vendredi 13 mars 2020

A3 : Un système de reconnaissance entre cellules : les recepteurs

Cellule présentatrice de l'antigène, CD, CMH (complexe majeur d'histocompatibilité),

§ comment l'organisme reconnaît-il les cellules du soi ? Les antigènes à abattre ?

A4 : Notion de tolérance immunitaire

coopération entre immunité innée et adapative
cellules dendritiques
  • éliminer les cellules autoréactives
  • garder des cellules tolérantes au soi et intolérantes à un antigène
en résumé :
La nature du problème :
  • Les lymphocytes T et les lymphocytes B perçoivent constamment des signaux antigéniques auxquels il serait in/opportun de répondre
  • Un système de filtrage actif des signaux doit donc être mis en place.
  • L’effet de ce filtrage, c’est la tolérance immunitaire
Un lymphocyte en contact ligand-récepteur avec une cellule présentatrice de l'antigène (dendritique ou macrophage) va être mis en
  • anergie ou
  • apoptose ou
  • prolifération
lymphocytes B → plasmocytes sécrétant des Immunoglobulines
lymphocytes cytotoxiques : LT CD8 → LTcytotoxique
lymphocytes T CD4 → lymphocytes T auxiliaire sécrétant des Interleukines
IL = Interleukines [entre - globules blancs]
C’est dans les organes lymphoïdes primaires que la plus grande partie des lymphocytes capables de percevoir le soi (autoréactifs) sont éliminés par apoptose
Les organes lymphoïdes doivent donc posséder un échantillon des signaux du soi
Les cellules présentatrices d’antigène (et en particulier les cellules dendritiques) jouent un rôle fondamental dans le maintien ou la rupture de la tolérance immunitaire
Les cellules activées (LTc, LTa, Plasmo¢) prolifèrent dans les ganglions lymphoïdes

A5 : Phylogénie à partir des molécules immunitaires

Manuel p284
immunité, héritée, évolution

Bilan : Immunité acquise & adaptative

Alors que l'immunité innée est largement répandue chez les êtres vivants, l'immunité adaptative est propre aux vertébrés.
Le système immunitaire, normalement, ne se déclenche pas contre des molécules de l'organisme ou de ses symbiotes. Cela est vrai notamment pour la réponse adaptative.
Pourtant, les cellules de l'immunité adaptative, d'une grande diversité, sont produites aléatoirement par des mécanismes génétiques complexes qui permettent potentiellement de répondre à une multitude de molécules. La maturation du système immunitaire résulte d'un équilibre dynamique entre la production de cellules et la répression ou l'élimination des cellules autoréactives.
Mots-clés : Cellule présentatrice de l'antigène, lymphocytes B, plasmocytes, immunoglobulines (anticorps), séropositivité, lymphocytes T CD4, lymphocytes T auxiliaire, interleukine 2, lymphocytes T CD8, lymphocytes T cytotoxiques ; sélection, amplification, différenciation clonales. Réponse adaptative à médiation humorale.

C pour suivre

Gene/Protein Name Etymology : https://www.biostars.org/p/88965/
40N
Achtung : petit test de connaissances dans la semaine de la rentrée !

jeudi 12 mars 2020

https://www.the-scientist.com/news-opinion/coronavirus-landing-page-67127

Why don't children seem to get very ill from the coronavirus?

3.2 - L’histoire de l’âge de la Terre (SVT)

1/ l’âge de la terre au fil de l’histoire des sciences

Interpréter des documents présentant des arguments historiques utilisés pour comprendre l’âge de la Terre. Identifier diverses théories impliquées dans la controverse scientifique de l’âge de la Terre.
Réaliser une frise chronologique à partir de textes sur l’histoire des sciences de l’âge de la terre.

2/ datation par les sédiments

  1. Apparition de la vie estimée selon l’âge des plus vieux fossiles trouvés
  2. nautiles et spongiaires mauvais fossiles stratigraphiques car présents sur de trop longues périodes
  3. fossiles stratigraphiques : ammonites, trilobites,.. présents sur de croutes périodes de temps : ère II datée par trilobites, ère III datée par ammonites
La divergence des plaques de part et d’autre des dorsales permet la mise en place d’une nouvelle lithosphère. Celle-ci se met en place par apport de magmas mantelliques à l’origine d’une nouvelle croûte océanique. Dans certaines dorsales (dorsales lentes) l’activité magmatique est plus réduite et la divergence met directement à l’affleurement des zones du manteau.

2/ Roches magmatiques et métamorphiques

Observation basaltes et gabbros au microscope
pillow, ophiolithes, fumeurs noires, gabbros, magmatisme, hydrométamorphisme
exp de modelisation : beurre+bouteilles+pompes à vélo+bain marie : http://chouzenoux.jean-pierre.pagesperso-orange.fr/svt/Fusion/fusion.htm#pression
- Études des basaltes/gabbros/péridotites et leurs équivalents hydratés (serpentinite, gabbros à hornblende, etc.).
magmatisme et roches associées
hydrothermalisme : La croûte océanique et les niveaux superficiels du manteau sont le siège d’une circulation d’eau qui modifie les minéraux.

