vendredi 15 mai 2026

mercredi 13 mai 2026

Misensituation

Perles :

« Pour aider les enfants à aller aux toilettes, on leur met des suppositoires de nitroglycérines. » Séverine , 20 ans, Ecole de soins infirmiers
« La plus contagieuse des maladies est la vermicelle. »
« A l'école le médecin est venu pour le vaccin anti-titanic »
« Dans les écoles, les médecins vaccinent contre le BCBG »

video : Immunologie - Tu mourras moins bête – ARTE video 3’14 : https://youtu.be/vfHMGPbbxvs

1tro /Antigènes

Sida, Ebola, Zika, Corona… font fémir chaque année la planète alors qu’il n’y a pas plus petit organisme sur terre, si l’on admet que les virus sont vivants, ce qui est encore en débat entre les scientifiques. Qu’est-ce qu’un virus ? Voici quelques infos qui provoqueront sans doute des questions que j’attend par mail ou commentaire avec impatience !

1/ Coronavirus

https://prezi.com/view/PuWIC6cDfne6TJz8TddA/

C’est quoi ?

Le SRAS-CoV2 (SARS, in English), pour Syndrôme Respiratoire Aigü Sévère au CoronaVirus 2 est l’agent de la maladie COVID19 ou 2019-nCoV pour Coronavirus infection disease 2019, littéralement « maladie infectieuse à coronavirus de 2019 ».
Les coronavirus humains comptent parmi les agents du rhume, derrière les rhinovirus. Ce sont des virus à ARN, enveloppés, avec certaines particularités : le génome le plus long des virus à ARN (30 kb) ; de très larges spicules d’enveloppe, donnant à la particule virale un aspect en couronne ; une relative résistance dans l’environnement et la présence dans les selles (en rapport avec cette enveloppe particulière ?).
Enveloped, spherical, about 120 nm in diameter. The RNA genome is associated with the N protein to form the nucleocapsid. see Neuman BW et al. for virion cryo-electron microscopy analysis. Monopartite, linear ssRNA(+) genome of 27-32kb in size (the largest of all RNA virus genomes). Capped, and polyadenylated. The leader RNA (65-89 bp) at the 5' end of the genome is also present at the end of each subgenomic RNAs.

Pour quoi ?

C’est la première menace de pandémie du troisième millénaire. Cette pneumonie sévère, apparue en novembre 2002 dans la province de Guangdong (ex Canton) en Chine, a diffusé jusqu’en avril 2003, touchant plus de 8000 personnes. Elle est due à un virus nouveau, d’origine très probablement animale (la civette), les coronavirus humains déjà connus ne donnant que des rhumes. L’implication de ce nouveau virus comme agent du SRAS a été démontrée par la reproduction de la maladie chez le singe (cynomolgus).
Physiopathologie : Le SRAS diffère de la grippe par les caractères suivants : mortalité plus élevée (10 %) ; incubation plus longue (six jours, avec des extrêmes de 14 jours) ; caractère généralisé de l’infection (le virus est présent dans les sécrétions respiratoires, mais aussi dans les urines, les selles, le sang) ; pic de multiplication virale relativement tardif (10 jours après le début des signes cliniques) ; rareté des affections asymptomatiques ; fréquence de la pneumonie plus grande chez l’adulte que chez l’enfant (comme pour la pneumonie de la varicelle) ; contagiosité limitée (deux à quatre cas secondaires par cas index, mais exceptionnellement beaucoup plus ; pour la grippe, c’est 5 à 10 cas, voire 15 en cas de pandémie) ; diffusion nosocomiale importante parmi le personnel (« maladie des blouses blanches ») ; enfin contrôle possible de l’épidémie par des mesures d’hygiène (isolement, quarantaine, bannissement des aérosols) dès que les cas sont reconnus.
Diagnotic virologique : La difficulté de leur isolement en culture de cellules, la bénignité du rhume et l’absence de traitement antiviral font que le diagnostic virologique, hors enquêtes spécifiques, n’en est pas fait. En phase aiguë, on recherche le génome viral par RT-PCR en temps réel sur les sécrétions respiratoires, les urines, les selles. Le diagnostic rétrospectif peut se faire par la recherche d’une séroconversion sur deux prélèvements sériques, précoce et tardif (IF ou ELISA… si le patient survit).
Traitement : Il n’y a actuellement pas de traitement antiviral validé. La question : cette épidémie liée à une zoonose [du grec ζῷον : zôion : animal + νόσος : nósos : maladie] peut-elle reprendre tous les ans ? Importance de la surveillance en Chine de la civette et autres animaux sauvages vendus sur les marchés et utilisés en plats cuisinés.

