4/ Comparaison de séquences / logiciel Anagène

12 étapes de travaux pratiques sur logiciel Anagene pour définir les mots gène, allèle, mutation

Objectifs : -Exprimer et exploiter des résultats à l’écrit en utilisant les technologies de l’informatique

Principe : le logiciel Anagène est une banque de données « database » permettant de manipuler des séquences d’ADN. Il suffit d’ouvrir les « tiroirs » pour trouver des séquences d’ADN puis de les comparer...

-Comparer des séquences de nucléotides de 4 gènes pour donner une définition du mot gène.

-Comparer des séquences de nucléotides de 3 allèles d’un même gène pour donner une définition du mot allèle et du mot mutation

Protocole :

1. Lancez le logiciel « Anagène » qui se trouve dans le dossier «SVT»
2. Sélectionnez « banque de séquences » dans le menu fichier .
3. Choisissez le gène béta de l’hémoglobine. Prendre une molécule ayant comme suffixe .cod ou .adn
4. Répétez les mêmes opérations pour 3 autres gènes.
5. Sélectionnez les séquences de nucléotides en cochant leur case (celle qui est marquée est choisie comme référence) puis « comparer les séquences » puis « comparaison simple» pour obtenir leur comparaison. votre résultat met en évidence la différence entre les gènes. Des - mettent en évidence les similitudes entre séquences, seules les différences sont notées.
6. Rédiger une définition du mot « gène »
7. Sélectionnez « banque de séquences » dans le menu fichier.
8. Choisissez le gène béta de l’hémoglobine.
9. Prendre l'allèle « betacod.adn »
10. Répétez les mêmes opérations pour les 2 autres séquences (qui sont les allèles mutés de beta), puis validez.
11. Sélectionnez les séquences de nucléotides, et utilisez l'icône « comparer les séquences/ comparaison simple» pour obtenir leur comparaison.
12. Rédiger une définition des mots « allèle » et « mutation »

gène, allèle, mutation, séquence.

la structure moléculaire de l’ADN lui permet de porter une information.

Bilan/ L’organisme pluricellulaire, un ensemble de cellules spécialisées

 Réaliser et /ou observer des préparations microscopiques montrant des cellules animales ou végétales.

 Observer et analyser des images de microscopie électronique.

 Distinguer les différentes échelles du vivant (molécules, cellules, tissus, organes, organisme) en donnant l’ordre de grandeur de leur taille.

cellule, matrice extracellulaire/paroi, tissu, organe ; organite, spécialisation cellulaire, ADN, double hélice, nucléotides (adénine, thymine, cytosine, guanine), complémentarité, gène, séquence.

Les cellules spécialisées ont une fonction particulière dans l’organisme, en lien avec leur organisation et la structure moléculaire l’ADN lui permet de porter une information.

La matrice extracellulaire est constituée de différentes molécules qui, dans leur grande majorité, permettent l’adhérence cellulaire.

Chez les organismes unicellulaires, toutes les fonctions sont assurées par une seule cellule. Chez les organismes pluricellulaires, les organes sont constitués de cellules spécialisées formant des tissus, et assurant des fonctions particulières.

Toutes les cellules d’un organisme sont issues d’une cellule unique à l’origine de cet organisme. Elles possèdent toutes initialement la même information génétique organisée en gènes constitués d’ADN (acide désoxyribonucléique). Cependant, les cellules spécialisées n’expriment qu’une partie de l’ADN.