vendredi 24 novembre 2017

Optogenetic Therapies Move Closer to Clinical Use

Optogenetic Therapies Move Closer to Clinical Use: With a clinical trial underway to restore vision optogenetically, researchers also see promise in using the technique to treat deafness, pain, and other conditions.

Researchers Build a Cancer Immunotherapy Without Immune Cells

Researchers Build a Cancer Immunotherapy Without Immune Cells: A team has engineered two stem cell lines into “synthetic T cells” that destroy breast cancer cells in vitro.

Lighting Up Monkey Brains

Lighting Up Monkey Brains: Optogenetic and chemogenetic tools illuminate brain and behavior connections in nonhuman primates.

Quand les bateaux font le zèbre

Quand les bateaux font le zèbre: Au cours de la Première Guerre mondiale, des centaines de navires ont échappé aux torpilles, en partie grâce aux motifs géométriques dont ils ont été peints.

Les punaises d’eau, témoins de l’évolution

Les punaises d’eau, témoins de l’évolution: En étudiant des punaises d’eau, une équipe de chercheurs a précisé les mécanismes évolutifs à l'origine de l'apparition de nouveaux caractères.

Les bactéries influencent la séquestration du carbone dans les basaltes

Les bactéries influencent la séquestration du carbone dans les basaltes: La séquestration de dioxyde de carbone dans les aquifères baignant les basaltes profonds paraît prometteuse, mais les bactéries habitant ces milieux réagissent à l'injection de CO2 et influencent sa minéralisation.

Les volcans, berceau de la vie ?

Les volcans, berceau de la vie ?: La vie n'a peut-être pas émergé au fond des océans, mais dans des sources chaudes à proximité de volcans. Telle est l'histoire que racontent des bulles anciennes récemment trouvées dans des roches australiennes.

L’ADN d’une deuxième femme de Néandertal séquencé

L’ADN d’une deuxième femme de Néandertal séquencé: La grotte de Vindija en Croatie a livré le deuxième génome complet d'un néandertalien – une femme – qui a pu être séquencé de façon fiable.

Une enzyme cruciale enfin démasquée

Après 40 ans de recherche, des chercheurs du CEA, du CNRS, de l'Université Grenoble Alpes, de l'Université de Montpellier et de l'Inserm ont enfin démasqué l'enzyme responsable de la détyrosination de la tubuline. Surprise : ce n'est pas une enzyme mais deux qui ont été découvertes capables de modifier ce composant essentiel du squelette de la cellule. Ces travaux ouvrent de nouvelles pistes pour mieux comprendre le rôle de la tubuline dont les altérations accompagnent cancers, maladies cardiaques et défauts neuronaux. Ces résultats sont publiés le 16 novembre 2017 dans la revue Science.

Cancer gastrique : une nouvelle stratégie de Helicobacter pylori ciblant les mitochondries

Des chercheurs de l'Institut Pasteur et du CNRS viennent d'identifier de nouvelles stratégies utilisées par la bactérie Helicobacter pylori pour infecter les cellules. En ciblant spécifiquement les mitochondries, cette bactérie, bien qu'étant extracellulaire, peut intensifier l'infection subie par l'hôte. Alors que la bactérie H. pylori est associée à la majorité des cas de cancers gastriques, ces découvertes permettent aujourd'hui d'envisager de nouvelles stratégies de lutte contre cette infection et les pathologies gastriques associées. Les résultats de cette étude sont publiés le 21 novembre dans la revue Scientific Reports.

Plasticité des ribosomes : une nouvelle piste de thérapie ciblée pour combattre le cancer

L'équipe « Domaines nucléaires et pathologie » dirigée par Jean-Jacques Diaz, directeur de recherche Inserm au Centre de recherche en cancérologie de Lyon (Inserm/CNRS/Université Claude Bernard Lyon 1/Centre Léon Bérard), vient de démontrer qu'un des composants essentiels de la « machinerie cellulaire » qui fabrique les protéines, le ribosome, est dénaturé dans les tumeurs. Les chercheurs observent en effet que ces ribosomes modifiés fonctionnent différemment dans les cellules cancéreuses et produisent préférentiellement des protéines favorisant la prolifération et la survie des cellules cancéreuses. Cette découverte ouvre de nouvelles perspectives pour le développement de thérapeutiques innovantes anti-cancéreuses, ciblant ces machineries anormales. Ces travaux sont publiés ce jour dans la revue PNAS (Proceedings of the National Academy of Sciences).

