mercredi 1 avril 2026

3/ evolutions non génétiques

quelle est votre définition du mot "culture" ?

Vers 1950, des chercheurs distribuaient des patates douces aux macaques sur la plage de l'îlot japonais de Koshima. Un jour, Imo, une petite femelle eut l'idée d'aller laver sa patate dans l'eau. Dans les mois qui suivirent, plusieurs de ses compagnons firent de même. Quelques années plus tard, presque tous les membres du groupe étaient capables de laver leurs aliments. Seuls ceux qui avaient plus de dix ans lors de la découverte n'ont jamais appris. Par la suite, la tradition s'est transmise de la mère au petit.

le chimpanzé mange une plante de la famille des phytolaccacées reconnue pour ses vertus thérapeutiques et largement utilisée dans l’industrie pharmaceutique. Depuis une vingtaine d’années, les observations d’automédication chez les animaux s’accumulent, principalement chez les primates.

Les innovations culturelles se sont révélées déterminantes dans l’évolution des premiers hominidés. Des préhistoriens, dont Sandrine Prat, ont ainsi montré que les premiers outils trouvés dans la lignée humaine, au sens large, existaient bien avant la lignée Homo et étaient contemporains des australopithèques.


le cacatoès de Goffin, endémique de l’Indonésie, taille un bâtonnet dans du carton pour attraper des noix de cajou . Son cousin le cacatoès noir était déjà connu pour signaler son territoire et son nid en jouant de la batterie avec des bâtonnets , remarque Alice Auersperg, de l’université de Vienne. Mais le cacatoès de Goffin est un véritable artisan : après plusieurs essais, il parvient à tailler son instrument pile à la bonne longueur pour faire tomber, au travers d’une fente, sa récompense : un morceau de noix de cajou piégé dans une cage de verre.

De nouvelles expériences montrent que les corbeaux sont disposés à renoncer à une récompense immédiate de manière à en obtenir une meilleure plus tard.

Un exemple bien connu de transmission culturelle chez l'animal date des années trente en Angleterre. A l'époque le lait était livré en bouteilles laissées sur le pas de la porte. Les bouteilles étaient fermées par un opercule en carton, et, le lait n'étant pas homogénéisé comme maintenant, la crème montait en surface.

Des clients d'un certain quartier de Londres se sont mis à se plaindre que les bouteilles étaient "écrémées" au matin. Apparemment le coupable était une mésange bleue (Parus caeruleus) qui s'était mise à ouvrir les bouteilles en "pelant" le carton, pour voler la crème.

Les plaintes des clients se sont étendues depuis le point original (Londres) à une bonne partie du sud de l'Angleterre (et à une deuxième espèce de mésange, la mésange charbonnière, Parus major), indiquant que d'autres mésanges suivaient l'exemple de la première. Un peu avant 1950, ce pillage fut stoppé par des changements dans la technique d'emballage du lait.

On a donc assisté à la naissance d'une tradition "culturelle" née chez un individu et se répandant dans la population; cette tradition a pu se répandre assez facilement car elle repose sur un comportement préexistant: les mésanges mangent entre autres des larves d'insectes qu'elles attrapent sur les arbres en pelant l'écorce. Le comportement qui consiste à "peler" un obstacle fait donc partie du répertoire comportemental de ces animaux.

Développement des chants des oiseaux

"Les oiseaux doivent apprendre en copiant un tuteur qui est en principe leur père. Cet apprentissage démarre quand l’oiseau est presque mature. Il développe alors un chant qui contient sa signature et celle de son espèce. On peut presque parler de culture animale. Qui dit copie dit erreur de copie.

Si des individus partent avec une erreur de copie créer d’autres colonies, alors les risques de divergence apparaissent. Les femelles d’une des populations risquent de ne plus comprendre certains mâles. La reproduction n’étant plus possible alors il y a spéciation. " Nicolas Mathevon, professeur de Biologie à l’Université Jean Monnet de Saint Étienne

Konrad Zacharias Lorenz (Vienne, 7 novembre 1903 - Vienne, 27 février 1989), biologiste et zoologiste autrichien titulaire du prix Nobel de physiologie ou médecine. La suite d'expérimentations de cet éthologue mettra en évidence le principe d'imprégnation (ou d'empreinte psychologique).

