle de Krebs,

L’oxydation du glucose comprend la glycolyse (dans le hyaloplasme) puis le cycle de Krebs (dans la mitochondrie) : dans leur ensemble, ces réactions produisent du CO2 et des composés réduits NADH, H+. La chaîne respiratoire mitochondriale permet la réoxydation des composés réduits, par la réduction de dioxygène en eau. Ces réactions conduisent à la production d’ATP qui permet les activités cellulaires.

lundi 14 décembre 2020

What is Natural Selection?

Wallace, Darwin's Forgotten Frenemy

 

History of Evolution

Listen : http://www.evolution-of-life.com/en/observe/video/fiche/darwin-on-the-evolution-trail.html

Read : https://www.bioexplorer.net/history_of_biology/evolution/

ToDO : Two-word expressions http://medicine.kaums.ac.ir/UploadedFiles/Files/Check_Your_English_Vocabulary_for_Medicine.pdf

Medical Dictionary : https://medical-dictionary.thefreedictionary.com/

1,3,2/ L’histoire humaine lue dans son génome

3/ Comparaison de génômes humains du passé

Page 70-75

http://acces.ens-lyon.fr/acces/thematiques/evolution/logiciels/phylogene/archives-non-utilisees/adn-mitochondrial#Hommes_actuels_et_l_origine_d_Homo_sapiens

https://svt.ac-versailles.fr/spip.php?article1022

https://www.pedagogie.ac-nantes.fr/sciences-de-la-vie-et-de-la-terre/enseignement/lycee/specialite-svt/terminale/un-regard-sur-l-evolution-de-l-homme/tp-type-ece-homo-heidelbergensis-835220.kjsp?RH=PEDA

- Rechercher et exploiter des documents sur les génomes de néandertaliens et/ou de denisoviens.

- Rechercher et exploiter des documents montrant l’existence d’allèles néandertaliens dans les génomes humains actuels.

Grâce aux techniques modernes, on peut connaître les génomes d’êtres humains disparus à partir de restes fossiles. En les comparant aux génomes actuels, on peut ainsi reconstituer les principales étapes de l’histoire humaine récente.

La diversité allélique entre les génomes humains individuels permet de les identifier et, par comparaison, de reconstituer leurs relations de parentés.

4/ Histoire de mutations passées

Pour clore le chapitre : retour à ce qui a permi de le lancer : l’intolérance au lactose

manuel p.72-73

Video CNRS : http://videotheque.cnrs.fr/video.php?urlaction=visualisation&method=QT&action=visu&id=2242&type=grandPublic

catalogue videos : http://videotheque.cnrs.fr/index.php?urlaction=docListe&cherche=1&domaine=catalogue

Certaines variations génétiques résultent d’une sélection actuelle (tolérance au lactose, résistance à la haute altitude) ou passée (résistance à la peste).

Objectifs : les génomes portent en eux-mêmes les traces de l’histoire de leurs ancêtres. Ces traces s’altèrent avec le temps mais permettent néanmoins de remonter à un grand nombre de générations. 

bilan/ L’histoire humaine lue dans son génome

2,2,2/ l’énergie cellulaire

 préparation BB

2/ la mitochondrie, centrale énergétique de la cellule eucaryote

Observer des électronographies de mitochondries.

vendredi 11 décembre 2020

The menstrual cycle

 

Listen 11’24 : https://youtu.be/tOluxtc3Cpw

What is the menstrual cycle? The menstrual cycle refers to the regular changes in the activity of the ovaries and the endometrium that make reproduction possible.

Read : Ovulatory cycle effects on tip earnings by lap dancers: economic evidence for human estrus?

Ovulatory cycle effects on tip earnings by lap dancers: economic evidence for human estrus? https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1090513807000694

 

Listen 11’24 : https://youtu.be/tOluxtc3Cpw

What is the menstrual cycle? The menstrual cycle refers to the regular changes in the activity of the ovaries and the endometrium that make reproduction possible.

Read : Ovulatory cycle effects on tip earnings by lap dancers: economic evidence for human estrus?

