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Equilibre
du microbiote
La bactérie Clostridium difficile observée au
MEB (image colorisée), est responsable de colites entraînant des
douleurs abdominales et des diarrhées qui peuvent être mortelles
dans 5 % des cas. Près d’un demi-million de cas ont été
diagnostiqués en 2017 aux États-Unis. Cette infection survient
généralement après un traitement antibiotique, surtout en milieu
hospitalier, ou chez des personnes qui ont un système immunitaire
affaibli. 4 % de la population sont des porteurs sains de la
bactérie, c’est-à-dire qu’ils présentent la bactérie sans
symptômes associés.
Candida albicans est une levure (champignon
microscopique) naturellement présente dans la bouche des êtres
humains. Généralement inoffensive, elle est cependant à l’origine
de candidoses, des maladies se manifestant par des taches blanches
douloureuses sur la langue ou le palais. Ces maladies surviennent
après un traitement antibiotique prolongé ou chez des personnes
avec un système immunitaire affaibli, comme les personnes atteintes
du sida.
Chez deux volontaires ayant consommé le même
repas, la quantité de C. albicans varie en fonction de la fréquence
du brossage de dents.
Association de microorganismes
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Conséquences
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Candida albicans + Streptococcus oralis
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Candidose, inflammation des tissus
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Candida albicans + Streptococcus mutans
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Apparition précoce de caries dans l’enfance
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Candida albicans + Fusobacterium nucleatum
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Coexistence sans effets néfastes sur la santé
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Près d’un enfant sur deux
souffre de caries, une dégradation des dents causée par certaines
bactéries.
Effet de l’alimentation sur la
modification du microbiote intestinal.
Des individus végétariens ou ayant un régime
riche en produits d’origine animal ont changé de type
d’alimentation pendant 4 jours. Ils reprennent ensuite leur
alimentation habituelle. La diversité microbienne est augmentée
après un changement de régime alimentaire.
rôle du microbiote dans la
nutrition.
Des souris axéniques reçoivent le microbiote
d’individus soit obèses (Ob), soit minces (Mi). Les souris sont
ensuite élevées en groupes, soit homogènes soit mixtes (on parle
alors de coélevage). Les souris se nourrissent des excréments
présents dans la cage, ce qui permet des transferts de microbiote.
Il existe des souris si propres et si soignées
que, de leur vie, elles n’ont jamais vu un microbe. Ce sont les
souris axéniques, dépourvues de microbiote car nées par
césarienne, animaux de laboratoire élevés « en bulles », dans
des conditions stériles. La vie n’est pas facile pour elles. Cette
absence de bactéries les rend particulièrement sensibles aux
pathogènes, aux allergies, au stress. Des travaux ont montré chez
elles des troubles de croissance par rapport à leurs congénères
habitées par des bactéries. Ces animaux font cependant l’objet de
nombreuses expérimentations pour l’étude du microbiote. Ils
permettent par exemple d’étudier l’effet des transferts de
microbiotes, ou encore, de caractériser les effets sur la santé des
différentes souches bactériennes.
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Souris axénique sans traitement
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Souris axénique + Bacteroides fragilis inoculées dans l’intestin
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Rate et ganglions
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Petit et mal formés
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Normaux
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Lymphocytes dans la rate et l’intestin
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Déficit global
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Normaux
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Anticorps dans l’intestin et le sang
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Déficit total ou partiel
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Normaux
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Expérience 1 : transfert du microbiote
intestinal d’un couple de femmes jumelles, l’une obèse, l’autre
mince, dans l’intestin de souris axéniques soumises ensuite à la
même alimentation. On a constaté des différences entre les
microbiotes de personnes obèses et de personnes minces. Résultat :
la souris contenant du microbiote de femme obèse est devenue
elle-même obèse alors que la souris contenant du microbiote de
femme mince est restée mince.
Expérience 2 : cohabitation des 2 souris,
celle devenue obèse avec l’autre restée mince, dans une même
cage. On précise que les souris sont coprophages, c’est-à-dire
qu’elles mangent leurs crottes. Résultat : les deux souris
sont minces.
Effet de traitements antibiotiques puis du
transfert de microbiote intestinal sur une infection à C.
difficile.