« empreinte » : processus d’apprentissage mis en jeu pendant le développement des jeunes et qui produit une modification durable d’un comportement. Cette empreinte pourrait être héritable, bien qu’elle ne soit pas génétique. Cette héréditabilité ne se fera que si l’empreinte affecte la valeur sélective.

Chez certains animaux, les comportements acquis peuvent être transmis d’une génération à l’autre par voie non génétique, et constituer une source de diversité : ainsi

  • du chant des oiseaux,

  • de l’utilisation d’outils dans des populations animales,

  • de la culture notamment dans les sociétés humaines.

Ces traits sont transmis entre contemporains et de génération en génération, et subissent une évolution (apparition de nouveaux traits, qui peuvent être sélectionnés, contre-sélectionnés ou perdus par hasard).

Manuel p.228-29


Certains caractères sont transmis de manière non génétique : microbiote, comportements appris dont la langue, les habitudes alimentaires, l’utilisation d’outils…

3/ Microscopie électronique

Observer et analyser des images de microscopie électronique.

ultrastructure cellulaire

1 mm = 1 000 µm = 1 000 000 nm : http://www.cellsalive.com/howbig.htm

mitochondries : https://bio.m2osw.com/gcartable/mitochondrie.htm

chloroplastes : http://fr.wikipedia.org/wiki/Image:Plast.JPG

organites cellulaires : http://tristan.ferroir.fr/wp-content/The_illuminated_cell.jpg

cellule végétale, animale : http://www.cellsalive.com/cells/cell_model.htm

unicellulaires / pluricellulaires

Ȼ+organite, chloroplaste, mitochondrie

eucaryote ou procaryote

Chez les organismes unicellulaires, toutes les fonctions sont assurées par une seule cellule. Chez les organismes pluricellulaires, les organes sont constitués de cellules spécialisées formant des tissus, et assurant des fonctions particulières.

mardi 31 mars 2026

Complexes sans gène ... La complexification des génomes sans transfert de gène existe dans la nature

4,2,2/ Relations biotiques

1/ Typologie des relations hétérospécifiques

hétérospécifiques [entre différentes espèces]

  • bénéfique, neutre ou néfaste,

  • inter- ou intraspécifique

  • extra- ou intracelluaire

  • obligatoire ou facultative

  • occasionnelle ou permanent

  • directement (ex prédateur-proie) ou indirectement (ex ressource commune)

  • => coévolution induite par ces échanges

Relation

Hôte

cible

effet

obligatoires=stricte (exemples)

facultatives (exemples)

Neutralisme

0

0

neutre

musaraigne & cerf dans une forêt

0

Symbiose Mutualisme Coopération


+

+

synergique

corail & zooxanthelles , lichens, héron pique bœuf, coccinelle

mycorhizes, nodosités, plantes nectarifères entomogames & insectes nectarivores pollinisateurs

Commensalisme

0

+

bénéfique

Remora, microbiote

poisson clown & anémone,

certains mulots cohabitent avec des blaireaux, certaines chouettes nichent dans les cavités creusées et laissées par les pics noirs.

Amensalisme

0

+

néfaste

le noyer produit des inhibieurs de croissance interdisant tout autre végétal sous sa ramure

la truffe produit des substance supprimant tout végétal autour de l'arbre (brulis de truffe)

Parasitisme

-

+

néfaste

tique, puceron, puce

& mammifère ; Coucou ; oïdium, mildiou, .... la graphiose de l’orme (champignon Ophiostoma ulmi)


Prédation

-

+

néfaste

chat&souris, coccinelle&puceron

plante carnivore

Compétition

-

-

néfaste

Vulpes vulpes & Buteo buteo

Quercus robur & Fagus sylvatica

parasitisme : [du grec para : contre, à côté] aux dépens d'un hôte , de façon permanente ou pendant une phase de son cycle vital.

commensalisme : [du latin cum- : avec + mensa : table] « compagnon de table » association fréquente ou systématique entre deux êtres vivants dans laquelle l'hôte fournit une partie de sa nourriture au commensal qui ne lui nuit et ne le dérange pas ; il n’obtient en revanche aucune contrepartie évidente de ce dernier

mutualisme : [du latin mutuus, réciproque, qui s'échange]

symbiose : [du grec βίος bio : vie + σύν syn : ensemble] association à bénéfice réciproque, obligatoire ou permanente, de deux ou plusieurs organismes différents, mutuellement bénéfique, voire indispensable à leur survie. La symbiose est un cas particulier de mutualisme.

