vendredi 30 janvier 2015

Leucine* à 0' hors de la cellule - 3' ds réticulum endoplasmique - 7' ds appareil de Golgi - 30' ds vésicules - 120' dans lumière du canal pancréatique

source : http://svt.ac-creteil.fr/archives/tp/Tp1S/biosynprot.htm

évaluation formative : organites d'une cell animale : http://www.ac-creteil.fr/biotechnologies/doc_biocell-structurecellanimale.htm

Noyau, cytoplasme, organites : réticulum [réseau] endoplasmique, appareil de Golgi, vésicules

A8/ Construction de l'arbre de la vie /sites www

Interactive tree of life : http://www.onezoom.org/

construction de l'arbre au cours des ans : http://www.onezoom.org/tetrapods.htm (clic en haut à droite, compteur années en bas)

another tree of life : http://tolweb.org/tree/

Timetree : http://timetree.org/

Diap : histoire arbre évolution

jeudi 29 janvier 2015

GEOS5 aerosols

A5/ Histoire du concept d'évolution

© \histoire_concept_evolution.odp

D\histoire_concept_evolution.odp

http://acces.ens-lyon.fr/evolution/biodiversite/dossiers-thematiques/les-trois-domaines-du-vivant/historique-de-la-classification-du-vivant-1

concept, histoire, sélection naturelle, évolution, espèce, taxon

28 janvier : TP phylogène

A6/ Rapprochements d'espèces / logiciel phylogéne

© TS TP phylogene.docx

Protocole / manuel p80 : ouvrir le logiciel Phylogène – tableau de caractères – dossier « Archontes » - sélectionner les espèces que vous voulez – afficher la « matrice des distances » - puis « arbres » → arbre phylogénétique des archontes
Protocole / manuel p83 : sélectionner la collection « Homininés » - construire la matrice avec les espèces proposées et les caractères « prognatisme » « trou occipital » « saillie des pommettes » - établir des parentés possibles pour chacun des caractères. → arbre phylogénétique des Homininés
Protocole / manuel p77 : « tableau de séquences - « archontes » - « molécules » - « globines » - afficher matrices puis arbres → arbre phylogénétique des archontes à partir des données moléculaires

→ Phylogénèse, arbre, matrice, groupes, taxon, état dérivé ou évolué / ancestral ou primitif des caractères, innovation évolutives

FT fournies au TP de Bac (ECE) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/bankact/index.php?m=1&sm=1

A7/ Phylogénèse des opsines / rappel de 1S

D/ oeil_évolution.odp

D/ oeil genes opsines.odp

Phylogénèse et Famille multigénique, mutations neutres (silencieuses),

Les bases biologiques d'une « bonne santé »

Que signifie, au sens biologique, « être en bonne santé » ? C'est à cette vaste question qu'est consacré le projet du Laboratoire d'Excellence Milieu Intérieur, coordonné à l'Institut Pasteur par le Pr Matthew Albert (unité Immunobiologie des cellules dendritiques, Institut Pasteur/Inserm) et par le Dr Lluis Quintana-Murci (unité de Génétique évolutive humaine, Institut Pasteur/CNRS). Les chercheurs de ce consortium viennent de franchir une étape importante, en analysant les premiers résultats générés à partir de la cohorte Milieu Intérieur - mille donneurs bien portants, première cohorte française du genre - dont l'étude devra servir à définir les paramètres d'un système immunitaire sain. Outre une application directe dans le domaine de la santé, les résultats de ce programme intéressent directement la communauté scientifique, en définissant un nouveau cadre de contrôle aux études menées chez des populations de malades. Ils devraient également permettre de mieux comprendre la variabilité entre individus, et ainsi fournir des outils de référence pour adapter les traitements, en vue du développement de la médecine personnalisée.

A1/ Effet mutagène des UV sur levure ade2 / expérience in vitro

Manuel p86 à 89

TP irradiation UV sur levures Saccharomyces cerevisiae ade2

http://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/ress/mutations/lev_mut.html

http://www.didier-pol.net/4MUT-LEV.html

http://www.snv.jussieu.fr/vie/informations/2/22ADN/mutagenese/levureADE/levureade.htm

http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/lycee/iprnob/ade2/

http://www.jeulin.fr/fr/a-a1000004266-edc1000005/ressource/1001176/Influence-de-l-irradiation-aux-UV-sur-une-culture-de-levure.html