Ovulatory cycle effects on tip earnings by lap dancers: economic evidence for human estrus? https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1090513807000694

1,3/ Variations du patrimoine génétique

Bilan/ Mutations de l’ADN et variabilité génétique

Connaissances

  • Des erreurs peuvent se produire aléatoirement lors de la réplication de l'ADN. Leur fréquence est augmentée par l’action d’agents mutagènes. L’ADN peut également être endommagé en dehors de sa réplication.

  • Les mutations sont à l’origine de la diversité des allèles au cours du temps. Selon leur nature elles ont des effets variés sur le phénotype.

  • Les erreurs réplicatives et les altérations de l’ADN peuvent être réparées par des mécanismes spécialisés impliquant des enzymes. Si les réparations ne sont pas conformes, la mutation persiste à l’issue de la réplication et est transmise au moment de la division cellulaire.

  • Chez les animaux dont l’être humain, une mutation survient soit dans une cellule somatique (elle sera présente dans le clone issu de cette cellule) soit dans une cellule germinale (elle devient potentiellement héréditaire).

  • Notions fondamentales : allèles, mutations, nature et fréquence des mutations, mutations spontanées et induites, systèmes de réparation, ADN polymérase.

  • Objectifs : la formation des mutations. La notion d’allèles s’applique à tout segment d’ADN codant ou non.

Capacités

- Concevoir et réaliser un protocole pour étudier l'action d'un agent mutagène (par exemple les UV) sur la survie des cellules et sur l'apparition de mutants. Quantifier.

- Recenser et exploiter des informations permettant de montrer l'influence d'agents mutagènes physiques (rayonnements) ou chimiques (molécules).

- Recenser et exploiter des informations permettant de caractériser des mutations.

- Recenser et exploiter des informations sur la diversité allélique au sein des populations (par exemple humaine).

- Recenser et exploiter des informations de recherche sur les génomes des trios (père, mère, enfant) afin de se faire une idée sur la fréquence et la nature des mutations spontanées chez l’être humain.

- Exploiter des bases de données pour mettre en relation des mutations et leurs effets.

Précisions : on distinguera les mutations spontanées de l’ADN des modifications introduites volontairement par génie génétique conduisant par exemple à la création d’OGM, aux thérapies géniques, etc.

L’action des agents mutagènes est étudiée à titre d’exemple mais le mécanisme n’est pas attendu. Aucune exhaustivité n’est attendue pour la présentation de ces agents. La liste des mutations possibles n’est pas attendue. Les mécanismes de réparation de l’ADN ne doivent pas être détaillés. Pour des expériences impliquant des micro-organismes, on respecte des protocoles stricts concernant à la fois la culture de micro-organismes et leur destruction systématique en fin de manipulation.

En observant les mutations on devrait donc pouvoir reconstituer l’histoire d’un génôme...

1,3,2/ L’histoire humaine lue dans son génome

1/ Histoire du séquençage du génôme humain

Video INSERM 3’54 : https://youtu.be/TCnG7R50IlU

- Mener une démarche historique ou une étude documentaire sur le séquençage des macromolécules (protéines, ARN et ADN).

http://www.genoscope.cns.fr/externe/Francais/Sequencage/#tableau1

https://binf.snipcademy.com/lessons/dna-sequencing-techniques/maxam-gilbert

https://loverde.pagesperso-orange.fr/GENOME-OGM/Sequencage-Historique.htm

- Rechercher et exploiter des documents montrant comment a été déterminée la première séquence du génome humain.

- Explorer quelques stratégies et outils informatiques de comparaisons de séquences entre génomes individuels.

Histoire

Équipe

Pays

matériel

methode

Taille

Nb de gènes

1953

Watson, Crick, Franklin, Wilkins



Découverte de la structure de la molécule d’ADN



1971

Arber, Smith, Nathans

Suisse, USA

Haemophilus influenzae, virus SV40

Enzymes de restriction



1977

Sanger

UK

Virus ΦX174

synthèse enzymatique sélective

5 kb


1977

Gilbert

USA

Bactérie

dégradation chimique sélective



1976 ?