Endosymbiose  => intracellulaire

Ectosymbiose  => extracellulaire

https://www.mnhn.fr/fr/alerte-presse/des-liens-inattendus-entre-plantes-et-truffes

https://www.maxicours.com/se/cours/les-interactions-au-sein-d-un-ecosysteme/

https://biodiversite-foret.fr/2022/12/21/les-interactions-biotiques-ou-comment-vivre-ensemble/

https://www.supagro.fr/ress-pepites/processusecologiques/co/RPop.html

2/ Différentes types de symbioses

ex : Oophila amblystomatis & Ambystoma maculatum

manuel p70

Endo ou ecto symbiose


Les endosymbioses transmises entre générations, fréquentes dans l’histoire des eucaryotes, jouent un rôle important dans leur évolution. Le génome de la cellule (bactérie ou eucaryote) intégré dans une cellule hôte régresse au cours des générations, certains de ses gènes étant transférés dans le noyau de l’hôte.

3/ Origine endosymbiotique des plastes eucaryotes

  • Mettre en oeuvre une méthode permettant de comprendre les arguments qui ont conduit à considérer que les organites énergétiques sont issus de symbioses dans la lignée des eucaryotes.


Manuel p72 en devoir type bac

Histoire de la théorie endosybiotique

1869 : Antoine Béchamp (1816-1908) auteur d'une théorie sur les « microzymas ».

1879 : Patrick Geddes (1854-1932) décrit le ver vert de Roscoff

1880 : Richard Altman (1852-1900) découvre les mitochondries

1883 : Andreas Schimper (1856-1901) découvre des plastes dans la cellule végétale

1883 : Karl Brandt décrit les Xanthelles symbiotes des coraux

1905 : Constantin Mereschkowsky (1855-1921) invente le terme symbiogénèse

1918 : Paul Portier (1866-1962) énonce la théorie des symbiotes

1919 : Auguste Lumière (1862-1954) le mythe des symbiotes

1925 : Edmund Wilson (1856-1939) déclare la théorie infondée

1937 : Hans Krebss (1900-1980) cycle biochimique d’oxydation du carbone

1950 : Melvin Calvin (1911-1997) cycle biochimique de réduction du carbone

1970 : Lynn Margulis (1938-2011) démontre l’endosymbiose des plantes


Arguments en faveur le la théorie endosymbiotique eucaryote :

  • Exemples d’endosymbioses héritées nombreux

  • les deux mb des plastes sont différentes : membrane interne + des thylacoïdes présentent des analogies avec les membranes bactériennes.

  • Les mb mitochondriales contiennent des cardiolipides, les mb de plastes contiennent des galactolipides et sulfolipides, absents des des membranes eucaryotes mais présents dans les mb procaryotes

  • => Double membrane = celle du procayote initial + celle du phagosome

  • matrice et stroma contiennent de l'ADN et des ribosomes

  • gènes communs mito-αprotéobactéries, plastes-cyanobactéries

  • ADN du chloroplaste est circulaire et non associé à des histones # chez les bactéries,

  • ADN code pour une partie des protéines chloroplastiques (organites semi autonomes),

  • une partie de la synthèse de protéines chloroplastiques s'effectue dans le chloroplaste, grâce à la présence de ribosomes qui présentent des analogies avec les ribosomes bactériens,

