Misensituation

Perles :

• « Pour aider les enfants à aller aux toilettes, on leur met des suppositoires de nitroglycérines. » Séverine , 20 ans, Ecole de soins infirmiers

• « La plus contagieuse des maladies est la vermicelle. »

• « A l'école le médecin est venu pour le vaccin anti-titanic »

• « Dans les écoles, les médecins vaccinent contre le BCBG »

video : Immunologie - Tu mourras moins bête – ARTE video 3’14 : https://youtu.be/vfHMGPbbxvs

1tro /Antigènes

Sida, Ebola, Zika, Corona… font fémir chaque année la planète alors qu’il n’y a pas plus petit organisme sur terre, si l’on admet que les virus sont vivants, ce qui est encore en débat entre les scientifiques. Qu’est-ce qu’un virus ? Voici quelques infos qui provoqueront sans doute des questions que j’attend par mail ou commentaire avec impatience !

1/ Coronavirus

https://prezi.com/view/PuWIC6cDfne6TJz8TddA/

C’est quoi ?

• Le SRAS-CoV2 (SARS, in English), pour Syndrôme Respiratoire Aigü Sévère au CoronaVirus 2 est l’agent de la maladie COVID19 ou 2019-nCoV pour Coronavirus infection disease 2019, littéralement « maladie infectieuse à coronavirus de 2019 ».

• Les coronavirus humains comptent parmi les agents du rhume, derrière les rhinovirus. Ce sont des virus à ARN, enveloppés, avec certaines particularités : le génome le plus long des virus à ARN (30 kb) ; de très larges spicules d’enveloppe, donnant à la particule virale un aspect en couronne ; une relative résistance dans l’environnement et la présence dans les selles (en rapport avec cette enveloppe particulière ?).

• Enveloped, spherical, about 120 nm in diameter. The RNA genome is associated with the N protein to form the nucleocapsid. see Neuman BW et al. for virion cryo-electron microscopy analysis. Monopartite, linear ssRNA(+) genome of 27-32kb in size (the largest of all RNA virus genomes). Capped, and polyadenylated. The leader RNA (65-89 bp) at the 5' end of the genome is also present at the end of each subgenomic RNAs.

Pour quoi ?

• C’est la première menace de pandémie du troisième millénaire. Cette pneumonie sévère, apparue en novembre 2002 dans la province de Guangdong (ex Canton) en Chine, a diffusé jusqu’en avril 2003, touchant plus de 8000 personnes. Elle est due à un virus nouveau, d’origine très probablement animale (la civette), les coronavirus humains déjà connus ne donnant que des rhumes. L’implication de ce nouveau virus comme agent du SRAS a été démontrée par la reproduction de la maladie chez le singe (cynomolgus).

• Physiopathologie : Le SRAS diffère de la grippe par les caractères suivants : mortalité plus élevée (10 %) ; incubation plus longue (six jours, avec des extrêmes de 14 jours) ; caractère généralisé de l’infection (le virus est présent dans les sécrétions respiratoires, mais aussi dans les urines, les selles, le sang) ; pic de multiplication virale relativement tardif (10 jours après le début des signes cliniques) ; rareté des affections asymptomatiques ; fréquence de la pneumonie plus grande chez l’adulte que chez l’enfant (comme pour la pneumonie de la varicelle) ; contagiosité limitée (deux à quatre cas secondaires par cas index, mais exceptionnellement beaucoup plus ; pour la grippe, c’est 5 à 10 cas, voire 15 en cas de pandémie) ; diffusion nosocomiale importante parmi le personnel (« maladie des blouses blanches ») ; enfin contrôle possible de l’épidémie par des mesures d’hygiène (isolement, quarantaine, bannissement des aérosols) dès que les cas sont reconnus.

• Diagnotic virologique : La difficulté de leur isolement en culture de cellules, la bénignité du rhume et l’absence de traitement antiviral font que le diagnostic virologique, hors enquêtes spécifiques, n’en est pas fait. En phase aiguë, on recherche le génome viral par RT-PCR en temps réel sur les sécrétions respiratoires, les urines, les selles. Le diagnostic rétrospectif peut se faire par la recherche d’une séroconversion sur deux prélèvements sériques, précoce et tardif (IF ou ELISA… si le patient survit).

• Traitement : Il n’y a actuellement pas de traitement antiviral validé. La question : cette épidémie liée à une zoonose [du grec ζῷον : zôion : animal + νόσος : nósos : maladie] peut-elle reprendre tous les ans ? Importance de la surveillance en Chine de la civette et autres animaux sauvages vendus sur les marchés et utilisés en plats cuisinés.

Comment ?

• REPLICATION CYTOPLASMIC :

1. Attachement of the viral S protein (maybe also HE if present) to host receptors mediates endocytosis of the virus into the host cell.

2. Fusion of virus membrane with the endosomal membrane (probably mediated by S2), ssRNA(+) genome is released into the cytoplasm.