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=365

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=1874

correction du CR /10

intro : pb → hyp → conséquences vérifiables /3pts

mat&met : levure ade2, chaine de synthèse de l'adénine, coloration, réversion ; culture en milieu stérile ; irradiation aux UV /3

résultats & interp : tableau % de réversion → graphe courbe /2

conclusion : => Les UV sont mutagènes et létaux /2

impact moléculaire des UV sur l'ADN : http://www.web-books.com/MoBio/Free/Ch7F5.htm

UV mutagènes et létaux

mercredi 28 janvier 2015

The first archaic Homo from Taiwan

Tape of life may not always be random

16:37 26 January 2015 by Bob Holmes
For similar stories, visit the Genetics and Evolution Topic Guides

Evolution may have fewer options for adapting to new challenges than you'd think. When terrestrial mammals returned to the ocean to become whales, walruses and manatees, the three lineages sometimes made use of strikingly similar genetic changes.

Natural selection led to the same genetic changes in the walrus, the whale and the manatee <i>(Image: Karen Munro)</i>

Natural selection led to the same genetic changes in the walrus, the whale and the manatee (Image: Karen Munro)

Polar bear penis bone may be weakened by pollution

12:36 26 January 2015 by Penny Sarchet
For similar stories, visit the Endangered Species , Climate Change and Love and Sex Topic Guides

PCBs are one thing you don't want to take to spice up your sex life <i>(Image: Paul Nicklen/NGS)</i>

PCBs are one thing you don't want to take to spice up your sex life (Image: Paul Nicklen/NGS)

Remarkable Fossils Push Back Snake Origins by 65 Million Years

The four oldest-known snake fossils were announced Tuesday, the most ancient of which was a roughly 25-cm-long reptile unearthed in a quarry near Oxford, England, that lived about 167 million years ago

On peut enfin regarder les mouches voler

L'observation en microtomographie par rayons X révèle les muscles qui contrôlent le vol des mouches.

Ces images exceptionnelles d’une mouche en plein vol ont été capturées grâce à une technique d’imagerie 3D par rayons X. On y voit les muscles de la mouche bleue (Calliphora vicina) se contracter, pour lui permettre d’agiter les ailes plus de 150 fois par seconde. Ces battements ne produisent pas seulement un vrombissement agaçant : ils permettent surtout à l’insecte de se mouvoir avec une agilité hors du commun.

Des Mille et une nuits aux oiseaux géants malgaches

L'oiseau Roc rencontré par Sinbad le Marin a-t-il existé ? Probablement pas, mais il a pu être inspiré par les œufs géants d'une espèce récemment éteinte, signalée à Madagascar au XVII^e siècle.

Eric Buffetaut

Les compagnons de Sinbad, lors de son cinquième voyage, découvrent un œuf de l'oiseau Roc, qu'ils brisent pour rôtir l'oisillon, s'attirant la colère des parents. Dans le récit des Mille et une nuits comme sur cette gravure de Gustave Doré, réalisée vers 1880, l'oiseau ressemble à un rapace géant. Un tel oiseau a-t-il existé ?http://www.pourlascience.fr/ewb_pages/a/article-des-i-mille-et-une-nuits-i-aux-oiseaux-geants-malgaches-33651.php

La diversité génétique africaine enfin étudiée

Les résultats de la première grande étude transcontinentale du génome des africains révèlent des aspects méconnus du peuplement du berceau de l’humanité.

François Savatier

Le devenir des déchets plastiques en mer

Plus de 5 000 milliards de débris plastiques flottent à la surface des océans, selon une récente étude internationale, soit plus de 260 000 tonnes. Ces chiffres ne correspondraient qu’à une infime part de la pollution des océans par le plastique. Éclairage de François Galgani, océanographe à l’Ifremer, à Bastia, et coauteur de l’étude.

Propos recueillis par Marie-Neige Cordonnier

Le dilemme du vaccin

Pourquoi tant de personnes refiusent-elles la vaccination ? Nous avons tendance à surévaluer les risques très faibles, et une dissymétrie psychologique entre l'action et l'inaction peut fausser notre jugement.

Gérald Bronner

Ces bactéries qui nous gouvernent

Le jeudi 22 janvier 2015 de 14h à 15h sur France Culture, en partenariat avec Pour la Science.

Jeudi 22 janvier 2015, dans l'émission La marche des sciences, Gérard Eberl, immunologiste à l'Institut Pasteur, questionnera l'histoire que nous entretenons avec les bactéries qui vivent dans un subtil équilibre au sein de nos organismes.

