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Comparaison de séquences / logiciel Anagène
12 étapes de travaux pratiques sur logiciel
Anagene pour définir les mots gène, allèle,
mutation
Objectifs :
-Exprimer
et
exploiter
des
résultats
à
l’écrit
en
utilisant
les
technologies
de
l’informatique
Principe :
le logiciel Anagène
est une banque de données « database » permettant de
manipuler des séquences d’ADN. Il suffit d’ouvrir les
« tiroirs » pour trouver des séquences d’ADN puis de
les comparer...
-Comparer
des
séquences
de
nucléotides
de
4 gènes
pour
donner
une
définition
du
mot
gène.
-Comparer
des
séquences
de
nucléotides
de
3 allèles
d’un
même
gène
pour
donner
une
définition
du
mot allèle et du mot mutation
Protocole :
Lancez le logiciel « Anagène » qui se
trouve dans le dossier «SVT»
Sélectionnez « banque de séquences » dans
le menu fichier .
Choisissez le gène béta de l’hémoglobine.
Prendre une molécule ayant comme suffixe .cod ou .adn
Répétez les mêmes opérations pour 3
autres gènes.
Sélectionnez les séquences de nucléotides
en cochant leur case (celle qui est marquée est choisie comme
référence) puis « comparer les séquences » puis
« comparaison simple» pour obtenir leur comparaison. votre
résultat met en évidence la différence entre les gènes. Des -
mettent en évidence les similitudes entre séquences, seules les
différences sont notées.
Rédiger une définition du mot « gène »
Sélectionnez « banque de séquences » dans
le menu fichier.
Choisissez le gène béta de l’hémoglobine.
Prendre l'allèle « betacod.adn »
Répétez les mêmes opérations pour les 2
autres séquences (qui sont les allèles mutés de beta), puis
validez.
Sélectionnez les séquences de nucléotides,
et utilisez l'icône « comparer les séquences/ comparaison simple»
pour obtenir leur comparaison.
Rédiger une définition des mots « allèle »
et « mutation »
gène,
allèle, mutation, séquence.
la
structure moléculaire de l’ADN lui permet de porter une
information.
Bilan/
L’organisme pluricellulaire, un ensemble de cellules spécialisées
Réaliser
et /ou observer des préparations microscopiques montrant des
cellules animales ou végétales.
Observer
et analyser des images de microscopie électronique.
Distinguer
les différentes échelles du vivant (molécules, cellules, tissus,
organes, organisme) en donnant l’ordre de grandeur de leur taille.
cellule,
matrice extracellulaire/paroi, tissu, organe ; organite,
spécialisation cellulaire, ADN, double hélice, nucléotides
(adénine, thymine, cytosine, guanine), complémentarité, gène,
séquence.
Les
cellules spécialisées ont une fonction particulière dans
l’organisme, en lien avec leur organisation et la structure
moléculaire l’ADN lui permet de porter une information.
La
matrice extracellulaire est constituée de différentes molécules
qui, dans leur grande majorité, permettent l’adhérence
cellulaire.
Chez
les organismes unicellulaires, toutes les fonctions sont assurées
par une seule cellule. Chez les organismes pluricellulaires, les
organes sont constitués de cellules spécialisées formant des
tissus, et assurant des fonctions particulières.
Toutes
les cellules d’un organisme sont issues d’une cellule unique à
l’origine de cet organisme. Elles possèdent toutes initialement la
même information génétique organisée en gènes constitués d’ADN
(acide désoxyribonucléique). Cependant, les cellules spécialisées
n’expriment qu’une partie de l’ADN.
