vendredi 21 novembre 2014
Shed GP of Ebola Virus Triggers Immune Activation and Increased Vascular Permeability http://www.plospathogens.org/article/info:doi/10.1371/journal.ppat.1004509
Multiple Roles of the Cytoskeleton in Bacterial Autophagy
http://www.plospathogens.org/article/info:doi/10.1371/journal.ppat.1004409#ppat-1004409-g00
Multiparametric Classification Links Tumor Microenvironments with Tumor Cell Phenotype
- Published: November 11, 2014
- DOI: 10.1371/journal.pbio.1001995
Author Summary
A large proportion of cancer deaths are due to metastasis—the spread of cancer from the primary tumor to other parts of the body. Movement of cells may require the formation of protrusions called invadopodia, which degrade extracellular matrix. Although some studies have reported on locomotion in primary tumors, the presence of invadopodia was not tested. Here, we show that single cells from mouse mammary carcinoma can move using a fast- or slow-locomotion mode depending on different levels of cues present in the tumor microenvironment. Using multiphoton microscopy in vivo combined with a machine-learning algorithm we show how manipulation of microenvironmental conditions can induce predictable changes in the number of locomoting cells or switch between the two locomotion modes. We also demonstrate that only the slower moving cells are associated with invadopodia in vivo, and that only tumor cells from regions rich in invadopodia degrade the surrounding extracellular matrix and disseminate. Specific targeting of invadopodia results in inhibition of lung metastasis. This work proposes a systems biology view of how tumor microenvironments regulate tumor progression and presents insight into the heterogeneity of the treatment response. The ability to define and predict conditions under which tumor cells disseminate offers potential therapeutic benefits in regulating tumor progression.http://www.plosbiology.org/article/info:doi/10.1371/journal.pbio.1001995#pbio-1001995-g004
Paris, 13 novembre 2014
Découverte de nouveaux « cocktails enzymatiques » décomposant la biomasse végétale
Pour la première fois, une approche génomique à haut débit démontre la grande diversité des activités enzymatiques permettant à une bactérie de fermenter différents types de biomasse végétale. Développée par des chercheurs du Genoscope (Institut de Génomique du CEA, CEA-IG), associés à l'Université d'Evry et au CNRS, cette approche pluridisciplinaire permet d'identifier les différentes enzymes impliquées dans la fermentation chez la bactérie Clostridium phytofermentans. Ces travaux, publiés le 13 novembre dans la revue PLOS Genetics, ouvrent de nouvelles voies de production industrielle de biocarburants et de bioproduits, à partir de la biomasse végétale.
Paris, 20 novembre 2014
Pollinisation des plantes d'altitude : les mouches prennent le relais des abeilles
Dans les milieux d'altitude des zones tempérées, les abeilles laissent la place aux diptères en tant que principaux visiteurs de fleurs. Parmi eux, les Empidinae sont les plus actifs : plus de la moitié des plantes échantillonnées sont principalement visitées par ces insectes, qui s'avèrent donc être un élément-clé du fonctionnement des écosystèmes alpins. C'est ce que montre une équipe du Muséum national d'Histoire naturelle, composée de chercheurs de l'Institut de systématique, évolution, biodiversité (MNHN/CNRS/EPHE/UPMC/IRD) et du Centre des sciences de la conservation (MNHN/CNRS/UPMC), dans une étude qui vient d'être publiée dans la revue Biology Letters.
Paris, 21 novembre 2014
Des virus pirates pris à leur propre piège ?
Pour infecter une cellule hôte et se multiplier, certains virus comme celui de l'hépatite C infiltrent les ribosomes, véritables usines d'assemblage des protéines présentes dans chacune de nos cellules. Les protéines virales sont ainsi produites au détriment des protéines cellulaires. Des scientifiques strasbourgeois ont démontré que l'un des 80 composants du ribosome est indispensable à l'infection par certains virus sans être essentiel au fonctionnement normal des cellules. Cette découverte, qui pourrait déboucher sur le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques, a été réalisée par des chercheurs du laboratoire Réponse immunitaire et développement chez les insectes (CNRS) et de l'Institut de recherche sur les maladies virales et hépatiques (Inserm/Université de Strasbourg)1, avec notamment le soutien de l'ANRS. Elle fait l'objet d'une publication dans la revue Cell le 20 novembre 2014.
© Jean-Luc Imler
Préparation de virus DCV (Drosophila C virus), utilisés dans l'étude.
Cette image est disponible à la photothèque du CNRS, phototheque@cnrs.fr.
