samedi 16 décembre 2017

quel est le lien entre mutations et maladies ?

A3 : Etude d'une maladie génétique : la mucoviscidose

effets de ces modifications moléculaires : http://www.vaincrelamuco.org/ewb_pages/s/symptomes-respiratoires.php
gène codant pour la protéine CFTR, sur le chromosome 7 → canal ionique
La mucoviscidose est une maladie fréquente, provoquée par la mutation d’un gène qui est présent sous cette forme chez une personne sur 40 environ.
=> le risque de transmission de la maladie.
Homozygote // hétérozygote 
autosome = chs homologues // gonosome = hétérosome = chs sex
Un TPE sur la thérapie génique : http://therapiegenique.free.fr/annexe/accueil.htm
localisation – isolement – amplification – transfert = thérapie gén(ét)ique
Pour de nombreuses maladies génétiques seuls les homozygotes pour l’allèle muté sont malades. L'étude d'un arbre généalogique permet de prévoir les risques de transmission de la maladie. On limite les effets de la maladie en agissant sur des paramètres du milieu. Un phénotype malade comporte des aspects macroscopiques (symptômes) qui s’expliquent par la modification d’une protéine. La thérapie gén(ét)ique constitue un espoir de correction de la maladie dans les cellules atteintes.
§ virus / mutation / maladies ?

A4 : Chasse aux microbes / internet

MAIS :
Sequencing Staph: New Genetic Analysis Tracks MRSA Mutations : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=mrsa-genome-sequencing
ET :
Microbes : pourquoi bactéries et virus nous sont indispensables : http://www.larecherche.fr/content/actualite-vie/article?id=28667
exploring biodiversity that live on us : http://www.yourwildlife.org/
maladies à microbes, variation génétique , bactérie, antibiotiques, résistance, sélection naturelle
Des mutations spontanées provoquent une variation génétique dans les populations de bactéries. Parmi ces variations, certaines font apparaître des résistances aux antibiotiques. L’application d’un antibiotique sur une population bactérienne sélectionne les formes résistantes et permet leur développement. L’utilisation systématique de traitements antibiotiques risque d'augmenter la fréquence des formes résistantes.

Bilan/ Mutations et maladies

Le plus souvent, l’impact du génome sur la santé n’est pas un déterminisme absolu. Il existe des gènes dont certains allèles rendent plus probable le développement d’une maladie sans pour autant le rendre certain. En général les modes de vie et le milieu interviennent également, et le développement d’une maladie dépend alors de l’interaction complexe entre facteurs du milieu et génome.

La détermination des causes d’une maladie n’est possible qu’en utilisant un mode de pensée statistique. Attention à la simplicité de certains messages affirmant le rôle déterminant de tel facteur, génétique ou non. Déterminer les facteurs génétiques ou non d'une maladie repose sur des méthodes particulières qui constituent les fondements de l'épidémiologie.


Ex de ROC ayant comme conclusion le bilan précédent : Certaines maladies comme la mucoviscidose sont liées à la mutation d'un gène (ici CFTR sur chs 7) mais d'autres pas.
A l'aide de vos connaissances vous développerez un texte structuré et illustré de schémas pour expliquer l'interaction complexe entre génôme et environnement.

C : Exemples de mutations avantageuses …

Paludisme : une mutation génétique avantageuse en Asie du Sud-est : http://www2.cnrs.fr/presse/communique/1756.htm?debut=120&theme1=3
mutation et adaptation des bactéries au tube digestif : http://cat.inist.fr/?aModele=afficheN&cpsidt=15424131
résistance aux benzimidazoles chez Teladorsagia circumcincta : http://cat.inist.fr/?aModele=afficheN&cpsidt=192980

Conclusion : expression, reproduction, mutation génétique

Les mécanismes de transcription et traduction expliquent l’équipement protéique des cellules. La réplication et la mitose permettent une reproduction cellulaire conforme. Toutefois, la fragilité de la molécule d’ADN - notamment lors de la réplication - est source de mutation, cause de variation génétique. Les mutations sont la source aléatoire de la diversité des allèles, fondement de la biodiversité. L’Homme aussi bien que les microorganismes infectieux susceptibles de l’attaquer présentent une forte variabilité génétique issue de mutations et conservée au cours des générations. Ces variations présentent des implications en matière de santé : les hommes ne sont pas génétiquement égaux devant la maladie et l’évolution rapide des microorganismes pose des problèmes en termes de prévention et de traitement.

vendredi 15 décembre 2017

§ Comment les montagnes vieillissent-elles  ?

