Diaporama : histoire arbre évolution

A8/ Exemples de spéciation / exposés

Protocole : recherche d'informations sur le sujet choisi → rédaction d'un article pour le blog → envoi de l'article en format doc ou odt sur elyco pour que je le copie/colle sur le blog

Une nouvelle espèce d'ours due au réchauffement climatique : http://www.pedagogie.ac-nantes.fr/02599123/0/fiche___ressourcepedagogique/&RH=1160729734281

Crepis sancta : Un exemple d'adaptation d'une plante au milieu urbain : http://www.pedagogie.ac-nantes.fr/1341330459731/0/fiche___ressourcepedagogique/&RH=1160729734281

Mouche de la pomme (Rhagoletis) → Sélection diversifiante : cas de spéciation sympatrique : La mouche de la pomme Rhagoletis pomonella : http://www.pedagogie.ac-nantes.fr/1336903953704/0/fiche___ressourcepedagogique/&RH=1160339982078

autres ex :

1. Moustiques du métro de Londres → mutations – spéciation par isolement géographique – sélection naturelle / Bascouert & Hebert
2. Souris de Madère → remaniements chromosomiques (fusions) – spéciation par isolement reproductif et/ou géographique – dérive génétique
3. Ours blanc/ours brun (hybride : « le pizzly »), Tigre/lion, Corneille noire/corneille mantelée, Pouillots asiatiques, Pieris napi/Pieris bryoniae → Hybrides fertiles / Ponroy & Mahmoud
4. Tournesols américains → modifications caryotypiques – spéciation par isolement reproductif – hybrides fertiles / Turbet
5. Certains insectes Diptères (Culex, Aedes, Drosophila) dont les gamètes sont parasités par des Rickettsies ou par des bactéries du genre Wolbachia → Spéciation par isolement reproductif (les gamètes infectés par les rickettsies ne sont pas « compatibles » avec les gamètes non infectés)
6. Saumons (Onchorhynchus), → Isolement reproductif écologique / Combaluzier & Denis
7. Crapauds du genre Bombina → Isolement reproductif écologique / Aubergeon & Asselin
8. Drosophiles → Selon les populations : isolement reproductif comportemental, écologique, mécanique
9. Pouillot verdâtre (Phylloscopus trochiloïdes), → Anneaux de spéciation (spéciation par isolement gégographique) / Justin & Froger
10. Goélands de l’hémisphère nord (Larus) → Anneaux de spéciation (spéciation par isolement gégographique) / Leroy & Juin
11. Géosptizes des Galapagos, → Spéciation – dérive génétique – sélection naturelle
12. Cyclidés des grands lacs africains, → Spéciation – dérive génétique – sélection naturelle / Marquet & Guilmet
13. Drépanicidés → Spéciation – dérive génétique – sélection naturelle
14. Fauvettes à tête noire → Spéciation – action de l’homme – compétition intraspécifique / Panetier
15. Mésanges → Notion d’espèces, définition, limites / Onimus & Gaudin
16. Guppy → Sélection naturelle / sélection sexuelle / Fuss
17. Tigre/lion → Spéciation prézygotique - Barrière de reproduction = géographie et comportement / Langlais & Millerand
18. Mouton/chèvre → Spéciation post-zygotique( développement de l’embryon stoppé au 1/3) / Naudet & Turbet & Guilleau
19. Cheval / zèbre / Blin & Feve
20. Hamster / Budain & Arnou

espèces, spéciation,

critères phénotypiques & interfécondité

isolement génétique, reproductif, géographique, écologique,

laps de temps

A9/ reflexion sur la notion d'espèce / concepts

Diapo : espèce.odp

des sites « spécialisés » :

Les mécanismes de l'évolution : http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/evolution/evol/tridiv_4.html#IVB ;

Speciation and extinction : http://www.bio.georgiasouthern.edu/bio-home/harvey/lect/lectures.html?flnm=bgsp&ttl=Speciation%20and%20Differentiation&ccode=el&mda=scrn

au programme de 6e : « La diversité des espèces est à la base de la biodiversité. Une espèce est un ensemble d'individus qui évoluent conjointement sur le plan héréditaire. » : http://www.education.gouv.fr/cid22120/mene0817023a.html

futura sciences : http://www.futura-sciences.com/fr/definition/t/zoologie-2/d/espece_2261/

« dans la nature il n’y a pas d’espèces : il n’apparait que des barrières de reproduction. Les espèces, c’est nous qui les créons à partir d’un modèle théorique » (G. Lecointre, professeur au Museum National d’Histoire Naturelle - Revue Espèces – n° 1 –septembre 2011) : http://www.especes.org/