3. Synthesis and proteolytic cleavage of the replicase polyprotein.

4. Replication occurs in viral factories. A dsRNA genome is synthesized from the genomic ssRNA(+).

5. The dsRNA genome is transcribed/replicated thereby providing viral mRNAs/new ssRNA(+) genomes. GENE EXPRESSION : The virion RNA is infectious and serves as both the genome and viral messenger RNA. Genomic RNA encodes ORF1a, as for ORF1b, it is translated by ribosomal frameshifting. Resulting polyproteins pp1a and pp1ab are processed into the viral polymerase (RdRp) and other non-structural proteins involved in RNA synthesis. Structural proteins are expressed as subgenomic RNAs.

6. Synthesis of structural proteins encoded by subgenomic mRNAs.

7. Assembly and budding at membranes of the endoplasmic reticulum (ER), the intermediate compartments, and/or the Golgi complex.

8. Release of new virions by exocytosis. A SARS-CoV-infected cell with virus particles in vesicles, which appear to migrate toward the cell surface and fuse with the plasma membrane, releasing the viral particles. Many of the particles adhere to the plasma membrane, creating a characteristic knob-like appearance on the surface of the cell.

Modifié d’après https://viralzone.expasy.org/764?outline=all_by_species et http://www.chups.jussieu.fr/polys/viro/oldpoly/POLY.Chp.8.html

https://fr.wikipedia.org/wiki/Coronavirus

https://youtu.be/PWzbArPgo-o

https://evolution.berkeley.edu/evolibrary/news/200409_coronavirus

sitographie

https://www.gouvernement.fr/info-coronavirus/carte-et-donnees

https://nextstrain.org/ncov/gisaid/global/6m

https://www.sentiweb.fr/france/fr/?

https://informationisbeautiful.net/visualizations/covid-19-coronavirus-infographic-datapack/#treatments

2/ Classification des virus

Virus en 3D : http://www.pbs.org/spillover-zika-ebola-beyond/about-viruses/virus-explorer/

Classification des virus => particularités structurales et fonctionnelles des virus

https://fr.wikipedia.org/wiki/Classification_des_virus

cours destiné aux étudiants en pharmacie : http://unt-ori2.crihan.fr/unspf/2010_Lille_Goffard_Virologie/co/03_classification_virale.html

fac médecine Jussieu : http://www.chups.jussieu.fr/polys/viro/oldpoly/POLY.Chp.1.html

Univ microbio Nantes : http://www.microbiologybook.org/French-virology/virol-french1.htm

universalis : https://www.universalis.fr/classification/sciences-de-la-vie/microbiologie/virologie/classification-des-virus/

virology : http://www.virology.wisc.edu/virusworld/viruslist.php

viralzone : https://viralzone.expasy.org/

dossier virus de l'INSERM : https://my.visme.co/view/kkyo6erk-exposition-inserm-des-virus-emergents-et-des-epidemies-3

vivants ou pas ? + Organique et non minéral, nait, se reproduit, meurt, - ne peut se faire sans la cellule hôte, pas d’exitence propre,

3/ Chasse aux microbes

antibiotiques : http://www.futura-sciences.com/fr/definition/t/medecine-2/d/antibiotique_2992/

Chikungunya virus loves warm New York winters : http://www.newscientist.com/article/dn21816-chikungunya-virus-loves-warm-new-york-winters.html

Public bathrooms house thousands of kinds of bacteria : http://blogs.scientificamerican.com/guest-blog/2011/11/23/public-bathrooms-house-thousands-of-kinds-of-bacteria/

MAIS :

Drug-Resistant Genes Spread among Bacteria : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=resistant-bacteria-genes

Sequencing Staph: New Genetic Analysis Tracks MRSA Mutations : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=mrsa-genome-sequencing

WHO demands action on drug-resistant gonorrhoea : http://www.newscientist.com/article/dn21910-who-demands-action-on-drugresistant-gonorrhoea.html

ET : rappels de 2° sur microbiote

How Bacteria in Our Bodies Protect Our Health : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=ultimate-social-network-bacteria-protects-health

Explore the Human Microbiome : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=microbiome-graphic-explore-human-microbiome#

Humans Carry More Bacterial Cells than Human Ones : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=strange-but-true-humans-carry-more-bacterial-cells-than-human-ones

exploring biodiversity that live on us : http://www.yourwildlife.org/

§ comment l'organisme se défend-t-il contre une infection ?

2/ LE FONCTIONNEMENT DU SYSTÈME IMMUNITAIRE HUMAIN

Le système immunitaire est constitué d'organes, de cellules et de molécules qui coopèrent pour assurer l’immunité de l'organisme et contribuer ainsi à sa santé. L’immunité est un ensemble de mécanismes intégrés visant à protéger l’organisme des agents infectieux, des cellules cancéreuses ou des dommages tissulaires. Tous les êtres vivants ont des systèmes de défense adaptés à leurs caractéristiques et leurs besoins. Chez les animaux, ces systèmes comprennent des dispositifs de surveillance qui fonctionnent sans relâche et qui patrouillent dans tout l’organisme, ainsi que des mécanismes de réaction déclenchés par la perception d’un élément étranger ou la modification d’une cellule de l’organisme.