3/ Evolution de la lithosphère océanique

Graphe densité/température profondeur, pression,
animations :
remontée asthénosphérique, fusion partielle
Le magmatisme à l’aplomb des dorsales s’explique par la décompression du manteau.
La nouvelle lithosphère formée se refroidit en s’éloignant de l’axe et s’épaissit. Cet épaississement induit une augmentation progressive de la densité de la lithosphère.
Bilan /La dynamique des zones de divergence
Connaissances
La divergence des plaques de part et d’autre des dorsales permet la mise en place d’une nouvelle lithosphère.
Celle-ci se met en place par apport de magmas mantelliques à l’origine d’une nouvelle croûte océanique. Ce magmatisme à l’aplomb des dorsales s’explique par la décompression du manteau.
Dans certaines dorsales (dorsales lentes) l’activité magmatique est plus réduite et la divergence met directement à l’affleurement des zones du manteau.
La nouvelle lithosphère formée se refroidit en s’éloignant de l’axe et s’épaissit. Cet épaississement induit une augmentation progressive de la densité de la lithosphère.
La croûte océanique et les niveaux superficiels du manteau sont le siège d’une circulation d’eau qui modifie les minéraux.
Capacités
- Études de l’affleurement à la roche des basaltes/gabbros/péridotites et leurs équivalents hydratés (serpentinite, gabbros à hornblende, etc.).
- Calcul de la densité moyenne de l’ensemble croûte – manteau lithosphérique en fonction de son épaisseur, puis de son âge en utilisant une loi empirique reliant épaisseur et âge.

3,1,1,2/ Le développement de l’embryon au fœtus

1/ Etapes du développement

9 mois de vie dans l’utérus en quelques minutes : https://youtu.be/u_NO3JU0LZk
The Multi-Dimensional Human Embryo : http://embryo.soad.umich.edu/index.html
Conception Slideshow: From Egg to Embryo : http://www.webmd.com/baby/ss/slideshow-conception
animation fécondation, début embryo, grossesse et développement : http://www.biologieenflash.net/animation.php?ref=bio-0073-3 : http://www.biologieenflash.net/sommaire.html
accouchement
zygote, embryon, fœtus
La mise en place de l’organisation et de la fonctionnalité des appareils sexuels se réalise sur une longue période qui va de la fécondation à la puberté.

2/ cas des jumeaux

« vrais » = monozygotic in english = clones => 1! cellule œuf
« faux » = dizygotic in english => 2 cellules œufs
En japonais courant, on utilise plus souvent le mot 双子, ふたご, futago, enfant-double.i
一卵性双生児
いち-らん-せい-そう-せい-
ichi-ran-sei-sō-sei-ji
un-œuf-nature-jumeau (double-vie-nourrisson)
二卵性双生児
-らん-せい-そう-せい-
ni-ran-sei-sō-sei-ji
deux-œuf-nature-jumeau (double-vie-nourrisson)
En chinois
vrais jumeaux : "des enfants doubles du même oeuf" 同卵双胞胎
faux jumeaux : "des enfants doubles d'oeufs différents" 异卵双胞胎.


i le japonais (et le chinois aussi d'ailleurs) ont un vocabulaire scientifique assez simple à comprendre à l'écrit, notamment parce qu'il suffit d'associer les concepts des caractères/ sinogrammes pour saisir de quelle maladie il s'agit. Les francophones ne peuvent pas toujours prétendre à pareille capacité de déduction, surtout lorsqu'ils ont oublié leur grec et leur latin!

À titre d'exemple, on peut donner:
Le diabète: 糖尿病 [とうにょうびょう, tō-nyō-byō, sucre-urine-maladie].
La leucémie: 白血病 [はっけつびょう, ha-kketsu-byō, blanc-sang-maladie].
La pneumonie: 肺炎 [はいえん, hai-en, poumon-inflammation]
L'encéphalite: 脳炎 [のうえん, nō-en, cerveau-inflammation]
Idem pour la gastrite, la néphrite, l'arthrite, l'otite, etc.

Les maladies identifiées avant l'utilisation des technologies d'analyse du XIXe ont parfois des noms populaires plus simples qui décrivent le symptôme le plus représentatif plutôt que la nature du dysfonctionnement.

De même, il arrive que le langage courant préfère au terme scientifique, parfois obscur à l'oreille, un terme plus explicite.

Exactement comme partout dans le monde j'imagine.

Lorsque la langue japonaise crée, comme toute langue vivante, des mots pour identifier de nouveaux concepts, elle emprunte maintenant à l'anglais et non plus au chinois comme il y a quelques siècles encore. Effectivement, les innovations technologiques sont le plus souvent américaines et l'anglais est devenue la langue commune des scientifiques.