Phage MS2 RNA


3,6 kb


1980

Messing


phage M13

vecteurs de séquençage



1984

Jeffreys

USA

Homo sapiens

Empreinte génétique



1995



Bactérie Haemophilus influenzae


1,8 kb


1996



Levure Saccharomyces cerevisiae


12 Mb

6 200

1996



Caenorhadbitis elegans


100 Mb

19 100

2000



Arabidopsis thaliana


125 Mb

25 500

2001



Homo sapiens


3,3 Gb

20 à 30 000

2002



Oryza sativa


289 Mb


Sanger

Gilbert

synthèse enzymatique sélective

dégradation chimique sélective

Extraction ADN

Amplification de l’échantillon

Séparation des deux brins par la chaleur

Amorçage

Marquage*/Isolement/électrophorèse/Séparation

Incubation +ADNpol +dNTP +amorces +ddNTP*

Coupures chimiques spécifiques des 4 bases

Analyse par électrophorèse

Sanger method in video : https://youtu.be/-QIMkQ4E_wE

Au cours des 25 dernières années, la méthode de Sanger a été largement développée grâce à plusieurs avancées technologiques importantes :

  • la mise au point de vecteurs de séquençage adaptés, comme le phage M13 développé par Joachim Messing au début des années 19802 ;

  • le développement de la synthèse chimique automatisée des oligonucléotides qui sont utilisés comme amorces dans la synthèse ;

  • l'introduction de traceurs fluorescents à la place des marqueurs radioactifs utilisés initialement. Ce progrès a permis de sortir le séquençage des pièces confinées nécessaires à l'usage de radio-isotopes ;

  • l'adaptation de la technique PCR pour le séquençage ;

  • l'utilisation de séquenceurs automatiques de gènes ;

  • l'utilisation de l'électrophorèse capillaire pour la séparation et l'analyse.

La méthode de Maxam et Gilbert nécessite des réactifs chimiques toxiques et reste limitée quant à la taille des fragments d'ADN qu'elle permet d'analyser (< 250 nucléotides). Moins facile à robotiser, son usage est devenu aujourd'hui confidentiel.

16 janvier

2/ Calculs généalogiques

- Calculer le nombre de générations humaines successives en mille, dix mille et cent mille ans et en déduire le nombre théorique d’ancêtres de chacun d’entre nous à ces dates. Conclure.1

11000/3=33,3333 ; 233=8 589 934 592

Genetic

Listen : 18 Things You Should Know About Genetics : http://youtu.be/bVk0twJYL6Y

read : https://blog.nationalgeographic.org/2013/04/11/read-francis-cricks-6-million-letter-to-son-describing-dna/

jeudi 10 décembre 2020

 premiers instants de la vie

 Gène, génôme, phenotype

2,2/ Produire le mouvement : contraction musculaire et apport d’énergie

2,2,1/ la contraction musculaire

1/ Les muscles

  • Disséquer un muscle,

  • observer à la loupe puis au miscroscope

observation de coupes de muscles : http://espace-svt.ac-rennes.fr/applic/muscle/muscle.htm

observation de coupes de muscles au microscope

Lames muscle : faire un dessin

stries noires & blanches

Fonctionnement du muscle squelettique : http://svt.ghediri.com/bac-sciences/10/neurophysiologie/20/fonctionnement-muscle-squelettique.html

Réaliser et/ou observer au microscope optique et au microscope électronique des préparations de cellules musculaires striées, pour enrichir la notion de cellule eucaryote spécialisée.

Le muscle strié est un ensemble de cellules musculaires dites striées, organisées en faisceaux musculaires.

2/ l’articulation

  • observer les os d’une articulation

  • Réalisez une maquette d’articulation pour montrer comment cela fonctionne

Manipuler, modéliser, recenser, extraire et organiser des informations et/ou manipuler (dissections, maquettes…) pour comprendre le fonctionnement du système musculo-articulaire.

Le raccourcissement et l’épaississement des muscles lors de la contraction musculaire permettent le mouvement relatif des deux os auxquels ils sont reliés par des tendons.

3/ la contraction musculaire

Myosine : https://libmol.org/?libmol=279&embedded=1

Utiliser un logiciel de modélisation moléculaire pour observer le pivotement des têtes de myosine.

http://www.phys.ens.fr/~vincent/courdea/Muscle.htm

La cellule musculaire, cellule spécialisée, est caractérisée par un cytosquelette particulier (actine et myosine) permettant le raccourcissement de la cellule. La contraction musculaire nécessite des ions calcium et l’utilisation d’ATP comme source d’énergie.