Ce système comprend deux étages de défenses aux stratégies différentes :

 l’immunité́ innée, la première à s’être mise en place aux cours de l’évolution, chez l’ancêtre commun des animaux ;

 l’immunité́ adaptative qui apparaît chez les vertébrés, s’ajoute et se combine à l’immunité innée.

Les capacités immunitaires d’un individu évoluent au cours de sa vie suite au contact avec différents antigènes. Elles faiblissent chez les personnes âgées. Elles peuvent être enrichies dès l’enfance et pendant toute la vie grâce à l'aide de vaccins, de sérums, de transplantations et autres interventions médicales préventives ou curatives.

2,1/ L’IMMUNITÉ INNÉE

Objectifs : le déclenchement d'une réaction immunitaire et l'importance de la réaction inflammatoire.

2,1,1/ Importance de la réaction inflammatoire.

1/ Réaction inflammatoire

Bd : Dr j’ai mal

Le quadrilatère de Celsus¹ : tumor, rubor, calor, dolor

symptômes stéréotypés (gonflement, rougeur, chaleur, douleur)

La réaction inflammatoire est essentielle. Elle traduit l’accumulation de molécules et de cellules immunitaires au lieu d’infection ou de lésion. Aigüe, elle présente des symptômes stéréotypés (rougeur, chaleur, gonflement, douleur). Elle prépare le déclenchement de l'immunité adaptative.

2/ cellules sanguines

- Observer et comparer une coupe histologique ou des documents en microscopie avant et lors d'une réaction inflammatoire aiguë.

1. Quelle différence observez-vous entre les deux frottis sanguins ? Entre les deux personnes ?

2. En vous aidant des dessins, légendez chaque cellule avec son initiale sur les photos.

3. Coloriez et légendez les dessins : membrane, noyau, cytoplasme.

4. Ecrivez en deux mots quel est le rôle de chaque type cellulaire.

- Recenser, extraire et exploiter des informations, sur les cellules impliquées dans la réaction inflammatoire aiguë.

Photos :

http://library.med.utah.edu/WebPath/jpeg5/HEME100.jpg

http://umvf.univ-nantes.fr/hematologie/enseignement/hematologie_166/site/html/images/figure_3.JPG

http://www.jle.com/e-docs/00/04/12/2C/texte_alt_jleabc00134_gr1.jpg

http://www.chups.jussieu.fr/polys/histo/histoP1/celllibres.html#ID-130

http://fr.academic.ru/dic.nsf/frwiki/1630808

https://cytologie-sanguine.com/html/sangnormal.php

schémas :

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article433

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article642&var_recherche=cellules+sang

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article734

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article2025

http://histoblog.viabloga.com/images/plasmo_t.800.jpg

globules = cellules = _cytes [κυτος : creux, vase, corps, cavité]

blanc = leuco_ [λευκος : blanc]

• thrombocytes = plaquettes [θρόμβωσις : coagulé]

• érythrocytes → globules rouges = hématies [ἐρυθρός : rouge][αίμα : sang]

• leucocytes = globules blancs

Organes lymphoïdes : rate, appendice, ganglions …

cellules immunitaires = leucocytes = globules blancs : macrophage [φάγος : glouton] , monocyte [μόνος : seul, unique], granulocyte [granulum : petit grain], phagocyte [μακρος : gros], mastocyte [all : gros], lymphocyte [νύμφη : nymphe]

3/ Molécules (anti)inflammatoires

COX = cyclooxygénase

- Recenser, extraire et exploiter des informations, sur les molécules impliquées dans la réaction inflammatoire aiguë.

- Recenser, extraire et exploiter des informations, y compris expérimentales, sur les effets de médicaments antalgiques et anti-inflammatoires.

réaction inflammatoire, médiateurs chimiques de l'inflammation, médicaments anti-inflammatoires

effet de l'aspirine sur la COX : http://www.takween.com/biotechnologies/prostaglandines-cyclooxygenase-aspirine.html

L’aspirine en prévention du cancer ? : http://www.futura-sciences.com/fr/news/t/medecine/d/laspirine-en-prevention-du-cancer_26515/

1Aulus Cornelius Celsus, francisé en Celse, est un polygraphe (auteur non spécialiste qui écrit sur des sujets variés) de l'Antiquité. il semble cependant certain qu'il ait vécu au temps de l'empereur Auguste (de la fin du I^er siècle av. J.-C.. au début du I^er siècle). né à Vérone, il écrivit le De Artibus, ouvrage aujourd'hui disparu, une vaste encyclopédie couvrant des domaines aussi variés que l'agriculture, l'art militaire, la rhétorique, la philosophie, la jurisprudence et la médecine. Celse était un encyclopédiste. Selon le jugement de Quintilien (XII, c ri), il traitait avec un intérêt égal l'agriculture, l'art militaire et la médecine ….

3/ modélisation moléculaire de l’ADN / logiciel

? Faire un compte-rendu individuel sur feuille :

 utiliser un logiciel pour synthétiser/simplifier/construire/schématiser une molécule d'ADN

Objectifs : Exprimer et exploiter des résultats à l’écrit en utilisant les technologies de l’informatique

Principe : les logiciels Rastop, Rasmol, Raswin, Jmol, … sont des banques de données permettant de manipuler des modèles moléculaires.