Paris, 21 novembre 2014
L'érosion pourrait provoquer des séismes
Les processus de surface, c'est-à-dire l'érosion et la sédimentation, pourraient déclencher des séismes superficiels (inférieurs à cinq kilomètres de profondeur) et favoriser la propagation de grands séismes profonds jusqu'à la surface. C'est ce que viennent de démontrer des chercheurs des laboratoires de Géosciences Rennes (CNRS/Université de Rennes 1)1, de Géosciences Montpellier (CNRS/Université de Montpellier 2) et de l'Institut de physique du globe de Paris (CNRS/IPGP/Université Paris Diderot) en collaboration avec un scientifique taiwanais. Alors que la tectonique des plaques était généralement considérée comme le seul mécanisme capable d'influencer durablement l'activité des failles, les processus de surface augmenteraient aussi les contraintes que subissent les failles actives, comme celles situées à Taïwan, une des zones les plus sismiques au monde. Ces travaux sont publiés dans Nature Communications le 21 novembre 2014.
Modélisation des lignes de forces du champ magnétique terrestre
Jeudi, 7 Août 2008
Conclusion : notion de modèle scientifique et son mode d’élaboration.
A1/ Discussion sur le statut du mot hypothèse en sciences
Définir selon vous le mot hypothèse
Demander une déf° au prof de
- maths : point de départ à infirmer, peu importe qu'elle soit vraie ou fausse ce qui compte c'est le raisonnement fait ensuite
- français : du grec : hypo = dessous => sous thèse pas encore validée
- bio : réponse provisoire au pb posé, à valider ou infirmer par l'expérience
A2/ Suivit pour prédiction des évènements géologiques
Séismes / Rénass :
http://renass.u-strasbg.fr/
Manuel p.126 : utilisation des données avec
sismologue
radioactivité / IRSN :
http://sws.irsn.fr/sws/mesure/index
séisme au Japon prévu depuis 2005 :
http://www2.cnrs.fr/presse/thema/751.htm
Tectonique des
plaques : un pas en avant vers la reconstitution du passé et la
prédiction de l'avenir :
http://www2.cnrs.fr/presse/communique/2585.htm
B/ La notion de modèle scientifique et son mode d’élaboration
Un
modèle est une construction intellectuelle
hypothétique et modifiable. Au cours du temps, la
communauté scientifique l’affine et le précise en le confrontant
en permanence au réel. Il a une valeur prédictive et c’est
souvent l’une de ces prédictions qui conduit à la recherche d’un
fait nouveau qui, suivant qu’il est ou non découvert, conduit à
étayer ou
modifier le modèle. La solidité du modèle est peu à
peu acquise par l’accumulation d’observations en accord avec lui.
Les progrès techniques accompagnent le perfectionnement du
modèle tout autant que des débats et controverses.
C/ Pour-suivre
Forage profond au large de Fukushima :
http://www.larecherche.fr/content/actualite-terre/article?id=31622
1-B
- Le domaine continental et sa dynamique
1-B-1
La caractérisation du domaine continental : lithosphère
continentale, reliefs et épaisseur crustale
1-B-2
La convergence lithosphérique : contexte de la formation des chaînes
de montagnes
1-B-3
Le magmatisme en zone de subduction : une production de nouveaux
matériaux continentaux
1-B-4
La disparition des reliefs
1.2.3- Modélisation globale
A1/ Suivit tectonique / tomographie sismique
Manuel p.169-170....
Tomographie sismique :
http://www.futura-sciences.com/uploads/tx_oxcsfutura/img/mantle-graphic-enlarged.jpg
site Planete Terre :
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/XML/db/planetterre/metadata/LOM-subduction-deformation.xml#id3021848
[tomo : coupe ; graphe : écrire]
A2/ Modélisation en laboratoire / maquettes
Carnet de sortie
les matériaux :
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/objets/Images/model-processus-tectoniques/model-processus-tectoniques-fig01.jpg
lien CNRS subduction :
http://www.cnrs.fr/cw/dossiers/dosgeol/01_decouvrir/02_subduction/04_subduction_plaques/03_pedago/01a.htm
lien CNRS extension :
http://www.cnrs.fr/cw/dossiers/dosgeol/01_decouvrir/01_extension/03_pedago/00.htm
histoire de la modélisation :
http://www.cnrs.fr/cw/dossiers/dosgeol/01_decouvrir/06_pionniers/00_intro.htm
A3/ Modélisation numérique / logiciel
Cf TP précédents
sur logiciels Educarte, Sismolog, tectoglob
A4/ Coupe géologique / profil sismique
Manuel p.165
© profil sismique dorsale.odg
A5/ Paléotectonique / animations
Carnet de sortie
paléotectonique animée :
=> liens
entre amincissement de la lithosphère, remontée / convection,
dépressurisation et fusion partielle de l’asthénosphère
sous-jacente et formation d’une nouvelle lithosphère.