L’infection des souris est mesurée par le
nombre de bactéries présentes dans leurs excréments. Les souris
ont subi deux traitements antibiotiques par la vancomycine (van) puis
une transplantation de microbiote intestinal de souris saines.
=> Un transfert de microbiote intestinal sur
une infection à C. difficile est plus efficace qu’un traitement
antibiotique
Effet des bactéries Faecalibacterium prausnitzii
sur des inflammations intestinales.
Des souris présentant des symptômes similaires à
la maladie de Crohn reçoivent ou non une administration de bactéries
intestinales présentes chez des personnes saines et absentes chez
les patients atteints de la maladie de Crohn.
=> Les souris ayant reçu une injection de
bactérie ont une inflammation intestinale divisée par 2
Proportion de souris atteintes d’un
diabète de type 1 chez des souris prédisposées génétiquement.
=> en milieu stérile il y a deux fois
plus de souris diabétiques
Résistance de S. aureus à un
antibiotique en milieu hospitalier.
Le lavage des mains effectif représenterait moins
de 50 % de ce qui est recommandé en milieu hospitalier et serait à
l’origine d’infections nosocomiales, notamment dues à S. aureus.
Du grec ancien νοσοκομεῖον, nosokomeîon (hôpital,
infirmerie), dérivé de νόσος, maladie, et ϰομεῖν,
soigner, est qualifiée de nosocomiale une infection contractée dans
un établissement de soins. Un nouveau protocole de lavage des mains
peut réduire de 10 % le taux d’infections nosocomiales
L’eczéma, ou dermatite atopique, est une
maladie inflammatoire chronique entraînant rougeurs et
démangeaisons.
Les patients ont souvent une prédisposition
génétique à l’eczéma, renforcée par des paramètres de
l’environnement.
Comparaison de quelques groupes de bactéries du
microbiote intestinal chez des patients sujets ou non à l’eczéma
(étude sur 132 sujets sud-coréens) : Les microorganismes présents
à la surface de la peau pourraient être impliqués dans le
phénomène.
Effets des microorganismes ou d’un traitement
placebo sur l’eczéma.
Le score SCORAD est une méthode utilisée en
médecine pour estimer l’ampleur de l’eczéma d’un patient. Les
bactéries utilisées sont naturellement présentes dans la bouche ou
dans l’intestin chez de nombreux humains.
Condition / Date
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Avant
traitement
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Après 3 mois
de traitement
|
2 mois après
arrêt du traitement
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Traitement avec ingestion de Lactobacillus salivarius et
Bifidobacterium breve
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46,25
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29,45
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22,63
|
Traitement placebo (sans microorganismes)
|
45
|
40,21
|
38
|
Le traitement avec ingestion de bactéries fait
diminuer l’eczéma de moitié.
La quantité de S.doré augmente pendant une crise
d’eczéma en même temps que la diversité microbiologique diminue.
Après une crise ou une prise d’antiinflammatoire la diveristé
microbiologique augmente et la proportion de S. doré diminue.
Effet de quelques microorganismes chez des souris
modèles.
Des lignées de souris pouvant facilement
déclencher de l’eczéma sont soumises à un traitement
antibiotique, puis à des dépôts sur la peau de solution contenant
soit des bactéries Corynebacterium mastitis, soit C. bovis, soit S.
aureus.
https://www.lelivrescolaire.fr/page/6095155
Les
interactions entre hôte et microbiote jouent un rôle essentiel
pour le maintien de la santé et du bien-être de l’hôte.
La
composition en microorganismes et la diversité du microbiote sont
des indicateurs de santé.
Certains
microorganismes normalement bénins du microbiote peuvent devenir
pathogènes pour l’organisme notamment en cas d’affaiblissement
du système immunitaire.
Les
travaux sur le microbiote établissent des corrélations entre des
compositions du microbiote et des pathologies.
La
modulation du microbiote ouvre des pistes de traitement dans
certains cas de maladies.
Mots
clefs : pathogène, vecteur, réservoir à pathogène, cycle
évolutif, épidémie/endémie, modes de transmission, traitements,
prophylaxie, vaccins, porteur sain.