  • Respiration dans αprotéobactéries (genre Rhizobium) libres # mitochondries

  • Photosynthèse dans cyanobactéries libres # chloroplastes

  • Phytochromes molécules codées par le noyau mais originaires de cyanobactéries

  • Synthèse de cellulose, molécules de la paroi eucaryote, est dues aux bactéries

  • Les plantes possèdent 1 gène sur 10 venant de cyanobactéries

  • tout plaste provient d'un plaste préexistant. Lorsque des cellules ne possèdent pas de plaste (certains cellules blanches de feuilles panachées), les cellules filles ne possèdent pas de plaste,

  • la division des chloroplastes suit un rythme indépendant de la division du noyau,


comparaison de gènes de plastes et eucaryotes sur https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/geniegen2/

sélectionner les séquences "endosymbiose"


Lendosymbiose est à l’origine des mitochondries et des chloroplastes, organites contenant de l’ADN. L'évolution d'une symbiose peut conduire à la fusion des deux symbiotes en un seul individu. Une symbiose peut être héritée. C'est ainsi qu'on explique la naissance des eucaryotes dans l'histoire de la vie : la fusion de procaryotes a donné des eucaryotes, hétérotrophes sans chloroplastes, autotrophes avec des chloroplastes. L'endosymbiose avec des protéobactéries a donné les mitochondries, avec des cyanobactéries a donné les chloroplastes.


netographie

vendredi 27 mars 2026

4,2/ LA COMPLEXIFICATION DES GÉNOMES PAR ÉCHANGES ENTRE ESPÈCES

Objectifs : il s’agit de comprendre ici que des mécanismes non liés à la reproduction sexuée enrichissent les génomes de tous les êtres vivants.

Liens : SVT – classe de seconde : la cellule différenciée ; les organites.

Misensit°

en VO : https://youtu.be/rdro1Eq9VMg

https://youtu.be/kP8KWVs XK3k

D’où vient le pouvoir de Spiderman ?

Les échanges de gènes relèvent-ils de la fiction ?

4,2,1/ Transferts de gènes

1/ Transferts horizontaux de gènes

  • Étudier des expériences historiques mettant en évidence la transformation bactérienne.

Manuel p.64

1928 Griffits : video 2'52 : https://youtu.be/d18t2fShMdQ?si=lK6-R86-Ql8Nl3F-

1944 Avery Mc Leod Mc Carty : video 6'07 : https://youtu.be/uVfW48pUlyY?si=szqk5mwTWip-UwuT

1955 : Hershey & Chase : video 2'44 : https://youtu.be/t0Y0llOWLho?si=q4hq_5X0CHXMWWNd


Des échanges de matériel génétique, hors de la reproduction sexuée (transferts verticaux), constituent des transferts horizontaux. Ils se font par des processus variés (vecteurs viraux, conjugaison et transformation bactérienne…). Les transferts horizontaux sont très fréquents et ont des effets très importants sur l’évolution des populations et des écosystèmes.


2/ Transgénèse pour fabrique d’OGM

  • Comprendre comment la connaissance des mécanismes des transferts horizontaux permet des applications biotechnologiques (notamment la production de molécules d’intérêt dans les lignées bactériennes).

Rappel de 1ères+2nde / transgénèse & OGM

voir chap 2,4,1,3

L’universalité de l’ADN et l’unicité de sa structure dans le monde vivant autorisent des échanges génétiques entre organismes non nécessairement apparentés.


3/ Traces de transferts chez l’humain

video 3' : https://www.arte.tv/fr/videos/087419-026-A/tu-mourras-moins-bete/ transfert de gènes

  • Recenser des informations attestant l’existence de transferts horizontaux de gènes dans l’histoire du génome humain.

  • Extraire et organiser des informations d’un arbre phylogénétique pour identifier l’importance des transferts horizontaux.

p.66-67 syncytine

TP Genigen : https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/geniegen2/

comparez les gènes des syncytines humaines et virale : chargez les séquences puis alignez puis affichez le tableau de comparaison

http://vandenschrick.free.fr/LYCEE/3TermSPE/T1/T1/Chap2/1A-7 (TP) Syncytines 2.pdf

http://m.pourcher.free.fr/2018/TermSPE/THEME1A/TP4-Complexification-genomes.pdf

http://langevin.svt.free.fr/Site_SVT/genome_TP5_files/TP5b.pdf

Les pratiques de santé humaine sont concernées par les transferts horizontaux de gènes (propagation des résistances aux antibiotiques).