4/ les myopathies

p.410 : qui prepare un oral sur le sujet à partir des docs ?

Remobiliser les acquis sur la matrice extracellulaire à travers l’exemple d’une myopathie.

Dans certaines myopathies, la dégénérescence des cellules musculaires est due à un défaut dans les interactions entre les protéines membranaires des cellules et la matrice extra-cellulaire.

2,2,2/ l’énergie cellulaire

1/ l’ATP, un nucléotide riche en énergie

Découverte en 1929, la molécule d’ATP a été mise en évidence dans toutes les cellules animales, végétales et bactériennes : c’est une molécule universelle. L’ATP est un ribonucléotide formé : – d’adénosine, composée de ribose et d’adénine, – de trois groupements phosphate.

Modélisation de l'ATP et de l'ADP / Rastop

ATP : http://www.librairiedemolecules.education.fr/molecule.php?idmol=46

ADP : http://www.librairiedemolecules.education.fr/molecule.php?idmol=74

  • Comptez les atomes de la molécule

  • recopiez la formule globale

  • dessinez la molécule en plan

L'ATP est une molécule instable dont les liaisons entre les deux derniers groupements phosphate sont des liaisons covalentes faibles. La synthèse de l’ATP par phosphorylation de d’ADP, c’est-à-dire création d’une liaison entre deux groupements phosphate, est catalysée par l’enzyme ATP synthase ou synthétase et nécessite de l’énergie. Quand la source d’énergie est la lumière, on parle de photophosphorylation. Dans le contexte de la photosynthèse, la réaction chimique produisant de l’ATP peut s’écrire :

ADP + Pi + ENERGIE → ATP

L’hydrolyse d’une molécule d’ATP, catalysée par l’enzyme ATPase, avec production d’une molécule d’adénosine diphosphate (ADP) et d’une molécule de phosphate inorganique (Pi), produit une grande quantité d’énergie : c’est pourquoi on parle de composé phosphorylé riche en énergie. Cette hydrolyse est une réaction exergonique, c’est-à-dire s’accompagnant d’une perte d’énergie.

ATP + H2O → ADP + Pi + énergie

L’énergie est apportée sous forme de molécules d’ATP à toutes les cellules. Il n’y a pas de stockage de l’ATP, cette molécule est produite par les cellules à partir de matière organique, notamment le glucose.

mercredi 9 décembre 2020

1 - Une longue histoire de la matière

 

https://www.lelivrescolaire.fr/page/6623382

1.2 - Des édifices ordonnés : les cristaux

1/ le sel, un exemple de cristal

Observation du sel et modélisation moléculaire / microscope et logiciel Rastop

http://microscopeyal.blogspot.com/2010/03/de-lordre-dans-la-cuisine.html

http://www.librairiedemolecules.education.fr/outils/minusc/app/minusc.htm

fichier → Halite

Utiliser une représentation 3D informatisée du cristal de chlorure de sodium.

Relier l’organisation de la maille au niveau microscopique à la structure du cristal au niveau macroscopique

Le chlorure de sodium solide (présent dans les roches, ou issu de l’évaporation de l’eau de mer) est constitué d’un empilement régulier d’ions : c’est l’état cristallin.

2/ Deux types de roches magmatiques

Roches issues d’un magma (matière en fusion)

Comparaison de roches / microscope

lundi 7 décembre 2020

 Presentation about Rosalin Franklin

1,3,1/ Mutations de l’ADN et variabilité génétique

 

3/ Conséquences de certaines mutations : la Phénylcétonurie

- Recenser et exploiter des informations permettant de caractériser des mutations.

- Exploiter des bases de données pour mettre en relation des mutations et leurs effets.

- Recenser et exploiter des informations sur la diversité allélique au sein des populations (par exemple humaine).

TP noté

Correction TP

allèles, mutations, nature et fréquence des mutations,

substitution = échange de bases ; délétion = suppression de base(s) ; addition = ajout de base(s)

faux-sens => changement d’acide aminé : non-sens => appartion d’un codon stop ; neutre= pas de changement d’ac.am.