Comment ?

REPLICATION CYTOPLASMIC :

Attachement of the viral S protein (maybe also HE if present) to host receptors mediates endocytosis of the virus into the host cell.
Fusion of virus membrane with the endosomal membrane (probably mediated by S2), ssRNA(+) genome is released into the cytoplasm.
Synthesis and proteolytic cleavage of the replicase polyprotein.
Replication occurs in viral factories. A dsRNA genome is synthesized from the genomic ssRNA(+).
The dsRNA genome is transcribed/replicated thereby providing viral mRNAs/new ssRNA(+) genomes. GENE EXPRESSION : The virion RNA is infectious and serves as both the genome and viral messenger RNA. Genomic RNA encodes ORF1a, as for ORF1b, it is translated by ribosomal frameshifting. Resulting polyproteins pp1a and pp1ab are processed into the viral polymerase (RdRp) and other non-structural proteins involved in RNA synthesis. Structural proteins are expressed as subgenomic RNAs.
Synthesis of structural proteins encoded by subgenomic mRNAs.
Assembly and budding at membranes of the endoplasmic reticulum (ER), the intermediate compartments, and/or the Golgi complex.
Release of new virions by exocytosis. A SARS-CoV-infected cell with virus particles in vesicles, which appear to migrate toward the cell surface and fuse with the plasma membrane, releasing the viral particles. Many of the particles adhere to the plasma membrane, creating a characteristic knob-like appearance on the surface of the cell.

Modifié d’après https://viralzone.expasy.org/764?outline=all_by_species et http://www.chups.jussieu.fr/polys/viro/oldpoly/POLY.Chp.8.html

https://fr.wikipedia.org/wiki/Coronavirus

https://youtu.be/PWzbArPgo-o

https://evolution.berkeley.edu/evolibrary/news/200409_coronavirus

sitographie

https://www.gouvernement.fr/info-coronavirus/carte-et-donnees

https://nextstrain.org/ncov/gisaid/global/6m

https://www.sentiweb.fr/france/fr/?

https://informationisbeautiful.net/visualizations/covid-19-coronavirus-infographic-datapack/#treatments

2/ Classification des virus

Virus en 3D : http://www.pbs.org/spillover-zika-ebola-beyond/about-viruses/virus-explorer/

Classification des virus => particularités structurales et fonctionnelles des virus

https://fr.wikipedia.org/wiki/Classification_des_virus

cours destiné aux étudiants en pharmacie : http://unt-ori2.crihan.fr/unspf/2010_Lille_Goffard_Virologie/co/03_classification_virale.html

fac médecine Jussieu : http://www.chups.jussieu.fr/polys/viro/oldpoly/POLY.Chp.1.html

Univ microbio Nantes : http://www.microbiologybook.org/French-virology/virol-french1.htm

universalis : https://www.universalis.fr/classification/sciences-de-la-vie/microbiologie/virologie/classification-des-virus/

virology : http://www.virology.wisc.edu/virusworld/viruslist.php

viralzone : https://viralzone.expasy.org/

dossier virus de l'INSERM : https://my.visme.co/view/kkyo6erk-exposition-inserm-des-virus-emergents-et-des-epidemies-3

vivants ou pas ? + Organique et non minéral, nait, se reproduit, meurt, - ne peut se faire sans la cellule hôte, pas d’exitence propre,