Si on considère cependant la prononciation approximative de l'anglais au Japon et de l'habitude locale à simplifier les mots (ce n'est pas un exemple médical mais セクハラ, se-ku-ha-ra, pour le harcèlement sexuel, vient de l'anglais sexual harassment), il va falloir potasser le japonais encore un moment avant de pouvoir se comprendre correctement en cours de sciences...


mercredi 11 mars 2020

Les lucratives ventes de données de santé au Royaume-Uni



Mise en situation et recherche à mener
Au cours de la réaction inflammatoire, l’acide arachidonique est métabolisé en prostaglandine responsable de l’apparition de certains symptômes inflammatoires. C’est une enzyme, nommée COX, qui catalyse la réaction aboutissant à la synthèse de la prostaglandine.
L'acide acétylsalicylique, mieux connu sous le nom d'aspirine, était un des anti-inflammatoires non-stéroïdiens (AINS) les plus utilisés. Cette molécule inhibe l’action de cette enzyme COX en bloquant son site actif.
L’apparition d’intolérance à l’aspirine a conduit depuis quelques années le milieu médical à lui préférer un autre AINS, l’ibuprofène.

On cherche à montrer que l’ibuprofène a une action équivalente à celle de l’aspirine pour empêcher la transformation de l’acide arachidonique en prostaglandine par l’enzyme COX.
Ressources
Document :
Pour catalyser la réaction métabolique, l’enzyme (COX) doit rentrer en contact avec la molécule de substrat (acide arachidonique) qui lui est spécifique pour former un complexe enzyme-substrat. Cette liaison avec la molécule de substrat conduit à la libération des produits de la réaction (prostaglandines).
Ce contact s’établit au niveau du site actif : zone particulière de l’enzyme, complémentaire de forme de la molécule de substrat (acide arachidonique).
Des études de biologie moléculaire ont déterminé que seuls certains acides aminés du site actif, dont on connait la position, assurent une liaison temporaire avec le substrat spécifique pour permettre le déroulement de la réaction.
  • Toute molécule pouvant être impliquée dans la réaction inflammatoire et son traitement.
Matériel envisageable :
  • de laboratoire (verrerie, instruments …)
  • d’observation (microscope, loupe binoculaire…)
  • de mesure et d’expérimentation (balance, chaine ExAO…)
  • informatique et d'acquisition numérique

Etape 1 : Concevoir une stratégie pour résoudre une situation problème (durée maximale : 10 minutes)
Proposer une démarche d’investigation permettant de montrer que l’ibuprofène a une action équivalente à celle de l’aspirine pour empêcher la transformation de l’acide arachidonique en prostaglandine par l’enzyme COX.
Appeler l’examinateur pour vérifier votre proposition et obtenir la suite du sujet.
Votre proposition peut s’appuyer sur un document écrit (utiliser les feuilles de brouillon mises à votre disposition) et/ou être faite à l’oral.

Le nouveau coronavirus : SARS-CoV-2 

Par Adrien Cartier, Clémence Venoux, publié le 25/02/2020, mise à jour le 26/02/2020
Contributeurs : Chloé Journo
Fiche de synthèse sur le coronavirus de Wuhan et l'épidémie de COVID-19. Les données présentées ont été mises à jour fin février 2020, date à laquelle la situation évolue encore rapidement. 

lundi 9 mars 2020

2,2,2/ La dynamique des zones de divergence

1/ Dorsales sismiques et volcaniques

morphologie d’une dorsale
failles normales //transformantes
dorsales lentes // rapides
ordres de grandeurs (vitesse) de la dynamique lithosphérique
Schémas dorsales / ophiolithes / rift
un graben (terme d'origine allemande signifiant « fossé », introduit en 1888 dans un volume du traité La face de la Terre du géologue autrichien Eduard Suess) est un fossé tectonique d'effondrement entre des failles normales. Le compartiment surélevé par rapport au graben est appelé « horst ».
un horst désigne un compartiment soulevé. Ce soulèvement résulte de la combinaison de failles normales conjuguées. Un horst est bordé par son contraire géologique, c'est-à-dire des grabens, des fossés effondrés.
Un rift (le terme signifiant en anglais « fissure, crevasse, rupture, déchirure ») est un fossé d’effondrement (graben) se localisant le long d’une fracture de l’écorce terrestre lors d'un processus d'extension. Le rift est limité par des bords plus ou moins surélevés (appelés épaulements de rift) formant généralement des gradins correspondant à une série de blocs basculés (horst, graben et demi-graben )
La divergence des plaques de part et d’autre des dorsales permet la mise en place d’une nouvelle lithosphère. Celle-ci se met en place par apport de magmas mantelliques à l’origine d’une nouvelle croûte océanique. Dans certaines dorsales (dorsales lentes) l’activité magmatique est plus réduite et la divergence met directement à l’affleurement des zones du manteau.