Doit-on abandonner le concept d’espèce ? : http://www.inra.fr/dpenv/leguyc46.htm

l'espèce est une réalité statistique, collective

A2/ Observation du cœur d’huître /video

http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/ATP/dis-hui.htm

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=686

coeur d'huître en video

automatisme cardiaque

A3/ Schématisation de la boucle de régulation nerveuse

Reprendre sch'bilan précédent et ajouter le contrôle nerveux : schbil

Schéma-bilan 2©

=> nerfs ortho et para sympathiques, centre de régulation bulbaire, barorecepteurs, nerf sensitifs de Cyon & Hering, inhibition, activation

control loop [boucle de régulation]

B23/ Une boucle de régulation nerveuse

La pression artérielle est une grandeur contrôlée par plusieurs paramètres. Par exemple, il existe une boucle réflexe de contrôle de la fréquence cardiaque (dont la pression artérielle dépend par l’intermédiaire du débit) :

- des capteurs (barorécepteurs) sont sensibles à la valeur de la pression artérielle ;

- un centre bulbaire intègre les informations transmises par des nerfs sensitifs issues des barorécepteurs et module les messages nerveux en direction de l’effecteur (cœur) ;

- les informations sont transmises du centre à l’effecteur par des nerfs orthosympathiques accélérateurs et parasympathique modérateur.

La boucle de régulation contribue à maintenir la pression artérielle dans d'étroites limites autour d'une certaine valeur. A l’effort, l’organisme s’écarte de cette situation standard.

Blood pressure is a size controlled by several parameters. For example, there is a reflex control loop of heart rate (which depends on blood pressure through the flow) :
- Sensors (baroreceptors) are sensitive to the value of blood pressure;
- Bulbar center integrates information from baroreceptors and modulates nerve signals in the direction of the effector (heart);
- Information is transmitted from the center to the effector by orthosympathetic and parasympathetic nerves.
The feedback loop helps to maintain blood pressure within narrow limits around a certain value. During the effort, the body deviates from this standard situation.

C/ pour-suivre

- Animation « la régulation du fonctionnement cardiaque » : http://www.ac-creteil.fr/biotechnologies/doc_heartregulation.htm

- simulation de la régulation du rythme cardiaque : http://svt.ac-creteil.fr/spip.php?article630

mise en couleur de la frise chronogéologique et installation vitrines

§ Comment se fait la coordination des fonctions de respiration et de circulation ?

23- A nervous control loop

A1/ Expérience virtuelle sur la régulation de la pression artérielle / logiciels www

animation expérience sur le chien : http://svt.ac-creteil.fr/?Une-animation-sur-l-influence-du

Expériences de section-stimulations : http://www.ac-nice.fr/svt/productions/freeware/regulpan/

Autre logiciels en ligne des expériences de section-stimulations : http://44.svt.free.fr/jpg/regulation_pression-arterielle.htm ; http://www.ec44.fr/tice/jpg2/regulation_pression/main.htm

logiciel Regnerv_RC sur la régulation cardiaque (à télécharger) : http://svt.ac-creteil.fr/spip.php?article629 ; http://svt.ac-creteil.fr/?Modulation-du-rythme-cardiaque-par

schéma à compléter : http://www.ac-creteil.fr/biotechnologies/doc_testcoeur.htm

schéma anatomique de la boucle de régulation : http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=2098 ; http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=2512 ; http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=2511

nerf X (10e nerf crânien) = pneumogastrique = nerf parasympathique = nerf moteur modérateur

nerf sympathique = orthosympathique = nerf moteur accélérateur

nerfs de Cyon et Hering = nerfs sensitifs

barorecepteur = recepteur de pression

réaliser un schéma de la boucle de régulation nerveuse de la pression artérielle, contenant les mots suivants :

barorécepteurs → nerf sensitif → centre bulbaire → nerfs orthosympathiques & parasympathiques → effecteur = cœur

§ quelles sont les étapes de la fabrication d'une protéine in vivo ?