B123/ modèle de synthèse actuel : PREM
En
permanence, de la lithosphère océanique est détruite dans
les zones de subduction et produite dans les dorsales.
La
divergence des plaques de part et d’autre de la dorsale
permet la mise en place d’une lithosphère nouvelle à partir de
matériaux d’origine mantélique. Dans les zones de subduction,
convergence, les matériaux de la vieille lithosphère
océanique s’incorporent au manteau.
B/ du modèle actuel / Schéma ©
© sch'bilan 5
Mots
clefs : représentation graphique synthétique du modèle
global, fonctionnement d’une dorsale type, subduction / accrétion,
glossaire :
http://operabaroque.fr/magmatiques.htm
1.2.2- Forages JOIDES et vecteurs GPS
A1/ Exploitation de données de forages / doc ©
Comment fait-on un forage?
diaporama sur http://www.iodp.org/
© TD_forages.doc
→ dessiner
un profil topographique avec des courbes de niveau
1. coupe
=> dorsale au niv Açores = dorsale émergée
2. dorsale, talus, plateau continental,
plaine abyssale
3. origine des sédiments qui se
déposent dans l'atlantique = érosion continentale
4. forages A à G de + en + loin de la
Dorsale
5. la limite supérieure des basaltes
de la croûte océanique = base des sédiments
6. strates de sédiments : de + en +
vielles en profondeur
7. sédiments de +en + vieux en
s'éloignant de la dorsale
8. absence de sédiments du jurassique
sur certaines parties du plancher océanique => n'existaient pas
au Jurassique
9. largeur de l'Atlantique au
Jurassique = 2 000 km
10. âge des basaltes de la croûte océanique = variable, de
+en + vieux en s'éloignant de la dorsale
11. vitesse d'ouverture de l'Atlantique (en cm/an) pendant le
crétacé supérieur : t = -96 à -65 Ma => 29 Ma ; d =
forage E – C = 1750 – 750 = 1000 km => d/t : 1 000 km en 29 Ma
=> 34,5 km/Ma = 3,45 cm/an
manuel p 160
TP divergence
/ Google Earth :
http://eduterre.ens-lyon.fr/eduterre-usages/ressources_gge/divergence/divergence
→ dessiner
un profil d'élévation sous Google earth
site de
données sur les forages :
http://www.isteem.univ-montp2.fr/IODP-France/
forages pour
trouver le Moho :
http://www.blogg.org/blog-50595-billet-541651.html
forages
IODP :
http://www.iodp.org/
ECORD :
http://www.ecord.org/
JOIDES
(Joint Oceanic Institution for Deep Earth Sampling)
IPOD
(International Phase of Ocean Drilling), puis ODP (Ocean Drilling
Project)
DSDP (Deep Sea
Drilling Projet)
IODP
(Integrated Ocean Drilling Program)
ECORD
(European Consortium for Ocean Drilling Research)
→ Cartographie des âges de fonds océaniques :
1S-EV_10.14.doc
Poster couloir labos
Manuel p.161
NOAA :
http://www.ngdc.noaa.gov/mgg/image/crustalimages.html ;
http://www.didiersvt.com/cd_1s/medias/c3/atlanticage.jpg
A2/ Exploitation des données GPS / sites + logiciel Tectoglob
Utilisation du logiciel Tectoglob :
http://pedagogie.ac-amiens.fr/svt/info/logiciels/Tectoglob/
Affichage des vecteurs GPS / NASA :
http://sideshow.jpl.nasa.gov/mbh/series.html
explication des données :
http://www.pedagogie.ac-nantes.fr/html/peda/svt/gps_2/donnees.htm
TP divergence / Google Earth :
http://eduterre.ens-lyon.fr/eduterre-usages/ressources_gge/divergence/divergence
GPS
= global positioning system
B/ forages et GPS / schéma ©
Mots
clefs : Âges des sédiments, forage, JOIDES, paléomagnétisme,
alignements volcaniques, GPS,
glossaire :
http://operabaroque.fr/magmatiques.htm
placez
les vecteurs GPS principaux sur schéma bilan précédent :
sch'bilan 4
B122/ GPS et forages confirment l'hypothèse
Le
modèle prévoit que la croûte océanique est d’autant plus
vieille qu’on s’éloigne de la dorsale. Les âges des
sédiments en contact avec le plancher océanique (programme de
forage sous-marins JOIDES) confirment cette prédiction et les
vitesses prévues par le modèle de la tectonique des plaques.
Le
modèle prévoit aussi des vitesses de déplacements des plaques
d’après le paléomagnétisme et les alignements de volcans
intraplaques. Avec l’utilisation des techniques de positionnement
par satellites (GPS), à la fin du XXème siècle, les
mouvements des plaques deviennent directement observables et leurs
vitesses sont confirmées.
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