3/ Chasse aux microbes

antibiotiques : http://www.futura-sciences.com/fr/definition/t/medecine-2/d/antibiotique_2992/

Chikungunya virus loves warm New York winters : http://www.newscientist.com/article/dn21816-chikungunya-virus-loves-warm-new-york-winters.html

Public bathrooms house thousands of kinds of bacteria : http://blogs.scientificamerican.com/guest-blog/2011/11/23/public-bathrooms-house-thousands-of-kinds-of-bacteria/

MAIS :

Drug-Resistant Genes Spread among Bacteria : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=resistant-bacteria-genes

Sequencing Staph: New Genetic Analysis Tracks MRSA Mutations : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=mrsa-genome-sequencing

WHO demands action on drug-resistant gonorrhoea : http://www.newscientist.com/article/dn21910-who-demands-action-on-drugresistant-gonorrhoea.html

ET : rappels de 2° sur microbiote

How Bacteria in Our Bodies Protect Our Health : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=ultimate-social-network-bacteria-protects-health

Explore the Human Microbiome : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=microbiome-graphic-explore-human-microbiome#

Humans Carry More Bacterial Cells than Human Ones : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=strange-but-true-humans-carry-more-bacterial-cells-than-human-ones

exploring biodiversity that live on us : http://www.yourwildlife.org/

§ comment l'organisme se défend-t-il contre une infection ?

2/ LE FONCTIONNEMENT DU SYSTÈME IMMUNITAIRE HUMAIN

Le système immunitaire est constitué d'organes, de cellules et de molécules qui coopèrent pour assurer l’immunité de l'organisme et contribuer ainsi à sa santé. L’immunité est un ensemble de mécanismes intégrés visant à protéger l’organisme des agents infectieux, des cellules cancéreuses ou des dommages tissulaires. Tous les êtres vivants ont des systèmes de défense adaptés à leurs caractéristiques et leurs besoins. Chez les animaux, ces systèmes comprennent des dispositifs de surveillance qui fonctionnent sans relâche et qui patrouillent dans tout l’organisme, ainsi que des mécanismes de réaction déclenchés par la perception d’un élément étranger ou la modification d’une cellule de l’organisme.

Ce système comprend deux étages de défenses aux stratégies différentes :

 l’immunité́ innée, la première à s’être mise en place aux cours de l’évolution, chez l’ancêtre commun des animaux ;

 l’immunité́ adaptative qui apparaît chez les vertébrés, s’ajoute et se combine à l’immunité innée.

Les capacités immunitaires d’un individu évoluent au cours de sa vie suite au contact avec différents antigènes. Elles faiblissent chez les personnes âgées. Elles peuvent être enrichies dès l’enfance et pendant toute la vie grâce à l'aide de vaccins, de sérums, de transplantations et autres interventions médicales préventives ou curatives.

2,1/ L’IMMUNITÉ INNÉE

Objectifs : le déclenchement d'une réaction immunitaire et l'importance de la réaction inflammatoire.

2,1,1/ Importance de la réaction inflammatoire.

1/ Réaction inflammatoire

Bd : Dr j’ai mal

Le quadrilatère de Celsus¹ : tumor, rubor, calor, dolor

symptômes stéréotypés (gonflement, rougeur, chaleur, douleur)

La réaction inflammatoire est essentielle. Elle traduit l’accumulation de molécules et de cellules immunitaires au lieu d’infection ou de lésion. Aigüe, elle présente des symptômes stéréotypés (rougeur, chaleur, gonflement, douleur). Elle prépare le déclenchement de l'immunité adaptative.

2/ cellules sanguines

- Observer et comparer une coupe histologique ou des documents en microscopie avant et lors d'une réaction inflammatoire aiguë.