232/ Etapes de la fabrication d'une protéine dans la cellule

FT/ Technique de l'autoradiographie / manuel p.397 + site www

http://svt.ac-creteil.fr/archives/Media/Med1S/Autoradiographie/autoradiographie.htm

pour télécharger le log : http://www.blaisepascalbrie.ac-creteil.fr/spip.php?article333

faire une fiche technique

A1/ Localisation des étapes / autoradiographie et MET

electronographie pancréas : http://www.uni-mainz.de/FB/Medizin/Anatomie/workshop/EM/externes/Wartenberg/Pankreas3.jpg

Technique de l'autoradiographie : http://svt.ac-creteil.fr/archives/Media/Med1S/Autoradiographie/autoradiographie.htm

autoradiographie sur acinus pancréatique avec Leucine radioactive ou avec Uridine radioactive : http://svt.ac-creteil.fr/archives/Media/Med1S/Autoradiographie/Cel_panc_WEB.htm

Uracile* à 0' hors de la cell - 1' dans noyau - 2' ds réticulum endoplasmique

Leucine* à 0' hors de la cellule - 3' ds réticulum endoplasmique - 7' ds appareil de Golgi - 30' ds vésicules - 120' dans lumière du canal pancréatique

source : http://svt.ac-creteil.fr/archives/tp/Tp1S/biosynprot.htm

évaluation formative : organites d'une cell animale : http://www.ac-creteil.fr/biotechnologies/doc_biocell-structurecellanimale.htm

Noyau, cytoplasme, organites : réticulum [réseau] endoplasmique, appareil de Golgi, vésicules

A6/ Phylogénèse des opsines / rappel de 1S

oeil_évolution.odp et oeil genes opsines.odp

A7/ Construction de l'arbre de la vie /sites www

Diaporama : histoire arbre évolution

Interactive tree of life : http://www.onezoom.org/

construction de l'arbre au cours des ans : http://www.onezoom.org/tetrapods.htm (clic en ahut à droite, compteur années en bas)

another tree of life : http://tolweb.org/tree/

Timetree : http://timetree.org/

A5/ Comparaison de séquences nucléiques et peptidiques / logiciel Anagène → diaporama

Diapo : synthese_proteines_anagene

code Morse international, fait avec 2 signes : « ti » ou « ta » : http://www.lexilogos.com/clavier/morse.htm

code ASCII = American Standard Code for Information Interchange : http://www.tableascii.com/ ; http://fr.wikipedia.org/wiki/American_Standard_Code_for_Information_Interchange

animation code génétique : http://www.snv.jussieu.fr/vie/documents/codegenet/index.htm#anim

tableau code génétique : http://www.monde-solidaire.org/spip/IMG/jpg/UniversalGeneticCode.jpg

tableaux autrement : http://pst.chez-alice.fr/codgenet.htm

ARN, portions codantes de l’ADN, Séquence, gène, code génétique, codon, anticodon

B231/ Polymères séquencés dans la cellule

La séquence des acides aminés des protéines est imposée par l'information génétique située dans la molécule d'ADN.

Un gène est donc défini par la séquence d'un polynucléotide (ADN, ARN) déterminant la séquence d'un polypeptide.

La séquence des acides aminés est gouvernée par celle des nucléotides suivant un système de correspondance, le code génétique.

Chaque acide aminé correspond à un triplet de nucléotides appelé codon.

Certains codons, dits redondants, correspondent au même acide aminé.

Il existe des codons dits "d'initiation", d'autres de "terminaison".

Le code génétique est identique pour toutes les espèces vivantes connues : il est universel et dégénéré (le doublet initial peut être seul déterminant, la nature dégénérée du code a pour conséquence sa redondance).

molécule	ADN	→ ARN	→ protéine
Polymère	Polynucléotide	Polynucléotide	Polypeptide
Monomères	Phospho-désoxyribo-nucléotides (bases T+A+G+C)	Phospho-ribo-nucléotides (bases U+A+G+C)	Acides aminés (20 différents)
nombre de brins	bicaténaire	Monocaténaire en général	Très variable
structure spatiale	double hélice	variable	hélices+feuillets+boucles
types	un seul	ARN m, t, r, ni, mi, ..	Très nombreuses molécules de structures (cytosquelette) ou enzymatiques (métabolisme)

Acides nucléiques polymères de

	Bases	Nucléoside = sucre + base	Nucléotide = sucre + base + phosphate
A	Adénine	Adénosine	Adénosine monophosphate = AMP Adénosine diphosphate = ADP Adénosine triphosphate = ATP
T	Thymine	Thymidine	Thymidine monophosphate
G	Guanine	Guanidine	GMP, GDP, GTP
C	Cytosine	Cytidine	Cytidine monophosphate
U	Uracile	Uridine	UMP, UDP, UTP

structure I, II, III, IV d'une protéine :

Structure primaire	Structure secondaire	Structure tertiaire	Structure quaternaire
séquence d'acides aminés = polypeptide	configuration spatiale simple = hélices, feuillets, boucles	configuration spatiale globale = enchaînement des hélices, feuillets et boucles	assemblage de sous-unités = complexe protéique

§ les gènes codent pour des protéines : comment ça se fait in vivo ?