Les mutations sont à l’origine de la diversité des allèles au cours du temps. Selon leur nature elles ont des effets variés sur le phénotype. La notion d’allèle s’applique à tout segment d’ADN codant ou non.

4/ Chimiothérapie par inhibiteurs de topoisomérases

http://www.oncoprof.net/Generale2000/g09_Chimiotherapie/g09_ct08a.php

http://www.arcagy.org/infocancer/traitement-du-cancer/traitements-systemiques/chimiotherapie/les-medicaments/les-modificateurs-de-l-adn/les-inhibiteurs-des-topoisomerases-i.html

enzymes indispensables pour 'dénouer' l'enroulement très important de l'ADN avant la transcription de l'ADN ou sa réplication

L’ADN peut être endommagé

système enzymatique de réparation cellulaire,

ADN polymérase

Les erreurs réplicatives et les altérations de l’ADN peuvent être réparées par des mécanismes spécialisés impliquant des enzymes. Si les réparations ne sont pas conformes, la mutation persiste à l’issue de la réplication et est transmise au moment de la division cellulaire.

5/ Etude de génômes de trios

- Recenser et exploiter des informations de recherche sur les génomes des trios (père, mère, enfant) afin de se faire une idée sur la fréquence et la nature des mutations spontanées chez l’être humain.

l’étude des génômes de trios (un enfant et ses deux parents) met en évidence des variations de séquences nucléotidiques chez l’enfant. Elles sont le résultat de mutation dites « de novo » apparues le plus souvent dans l’une des cellules à l’origine des gamètes des parents. Les résultats ci dessous ont été obtenus grâce à l’étude de 10 trios.

Types de mutations

Nombre / génôme

Fréquence estimée

Substitutions

8 370 000

1,27.10-8 / nucléotide / génération

Insertions ou délétions

1 240 000

1,5.10-9 / nucléotide / génération

Mutations d’une grand nombre de nucléotides

232 000

Non calculée

Sachant qu’une cellule humaine comporte 3 Gpb par lot de chromosomes, calculez le nombre de mutations « de novo » attendues chez un nouveau né comparé à ses parents1

Chez les animaux dont l’être humain, une mutation survient soit dans une cellule somatique (elle sera présente dans le clone issu de cette cellule) soit dans une cellule germinale [reproductrice, gamète] (elle devient potentiellement héréditaire).

13.109 x 1,27.10-8 = 3 x 12,7 = 38,1 substitutions + 3.109 x 1,5.10-9 = 3 x 1,5 = 4,5 addition ou délétion

vendredi 4 décembre 2020

You, the avocados, and a few thousand years.

Game : cycle cell : http://educationalgames.nobelprize.org/educational/medicine/2001/cellcycle.html

1,3,1/ Mutations de l’ADN et variabilité génétique

2/ Petit tour non exhaustif des agents mutagènes

http://mutations.genetiques.free.fr/Les%20differents%20agents%20mutagenes%20et%20leurs%20origines.html

http://acces.ens-lyon.fr/biotic/genetic/mutation/html/mutagen.htm


agents mutagènes : chimiques ou radiation

chimiques : imitent ou modifient la structure de l'ADN

radiation : rupture de brin, mutation, enchevêtrement de l'ADN

- Recenser et exploiter des informations permettant de montrer l'influence d'agents mutagènes physiques (rayonnements) ou chimiques (molécules).

mutations spontanées et induites, la formation des mutations.

Des erreurs peuvent se produire aléatoirement lors de la réplication de l'ADN. Leur fréquence est augmentée par l’action d’agents mutagènes. L’ADN peut également être endommagé en dehors de sa réplication.

3/ Conséquences de certaines mutations : la Phénylcétonurie

- Recenser et exploiter des informations permettant de caractériser des mutations.

- Exploiter des bases de données pour mettre en relation des mutations et leurs effets.

- Recenser et exploiter des informations sur la diversité allélique au sein des populations (par exemple humaine).

Lessons of Stratigraphy : https://www.msnucleus.org/membership/html/jh/earth/stratigraphy/index.html

visit a paleontologic museum : https://naturalhistory2.si.edu/vt3/NMNH-FH/z_NMNH-FH-002.html

jeudi 3 décembre 2020

2/ Corps humain et santé

§ Comment le muscle est-il l’effecteur un mouvement ?