CR /4 : taille séquences, tableau classé, phenogramme classé, comparaison onto/phylo

familles multigéniques, phylogénèse, ontogénèse

Évaluation

observations au microscope

Is It Alive?

text 300 words : https://learn.genetics.utah.edu/content/cells/insideacell20/ Basic Life Functions

video 7'56 : https://youtu.be/cQPVXrV0GNA?si=2h9c_3ZP9o_zezzw Life is difficult to define, but there are characteristics of life that can be explored! Join the Amoeba Sisters as they explore several characteristics of life. Click "show more" to expand video details to see table of contents & additional information. 👇 We chose not to give a numerical value for how many characteristics of life there are, because we do not want to imply that what we are listing must be a specific order, or that it cannot be expanded upon or include exceptions. Additionally, characteristics can also certainly be titled differently. Our goal is to promote thought and discussion about what it means for an organism to be alive as well as provide characteristics of life that can be explored when trying to study living things.

scale of life organisation : https://www.biologyexams4u.com/2013/02/the-characteristics-of-living-things.html

definitons & quizz : https://www.biologyonline.com/dictionary/life

game-card : https://learn.genetics.utah.edu/content/cells/alive/ : Is It Alive?

virtual scale : https://learn.genetics.utah.edu/content/cells/scale/ : Cell Size and Scale

jeudi 26 mars 2026

T. rex had lips, upending its enduring pop culture image

Whether carnivorous dinosaurs had lips has long been the stuff of palaeo-debate. A new study finds evidence that flesh covered the predators’ teeth.

By Riley Black

Published 31 Mar 2023, 14:55 BST

The fearsome jaws of Tyrannosaurus are famous. In museum halls, palaeo art, and even feature films such as Jurassic Park, the Cretaceous carnivore has traditionally been depicted with banana-size fangs and a sinister grin. But palaeontologists have now discovered that the living animal did not have a sharp-toothed smirk—T. rex, as well as many other carnivorous dinosaurs, had lips.

Reported today in Science, a multi-institution team of palaeontologists propose that carnivorous dinosaurs like T. rex and Allosaurus had fleshy lips covering their teeth, much as modern-day lizards do. The hypothesis will likely alter both the public image of dinosaurs as well as how palaeontologists study the ways these terrible lizards fed.

The new research got its start as discussions between co-authors Thomas Cullen, Kirstin Brink, and Derek Larson while all three were graduate students at the University of Toronto. Each had developed different expertise on dinosaurs and their anatomy, which began to meld together into tangible evidence for how dinosaurs like T. rex would have looked. (Read how billions of T. rex likely roamed Earth.)

Whether or not dinosaurs had lips has been a matter of debate among dinosaur fans and some experts for years. The arguments have often centered on whether the addition of lips, like fluffy body coverings, made dinosaurs less impressive and frightening to their adoring fans than the traditional, toothy renditions, and what evidence might justify such a change. The new study finally offers some tangible evidence to resolve the issue, moving beyond aesthetics to the biology of the extinct animals.

“There is a lot of interpretation in palaeo art. It’s nice to offer some scientific data to back it up,” says Brink, now a palaeontologist at the University of Manitoba.

286 words


https://www.nationalgeographic.co.uk/science-and-technology/2023/03/t-rex-had-lips-upending-its-enduring-pop-culture-image

4/ Familles multigéniques

phylogenese des globines : rendre un compte rendu écrit

  1. Chargez les gènes des globines. Quelle taille a chaque séquence ?

  2. Choisir HBA comme référence en cliquant sur la flèche. Aligner les séquences (AltA : le logiciel compare chaque séquence à celle de référence et met en face toutes le portions identiques, pour mettre en évidence toutes les différences). Afficher le tableau de comparaison (AltT : le logiciel calcule le % d'identité entre chaque séquence et donne une matrice). Classez les différentes globines dans les séquences chargées en fonction de leur % similitude / différence. Recopiez le tableau classé.

