vendredi 28 novembre 2014

§ Qu'est-ce que le matériel génétique ?

1.2.3 – Genetic control of the metabolism

A1/ Modélisation moléculaire de l'ADN / maquette + Logiciels

Logiciels Rastop, Rasmol, Raswin, Jmol, … = logiciels de modélisation moléculaire

logiciel Rasmol : http://www.inrp.fr/Acces/Biogeo/model3d/rasmol.htm

atomes CHONP,

ADN = polynucléotide

catégorie des acides nucléiques

A2/ Petite histoire génétique / diaporama

1865 (Allemagne) Mendel démontre l'existence de "facteurs génétiques"
1868 (Suisse) Miescher trouve une substance spécifique du noyau qu'il nomme la "nucléine"
1883 (Allemagne) Weismann utilise le terme "matériel génétique"
1880 to 1890 - Flemming, van Beneden, & Strasburger découvrent le chromosome.
1903 - Sutton hypothesized that chromosomes are hereditary units.
1905 - William Bateson coined the term “genetics”.
1910 (Amérique) Morgan montre que les gènes sont portés par les chromosomes
1933 - Jean Brachet was able to show that DNA was found in chromosomes
1944 (Amérique) Avery, Mc Leod et Mc Carty montrent que l'ADN est le support des gènes
1951 ( Amérique ) Chargaff établit sa règle : [A] = [T] et [C] = [G] pour toute cellule.
1953 (Angleterre) Franklin & Wilkins montrent que la molécule a la forme d'une double hélice, puis Watson & Crick établissent le modèle moléculaire de l'ADN
1962 Nobel Prize in Physiology & Medecine

L'ADN est formé de deux chaînes complémentaires de nucléotides en double hélice comportant les bases : Adénine, Thymine, Cytosine, Guanine.

Chaque chromosome contient une molécule d'ADN qui porte de nombreuses informations génétiques = gènes dont l'ensemble forme le programme génétique (= génôme) que l'on peut « visualiser » sous forme de caryotype '= ensemble des chromosomes d'une cellule)

Génôme = programme génétique = ensemble des gènes d'une cellule, d'un individu

Allèles = versions d'un gène

séquence = ordre des 4 lettres : ATCG

gène codé par séquence des bases

allèle = version d'un gène

double hélice,

double hélice faite de 2 brins de Phosphates+sucres (désoxyriboses) reliées entre elles par 4 bases azotées

p+s+b = nucléotide = monomère de l'ADN

C/ Scientific sources about genetics / www

http://www.dnai.org/a/index

http://learn.genetics.utah.edu/content/begin/tour/

http://www.dnaftb.org/#classical

http://www.dnajunction.com/history/discovery-of-dna.php

http://genmed.yolasite.com/history.php

Watson & Crick : http://www.exploratorium.edu/origins/coldspring/ideas/printit.html ; http://www.nature.com/nature/dna50/archive.html

in french :

http://www.snv.jussieu.fr/vie/documents/decouverteadn/index.htm

http://www.genoscope.cns.fr/externe/HistoireBM/

30 novembre

A3/ Schématisation d'une transgénèse / diaporama

http://youtu.be/LYpSUrWIys0

une souris verte, ...fluo : http://tubeaessai.blogs.nouvelobs.com/archive/2008/01/index.html ;http://www.greenpeace.org/canada/fr/Blog/cchons-ogm-vert-fluo-dune-mduse/blog/4029 ;http://www.bio.miami.edu/~cmallery/255/255hist/greenmice.jpg ; http://genetique.snv.jussieu.fr/BMC513.htm ;http://www.mbl.edu/news/features/shimomura.html ;http://www.collegeotr.com/boston_university/ucsd_bu_and_columbia_scientists_bring_home_nobel_prize_in_chemistry_make_stuff_glow_12809; http://www.scientificamerican.com/blog/post.cfm?id=chalfie-shimomura-and-tsien-win-che-2008-10-08

animation transfert de gène : http://www.hhmi.org/biointeractive/stemcells/scnt.html

=> transgenesis, DNA genes support and universal

OGM, transgénèse, ADN support gènes et universel

On fabrique des Organismes Génétiquement Modifiés (OGM) par transfert d'un gène (transgénèse) d'un autre individu qui peut être d'une espèce complètement différente.

La transgenèse repose sur l'universalité de la molécule d'ADN en tant que support de l'information génétique.