2,2/ Produire le mouvement : contraction musculaire et apport d’énergie

Les mouvements mobilisent les muscles. Les organismes pluricellulaires sont constitués de cellules ayant des particularités différentes selon l’organe auxquels elles appartiennent. 1/ La cellule musculaire dispose d’une organisation structurale lui permettant de se raccourcir, ce qui entraîne la contraction du muscle. 2/ Elle a besoin d’énergie apportée sous forme d’ATP, produit à partir du glucose. 3/ L’approvisionnement des cellules musculaires en glucose nécessite le maintien de la concentration de glucose sanguin, régulé par des hormones.

2,2,1/ la contraction musculaire

1/ Les muscles

  • observer  au miscroscope

observation de coupes de muscles : http://espace-svt.ac-rennes.fr/applic/muscle/muscle.htm

observation de coupes de muscles au microscope

Lames muscle : faire un dessin

stries noires & blanches

Fonctionnement du muscle squelettique : http://svt.ghediri.com/bac-sciences/10/neurophysiologie/20/fonctionnement-muscle-squelettique.html

Réaliser et/ou observer au microscope optique et au microscope électronique des préparations de cellules musculaires striées, pour enrichir la notion de cellule eucaryote spécialisée.

devoir sur  les myotpathies

p.410 : qui prepare un oral sur le sujet à partir des docs ?

Remobiliser les acquis sur la matrice extracellulaire à travers l’exemple d’une myopathie.

La fécondation 2018 (Remake l'Odyssée de la vie de Nils Tavernier 2005)

 génétique

mercredi 2 décembre 2020

3/ Quatre catégories de molécules organiques

modélisalisation de molécules / logiciels 3D

catégorie

Lipides 

Glucides

Protides

Acides nucléiques

Molécule simple

Acides gras

Glucose, fructose, (desoxy)ribose,

Acides aminés : glycine

Nucléotides : phospho(desoxy)ribo-adénine, -thymine, -uracile, -cytosine, -guanine

Molécule complexe (formée de l’assenblage de molécules simples


Saccharose, maltose, lactose




Cholestérol

Amidon

Protéines : enzymes, (amylase, lactase), histones,

ADN, ARN

atomes

CHO

CHO

CHONS

CHONP

Nb : Une vitamine est une substance organique, nécessaire en faible quantité, donc le terme ne classe pas les molécules selon leur nature mais leur utilité :

Besoins en vitamines moyens pour un adulte de 70 kg (1 µg = un millionième de gramme) :

Vitamine

Nom ou rôle

AJR

Vitamine C

acide ascorbique

80 mg

Vitamine B3 (PP)

nicotinamide

18 mg

Vitamine B5

acide pantothénique

6 mg

Vitamine B6

pyridoxine

2 mg

Vitamine B2

riboflavine

1,6 mg

Vitamine B1

thiamine

1,4 mg

Vitamine B9

acide folique

200 µg

Vitamine B8 (H)

biotine

150 µg

Vitamine B12

cobalamine

1 µg

Vitamine D

calciférol (antirachitique)

5 µg

Vitamine E

tocophérol (antioxydant)

10 mg

Vitamine A

rétinol (antixérophtalmique)

800 µg

Vitamine K

phylloquinone et ménaquinone (antihémorragique)

100 µg


modélisalisation de molécules / logiciels 3D

? Malgré leur grande diversité, les molécules qui composent la matière vivante

appartiennent à un nombre réduit de familles chimiques. Citer les quatre familles. Pour chaque exemple, un par famille, donner la composition atomique qualitative.

? Quels sont les atomes les plus représentés dans la matière vivante ? Au niveau des quatre familles, quel est l'atome majoritairement représenté dans le squelette chimique des molécules ?

Conclusion: quelles sont les différences entre molécules minérales et organiques ?

La matière connue de l’Univers est formée principalement d’hydrogène et d’hélium alors que la Terre est surtout constituée d’oxygène, d’hydrogène, de fer, de silicium, de magnésium et les êtres vivants de carbone, hydrogène, oxygène et azote.

lundi 30 novembre 2020

1/ Transmission, variation et expression du patrimoine génétique

 

Evaluation / les divisions cellulaires

Retour sur questions de départ :

Pourquoi y a-t-il différentes variantes de gènes ?