§ Quelle est l'origine du volcanisme continental ?

A4 : expériences de cristallisation / microscope

Échantillons évaporites CuSO4, FeSO4, NaCl cristallisés à différentes vitessse / évaporation différenciée
évaporation sel entre lame et lamelle :
solubilité : 357 g·L-1 (eau, 0 °C),
358,5 g·L-1 (eau, 20 °C),
380,5 g·L-1 (eau, 80 °C),
391,2 g·L-1 (eau, 100 °C),
0,65 g·kg-1 (éthanol, 25 °C),
donc combien1 faut-il de sel pour faire 1L d'eau saturée en sel à 20°C ?
cristallisation vanilline :

EV/ TP roches / µscopes

© TS-EV_TP_roches_microscopie.odt
© \TS EV TP et QCM roches.odt

1,4,2 : Modélisation globale

A1 : Répartition mondiale du volcanisme de subduction / site CNRS

13,58g

§ Génétique ou environnement ? Inné ou acquis ? Nature ou culture ?

A3 : Comparaison d'allèles phénylcétonuriques / Anagène → EVTP

© 1S_TP_phénylcétonurie_anagene.odt
FT BAC : Comparer des données avec Anagène 2 (version 24/10/2009) : (doc, odt, pdf) Avancé (doc, odt, pdf)
Anagène → fichier → banque de séquences –-→ la phenylalanine hydroxylase
remplir le tableau (attention avec bases complémentaires)
Allèle n°
Nucléotides de l'ADNcod
Nucléotides de l'ADN transcrit
Codons de l'ARNm
acides aminés de la Protéine
Type de mutation
homozygote
phenorm
Référence
Référence
Référence
Référence
Référence
Sain
phe1
T 165 Ø
A 165 Ø
UUU 55 UUG
Phe 55 Leu...
Délétion décalante
Sévère
phe2
ATC283à5Ø
TAG 283à5Ø
AUC 95 Ø
Ile 95 Ø
Dél° non décalante
Peu sévère
phe3
C331T
G 331 A
CGA 111 UGA
Arg 111 STOP
Sub° non sens
Sévère
phe4
G473A
C 473 T
CGG 158 CAG
Arg 158 Gln
Sub° faux sens
Assévère
phe5
GA664à5Ø
CT 664à5 Ø
GAU 222 UAA
Asp 222 stop
Délétion décalante
Sévère
phe6
A696G
T 696 C
CAA 232 CAG
Gln 232 Gln
Substitution neutre
Sain
phe7
C727T
G 727 A
CGA 243 UGA
Arg 243 STOP
Sub° non sens
Sévère
Phe8
G735A
C 735 T
GUG 245 GUA
Val 245 Val
Substitution neutre
Sain
phe9
G782A
C 782 T
CGA 261 CAA
Arg 261 Gln
Sub° faux sens
Peu sévère
phe10
G814T
C 814 A
CGA 272 UGA
Gly 272 STOP
Sub° non sens
Sévère
phe11
G838A
C 838 T
GAA 280 AAA
Glu 280 Lys
Sub° faux sens
Sévère
phe12
T 896 G
A 896 C
UUU 299 UGU
Phe 299 Cys
Sub° faux sens
Sévère

rôle de l'alimentation sur le génotype

jeudi 23 novembre 2017

§ Génétique ou environnement ? Inné ou acquis ? Nature ou culture ?

§ des phenotypes pas tous génétiques
gene-rayures2.2.odp

§ Génétique ou environnement ? Inné ou acquis ? Nature ou culture ?

1,3,2/ Gènes et environnement

A1 : Protéine thermomètre chez Arabidopsis thaliana / article PrLaSce

© protéine thermomètre plantes
protéine thermomètre planteschema.odg

A2 : Exercices sur lapins himalayens / documents → Ev 2,2

Diap gene_lapin_himmalaya.odp
© gene_lapin-himmalaya.odt
rôles de l’environnement et du génotype dans l’expression d’un phénotype.

