vendredi 11 septembre 2026

Biomolecules

Check_Your_English_Vocabulary_for_Medicine : http://medicine.kaums.ac.ir/UploadedFiles/Files/Check_Your_English_Vocabulary_for_Medicine.pdf

Text 787w : https://basicbiology.net/biology-101/molecules-of-life : Molecules of life

video 8'11 : https://youtu.be/YO244P1e9QM focuses on general functions of biomolecules. The biomolecules: carbs, lipids, proteins, and nucleic acids, can all can have important functions in the body. However, this video is not giving human dietary guidelines and should not be used in any attempt to do so. This is a video about the biomolecules.

Video 7’48 : https://youtu.be/1Dx7LDwINLU?si=vRc52wNGbewQrG2G Explore the four biomolecules and their importance for organisms and the structure and function of their cells! This 2023 UPDATED Biomolecules Amoeba Sisters video has some more detail and improved art from the 2016 Amoeba Sisters biomolecules video.

jeudi 10 septembre 2026

1,1,3/ Les marques de la fragmentation continentale et de l’ouverture océanique : marges continentales

1/ Marges passives

Recenser, organiser et exploiter des données (sismiques, tectoniques, sédimentaires) relatives à des marges passives divergentes ;

Manuel p.168-169ⁱ

Les marges passives bordant un océan portent des marques de distension (failles normales et blocs basculés) qui témoignent de la fragmentation initiale (=Rift continental) avant l’accrétion océanique.

2/ Rift continental

Recenser, organiser et exploiter des données (sismiques, tectoniques, sédimentaires) : relatives à un rift continental (par exemple, le rift des Afars).

Manuel p.166-169ⁱⁱ

	Rift continental	Marge passive
Structures tectoniques	Failles normales	→ listriques
Sédiments	continentaux syn-rift de type conglomérats et évaporites
Sédiments	0	marins post-rifts
Activité sismique	Importante, liée notamment au mouvement des failles normales	Faible ou absente (failles non actives)
Activité volcanique	Importante (volcanisme basaltique)	Absente

Les stades initiaux de la fragmentation continentale correspondent aux rifts continentaux.

i p169q1/ La vitesse des ondes sismiques indiquées sur le schéma interprétatif permet, en comparant avec les valeurs du tableau, d’identifier les roches magmatiques constitutives de la croûte continentale (granite), de la croûte océanique (basaltes) et du manteau (péridotites). Les failles normales peuvent être identifiées par le déplacement relatif des blocs de socle continental. Les sédiments peuvent être datés par les couleurs en se reportant au document 2 et être identifiés comme syn-rift ou post-rift en utilisant le document 3.

p169q3/ D’après la séquence stratigraphique du forage représenté sur le document 2 et le modèle présenté dans le document 3, on peut reconstituer deux grandes étapes de la formation de cette marge passive :

1– Oligocène (−34 à −23 Ma) : fragmentation continentale par formation d’un rift avec effondrement le long de failles normales actives et dépôts de sédiments continentaux syn-rift remplissant les bassins sédimentaires dissymétriques (conglomérats – évaporites).

2– Miocène à aujourd’hui (−23 à 0 Ma) : expansion océanique séparant les deux moitiés de l’ancien rift et recouvrement des blocs basculés par dépôts de sédiments marins post-rift argileux.

ii p169q1/ Les caractéristiques du rift d’Assal :

– tectonique en distension,

– failles normales avec effondrement central,

– volcanisme actif basaltique au centre du rift,

– dépôts de roches sédimentaires évaporitiques au fond du rift,

– sismicité active le long des failles et au niveau de la zone magmatique.

p169q2/ D’après l’étude des données GPS, le rift de l’Afar se trouve en régime tectonique distensif, entraînant un amincissement de la lithosphère continentale.

p169q3/ Le régime tectonique en distension (=extension) provoque un amincissement de la lithosphère s’accompagnant en surface de la fracturation de la croûte continentale le long de failles normales parallèles, ce qui forme un fossé d’effondrement ou rift. L’amincissement lithosphérique est également à l’origine du magmatisme responsable de l’activité volcanique au centre du rift. L’activité sismique est la conséquence du jeu des failles normales, mais aussi de l’activité magmatique. Enfin la faible épaisseur d’eau envahissant les zones basses est à l’origine, en climat chaud et sec, d’une sédimentation évaporitique.

video 5’16 : https://youtu.be/li1kO3hg4iE?si=lhb43zkmc0TPpapu TedEd Why do we have crooked teeth when our ancestors didn’t? - G. Richard Scott