1,3/ Variations du patrimoine génétique

1,3,1/ Mutations de l’ADN et variabilité génétique

Brain storming → carte mentale sur le mot mutation / QQQCOQP

définition du mot mutation

1/ Mutagénèse par ultra-violets

https://biblio.editions-bordas.fr/adistance/9782047388259/?openBook=9782047388259%3fdXNlck5hbWU9UVFGdno4NlNydnZRQWQrbWhmQUVvQT09JnVzZXJQYXNzd29yZD1XalB3YkZzdmZ2RmNDSHNXUmgyemt3PT0mZGVtbz10cnVlJndhdGVybWFyaz0=

https://www.svt-lycee-elorn.ovh/ade2.php

http://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/ress/mutations/lev_mut.html

http://www.didier-pol.net/4MUT-LEV.html

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article365

- Concevoir et réaliser un protocole pour étudier l'action d'un agent mutagène (par exemple les UV) sur la survie des cellules et sur l'apparition de mutants. Quantifier.

2/ Petit tour non exhaustif des agents mutagènes

http://mutations.genetiques.free.fr/Les%20differents%20agents%20mutagenes%20et%20leurs%20origines.html

http://acces.ens-lyon.fr/biotic/genetic/mutation/html/mutagen.htm


agents mutagènes : chimiques ou radiation

chimiques : imitent ou modifient la structure de l'ADN

radiation : rupture de brin, mutation, enchevêtrement de l'ADN

- Recenser et exploiter des informations permettant de montrer l'influence d'agents mutagènes physiques (rayonnements) ou chimiques (molécules).

2,1,4/ Cerveau et Mouvement volontaire

L’exploration du cortex cérébral permet de situer les aires motrices spécialisées à l’origine des mouvements volontaires. Les aires corticales communiquent entre elles par des voies neuronales où se propagent des potentiels d’action dont la fréquence d’émission est modulée par un ensemble de neurotransmetteurs.

3/ Intégration des messages nerveux : Sommation de PA

Modélisation de la sommation de potentiels d'action / logiciels :

« Nerf » de Perez : logiciel de simulation → menu « synapse »

https://disciplines.ac-toulouse.fr/svt/les-logiciels-de-pierre-perez

« somspat » de Consentino : logiciel sommation spatiale :

https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/flash/somspat/

https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/?tag=integration-nerveuse

Les messages nerveux moteurs qui partent du cerveau cheminent par des faisceaux de neurones qui « descendent » dans la moelle jusqu’aux neurones-moteurs. Le corps cellulaire du neurone-moteur reçoit des informations diverses qu’il intègre sous la forme d'un message moteur unique et chaque fibre musculaire reçoit le message d’un seul neurone moteur.

4/ Plasticité cérébrale

Expérimentation animale sur la plasticité cérébrale :

Approche clinique de la plasticité motrice cérébrale

Plasticité corticale chez l'homme adulte : http://www.inrp.fr/Acces/biotic/neuro/plasticite/html/plasthom.htm

Recenser, extraire et exploiter des informations permettant de comprendre et prévenir certains dysfonctionnements nerveux (par exemple : accident vasculaire cérébral, maladies neuro-dégénératives, infections virales…) ;

Recenser, extraire et exploiter des informations permettant de mettre en évidence la plasticité du cortex à partir de situations d’apprentissages ou de récupération post-dysfonctionnement.

Certains dysfonctionnements du système nerveux modifient le comportement et ont des conséquences sur la santé. L’apprentissage ou la récupération de la fonction cérébrale après un accident reposent sur une capacité essentielle : la plasticité cérébrale.

5/ Fragilité cérébrale

Effets des drogues : cf neuromed

Exp de Milner (1952) sur les circuits de la récompense 

addiction au porno : https://www.facebook.com/hashtag/wearelovers

Extraire des informations pour comprendre certains comportements addictifs face à des molécules exogènes.

Utiliser un logiciel de modélisation et visualisation moléculaire pour comparer neurotransmetteurs et molécules exogènes.

La prise de substances exogènes (alcool, drogues) peut entraîner la perturbation des messages nerveux et provoquer des comportements addictifs.