C : poursuivre avec quelques articles colorés

Mécanismes génétiques de la couleur des yeux : http://www.techno-science.net/?onglet=news&news=4116
Génétique de la couleur et de la texture du pelage chez le chat domestique : http://www.academie-veterinaire-defrance.org/fileadmin/user_upload/Bulletin/pdf/2012/numero_3/205.pdf
Mélanisme et évolution chez la souris pocketmice : http://www.svt-hatier.com/ressources/chap_4/svt2_c4_app.pdf
The genetic basis of adaptive melanism in pocket mice : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC154334/#_blank

A3 : Comparaison d'allèles phénylcétonuriques / Anagène → EVTP

© 1S_TP_phénylcétonurie_anagene.odt
FT BAC : Comparer des données avec Anagène 2 (version 24/10/2009) : (doc, odt, pdf) Avancé (doc, odt, pdf)
Anagène → fichier → banque de séquences –-→ la phenylalanine hydroxylase
remplir le tableau (attention avec bases complémentaires)
rôle de l'alimentation sur le génotype

Vaccinologie - Tu mourras moins bête - ARTE

Darwin - Tu mourras moins bête - ARTE

§ Quelle est l'origine du volcanisme continental ?

1.4 : Le magmatisme en zone de subduction

1,4,1 : Des roches magmatiques continentales

A1 : Les conditions pour produire un magma / diagrammes de phases

© origin magma.odg
à partir des diagrammes de phases de la péridotite et magmatisme : http://www.tulane.edu/~sanelson/eens211/earths_interior.htm
=> globalement peu de fusion dans le manteau
-> fusion partielle par hydratation du manteau au dessus des plaques en subduction

A2 : modélisation moléculaire des minéraux

modélisation structures moléculaires minérales par Merkel : http://www.le.ac.uk/eg/spg3/atomic.html bn
modélisation des formes cristallines: http://webmineral.com/crystall.shtml
librairie de molécules :
structure cristalline
minéral = cristal

A? : fusion de la vanilline

A3 : Observation de lames minces roches magmatiques / µscopes

TP_roches.odg©
granitoïdes (=granodiorite), rhyolite, andésite, …
laves enrichies en Si => visqueuses => gaz + éruptions explosives
volcanisme / plutonisme
pour apprendre à reconnaître les minéraux et roches : manuel p.402 à 405
atlas minerals / Siddall, London : http://www.ucl.ac.uk/~ucfbrxs/PLM/PLMhome.html
atlas de roches et minéraux webminéral BRGM :
atlas de lames minces Minéraux et roches / Aubry, Caen : http://www.discip.crdp.ac-caen.fr/svt/cgaulsvt/travaux/Micropol/index.html
article de minéralogie au microscope polarisant : http://www.svt-monde.org/spip.php?article26
Attention : Evaluation TP roches le 7/12/17

mardi 21 novembre 2017

la Fiebre de la Palma - Palma aceitera en Ecuador / Palmier à huile en E...

A : construction d'une échelle de niveaux d'organisation

Prg → SVT → Logiciel : « 9 niveaux d'organisation »
construire sur 1 feuille A4 (page de cahier) une échelle illustrée la plus complète possible avec les taille et unité, les niveaux (organe, molécule, cellule, ..), des exemples, dessins, instruments ou moyens d'observation (microscope, MET, …), domaines d'étude (biochimie, physiologie, microbiologie, ...)

Bilan : schématisation sur l'ADN

© Schéma-bilan
ADN, chromosome, gènes
Gène = information génétique codée dans l'ADN par la séquence des bases, transmis de génération en génération.
Mutation = changement de la séquence d'un brin d'ADN, donc d'un gène
un lexique bilingue français/anglais de génétique : http://www.dr-belair.com/dic/Medicine/Genetics/Genetics-eng-fr.htm
18 Things You Should Know About Genetics : http://youtu.be/bVk0twJYL6Y