A2 : Modélisation numérique de l'isostasie / logiciels

© TS TP isostasie1.doc
® TS TP isostasie ressource2.ods
TS TP isostasie ressource2correction.ods
Dia Isostasie.odp
Une simulation numérique de la profondeur de la racine crustale : http://www.svt.ac-versailles.fr/spip.php?article735
isostasie, différences d'altitude, épaississement crustal
épaississement raccourcissement empilement

A3 : L’érosion tectonique par déformation de chaîne / docs

Manuel Documents 1, 2 et 3 p 198 et 199
Les données GPS montrent qu'actuellement Lyon s'éloigne de Turin de 0,5 mm par an
Un paradoxe : extension + effondrement des terrains dans une chaîne de montagnes de collision
Des analyses structurales montrent, dans une partie des Alpes qui n'est plus affectée par des mouvements de compression, l'existence de nombreuses failles normales (marqueurs de divergence) relativement récentes. Cette fracturation tardive en extension contrôle ainsi l'effondrement de la zone briançonnaise et de la zone piémontaise. En effet, le cœur de la chaîne a tendance à s'effondrer sur lui même avec un mouvement d'extension.
« Contrairement à une idée tenace, l'érosion de surface n'est pas seule à l'origine de la disparition des reliefs. Étirées en profondeur, les montagnes s'allongent, s'affaissent. Un processus tectonique d'une efficacité redoutable qui, en quelques dizaines de millions d'années, a raison de nos montagnes, les ramenant inexorablement au rang de simples plaines. » La Recherche : http://www.larecherche.fr/la-destruction-des-montagnes
système instable
phénomènes tectoniques & destruction des reliefs

B15 : Erosion et isostasie

La lithosphère est en équilibre (isostasie) sur l'asthénosphère. Les chaînes de montagnes anciennes ont des reliefs moins élevés que les plus récentes. On y observe à l'affleurement une plus forte proportion de matériaux transformés et/ou formés en profondeur. Les parties superficielles des reliefs tendent à disparaître. Altération et érosion contribuent à l'effacement des reliefs. Les produits de démantèlement sont transportés sous forme solide ou soluble, le plus souvent par l'eau, jusqu'en des lieux plus ou moins éloignés où ils se déposent (sédimentation). Des phénomènes tectoniques participent aussi à la disparition des reliefs. L'ensemble de ces phénomènes débute dès la naissance du relief et constitue un vaste recyclage de la croûte
continentale.

B : Cycle des roches

Manuel p.194-5
cycle des roches : carnet sortie
schéma arénisation : carnet sortie
recyclage des matériaux de la croûte
érosion, transport, sédimentation
© TS Schbils.odg
schéma-bilan
TS-schbil-Cycle des roches.JPG
Suite : Evolution

Netographie

site Italien sur les Alpes et la paléotectonique : http://italiangeology.tripod.com/ingvideo.htm
étude structures géol /M photos = témoin collision : http://www.discip.crdp.ac-caen.fr/svt/cgaulsvt/travaux/collisionweb/index.htm

A :


isotherme d’une zone de subduction :

jeudi 14 décembre 2017

comment une roche formée en profondeur se retrouve-t-elle à la surface ?


A2 : Modélisation numérique de l'isostasie / logiciels

© TS TP isostasie1.doc
® TS TP isostasie ressource2.ods
TS TP isostasie ressource2correction.ods
Dia Isostasie.odp
Une simulation numérique de la profondeur de la racine crustale : http://www.svt.ac-versailles.fr/spip.php?article735
isostasie, différences d'altitude, épaississement crustal
épaississement raccourcissement empilement

§ Comment les montagnes vieillissent-elles ?


1.5 : La disparition des reliefs : érosion, sédimentation et recyclage des matériaux

Tout relief est un système instable qui tend à disparaître aussitôt qu'il se forme. Il ne s'agit pas ici d'étudier de façon exhaustive les mécanismes de destruction des reliefs et le devenir des matériaux de démantèlement, mais simplement d'introduire l'idée d'un recyclage en replaçant, dans sa globalité, le phénomène sédimentaire dans cet ensemble. Comme les matériaux océaniques, la lithosphère continentale est recyclée en permanence. Les mécanismes sont cependant différents, ce qui explique que la croûte continentale puisse conserver les roches les plus anciennes de la Terre.