Protocole :

1. Ouvrez le fichier « ADN » : https://libmol.org/?libmol=158

2. Admirez la molécule en la manipulant à la souris.

3. Changer (commande) la représentation des atomes et des liaisons.

4. Colorez la molécule par « atomes » : quels sont les atomes composant l’ADN ?

5. Colorez la molécule par « chaines » : combien de parties lui trouvez-vous ?

6. Affichez les « rubans » puis « squelette » : quelle est la forme globale de la molécule ?

7. Dessinez la forme globale de la molécule

8. Colorez la molécule par « résidus» : combien de nucléotides différents existe-t-il ? quels sont leurs noms (passez la souris dessus) ?

9. Quelle est la composition, la structure d'un nucléotide ? Utilisez vos notes et les informations du logiciel pour comprendre.

10. Schématisez la structure d'un nucléotide en utilisant différents symboles et couleurs de votre choix.

11. En 1951 Chargaff démontre que [A] = [T] et [C] = [G] pour toute cellule. Que signifie l'expression « bases complémentaires » ?

12. En utilisant les symboles précédents schématisez la structure de la molécule à plat, sans tenir compte de la forme dans l'espace.

Logiciels anatomie en 3D :

https://www.zygotebody.com/

https://cosphilog.fr/oscar3d/

Pancréas humain :

Tissu	ilôt endocrine	acinus exocrine
cellule	cellules A&B	cellule acineuse
organite	vésicules	vésicules
molécule	Hormones (glucagon, insuline, ...)	Enzymes (lipase, amylase, ...)
fonction	RÉGULATION GLYCÉMIE	DIGESTION ALIMENTS

spécialisation cellulaire,

Les cellules spécialisées ont une fonction particulière dans l’organisme, en lien avec leur organisation

Toutes les cellules d’un organisme sont issues d’une cellule unique (zygote) à l’origine de cet organisme.

Elles possèdent toutes initialement le même ADN mais n’expriment qu’une partie de l’information génétique.

§ qu’est-ce que l’ADN ?

2/ Histoire de la découverte de l’ADN

Quelle est l'histoire de la pensée humaine en matière de génétique ?

? notez les découvertes progressives

Réalisez une frise chronologique pour comprendre l’histoire des idées, le cheminement de la pensée humaine

• 1865 (Autriche) Mendel démontre l'existence de "facteurs génétiques"

• 1868 (Suisse) Miescher trouve une substance spécifique du noyau qu'il nomme la "nucléine"

• 1882 (Allemagne) Flemming, van Beneden & Strasburger dessinent les chromosomes lors de la division cellulaire.

• 1883 (Allemagne) Weismann utilise le terme "matériel génétique"

• 1900 (Hollande, Allemagne, Autriche) DeVries, von Tschermak et Correns redécouvrent le travail de Mendel

• 1901 (Allemagne) Kossel découvre les quatre bases nucléiques : Adénine, Guanine, Thymine et Cytosine

• 1903 (Amérique) Sutton fait l’hypothèse que les chormosomes sont le support de l’hérédité

• 1905 (Angleterre) Bateson utilise le terme “genetics” pour l'étude des caractères héréditaires

• 1909 (Danemark) Johannsen propose le mot gène pour remplacer celui de facteur utilisé par Mendel

• 1910 (Amérique) Morgan montre que les gènes sont portés par les chromosomes

• 1919 (Russie) Levene décrit la structure des nucléotides : phosphate-sucre-base

• 1928 (Amérique) Griffith démontre que l’hérédité est donnée par une molécule

• 1933 (France) Brachet démontre que l’ADN est dans les chromosomes

• 1937 (Angleterre) Astbury démontre que l’ADN a une structure en long filament

• 1944 (Amérique) Avery, Mc Leod & Mc Carty montrent que l'ADN est le support des gènes

• 1951 (Amérique) Chargaff établit la règle : [A] = [T] et [C] = [G] pour toute cellule

• 1953 (Angleterre) Franklin & Wilkins montrent que la molécule a la forme d'une double hélice

• 1953 (Amérique, Angleterre) Watson & Crick établissent le modèle moléculaire de l'ADN

• ...

compléter avec :

http://www.medecine.unige.ch/enseignement/dnaftb/

http://www.genoscope.cns.fr/externe/HistoireBM/

https://www.timetoast.com/timelines/genetics-timeline--15

https://www.timetoast.com/search/timelines?cx=partner-pub-3637961829875093%3Aehixnl-dg1y&cof=FORID%3A9&ie=UTF-8&q=genetics&sa=Search&siteurl=localhost%2F&ref=localhost%2Fcategories&ss=

DNA from the begining : http://www.dnaftb.org/

Lettre de Crick à son fils Mickael du 19/03/1953 : https://planet-vie.ens.fr/article/2459/lettre-francis-crick-son-fils-1953#telechargements

frise interactive : https://www.timetoast.com/timelines/dna-17486a4b-a390-4854-8b8b-89fe8efabeb1

ADN, double hélice,

nucléotides (adénine, thymine, cytosine, guanine), complémentarité,

l’information génétique est organisée en gènes constitués d’ADN (acide désoxyribonucléique).

