modélisalisation de molécules / logiciels 3D

On ne peut pas voir les molécules au microscope mais la chimie nous ayant permit de connaître le nombre d'atome et leur disposition dans l'espace, on peut modéliser avec des logiciels de visualisation moléculaire pour repérer quelques caractéristiques des molécules du vivant.

Molécules minérales: http://www.librairiedemolecules.education.fr/outils/minusc/app/minusc.htm

? Dans le fichier chercher cinq minéraux de votre choix et donner leur composition atomique (qualitative). A travers ces exemples, écrire quels sont les atomes les plus représentés dans la matière minérale.

molécules organiques : http://www.librairiedemolecules.education.fr/recherche.php?typeclassification=chimique&idcat[]=polysaccharide&idcat[]=autre_organique&reduire[]=organique

? Malgré leur grande diversité, les molécules qui composent la matière vivante

appartiennent à un nombre réduit de familles chimiques. Citer les quatre familles.Pour chaque exemple, un par famille, donner la composition atomique qualitative. On utilise en général des couleurs standard pour représenter les atomes les plus fréquents :

• Oxygène (O) : rouge
• Carbone (C) : noir ou blanc
• Hydrogène (H) : blanc ou noir
• Chlore (Cl) : vert
• Soufre (S) : jaune
• Azote (N) : bleu
• Phosphore (P) : orange
• Fer (Fe) : gris

? Quels sont les atomes les plus représentés dans la matière vivante ? Au niveau des quatre familles, quel est l'atome majoritairement représenté dans le squelette chimique des molécules ?

Conclusion: quelles sont les différences entre molécules minérales et organiques ?

Lipides CHO

protides CHONS

Glucides CHO

acides nucléiques CHONP

La matière connue de l’Univers est formée principalement d’hydrogène et d’hélium alors que la Terre est surtout constituée d’oxygène, d’hydrogène, de fer, de silicium, de magnésium et les êtres vivants de carbone, hydrogène, oxygène et azote.

1.2 - Des édifices ordonnés : les cristaux

Observation du sel et modélisation moléculaire / microscope et logiciel Rastop

http://microscopeyal.blogspot.com/2010/03/de-lordre-dans-la-cuisine.html

http://www.librairiedemolecules.education.fr/outils/minusc/app/minusc.htm

fichier → Halite

Utiliser une représentation 3D informatisée du cristal de chlorure de sodium.

Relier l’organisation de la maille au niveau microscopique à la structure du cristal au niveau macroscopique

Le chlorure de sodium solide (présent dans les roches, ou issu de l’évaporation de l’eau de mer) est constitué d’un empilement régulier d’ions : c’est l’état cristallin.

Comparaison de roches / microscope

https://youtu.be/n85JCOeSXEY

Mettre en relation la structure amorphe ou cristalline d’une roche et les conditions de son refroidissement

Dans le cas des solides amorphes, l’empilement d’entités se fait sans ordre géométrique. C’est le cas du verre. Certaines roches volcaniques contiennent du verre, issu de la solidification très rapide d’une lave.