§ Quel est le lien entre gènes et protéines ?

A4 : quelques exemples de protéines / Anagène

présentation d'Anagène

FT/ logiciel de séquençage moléculaire / manuel p.

FT fournies au TP de Bac (ECE) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/bankact/index.php?m=1&sm=1

Hémoglobine ….

les protéines sont des molécules à séquence, comme l'ADN

A5 : découverte historique de la relation gène-protéine / logiciels Anagène & Rastop

En 1965, Niremberg & Mattéi mettent au point un protocole permettant d’élucider le code génétique. Ils préparent tout d’abord des extraits de cytoplasme dépourvus d’ARN mais contenant les 20 acides aminés et tous les éléments nécessaires à la synthèse des protéines. Ils ajoutent ensuite à cette préparation des ARN de synthèse dont la séquence est connue, puis ils analysent la séquence des protéines obtenues.

3/ Utiliser le logiciel Anagène pour refaire les expériences de Niremberg & Mattéi et élucider le code génétique de l’ADN en travaillant avec la rubrique « Créer des séquences ».

Création d'une séquence de nucléotides :

1. Dans « Fichier », activer la commande Créer.
2. Sélectionner ADN ou ARN selon le type de séquence que vous souhaitez créer, donner un nom à la séquence*.
3. Confirmer vos sélections en cliquant sur OK.
4. Dans la fenêtre Edition des séquences, cliquer sur les bases souhaitées du pavé de bases azotées.

Traduction d'une séquence :

5. Sélectionner la séquence correspondante à l'aide du bouton de sélection.
6. Cliquer sur le bouton Convertir les séquences au niveau de la barre d'outils.
7. Pour que la séquence s'affiche : sélectionner l'option Peptidique pour la séquence à afficher, puis l'option Traduction simple, et l'option Résultat dans la fenêtre Affichage/édition.

En 1960, Francis Crick et Sydney Brenner cherchent à déterminer le nombre X de nucléotides nécessaire pour coder la synthèse d’un seul acide aminé. Cette séquence de X nucléotides est nommée codon.

4/ Calculez le nombre de codons possibles . Sachant qu’il existe 20 acides aminés, comment expliquer cette correspondance ? A l’aide d’Anagène, compléter le tableau fourni du code génétique. En comparant les protéines obtenues, indiquer le nombre X de nucléotides nécessaire pour coder un acide aminé :

5/ Utilisez le logiciel Anagène pour comparer la séquence d’ADN et d’ARNm du gène codant pour la globine β. Pour cela, recherchez la globine dans la base de données sachant que c'est une partie de l'hémoglobine. Comparez les séquences nucléotidiques des deux brins complémentaires du gène de la globine bêta et de l’ARNm de la globine β à l’aide du logiciel (comparaison simple). Que remarquez-vous ? Quelle est la différence entre les brins d'ADN « codant » et « transcrit » ?