Méditation : comment elle modifie le cerveau

Les neurosciences explorent le cerveau des méditants. Et confirment les effets bénéfiques de ces très anciennes pratiques méditatives.

Matthieu Ricard, Antoine Lutz et Richard Davidson

L'essentiel

- La méditation, dont il existe diverses formes, s'est répandue dans le monde laïc. Elle est notamment pratiquée dans les hôpitaux et les écoles.
- Elle produit plusieurs effets bénéfiques sur le plan psychologique. Par exemple, les pratiquants contrôlent mieux leur attention et sont moins sensibles au stress.
- L'imagerie cérébrale et d'autres techniques ont permis de montrer qu'elle modifie l'activité et la structure du cerveau.

Grâce aux carnivores, les acacias perdent leurs épines

terre - par Benjamin Le Sant dans mensuel n°494 daté décembre 2014 à la page 20 (265 mots) | Gratuit

La présence ou non d'épines sur les acacias dont se nourrissent les impalas tiendrait à la présence ou à l'absence de léopards, prédateurs des impalas.

Homo erectus gravait des coquillages

archéologie - 05/12/2014 par Bérénice Robert (463 mots)

Le plus vieil exemple de gravure abstraite a été découvert sur un coquillage trouvé sur l’ile de Java. Il serait l’oeuvre d’Homo erectus.

La plus ancienne gravure géométrique : voilà ce qu’a découvert une équipe néerlandaise, française et australienne, sur un coquillage mis au jour à Trinil sur l’Ile de Java. Le graveur ? L’homme de Java ou Homo erectus, le seul hominidé présent dans cette partie du monde à l’époque à laquelle ont été datés les coquillages, il y a entre 540 000 et 430 000 ans. De quoi relancer le débat autour de l’apparition d’un comportement abstrait chez l’homme. Avant de devenir Sapiens, le genre Homo maniait donc déjà les symboles.

Les jeux vidéo d'action dopent les capacités d'apprentissage

cerveau - par Marie-Laure Théodule dans mensuel n°495 daté janvier 2015 à la page 16 (268 mots) | Gratuit

Les joueurs assidus de jeux d'action deviennent plus vite performants dans des tâches d'identification visuelle.

Une barrière protège la Terre

astres - 06/01/2015 par Julien Bourdet (299 mots)

Des chercheurs américains ont mis en évidence qu'un immense bouclier entourait la Terre, empêchant les électrons de haute énergie de l'atteindre.

L'anguille électrique paralyse ses proies à distance

vie - par Benjamin Le Sant dans mensuel n°496 daté février 2015 à la page 22 (371 mots) | Gratuit

Grâce à l'utilisation d'impulsions électriques, un poisson-prédateur contrôle puis immobilise ses prises à quelques centimètres de distance.

Comment l'anguille électrique Electrophorus electricus parvient-elle à repérer et à paralyser ses proies dans les eaux boueuses d'Amazonie ?

Cerveau et attention spatiale : l'hémisphère gauche peut-il compenser une lésion de l'hémisphère droit ?

Le Dr Paolo Bartolomeo, Directeur de recherche Inserm et chef d'équipe de PICNIC LAB¹ à l'Institut du cerveau et de la moelle épinière - ICM (Institut sous tutelle de l'Inserm, du CNRS et de l'UPMC) - et ses collaborateurs ont publié le 21 janvier 2015 dans la revue Brain, les résultats de leurs recherches sur la "négligence spatiale unilatérale" encore connue sous le terme "d'héminégligence". Les personnes atteintes de ce trouble agissent comme si elles ignoraient la moitié gauche du monde. Ce trouble survient essentiellement après une lésion de l'hémisphère droit du cerveau, par exemple suite à un AVC (accident vasculaire cérébral), et en aggrave le handicap en gênant la rééducation et la récupération. Les scientifiques ont donc recherché des facteurs prédictifs de la persistance de ce trouble, afin de proposer aux patients une rééducation adaptée. Le travail publié montre que les deux hémisphères peuvent en partie se compenser l'un l'autre en cas de lésion, grâce à des mécanismes, dits de "plasticité cérébrale", encore peu connus. Les résultats suggèrent cependant que cette compensation nécessite que les deux hémisphères "se parlent" via des connexions – faisceaux de matière blanche formés par les prolongements des neurones – non lésées.

§ Comment la biodiversité a-t-elle pu être modifiée au cours de l'évolution ?