C/ Débats sur éthique, transgénèse et ogm / articles + films

La carte du maïs OGM en France : http://www.futura-sciences.com/fr/sinformer/actualites/news/t/genetique-1/d/la-carte-du-mais-ogm-en-france_12336/

MON 863 : maïs OGM destiné à l'alimentation humaine suspecté puis innocenté : http://www.futura-sciences.com/fr/sinformer/actualites/news/t/genetique-1/d/mon-863-mais-ogm-destine-a-lalimentation-humaine-suspecte-puis-innocente_12332/

films sur les OGM :

de journalistes :

http://www.dailymotion.com/video/xrn35_ogm-lhorreur-reveillez-vous-avant

http://www.dailymotion.com/video/xqqe3_le-coton-ogm-tue

http://www.dailymotion.com/video/x119pg_main-basse-sur-les-genes

de scientifique, C.Vellot :

http://www.dailymotion.com/video/xpwco_eclairage-scientifique-sur-les-ogm

http://www.dailymotion.com/video/xpync_eclairage-scientifique-sur-les-ogm

Monsanto se présente : http://www.monsanto.com/global/fr/qui-sommes-nous/Pages/default.aspx

les dernières news : http://www.lafranceagricole.fr/actualite-agricole/alimentation-animale-bruxelles-autorise-deux-combinaisons-de-mais-ogm-79759.html

B/ schématisation sur l'ADN

ADN, chromosome, gènes

Gène = information génétique codée dans l'ADN par la séquence des bases, transmis de génération en génération.

un lexique bilingue français/anglais de génétique : http://www.dr-belair.com/dic/Medicine/Genetics/Genetics-eng-fr.htm

18 Things You Should Know About Genetics : http://youtu.be/bVk0twJYL6Y

B123/ Plan du vivant : Structure et fonction de l'ADN

La transgénèse montre que l’information génétique est contenue dans la molécule d’ADN et qu’elle y est inscrite dans un langage universel. La variation génétique repose sur la variabilité de la molécule d’ADN (mutation). L’universalité de structure et du rôle de l’ADN est un indice de la parenté des êtres vivants.

Transgenesis shows that genetic information is contained in the DNA molecule and that it is inscribed in a universal language. The genetic variation (mutation) is based on the variability of the DNA molecule . The universal role of DNA is an indication of the kinship of living beings.

C/ Pour aller plus loin

un article sur le clonage animal : http://biotechbuddy.googlepages.com/animal_cloning.html

des articles d'actualité sur le clonage : http://news.bbc.co.uk/2/hi/science/nature/377046.stm

un article sur le clonage d'un faon au Texas : http://www.innovations-report.de/html/berichte/biowissenschaften_chemie/bericht-24409.html

construction schématique d'une molécule d'ADN : http://learn.genetics.utah.edu/units/basics/builddna/

schéma molécule : http://fr.wikipedia.org/wiki/Fichier:ADN.jpg

extraction ADN : http://www.pedagogie.ac-nantes.fr/1169107087593/0/fiche___ressourcepedagogique/&RH=1160729734281
DNA learning center : http://www.dnaftb.org/dnaftb/

Transgenic Fly lab : http://www.hhmi.org/biointeractive/vlabs/transgenic_fly/index.html

Site du prix Nobel : http://nobelprize.org/index.html

DNA interactive : http://www.dnai.org/

BIOTIC INRP : http://www.inrp.fr/Acces/biotic//genetic/adn/accueil.htm

SNV : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/ATP/transgen.htm

Banques de séquences ADN : http://www.ebi.ac.uk/embl/

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=nucleotide

http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/

École de l’ADN : http://www.ecole-adn.fr/WEB_F/home.html

§ chaque bilan précédent se termine par « indice de la parenté des êtres vivants. »

A4/ Classement des phases de la mitose / photographies

http://www.didiersvt.com/cd_1s/html/index12.html cliquer sur chap 2

http://bio.m2osw.com/gcartable/mitose.JPG

http://www.cnrs.fr/cw/dossiers/doscel/decouv/ximg/cycell/mito/mito1.jpg

résultats : http://back.ac-rennes.fr/pedagogie/svt/cartelec/cartelec_lyc/premiere_s/vegetal/racine/racine.htm

ou : http://www.inrp.fr/Acces/biotic/morpho/html/photomeri.htm

http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Mitose/51mit-fluo.htm#

http://www.ascb.org/ascbpost/index.php/ascbpost-home/item/82-too-many-centrosomes-cause-microcephaly