CORRECTION

Exercice 1 Bac Spécialité SVT Métropole 11 septembre 2024 (session de remplacement): Génétique et contraction musculaire

	logique & organisée		complète & exacte		claire & correcte
	Introduction définitions problématique plan Organisation faits & idées 2 à 4 § transitions Conclusion bilan ouverture		MYH7 code une chaîne de la myosine un allèle dominant suffit à provoquer la maladie risque de transmission (≈ 50 %) mutation → myosine anormale → contraction perturbée structure/fonction de la myosine (tête, activité ATPasique, interaction actine-myosine) mécanisme de contraction myosine anormale : mauvaise fixation à l’actine, défaut d’ATPase, force réduite désorganisation des sarcomères / accumulation de myosine anormale effet dominant négatif (la protéine mutée perturbe la normale) Conséquences physiologiques : faiblesse musculaire, myopathie génotype : présence d’un allèle muté dominant phénotype moléculaire : myosine anormale phénotype cellulaire : dysfonctionnement des fibres musculaires phénotype macroscopique : faiblesse musculaire, troubles de la contraction		syntaxe, orthographe, présentation, propreté, soin, illustration vocabulaire	7 6 5 4 3 2 1 0

Exercice 2 deuxième proposition bac Spécialité SVT 15 mars 2021 Métropole - Les climats de la Terre : comprendre le passé pour agir aujourd'hui et demain

	démarche		documents		connaissances		rédaction
	cohérente complète pertinente rigoureuse Introduction définitions problématique plan Organisation faits & idées 2 à 4 § transitions Conclusion bilan ouverture		doc.1 : graphe données niveau marin diminue de ~ 60 m ↓T°C δ18O augmente de ~ 1‰ ↓T°C [CO2] diminue de ~ 300 ppm ↓Effet serre [CO2] seuil glaciation antarctique doc.2 : carte courants antarctique ouverture passage de Tasmanie <86Ma ouverture passage de Drake <34Ma création du courant froid circumpolaire doc.3 : tableau albédo glace et neige > sable, mer, .... doc.4+5 : équations/log stratigraphique Eocène : sédimentation détritique forte = libère CO2 volcanisme = libère du CO2 Oligocène : altération des roches = piège à CO2 photosynth. mat.orga.pélites = piège CO2 discordance		phosphatières Valdro baisse de température augmentation glaces pôles baisse effet serre courant froid polaire circulation circumpolaire boucles de rétroactions amplification albédo Orogénèse alpine Importante altération des reliefs Consommation de CO2 baisse du CO2 atmosphérique Diminution de l'effet de serre Refroidissement global Mécanismes amplificateurs (albédo, solubilité du CO2)		syntaxe, orthographe, présentation, propreté, soin, illustration vocabulaire	8 7 6 5 4 3 2 1 0

text read 6'56 : https://www.nationalgeographic.com/history/article/neanderthal-fetus-bottleneck What a 55,000-year-old fetus reveals about the decline of Neanderthals

By sequencing ancient DNA from the fetus, scientists revealed a severe genetic bottleneck that reshaped Neanderthal history long before they vanished. ByTom Metcalfe Published March 23, 2026

video 4'20 : https://youtu.be/FMc81qpCQ3g?si=jmUPyxxXDsTJRbhw Who were the neanderthals? Do humans really share some of their DNA? Learn facts about Neanderthal man, the traits and tools of Homo neanderthalensis, and how the species fits into our evolution story.

Fossil fuels

video 4'40: https://youtu.be/e9wiM_mUbXU What is oil even made of? Here's how fossil fuels form in the ocean and how scientists know where to find it.

text : https://www.livescience.com/9404-mysterious-origin-supply-oil.html

Zero Gravity, Zero Gain: The Genetics Behind Muscle Loss in Space

Simulated microgravity in mice reveals a constellation of genes that may influence muscle weakening during spaceflight.

Kamal Nahas, PhD Jan 29, 2024 | 4 min read

Floating through the weightlessness of space, astronauts seldom need to flex their muscles. Slowly diminishing in size and strength, their wasting muscles struggle to support their weight when they return to Earth.¹ Space travel’s next frontiers require long-haul odysseys, leaving scientists to contend with the toll of prolonged spaceflight on human anatomy. “Some people lose a ton of bone and muscle, and other individuals lose very little, so that suggests that, not surprisingly, genetic diversity plays a role,” said Henry Donahue, a biomedical scientist at Virginia Commonwealth University. Reporting in npj Microgravity, Donahue and his team placed genetically distinct mice in simulated gravity to explore whether genes influence muscle loss.² They found that some mice were more susceptible to muscle loss, but they spotted three genes that showed disrupted expression across all strains.

“Clearly this has implications for spaceflight and any future plans on inhabiting any sort of planets, including Mars,” said Stefan Judex, a biomedical engineer at Stony Brook University who was not involved with the work. However, Judex noted, “It must be viewed as a first step simply because this is a mouse study and not a human study.” 

