3/ Comparaison de variétés

: Utiliser un logiciel de comparaison de séquence d’ADN pour identifier et quantifier la variabilité allélique au sein d’une espèce

https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/geniegen2/

1. Ouvrir une banque de séquences (Alt B) - Décochez ARN et protéines - Choisir les gènes PSY de la carotte : quelle est la longueur de chaque gène ?

2. Clic droit sur une séquence donne accès aux informations sur le gène : Réalisez un tableau de comparaison des trois séquences

3. Faire remonter en tête de liste la séquence PSY2 - Aligner les séquences (Alt A) : quelles sont les différences entre les séquences ?

4. Décochez PSY2 et recommencez l'alignement entre PSY et PSY1 : quelles différences ? combien ? où ? En notant une différence de bases ainsi : base de référence - numéro dans la molécule (utilisez la règle) - base changée, comment pouvez-vous écrire les différences de séquences.

5. Calculez le pourcentage de différence entre les séquences

6. Sélectionner affichage du tableau de comparaison (Alt T) : quelles sont les variétés les plus proches génétiquement ?

7. Comment nomme-t-on ces séquences les unes par rapport aux autres ? Donnez une définition.

8. Quel évènement a pu créer les différentes séquences ? Donnez une définition.

variabilité, mutation, allèle.