  3. Afficher, vérifiez puis Recopiez le phénogramme (AltP : le logiciel calcule la phylogénèse des molécules en fonction de leur pourcentage de similitude, homologie)

  4. Comparez le phénogramme (phylogénèse) avec l'ordre d'appartion des globines dans l'embryogénèse (ontogénèse).

Chez les mammifères, 4 globines s'associent pour former l'hémoglobine, 2 sous-unités de deux types différents . Les gènes fonctionnels ne sont pas les même au cours de la vie. Les chaînes α et ξ ont une séquence primaire très ressemblante de 141 aminoacides. Les chaînes β, ε, δ et γ sont également très ressemblantes. Il y a 10 acides aminés différents entre β et δ (sur 146) et 37 entre β et γ. La myoglobine diffère des sous-unités alpha et bêta de l'hémoglobine, plus que celles-ci ne diffèrent l'une de l'autre, ce qui indique que la myoglobine a divergé avant l'apparition des gènes a et b. Tous les Vertébrés, à l'exception des Agnathes (lamproie), ayant deux gènes de globine (alpha et bêta) et les plus anciens poissons étant datés d'environ 450 Ma alors que les premiers Vertébrés sont apparus il y a environ 550 Ma, on en déduit que la première duplication a dû avoir lieu entre ces deux dates.

mercredi 25 mars 2026

2/ Microscopie photonique

Réaliser et observer des préparations microscopiques montrant des cellules animales ou végétales.

? Réaliser 1 dessin d'observation au microscope, légendez, titrez

cellule, membrane, cytoplasme, noyau, organites

compte-rendu = Dessin d'observation

critères évaluation d'un dessin en SVT :

Dessin :

  • papier blanc, crayon,

  • orientation, taille,

  • netteté, finesse,

  • fidélité // modèle.

Légende :

  • position,

  • traits droits, flèches,

  • légende : paroi-membrane-cytoplasme

  • légende : noyau, (vacuole, chloroplastes)

Titre :

  • organisme observé, : Alium cepa

  • organe (coupe CL ou CT), ou tissus : épiderme

  • mode d’observation, coloration : microscope photonique (optique) + éosine

  • grossissement : x400 à 600

mardi 24 mars 2026

3/ phénétique et génétique

Mettre en relation la ressemblance génétique entre les espèces de primates et leur degré de parenté.

Manuel p.225

Une classification phénétique ou classification numérique est une méthode d'établissement des relations de parenté basée sur le nombre de caractères communs (d’acides aminés ou de nucléotides) partagés par des molécules (protéines ou acides nucléiques), indépendamment de toute notion d'homologie anatomique, plus ce nombre de caractères communs est important et plus l'ancêtre commun est récent. Les relations de parenté sont souvent précisées à partir d'une matrice des distances.

La matrice taxons-caractères contient une information phylogénétique (partage d'états dérivés des caractères) dont une partie est perdue lors du remplacement de la matrice taxons-caractères par une matrice de distances. Même si la matrice taxons-caractères permet une reconstitution phylogénétique correcte, le traitement phénétique de la même information de départ peut conduire à une phylogénie erronée, du fait de cette perte d'information. Les deux méthodes ne sont donc pas équivalentes. Le remplacement de l'information de la matrice taxons-caractères par une matrice de distance est de même nature : les distances résument les distributions des états de caractères de façon incomplète. Autant, à partir de la matrice taxons-caractères, on peut construire la matrice de distances, autant remonter de la matrice de distances à la matrice taxons-caractères est mission impossible. Il y a eu perte d'information, lors du passage de la matrice taxons-caractères à la matrice de distances. Si l'on dispose d'une distribution (par exemple un histogramme des notes à un devoir), on peut résumer cette distribution par une moyenne (la note moyenne au devoir). Mais si l'on vous donne la moyenne, il n'y a aucun moyen de remonter à la distribution : il y a une multitude de distributions des notes qui donnent la même moyenne. Il y a une perte d'information lors du passage de la distribution complète à la moyenne.