In a previous animal study, scientists searched for the genetic culprits behind muscle weakening, but they used a single strain in order to limit unexplainable variation in the results.³ “That’s like doing a clinical trial on one person,” Donahue noted. Instead, his team used eight genetically distinct mouse strains to explore muscle loss across a diverse population.

248 words

https://www.the-scientist.com/news/zero-gravity-zero-gain-the-genetics-behind-muscle-loss-in-space-71612

phylogène : collection "Homininés"

1. sélectionner la collection "Homininés"

2. consulter les informations de quelques fossiles

3. comparer les fossiles

4. construire une matrice

5. polariser les états de caractères

6. trouver les états primitifs

7. choisir le taxon extragroupe

8. colorer les états primitifs suivant l'extragroupe

9. coder les états dérivés en colorant les cellules

10. trier la matrice, organiser le tableau

11. établir des parentés pour obtenir un arbre

12. organiser les données paléonthologiques

13. réaliser un compte-rendu

Il reposait à plus de 2.500m de profondeur depuis cinq siècles : le « coffre au trésor » d’une épave de bateau remonté à la surface par la Marine nationale au large de Cavalaire

En mars 2025, la Marine nationale découvrait au large de Cavalaire une épave par 2.500 mètres de profondeur. Un an plus tard, elle est retournée sur les lieux du naufrage, cette fois accompagnée du Drassm. Reportage.

Pierre-Louis Pagès CRÉÉ LE 28 avril 2026 • 04:45 MIS À JOUR LE 28 avril 2026 • 09:11

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https://www.nicematin.com/societe/sciences/immergees-a-plus-de-2-500-m-depuis-cinq-siecles-des-poteries-remontees-a-la-surface-par-la-marine-nationale-au-large-de-cavalaire-1067851

 

5,1,3/ Climats du passé

1/ climat paléozoïque = ère primaire : Cam Or Si De Ca Pe

Reconstituer l’extension de la glaciation permienne à partir de la distribution des tillites.

Reconstituer un paléoclimat local à partir d’une variété d’indices paléontologiques ou géologiques en tenant compte de la paléo-latitude (ex : paléobiocénose des forêts carbonifères de Montceau-les-Mines par rapport à d’autres indices localisés à d’autres endroits de la planète).

Manuel p.306

Tillite : (moraine consolidée) conglomérat d'origine glaciaire, constitué d'éléments mal classés, emballés dans une matrice argilo-sableuse, signalant une période de glaciation.

https://www.profsvt71.fr/pages/terminale-spe-svt/les-climats-de-la-terre/variations-climatiques-anciennes.html

Moraine : amas de débris rocheux, érodé et transporté par un glacier ou par une nappe de glace.

pierres qui bougent : https://www.pourlascience.fr/sd/geosciences/le-mystere-des-pierres-mouvantes-elucide-11998.php

La forêt marécageuse de Montceau-les-Mines il y 300 millions d'années : http://blog.ac-versailles.fr/stratetik/public/e_education/XiaMontceau_les_Mines/XiaMontceau_les_Mines/La_foret_mareca_material.html

reconstitution paléotectonique : https://dinosaurpictures.org/ancient-earth/view/Dacentrurus#0

en video : https://youtu.be/g_iEWvtKcuQ?si=HG4lMJWCiJ4D8fmJ

17 avril

Au Paléozoïque, des indices paléontologiques et géologiques, corrélés à l’échelle planétaire et tenant compte des paléolatitudes, révèlent une importante glaciation au Carbonifère-Permien. Par la modification du cycle géochimique du carbone qu’elles ont entraînée, l’altération de la chaîne hercynienne et la fossilisation importante de matière organique (grands gisements carbonés) sont tenues pour responsables de cette glaciation.

2/ climat mésozoïque = ère secondaire = Trias – Jurassique - Crétacé

Manuel p.304

la zone de répartition des coraux remonte au-delà des latitudes 30°N et 30°S, ce qui indique une étendue plus importante des zones équatoriales et tropicales par rapport à l’actuel. Il faut donc tenir compte de cette observation pour l’interprétation des données des autres documents de cette étude.

Concernant les évaporites du Crétacé : on les trouve aujourd’hui en Amérique du Sud, en Afrique du Nord et du Sud mais aussi en Inde et en Chine. Ces continents avaient une répartition géographique différente au moment de la formation de ces roches, ils occupaient des latitudes plus hautes. les évaporites se forment en climat aride, ce qui signifie que des climats arides devaient régner au Crétacé aux hautes latitudes, traduisant une époque plus chaude que l’actuel.

Le même raisonnement peut être mené à l’identique pour les autres roches. Leurs conditions de formation sont déterminées par principe d’actualisme et l’on sait sous quel climat elles se forment. En connaissant la position des continents au Crétacé, donc le lieu de formation des roches, on peut connaître les conditions climatiques qui régnaient à telle latitude à cette période, donc caractériser l’étendue des zones climatiques et, par extension, la moyenne des températures terrestres définissant le Crétacé comme une période chaude.