2/ Contraintes historiques

Interpréter des caractéristiques anatomiques humaines en relation avec des contraintes historiques (comme le trajet de la crosse aortique), des contraintes de construction (comme le téton masculin)

manuel p.276-277 / p.209

video 4’03 : https://www.dailymotion.com/video/xdm5he dissection girafe par Dawkins :

viceo 0’34 : https://youtu.be/iUoAm1eHtok?si=88MZRR-Z5JaG5VeD

https://www.chimio-pratique.com/cancer-sein-homme-tumeur/

https://www.lelivrescolaire.fr/page/5339666

Le pharynx [du grec φάρυγξ « phárynx » : gorge] est un carrefour aéro-digestif entre les voies aériennes, de la cavité nasale au larynx, et les voies digestives, de la cavité buccale à l'œsophage. L'ouverture de la trompe d'Eustache (tube auditif) le met en communication avec l'oreille moyenne. Le nerf laryngé, un nerf crânien, n'a pas le même trajet à droite et à gauche du fait des origines différentes des artères. A droite il naît juste en dessous de l'artère subclavière et la crochète pour remonter obliquement vers le pharynx en innervant les organes du cou : œsophage, larynx, trachée. À gauche il naît dans le thorax sous la crosse aortique et son trajet est plutôt vertical, cheminant entre l'œsophage et la trachée. Responsable de l'innervation des muscles intrinsèques du larynx, dont le muscle vocal, il est le nerf de la phonation (nerf des cordes vocales). Le parcours du nerf représente un détour qui heurte le bon sens, mais s'explique par l'évolution : son parcours était quasiment rectiligne chez les poissons et s'est graduellement allongé au cours de l'évolution des tétrapodes, au fur et à mesure de la formation du cou (et de l'éloignement entre le cœur et le cerveau). Ainsi, lors de la dissection publique d'une girafe en 2009, Richard Dawkins a mis en évidence que son nerf laryngé récurrent atteignait une longueur de 4,6 mètres.

=> le nerf laryngé récurent est « emporté » par la formation de la crosse aortique lors du développement de l’embryon

Le parcours du nerf représente un détour qui heurte le bon sens mais s'explique par l'évolution : son parcours quasiment rectiligne chez les poissons, s'est graduellement allongé au cours de l'évolution des tétrapodes, au fur et à mesure de la formation du cou et de l'éloignement entre le cœur et le cerveau.

Autres contraintes historiques : le téton ♂ ; canaux déférents ♂

3/ Compromis sélectif

Interpréter des caractéristiques anatomiques humaines en relation avec des compromis sélectifs (comme les difficultés obstétriques)

https://www.lelivrescolaire.fr/page/5339666

Manuel p.209

Les difficultés obstétriques

Teeth evolution

text 296 words : https://www.science.org/doi/full/10.1126/science.1125956 : Medicine Needs Evolution

photos : https://www.orthodontisteenligne.com/en/wisdom-teeth-myths-and-realities/

video 3'20 : https://youtu.be/QQvlCZP-wTQ

video 4’45 : https://youtu.be/wrPEjEqURJg?si=jJWJzy4EgYQZlqQb TedEd How did teeth evolve? - Peter S. Ungar

vendredi 4 septembre 2026

Où suis-je, où vais-je, dans quel état j’Ere ?

1/ Géosciences et dynamique des paysages

Dans ce thème, l’étude des paysages actuels permet de comprendre les mécanismes de leur évolution, le caractère inexorable de l’érosion et l’importance des mécanismes sédimentaires. Une première approche pétrologique [petra : pierre] sera ensuite enrichie dans l’enseignement de spécialité. Les géosciences permettent de comprendre le monde qui nous entoure mais aussi d’identifier les ressources utilisables par l’humanité et prévenir les risques.

1,1/ Erosion & altération

Objectifs : comprendre qu’un paysage change inéluctablement avec le temps du fait de l’érosion ; identifier les agents d’érosion et leur importance.

4 septembre

La géologie s’apprend par les pieds : on sort !

1/ Sortie géologique

- Décrire la composante géologique d’un paysage avec ses reliefs, ses pentes et ruptures de pente, et proposer des hypothèses sur leurs origines.

- Extraire des données, issues de l’observation d’un paysage local, de manière directe (observations, relevés, etc.)

- Relier reliefs et circulation de l’eau.

- Relier la nature de la roche à sa résistance à l’altération.

Les marnes sont plus tendres que les calcaires.

L’eau creuse la roche pour former le relief.

