: Utiliser un logiciel de comparaison de séquence d’ADN pour identifier et quantifier la variabilité allélique au sein d’une espèce

 Réaliser un compte rendu individuel sur feuille

https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/geniegen2/

1. Ouvrez la banque de séquences (Alt B) - Décochez ARN et protéines - Choisir les gènes PSY de la carotte : quelle est la longueur de chaque gène ? quelle est la différence entre la séquence PSY2 et les autres ?

2. Un clic droit sur une séquence donne accès aux informations sur le gène : Réalisez un tableau de comparaison des trois séquences.

3. Décochez PSY2. Aligner les séquences (Alt A) avec PSY comme référence (à placer en tête de liste grâce aux flèches) : quelles différences entre PSY et PSY1 ? En notant une différence de bases ainsi : base de référence dans PSY - numéro de la base dans la molécule (utilisez la règle) - base changée dans PSY1, écrire les différences de séquences entre PSY et PSY1. ex : A-654-T

4. Calculez le pourcentage de différence entre les séquences PSY et PSY1 à l'aide des résultats des questions 1&3.

5. Affichez le tableau de comparaison (Alt T) des trois séquences : quelles sont les variétés les plus proches génétiquement ? Justifiez par pourcentage

6. Comment nomme-t-on ces séquences les unes par rapport aux autres ? Donnez une définition.

7. Quel évènement a pu créer les différentes séquences ? Donnez une définition.