La teneur en CO2 de l’atmosphère par rapport à la teneur actuelle. On constate que cette concentration atmosphérique est 5 fois plus élevée au Crétacé qu’actuellement, ce qui laisse penser que l’effet de serre important qui en découle a nécessairement engendré une augmentation des températures. L’une des hypothèses concernant ce taux élevé de CO2 est que ce dernier serait issu de l’activité volcanique intense des dorsales océaniques. Ainsi, le fractionnement de la Pangée et son accentuation au Crétacé engendre un dégazage de CO2 dans l’atmosphère, lui-même responsable d’une augmentation de l’effet de serre et, par conséquent une élévation des températures.

la mise en place du courant circumpolaire grâce à l’ouverture du détroit de Drake, il y a 35 millions d’années c’est-à-dire après le Crétacé. Ce courant est considéré comme un super-régulateur des températures océaniques mondiales et, par entraînement, un régulateur climatique. Actuellement, il permet le mélange rapide, à l’échelle des temps géologiques, des eaux en provenance des trois océans à répartition latitudinale importante. Ce qui a pour effet de niveler les températures dans l’espace et dans le temps.

Au Crétacé, la liaison entre l’Amérique du Sud et l’Antarctique, visible sur le document , ne permet pas la mise en place d’un tel courant. Les eaux de chaque océan ne se mélangent pas et n’ont pas le temps de se refroidir en tournant pendant un certain temps aux hautes latitudes soumises à de faibles températures. Il en résulte sans doute une augmentation de la température des océans, ce qui aura également un impact sur la température de l’atmosphère. Ces deux phénomènes, servant ici d’exemples, ne sont pas exhaustifs et ont même très certainement agi en synergie. Ils sont tous deux induits par la tectonique des plaques qui, en fragmentant la Pangée, transforme la face du monde et l’équilibre fragile qui régnait précédemment.

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Tectoglob3D : https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/tectoglob3d/

Pour afficher la carte, sélectionner « données affichées » puis « calques intégrés » puis « Âge du plancher océanique ». Pour effectuer les mesures, sélectionner « Actions » puis « Mesurer une longueur ».

Quelques valeurs obtenues sur Tectoglob3D pour l’océan Atlantique :

	Jurassique	Crétacé	Cénozoïque
Durée (Ma)	40	40	60
Largeur des fonds créés (km) à +25°N	970	1 550	1 800
Vitesse moyenne d’expansion (km/Ma)	24	39	30
Largeur des fonds créés (km) à –35°S	650	2100	2470
Vitesse moyenne d’expansion (km/Ma)	16	53	41

Utiliser les connaissances acquises sur la géodynamique interne et la tectonique des plaques pour comprendre leur rôle sur le climat et mettre en relation la nature des roches formées avec les paléoclimats du Crétacé.

modèle explicatif du climat au Crétacé :

1. époque de séparation des masses continentales & d'expansion océanique

2. forte activité magmatique (dorsales)

3. dégazage de CO₂ (dorsales)

4. augmentation de la teneur atmosphérique en CO₂

5. augmentation de l'effet de serre

6. réchauffement global

Au Mésozoïque, pendant le Crétacé, les variations climatiques se manifestent par une tendance à une hausse de température.

Du fait de l’augmentation de l’activité des dorsales, la géodynamique terrestre interne semble principalement responsable de ces variations.

3/ climat cénozoïque = ère tertiaire = paléo-néogène

Manuel p.302

Le document 1 permet de comprendre comment reconstituer les caractéristiques du climat et de l’atmosphère sur des temps anciens. Pour ce faire, les chercheurs utilisent des données scientifiques afin de construire des modèles.

Données scientifiques (registre empirique) :

• sédimentologiques

• isotopiques (δ¹⁸O des foraminifères benthiques)

• isotopiques du carbone dans les sédiments carbonatés

Modèle de Reconstitution

• des calottes polaires

• de la température des eaux profondes

• de la teneur atmosphérique en CO₂

Les modèles montrent qu’à partir d’un optimum climatique au début de l’Éocène, un refroidissement progressif a lieu durant tout le restant du Cénozoïque. Ce refroidissement est corrélé à une diminution de la teneur atmosphérique en CO₂.

Le document 2 aborde un des mécanismes géologiques intervenant dans le cycle du carbone : l’altération des roches continentales. Ce mécanisme a déjà été étudié en classe de seconde. Ici, il s’agit de comprendre son effet sur la teneur atmosphérique en CO₂.

la réaction 1, correspond à l’hydrolyse du plagioclase en un minéral argileux, la kaolinite, et en ions solubles calcium et hydrogénocarbonate. Cette réaction consomme du CO₂ atmosphérique dissous dans l’eau. Le devenir des ions solubles est présenté par la précipitation biochimique des carbonates selon la réaction 2, produisant du CO₂. Le bilan des deux mécanismes aboutit à une consommation de CO₂.

Le document 3 permet de montrer l’importance du phénomène d’altération des roches au Cénozoïque. Le document A illustre la relation entre formation de reliefs et altération à travers les cônes d’alluvions issus de l’érosion des reliefs himalayens dans la plaine de l’Indus. L’activité pratique (document B) permet de remobiliser les acquis sur le passé géologique de la Terre en observant, grâce au module « Disposition passée des continents » de Tectoglob3D, le déplacement des masses continentales et la formation de la ceinture orogénique alpine au Cénozoïque. Enfin, l’histogramme C présente une estimation de la masse de sédiments issus de l’altération et de l’érosion des reliefs. On observe une augmentation de celle-ci depuis 30 Ma.