28 janvier : TP phylogène

A5/ Rapprochements d'espèces / logiciel phylogéne

© TS TP phylogene.docx

Protocole / manuel p80 : ouvrir le logiciel Phylogène – tableau de caractères – dossier « Archontes » - sélectionner les espèces que vous voulez – afficher la « matrice des distances » - puis « arbres » → arbre phylogénétique des archontes
Protocole / manuel p83 : sélectionner la collection « Homininés » - construire la matrice avec les espèces proposées et les caractères « prognatisme » « trou occipital » « saillie des pommettes » - établir des parentés possibles pour chacun des caractères. → arbre phylogénétique des Homininés
Protocole / manuel p77 : « tableau de séquences - « archontes » - « molécules » - « globines » - afficher matrices puis arbres → arbre phylogénétique des archontes à partir des données moléculaires

→ Phylogénèse, arbre, matrice, groupes, taxon

FT fournies au TP de Bac (ECE) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/bankact/index.php?m=1&sm=1

lundi 26 janvier 2015

§ Comment le cœur et les poumons fonctionnent-ils pendant un effort ?

23 janvier

=> Heart, artery, vein, capillary, blood pressure, double movement in series, parallel circulation. systolic, diastolic, frequency, flow

B22/circulation et respiration au cours de l'effort

During the effort a number of physiological parameters are modified : heart frequency, volume of systolic ejection and thus cardiac flow & blood pressure, ventilation frequency and volume and thus pulmonary flow. These physiological changes allow a better supply of muscle in dioxygen and nutrients.The anatomical organization facilitates this privileged contribution. A good cardiovascular and respiratory status is essential to the practice of physical exercise.

Au cours de l’effort un certain nombre de paramètres physiologiques sont modifiés : fréquence cardiaque, volume d’éjection systolique et donc débit cardiaque & pression artérielle ; fréquence ventilatoire, volume courant et donc débit ventilatoire. Ces modifications physiologiques permettent un meilleur approvisionnement des muscles en dioxygène et en nutriments. L’organisation anatomique facilite cet apport privilégié. Un bon état cardiovasculaire et ventilatoire est indispensable à la pratique d’un exercice physique.

C/ pour-suivre

Le coeur artificiel implanté chez un premier patient : http://www.larecherche.fr/actualite/sante/coeur-artificiel-implante-premier-patient-31-12-2013-168602

Dossier Le coeur : organe de vie – 02/04/2012 : http://www.futura-sciences.com/fr/doc/t/medecine-1/d/coeur_1474/c3/221/p1/

Quizz coeur : http://www.ac-creteil.fr/biotechnologies/doc_biohum-heart-anatomy.htm ; http://www.ac-creteil.fr/biotechnologies/doc_biohum-heart_bloodflow_test.htm

mesure de l’indice de Ruffier : www.didier-pol.net/1COEUR.html

historique de la mesure : http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/PA/ensPA.htm

histoire d’un raisonnement : la découverte de la circulation : http://www.svt.ac-aix-marseille.fr/outils/experimentation/harvey.htm

Calcul du coût énergétique d’un effort : http://entrainement-sportif.fr/calories.htm ; http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=1340

Calcul de la puissance d’un exercice (flexions) : http://www5.ac-lille.fr/~svt/exaojmm/Default_prog.htm

Estimation de la VMA (test de Leger ou Harvard) : http://entrainement-sportif.fr/vma.htm ; http://www.irbms.com/rubriques/Evaluations/test-de-navette-luc-leger.php

L’entraînement sportif, l’avis d’un professeur d’EPS : http://entrainement-sportif.fr/

Détermination d’une ration énergétique en fonction du travail physique logiciel gratuit « MacDO » : http://wwwppeda.free.fr/logiciels/mcdo.htm

Dissection du coeur complétée d’expériences d’injections (www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/coeurmouton/mouton.html) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/lycee/perez/coeur/coeurpp.htm

Simulation du fonctionnement de l’appareil pulmonaire humain (logiciel Pulmo, P. Perez, animation Cosentino, annuaire de

références de logiciels - E. Jourdan) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/lycee/perez/pulmo/pulmo.htm ; http://www.ac-nice.fr/svt/productions/2ao/respi/respi.swf ; http://pagesperso-orange.fr/jourdan.eric/log/anatomie.htm

Simulation de prises de sang (F. Sauvion) : http://ww2.ac-poitiers.fr/svt/spip.php?article414

Simulation d’affections cardiovasculaires et pulmonaires (annuaire E. Jourdan) : http://pagesperso-orange.fr/jourdan.eric/log/anatomie.htm

26-28 janvier : devoirs communs