correc DS

Gène : information héréditaire portée par l'ADN / chromosome (locus), codée par la séquence des bases (nucléotides)

Génomique : étude des génômes, ensemble des gènes d'un être vivant, se charge du séquençage du génome entier

Métagénomique : génomique environnementale est une méthode d'étude du contenu génétique d'échantillons issus d'environnements complexes consiste à étudier l’ADN total d’un échantillon issu du sol, de l’eau de mer, etc ... en le séquençant puis en le comparant aux ADN d’espèces déjà connues. Ainsi, on repère des espèces déjà connues, on peut découvrir de nouvelles espèces.

méta : dans un milieu donné, donc de multiples taxons

objectifs : identifier + découvrir + quantifier

Cette méthode permet de déterminer la richesse spécifique ( nombre d’espèces d’un milieu donné), et l’abondance relative des espèces ( proportion d’individus d’une espèce par rapport au nombre total d’individus d’un écosystème).

Barcoding moléculaire consiste à identifier une espèce en comparant une courte séquence de son ADN à toutes les séquences connues d’ADN rassemblées dans une banque de données, comme si l’on « scannait » son code-barres génétique. En comparant toutes les séquences d’ADN retrouvées dans un échantillon d’eau ou de sol à cette banque de données, les chercheurs peuvent identifier les espèces qui se trouvent dans cet échantillon : c’est le metabarcoding. Ces méthodes sont cependant coûteuses et ne peuvent pas remplacer complètement les reconnaissances sur le terrain.

Taxon : du grec ancien τάξις, táxis « rangement, ordre » groupe d'organismes vivants qui ont certains caractères dérivés communs, qui ont donc un ancêtre commun. Les règnes, {embranchements, {classes, {ordres, {familles, {genre et {espèces}}}}}}} sont des taxons. Généralement le terme est employé aux rangs spécifiques (l'espèce) et sub-spécifiques (la sous-espèce). La science qui étudie les taxons est la taxonomie.

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		01/09/13	01/05/14
Saison		humide	sèche
Moustiques marqués relâchés	n1	3 407	5 267
Moustiques capturés non marqués	no	5 843	363
Moustiques capturés marqués	p	44	49
Moustiques capturés au total : no+p	n2	5 887	412
estimation de la population : n1 x n2 / p	N	455 841	4 4286
fréquence marquée observée : p/n2	f	0,00747409546458298	0,118932038834951
√n2		76,7267880208731	20,2977831301844
Intervalle mini : f – 1 / √n2	m	-0,00555916222539037	0,0696655749267368
Intervalle maxi : f + 1 / √n2	M	0,0205073531545563	0,168198502743166
amplitude : M-m	a	0,0260665153799467	0,0985329278164293
marge d’erreur : a/2	Ɛ	0,0130332576899734	0,0492664639082147

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