Quelle différence observez-vous entre les deux frottis sanguins ? Entre les deux personnes ?
En vous aidant des dessins, légendez chaque cellule avec son initiale sur les photos.
Coloriez et légendez les dessins : membrane, noyau, cytoplasme.
Ecrivez en deux mots quel est le rôle de chaque type cellulaire.

- Recenser, extraire et exploiter des informations, sur les cellules impliquées dans la réaction inflammatoire aiguë.

Photos :

http://library.med.utah.edu/WebPath/jpeg5/HEME100.jpg

http://umvf.univ-nantes.fr/hematologie/enseignement/hematologie_166/site/html/images/figure_3.JPG

http://www.jle.com/e-docs/00/04/12/2C/texte_alt_jleabc00134_gr1.jpg

http://www.chups.jussieu.fr/polys/histo/histoP1/celllibres.html#ID-130

http://fr.academic.ru/dic.nsf/frwiki/1630808

https://cytologie-sanguine.com/html/sangnormal.php

schémas :

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article433

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article642&var_recherche=cellules+sang

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article734

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article2025

http://histoblog.viabloga.com/images/plasmo_t.800.jpg

globules = cellules = _cytes [κυτος : creux, vase, corps, cavité]

blanc = leuco_ [λευκος : blanc]

thrombocytes = plaquettes [θρόμβωσις : coagulé]
érythrocytes → globules rouges = hématies [ἐρυθρός : rouge][αίμα : sang]
leucocytes = globules blancs

Organes lymphoïdes : rate, appendice, ganglions …

cellules immunitaires = leucocytes = globules blancs : macrophage [φάγος : glouton] , monocyte [μόνος : seul, unique], granulocyte [granulum : petit grain], phagocyte [μακρος : gros], mastocyte [all : gros], lymphocyte [νύμφη : nymphe]

3/ Molécules (anti)inflammatoires

COX = cyclooxygénase

- Recenser, extraire et exploiter des informations, sur les molécules impliquées dans la réaction inflammatoire aiguë.

- Recenser, extraire et exploiter des informations, y compris expérimentales, sur les effets de médicaments antalgiques et anti-inflammatoires.

réaction inflammatoire, médiateurs chimiques de l'inflammation, médicaments anti-inflammatoires

effet de l'aspirine sur la COX : http://www.takween.com/biotechnologies/prostaglandines-cyclooxygenase-aspirine.html

L’aspirine en prévention du cancer ? : http://www.futura-sciences.com/fr/news/t/medecine/d/laspirine-en-prevention-du-cancer_26515/

1Aulus Cornelius Celsus, francisé en Celse, est un polygraphe (auteur non spécialiste qui écrit sur des sujets variés) de l'Antiquité. il semble cependant certain qu'il ait vécu au temps de l'empereur Auguste (de la fin du I ^er siècle av. J.-C.. au début du I ^er siècle). né à Vérone, il écrivit le De Artibus, ouvrage aujourd'hui disparu, une vaste encyclopédie couvrant des domaines aussi variés que l'agriculture, l'art militaire, la rhétorique, la philosophie, la jurisprudence et la médecine. Celse était un encyclopédiste. Selon le jugement de Quintilien (XII, c ri), il traitait avec un intérêt égal l'agriculture, l'art militaire et la médecine ….

3/ modélisation moléculaire de l’ADN / logiciel

? Faire un compte-rendu individuel sur feuille :

 utiliser un logiciel pour synthétiser/simplifier/construire/schématiser une molécule d'ADN

Objectifs : Exprimer et exploiter des résultats à l’écrit en utilisant les technologies de l’informatique

Principe : les logiciels Rastop, Rasmol, Raswin, Jmol, … sont des banques de données permettant de manipuler des modèles moléculaires.