Selon la dureté de la roche, l’eau creuse plus ou moins.

L’érosion affecte la totalité des reliefs terrestres.

L’eau est le principal facteur de leur altération et de leur érosion.

1,1,2/ A la recherche d’océans disparus : complexes ophiolitiques

ophiolithes : du grec ὄφις [ophis « serpent »] + λιθοσ [lithos « pierre »], en référence à la texture superficielle de certaines de ces roches — la serpentinite notamment — qui évoque une peau de serpent.

complexe ophiolithique = basalte / gabbro / péridotite

1/ Origine océanique des ophiolites

Recenser, extraire et organiser des données de terrain ou cartographiques pour argumenter : sur l’origine océanique d’un complexe ophiolitique (données pétrographiques et minéralogiques) ;

manuel p.162-163ⁱ

Les ophiolites sont des roches de la lithosphère océanique. La présence de complexes ophiolitiques formant des sutures au sein des chaînes de montagnes témoigne de la fermeture de domaines océaniques, suivie de la collision de blocs continentaux par convergence de plaques lithosphériques.

2/ Métamorphisme des ophiolites

p.164-165ⁱⁱ

	Minéralogie	Faciès	Domaine de stabilité	densité
gabbro	Plagioclase + pyroxènes		haute température basse pression	2,9

Métagabbro	Plagioclase + pyroxènes + glaucophane	Schistes bleus	Basse température (< 400 °C) Moyenne pression (0,5 à 1,5 GPa)	3,3
Eclogite	Pyroxènes dont omphacite / jadéite + grenat	Éclogites	Basse température (200 à 500 °C) Haute pression (> 1 GPa)	3,5

métagabbro, schistes, éclogite, faciès

=> TP Lames minces de roches métamorphiques au microscope

Établir des corrélations entre la composition minéralogique d’une roche et les différentes conditions de pression et de température, déterminées par les contextes de subduction.

Gabbros du Chenaillet, métagabbros, éclogites

Collection de roches subduites dans les Alpes : éclogite et métagabbro :https://phototheque.enseigne.ac-lyon.fr/photossql/photos.php?TopicID=Lames

Roches : https://prezi.com/aanufhjcxh-p/?utm_campaign=share&utm_medium=copy&rc=ex0share

facies métamorphiques :

http://christian.nicollet.free.fr/page/CO/PTCO.html

http://christian.nicollet.free.fr/page/Figures/facies.html

http://tristan.ferroir.fr/index.php/2011/12/29/les-facies-metamorphiques-deskola-et-lutilisation-dune-grille-petrogenetique/

trajet d'un gabbro de la croûte oc (Nicollet) : http://christian.nicollet.free.fr/page/Figures/phototeque.html#TrajetCO

prezzi des roches à connaître : http://prezi.com/aanufhjcxh-p/?utm_campaign=share&utm_medium=copy

3/ Sur les traces de l’océan Alpin

Recenser, extraire et organiser des données de terrain ou cartographiques pour argumenter : sur l’idée de suture (données cartographiques : par exemple, les Alpes ou l’Himalaya).

film trajet PTP dans les Alpes

site Nicolet : http://christian.nicollet.free.fr/page/Figures/phototeque.html#TrajetCO

petit jeu d’images à replacer : http://tice.svt.free.fr/spip.php?article1951 : https://svt.ac-versailles.fr/IMG/xia/etapes_alpes/index.html

subduction [du latin « subductio », qui signifie « action de tirer les navires sur le rivage »] : Processus d'enfoncement d'une plaque tectonique sous une autre plaque de densité plus faible, généralement une plaque océanique sous une plaque continentale ou océanique

obduction [dérivé savant du latin obductio « action de couvrir »] : Chevauchement d’une plaque océanique sur une plaque continentale.

Les montagnes portent la trace d'anciens océans : pillows lavas, sédiments, fossiles marins, ripple marks, failles normales / marges passives, complexe ophiolitique

L’émergence d’ophiolites résulte de phénomènes d’obduction ou de subduction, suivis d’une exhumation.