Tectoglob3D : https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/tectoglob3d/

Les cartes paléogéographiques du document 4 apportent des informations sur les relations entre la disposition des masses continentales, la circulation océanique et ses impacts climatiques.

1. On observe depuis le début de l’Éocène un refroidissement progressif du climat d’environ 16 °C avec formation des calottes polaires dès la fin de l’Éocène pour l’hémisphère sud et au Pliocène pour l’hémisphère nord. Ce refroidissement est corrélé à une diminution importante de la teneur en CO₂ dans l’atmosphère.

2. D’après le document 3, la dynamique des masses continentales a entraîné au Cénozoïque la formation de la ceinture orogénique alpine, dont l’altération a été importante. L’altération des roches constituant ces reliefs, couplée à la précipitation des carbonates a provoqué une diminution de la teneur atmosphérique en CO₂ suivant le bilan : 2 CaSi₂Al₂O₈ + 2 CO₂ + 4 H₂O → Si₄O₁₀Al₄(OH)₈ + 2 CaCO₃

3. La diminution de la teneur atmosphérique en CO₂ a entrainé, par diminution de l’effet de serre, un refroidissement climatique global.

graphanimé : https://youtu.be/8KOPl1a_eho?si=cs6r__qG12tS_bv7 The history of atmospheric CO₂ levels over the last 60 million years alongside potential pathways of future CO₂ change. Data are from a study led by Earth and Environmental Scientists at University of St Andrews, available at https://www.annualreviews.org/doi/abs...

Les climats du Cénozoïque : https://actugeologique.fr/2019/03/les-glaciations-du-cenozoique/

Dynamique des masses continentales au Cénozoïque

Modification de la circulation océanique globale : Passage d'une circulation équatoriale à une circulation circumpolaire et méridienne

1. Formation de la ceinture orogénique alpine

2. Importante altération des reliefs

3. Consommation de CO₂

4. Diminution du CO₂ atmosphérique

5. Diminution de l'effet de serre

6. Refroidissement global

7. Mécanismes amplificateurs (albédo, solubilité du CO₂)

Globalement, à l’échelle du Cénozoïque, et depuis 30 millions d’années, les indices géochimiques des sédiments marins montrent une tendance générale à la baisse de température moyenne du globe. Celle-ci apparaît associée à une baisse de la concentration atmosphérique de CO₂ en relation avec l’altération des matériaux continentaux, notamment à la suite des orogénèses du Tertiaire.

4/ climat quaternaire

Mettre en évidence l’amplitude et la période des variations climatiques étudiées à partir d’une convergence d’indices.

Rassembler et confronter une diversité d’indices sur le dernier maximum glaciaire et sur le réchauffement de l’Holocène (changement de la mégafaune dans les peintures rupestres, cartographie des fronts morainiques, construction et utilisation de diagrammes polliniques, terrasses, paléoniveaux marins…).

Discuter de l’existence d’indices pas toujours cohérents avec l’amplitude, la période et la temporalité des variations climatiques pour des raisons résolues (exemples des terrasses fluviatiles) ou encore à résoudre (petit âge glaciaire).

Manuel p.300

dossier Google earth d'origine : https://svt.ac-versailles.fr/spip.php?article286

http://svt.ac-besancon.fr/bac-s-septembre-2020-metropole/ Bac S – Sujet de SVT – Session Septembre 2020 – Métropole - 2ème PARTIE – Exercice 2 (5 points)

cartes des sites archéologiques : https://www.google.com/maps/d/u/0/viewer?mid=1F0dGVVuKUQBoHEuE98rpZMwwNI0&hl=en_US&ll=43.92991481311158%2C10.00391080956803&z=6

https://www.google.com/maps/d/u/0/viewer?mid=15EgKa_2TI9UnuFtbVNRK_v5UU2I&hl=en_US&ll=43.06487401920962%2C0.9524286164400619&z=8

http://rupestre.on-rev.com/styled-2/

https://www.hominides.com/art-prehistorique/art-parietal/

À l’échelle du Quaternaire, des données préhistoriques, géologiques et paléo-écologiques attestent l’existence, sur la période s’étendant entre -120 000 et -11 000 ans, d’une glaciation, c’est-à-dire d’une période de temps où la baisse planétaire des températures conduit à une vaste extension des calottes glaciaires.

Les témoignages glaciaires (moraines), la mesure de rapports isotopiques de l’oxygène dans les carottes polaires antarctiques et les sédiments font apparaître une alternance de périodes glaciaires et interglaciaires durant les derniers 800 000 ans.

Les rapports isotopiques montrent des variations cycliques coïncidant avec des variations périodiques des paramètres orbitaux de la Terre. Celles-ci ont modifié la puissance solaire reçue et ont été accompagnées de boucles de rétroactions positives et négatives (albédo lié à l’asymétrie des masses continentales dans les deux hémisphères, solubilité océanique du CO₂) ; elles sont à l’origine des entrées et des sorties de glaciation.

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