Protocole :

Ouvrez le fichier « ADN » : https://libmol.org/?libmol=158
Admirez la molécule en la manipulant à la souris.
Changer (commande) la représentation des atomes et des liaisons.
Colorez la molécule par « atomes » : quels sont les atomes composant l’ADN ?
Colorez la molécule par « chaines » : combien de parties lui trouvez-vous ?
Affichez les « rubans » puis « squelette » : quelle est la forme globale de la molécule ?
Dessinez la forme globale de la molécule
Colorez la molécule par « résidus» : combien de nucléotides différents existe-t-il ? quels sont leurs noms (passez la souris dessus) ?
Quelle est la composition, la structure d'un nucléotide ? Utilisez vos notes et les informations du logiciel pour comprendre.
Schématisez la structure d'un nucléotide en utilisant différents symboles et couleurs de votre choix.
En 1951 Chargaff démontre que [A] = [T] et [C] = [G] pour toute cellule. Que signifie l'expression « bases complémentaires » ?
En utilisant les symboles précédents schématisez la structure de la molécule à plat, sans tenir compte de la forme dans l'espace.

Logiciels anatomie en 3D :

https://www.zygotebody.com/

https://cosphilog.fr/oscar3d/

Pancréas humain :

Tissu	ilôt endocrine	acinus exocrine
cellule	cellules A&B	cellule acineuse
organite	vésicules	vésicules
molécule	Hormones (glucagon, insuline, ...)	Enzymes (lipase, amylase, ...)
fonction	RÉGULATION GLYCÉMIE	DIGESTION ALIMENTS

spécialisation cellulaire,

Les cellules spécialisées ont une fonction particulière dans l’organisme, en lien avec leur organisation

Toutes les cellules d’un organisme sont issues d’une cellule unique (zygote) à l’origine de cet organisme.

Elles possèdent toutes initialement le même ADN mais n’expriment qu’une partie de l’information génétique.

§ qu’est-ce que l’ADN ?

2/ Histoire de la découverte de l’ADN

Quelle est l'histoire de la pensée humaine en matière de génétique ?

? notez les découvertes progressives

Réalisez une frise chronologique pour comprendre l’histoire des idées, le cheminement de la pensée humaine

1865 (Autriche) Mendel démontre l'existence de "facteurs génétiques"
1868 (Suisse) Miescher trouve une substance spécifique du noyau qu'il nomme la "nucléine"
1882 (Allemagne) Flemming, van Beneden & Strasburger dessinent les chromosomes lors de la division cellulaire.
1883 (Allemagne) Weismann utilise le terme "matériel génétique"
1900 (Hollande, Allemagne, Autriche) DeVries, von Tschermak et Correns redécouvrent le travail de Mendel
1901 (Allemagne) Kossel découvre les quatre bases nucléiques : Adénine, Guanine, Thymine et Cytosine
1903 (Amérique) Sutton fait l’hypothèse que les chormosomes sont le support de l’hérédité
1905 (Angleterre) Bateson utilise le terme “genetics” pour l'étude des caractères héréditaires
1909 (Danemark) Johannsen propose le mot gène pour remplacer celui de facteur utilisé par Mendel
1910 (Amérique) Morgan montre que les gènes sont portés par les chromosomes
1919 (Russie) Levene décrit la structure des nucléotides : phosphate-sucre-base
1928 (Amérique) Griffith démontre que l’hérédité est donnée par une molécule
1933 (France) Brachet démontre que l’ADN est dans les chromosomes
1937 (Angleterre) Astbury démontre que l’ADN a une structure en long filament
1944 (Amérique) Avery, Mc Leod & Mc Carty montrent que l'ADN est le support des gènes
1951 (Amérique) Chargaff établit la règle : [A] = [T] et [C] = [G] pour toute cellule
1953 (Angleterre) Franklin & Wilkins montrent que la molécule a la forme d'une double hélice
1953 (Amérique, Angleterre) Watson & Crick établissent le modèle moléculaire de l'ADN
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