i p163q1/ ophiolites = basaltes / gabbros / péridotites

pillow-lavas, typiques des dorsales océaniques

péridotites du Chenaillet → serpentinites contenant serpentine (minéral hydraté)

gabbros → métagabbro schistes verts contenant actinote (minéral hydraté)

donc ophiolite métamorphisées / refroidissement + eau

p163 q2/ position des ophiolites à la frontière d’anciennes plaques tectoniques et séparant les deux masses continentales entrées en collision. L’interprétation des complexes ophiolitiques comme un lambeau d’une ancienne lithosphère océanique pris « en sandwich » entre les masses continentales permet d’en faire un repère de la suture entre blocs continentaux

ii p165q1/ Les ophiolites de Bou Azzer proviennent d’une obduction, c’est-à-dire du charriage de lithosphère océanique par-dessus la lithosphère continentale, alors que celles du Mont Viso proviennent d’une lithosphère océanique ayant subi une subduction, c’est-à-dire un enfoncement de la lithosphère océanique dans l’asthénosphère, sous la lithosphère continentale.

p165q2/ La formation des métagabbros du Mont Viso à partir de métagabbros faciès schistes verts, comme ceux du Chenaillet, s’effectue par augmentation importante de la pression et moins importante de la température, lors de l’enfoncement de la lithosphère océanique par subduction. En effet les conditions de pression et de température du métamorphisme suivent le géotherme des zones de subduction.

Roches magmatiques effusives

Roches :, gabbro, basalte

minéraux : pyroxène, feldspaths, olivine

texture : microlithique (verre + cristaux) / grenue (structure cristalline)

refroidissement : rapide en surface / lent en profondeur

roche magmatique plutonique / volcanique

structure géologique : pluton / volcan

- Mener une observation comparative des roches des croûtes océanique et continentale (composition, structure, etc.).

observer à l'oeil nu et à la loupe : aspect général : minéraux, couleurs, structure
observer les lames minces au microscope en LPnA puis LPA: structure de la roche : grenue, microgrenue, microlithique et minéraux en présence
réaliser un dessin d'observation légendé

prezzi des roches à connaître en terminale : http://prezi.com/aanufhjcxh-p/?utm_campaign=share&utm_medium=copy

collection de lames minces de roches : http://www.lame-mince.com/examples-lame-mince.html

minéralogie au microscope polarisant : http://www.svt-monde.org/spip.php?article26

site complet sur les roches silicatées : http://ressources.unisciel.fr/petronille/co/module_petronille.html

lames minces en photo : http://avg85.fr/category/lames-minces-de-roches/

site de F.Laubane : http://www.macromicrophoto.fr/petrography/index.html

Utiliser un microscope polarisant, reconnaître les minéraux d’une lame mince pour identifier 2 roches magmatiques

Objectifs : données fondamentales sur les principales roches rencontrées (basalte, gabbro,)

Molecules

video 4'57 : https://youtu.be/_lNF3_30lUE How Small Is An Atom? Spoiler: Very Small. Atoms are very weird. Wrapping your head around exactly how weird, is close to impossible – how can you describe something that is SO removed from humans experience? But then again, they kind of make up everything, so let us try anyways.

write : names for the symbols of the chemical elements and compounds in a table

answers of doc. (c)

Check_Your_English_Vocabulary_for_Medicine : http://medicine.kaums.ac.ir/UploadedFiles/Files/Check_Your_English_Vocabulary_for_Medicine.pdf

build and draw your molecules : https://molview.org/?cid=21262180 to try to understand chemestry !

jeudi 3 septembre 2026

Misensit°

Les questions que pose l’âge de glace

1/ Histoire de l'humain

Les concepts de biologie évolutive ont une large portée explicative, présentée ici à travers plusieurs exemples. Ils permettent de comprendre l’anatomie comme le résultat d’une longue histoire évolutive, faite d’adaptations, de hasard, de contingences et de compromis. Les concepts de variation et de sélection naturelle éclairent des pratiques humaines (médicales et agricoles) et certaines de leurs conséquences.

1,1/ Traces de l'évolution sur l'humain

1/ Régressions en cours

Interpréter des caractéristiques anatomiques humaines en relation avec des régressions en cours (comme les dents de sagesse).

video 6'29 : https://youtu.be/gdjQiao1QYE?si=5ED7_VzS36G19aoZ

radio 5'46 : https://youtu.be/p0vTo5wYvss

« la faiblesse de cette dent, qui naît la dernière [...] et fait souvent défaut » Charles Darwin

Le nombre de dents peut varier selon les individus, mais le modèle chez l’adulte est pour chaque demi-mâchoire : 3 molaires (numérotées M1, M2, M3), 2 prémolaires (P), 1 canine (C), 2 incisives (I). Les dents de sagesse correspondent à la molaire M3.