A1 : Granulométrie des sables de Loire / logiciel Google earth + Excel

Transport et sédimentation1.kmz
© TP Transport et sédimentation des particules
Les fichiers Excel sont sur le fichier transport sédimentation KMZ. Il faut charger sur google earth le fichier KMZ. Ensuite sur google earth, l'ouvrir et suivre les différentes étapes du TP. Pour accéder au fichier excel, il faut cliquer sur les punaises situées au Puy en Velay, Orléans et Nantes.
TS_TP_Transport sédimentation Google earth.xls
Diap /_Transport sédimentation Google earth.odp
Manuel p.196-7
chaînes de montagnes, Reliefs matériaux transformés et/ou formés en profondeur
Altération et érosion
transport solide ou soluble / eau
sédimentation
recyclage

Sortie perruches et roches

mercredi 13 décembre 2017

bobo bb

The Mystery of How Babies Experience Pain

We may be underestimating how much pain babies feel when they are under stress
The Mystery of How Babies Experience Pain
Credit: Tom Merton Getty Images

Où la vie est-elle possible ?

1.8 : Les conditions de la vie

Activité 1 : Comparaison des planètes de notre système solaire / tableau

Logiciel Planète 3D / Perez : http://svtolog.free.fr/article.php3?id_article=274
explore solar system : http://www.bbc.co.uk/solarsystem/
faire un tableau de comparaison des planètes : distance au soleil / diamètre / température de surface / présence d'atmosphère / composition, ...
Système solaire, étoile, planète gazeuse ext, planète rocheuse int, ceinture d'astéroïdes, comète.

Agenda : faire acT2 :

Activité 2 : Classement des planètes de notre système solaire / Schéma

sur une feuille A4 (blanche c'est mieux !) et à l'aide de votre tableau de comparaison ou celui de la p.15 du manuel : 
  1. Tracer une droite en diagonale (= distance au soleil) à l'échelle 1 cm = 140 Mkm ou 1 cm = 1 Unité Astronomique (voir manuel p.15)
  2. Représentez les planètes de part et d'autre de la droite à l’échelle 1mm = 2 000 km donc 1 cm = 20 000 km
  3. Complétez le schéma avec le nom de chaque planète, coloriez les planètes telluriques en rouge, les planètes gazeuses en vert, l’atmosphère en bleu, précisez la température au sol, les états de l’eau et la présence de vie.
  4. A partir de toutes ces informations, comparez la Terre avec les autres planètes telluriques afin d’indiquer ses particularités.
Diamètre des planètes // distance au soleil : http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=612
Diamètre des planètes # distance au soleil
Particularités de la terre : atmosphere, roche, eau liquide, vie,

mardi 12 décembre 2017

Une simulation numérique de la profondeur de la racine crustale :
logiciel simulairy :
logiciel Airy :

Star Size Comparison HD

comment l'évolution se fait-elle ?

A3 : Définition de 4 forces évolutives

® derive genetique.odt
définir en 4 mots clefs ce qui peut conduire à l'apparition de nouvelles espèces.
Evolution_forces.odp
Migration = changement de lieu d'un organisme provoquant l'isolement de certains génômes, donc une évolution différente et éventuellement un croisement avec une nouvelle population et dans ce cas l'apport de nouveaux gènes pour la population.
Mutation = provoque l'apparition de nouveaux allèles par modification de gènes c'est-à-dire d'une séquence de nucléotides (bases) dans l'ADN.
Sélection = filtre à allèles par l'intermédiaire du milieu, de la reproduction, de l'alimentation, de la prédation, ...
Dérive [drift] = modification aléatoire de la fréquence des allèles dans une population

Bilan/ 4 forces évolutives : mutation, dérive, sélection, migration

La diversité des allèles est l’un des aspects de la biodiversité. La dérive génétique est une modification aléatoire de la diversité des allèles. Elle se produit de façon plus marquée lorsque l’effectif de la population est faible. Mutations, migrations, dérive génétique et sélection naturelle peuvent conduire à l’apparition de nouvelles espèces.
Genetic drift, alleles, mutation, natural selection, migration
dérive génétique, allèles, mutation, sélection naturelle, migration
The diversity of alleles is one aspect of biodiversity. Genetic drift is a random modification of the diversity of alleles. It occurs most dramatically when the population size is low. Mutation, migration, natural selection and genetic drift can lead to the emergence of new species.

C/ Pour-suivre

Modélisation :
Modéles multi-agents :
Modèles divers
Banque de données alléliques :
La science, l’évolution et le créationnisme : http://www.academie-sciences.fr/enseignement/Darwin_260108.pdf
2V : décembre
2J : décembre
Next week : évaluation