Les amas d'étoiles : nouveaux terrains d'investigation pour la quête des exoplanètes

http://www2.cnrs.fr/presse/communique/3391.htm

Sur le millier d'exoplanètes découvert à ce jour, seul un tout petit nombre a été décelé au sein d'amas d'étoiles. Six années de recherches auront été nécessaires à une équipe européenne impliquant un chercheur CNRS du laboratoire Galaxies, Etoiles, Physique et Instrumentation – GEPI¹ à l'Observatoire de Paris (Observatoire de Paris/CNRS/Université Paris Diderot) pour passer en revue un échantillon important d'étoiles au sein de l'amas Messier 67 et mettre au jour trois exoplanètes. Et, fait remarquable, l'une d'entre elles orbite autour d'une étoile quasi identique au Soleil. Ce résultat marque un tournant dans la recherche des exoplanètes, rendant leur quête possible de façon plus systématique dans les amas d'étoiles. Il laisse aussi entrevoir de nouveaux scénarios sur la formation et l'évolution de systèmes planétaires autour d'étoiles comme le Soleil. Ces travaux sont publiés le 15 janvier dans la revue Astronomy & Astrophycics.

Leucémie : mode d'action d'un traitement ciblé élucidé

Le mécanisme de la sénescence - ou vieillissement prématuré des cellules - peut avoir un effet anticancéreux. Ces nouveaux travaux, menés par Hugues de Thé et son équipe (université Paris Diderot/ Inserm/ CNRS/ AP-HP), sont publiés dans Nature Medecine le 12 janvier 2014. Ils révèlent que les traitements ciblés de la leucémie aiguë promyélocytaire, une forme rare de cancer du sang, induisent une cascade d'événements moléculaires qui conduit à la sénescence cellulaire et à la guérison. Ce modèle d'action pourrait être activé dans d'autres types de cancers. http://www2.cnrs.fr/presse/communique/3389.htm

La protéine des fleurs révèle un pan de son histoire…

Présente chez des algues avant même que les plantes conquièrent la terre ferme, la protéine LEAFY joue aujourd'hui un rôle essentiel dans la beauté du monde végétal : c'est elle qui gouverne la formation des fleurs. Dans le cadre d'une collaboration internationale, une équipe mixte ¹associant le CEA, le CNRS et l'UJF, est parvenue à retracer son histoire et à élucider le mécanisme d'évolution qui lui a donné la capacité de diriger la morphogenèse florale. Ce mécanisme a pu être révélé grâce à la découverte d'une forme intermédiaire ancestrale de la protéine qui a perduré jusqu'à nos jours chez une espèce apparentée aux mousses. Ces résultats sont publiés dansScience le 16 janvier 2014.

http://www2.cnrs.fr/presse/communique/3395.htm

Un mécanisme bactérien inédit pour échapper au système immunitaire

Dans une étude publiée le 16 janvier dans PLoS Pathogens, une équipe composée de chercheurs de l'Institut Pasteur, du CNRS, et de l'université Paris Diderot, a identifié un nouveau mécanisme de régulation qui permet l'adaptation rapide d'une bactérie pathogène du genre Streptococcus à son hôte. Ce mécanisme permet à cette bactérie de minimiser son exposition au système immunitaire et de maintenir une bonne capacité de colonisation des tissus. Ces travaux ont été réalisés chez Streptococcus gallolyticus, une bactérie du système intestinal responsable d'endocardites et de septicémies chez les personnes âgées.

A5/ Rapprochements d'espèces / logiciel phylogéne

Protocole / manuel p80 : ouvrir le logiciel Phylogène – tableau de caractères – dossier « Archontes » - sélectionner les espèces que vous voulez – afficher la « matrice des distances » - puis « arbres » → arbre phylogénétique des archontes

Protocole / manuel p83 : sélectionner la collection « Homininés » - construire la matrice avec les espèces proposées et les caractères « prognatisme » « trou occipital » « saillie des pommettes » - établir des parentés possibles pour chacun des caractères. → arbre phylogénétique des Homininés

Protocole / manuel p77 : « tableau de séquences - « archontes » - « molécules » - « globines » - afficher matrices puis arbres → arbre phylogénétique des archontes à partir des données moléculaires

→ Phylogénèse, arbre, matrice, groupes, taxon

FT fournies au TP de Bac (ECE) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/bankact/index.php?m=1&sm=1