comparaison crânes Pan//Homo

Personnes présentant un mauvais positionnement des dents de sagesse lors de leur croissance	50 %
Proportion de la population actuelle dont au moins une dent (hors M3) ne pousse pas	1 à 6 %
Proportion de la population actuelle dont au moins une dent de sagesse ne pousse pas	20 à 30 %
Diminution de la taille des dents entre les humains actuels (H. sapiens) et l’homme de Dmanisi (H. georgicus), dont les fossiles sont datés de 1,8 Ma	15 %

Comme les dents de sagesse ne sont plus indispensables, les mutations qui touchent des gènes impliqués dans leur formation n’affectent pas le succès reproducteur des individus. La sélection naturelle n’a donc pas d’effet. Il est donc possible que les fréquences des allèles impliqués évoluent au hasard. Il est cependant difficile de tirer des conclusions à partir des statistiques sur les dents de sagesse ou des quelques fossiles disponibles. Il n’est pour l’instant pas possible d’affirmer que l’absence de formation de dents de sagesse corresponde à une évolution de l’être humain. Si ces absences semblent plus nombreuses, c’est parce qu’elles sont mieux diagnostiquées. Ainsi il peut s’agir d’incidents liés à la diversité humaine. Nous aurons sans doute encore longtemps une formule dentaire à 32 dents.

Biphalangie : deux des trois phalanges du petit orteil sont souvent fusionnées dans les populations modernes. La biphalangie des orteils est un phénomène exclusivement humain, et son évolution est considérée comme une adaptation à la bipédie, puisque l'humain est le seul mammifère bipède.

80 % au Japon et 40 % aux États-Unis
41 % de biphalangie sur le petit orteil, 2,1 % de biphalangie sur le quatrième orteil en Pologne d’après Surgical and Radiologic Anatomy
46 % de biphalangie sur le petit orteil chez les Américains d’ascendance européenne, 44 % chez les Afro-Américains d’après Journal of Comparative Human Biology

L'appendice — ce petit sac (~5-10 cm) au bout du côlon aidait probablement les ancêtres herbivores à digérer la cellulose (feuilles, écorces). Il n'a plus de rôle direct dans la digestion, tissu lymphoïde (follicules avec lymphocytes B et T, production d'IgA) et réservoir de microbiote intestinal.

Le coccyx — c'est le vestige de la queue de nos ancêtres, devenue inutile pour l'équilibre une fois la bipédie acquise. Il sert aujourd'hui de point d'attache pour des muscles du plancher pelvien.

Autres exemples moins connus

La plica semilunaris — ce petit repli de peau au coin interne de l'œil est le vestige de la membrane nictitante (troisième paupière) que beaucoup d'animaux utilisent encore pour protéger leurs yeux.

Le muscle palmaris longus : un muscle de l'avant-bras que ~10-15% des humains n'ont même plus. Vous pouvez tester si vous l'avez en joignant pouce et auriculaire puis en fléchissant le poignet — un petit cordon apparaît (ou pas).

Les muscles de l'oreille (auriculaires) : chez la plupart des mammifères ils orientent l'oreille vers un son ; chez l'humain ils sont largement inactifs (sauf chez les rares personnes qui savent "bouger les oreilles").

La chair de poule (muscles arrecteurs des poils) : hérisse le poil pour se réchauffer ou paraître plus imposant chez les animaux poilus — chez l'humain glabre, ça ne sert plus à grand-chose.

Le tubercule de Darwin : petit repli cartilagineux sur le bord de l'oreille, vestige de la pointe d'oreille ancestrale.

Le muscle plantaris : présent chez les primates grimpeurs pour la préhension du pied, absent chez ~10% des humains sans conséquence.

À quoi ressembleront les humains de demain ?

« La stature des Européens les plus grands (les Néerlandais) n’augmente plus alors que celle des pays de l’Europe du sud, où la taille était plus faible, continue. Il en va de même des performances sportives qui n’augmentent plus beaucoup, une fois que la limite physiologique humaine est atteinte.

D’autres phénomènes, comme la maturation sexuelle, ont évolué, notamment l’âge des premières règles (la ménarche), qui est passé de 15 ans à 12 ans en deux siècles. Mais là encore le mouvement se ralentit et se stabilisera là où les conditions sanitaires sont optimales.

Quant à notre apparence générale, la couleur de la peau de l’Homme devrait également changer, avec une plus grande variabilité à l’intérieur d’une population donnée. Les gènes qui déterminent la couleur de la peau sont en effet multiples et se dispersent petit à petit dans les différentes populations au gré des migrations humaines. » en 2015. Alain Froment, Associé au Muséum d’histoire naturelle (UMR 7206, Éco-anthropologie)