http://www.frontiers-in-genetics.org/page.php?id=hp-2012_fr

Mitose, pro-méta-ana-télophase

A5/ Etapes de la mitose en continu / film

http://www.ac-creteil.fr/biotechnologies/doc_biocell-videomitosis.htm

http://youtu.be/K1lAknL1B4c

http://youtu.be/czaO1wYLSDo

http://youtu.be/kmWOGye7yGI

http://youtu.be/-QRgofKbvbQ

Mitose = reproduction conforme

B/ Schématisation de la Mitose / animation +doc©

http://www.biologieenflash.net/sommaire.html

animations mitose :

http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Mitose/img-anim/mitose-anim.htm ;

http://cell.sio2.be/mitose/10.php ;

http://youtu.be/ATlUv-AGhEU

schéma interactif : http://svt.ac-rouen.fr/tice/animations/fusin/division_cellulaire.swf

Mots clefs : Chromatide, ADN, caryotype, chromosomes, interphase, mitose (pro-méta-ana-télophase)

glossaire : http://www.cnrs.fr/cnrs-images/sciencesdelavieaulycee/lexique.htm#meiose ; http://www.premiumwanadoo.com/renard/revisions/SVT/lexBio.htm

à colorier+légender

schéma : http://cyberlesson.free.fr/Cybersciences/Cours/images/mitose_general.gif

Mitose, pro-méta-ana-télophase

B211/ La mitose, multiplication par division cellulaire

les 4 phases de la mitose :

prophase : [pro = premier] formation des chromosomes, la chromatine devient chromatides ; formation du fuseau mitotique ; désintégration de l'enveloppe nucléaire,

métaphase : [méta = changement] rangement des chromosomes dans le plan équatorial de la cellule, c'est la phase où on observe le mieux les chromosomes,

anaphase : [ana = séparation] séparation des chromatides de chaque chromosome aux pôles de la cellule, le long du fuseau qui sert de guide et de moteur,

télophase : [télo = fin] individualisation des deux cellules filles : décompactage des chromosomes, les chromatides deviennent chromatine, formation de deux enveloppes nucléaires, désintégration du fuseau, poil au museau, cytodiérèse [séparation des cellules].

Les chromosomes sont des structures constantes des cellules eucaryotes qui sont dans des états de condensation variables au cours du cycle cellulaire. Ils peuvent avoir une ou deux chromatides jointes par le centromère. Chaque chromatide contient une molécule d’ADN. En général la division cellulaire est une reproduction conforme qui conserve toutes les caractéristiques du caryotype (nombre et morphologie des chromosomes, zomzom).

A2/ Petite histoire génétique / diaporama

1865 (Autriche) Mendel démontre l'existence de "facteurs génétiques"
1868 (Suisse) Miescher trouve une substance spécifique du noyau qu'il nomme la "nucléine"
1883 (Allemagne) Weismann utilise le terme "matériel génétique"
1880 to 1890 - Walter Flemming, Edouard van Beneden, and Eduard Strasburger elucidated chromosome distribution during the process of cellular division.
1903 - Walter Sutton, American physician and geneticist, hypothesized that chromosomes are hereditary units.
1905 - William Bateson coined the term “genetics”.
1910 (Amérique) Morgan montre que les gènes sont portés par les chromosomes
1913 - Alfred Sturtevant made the first genetic map of a chromosome.
1928 - Frederick Griffith made a revolutionary discovery from an experiment: dead bacteria can have genetic material incorporated by living bacteria!
1933 - Jean Brachet was able to show that DNA was found in chromosomes and that RNA was found in the cytoplasm of all cells.
1941 - George Wells Beadle and Edward Lawrie Tatum made an extremely important fundamental discovery: genes code for proteins.
1944 (Amérique) Avery, Mc Leod et Mc Carty montrent que l'ADN est le support des gènes
1951 ( Amérique ) Chargaff établit sa règle : [A] = [T] et [C] = [G] pour toute cellule. Exemple chez l'homme : A= T=30% ; C=G=19%.
1953 (Angleterre) Franklin & Wilkins montrent que la molécule a la forme d'une double hélice,
puis Watson & Crick établissent le modèle moléculaire de l'ADN : http://www.snv.jussieu.fr/vie/documents/decouverteadn/index.htm
1958 Meselson et Stahl montrent comment se réplique l'ADN
1962 Wilkins, Watson & Crick obtiennent le prix Nobel de Médecine pour la structure de l'ADN
1965 Niremberg & Mattéi découvrent le code génétique : http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/m&s/m&s.html#exp1

compléter avec : http://www.medecine.unige.ch/enseignement/dnaftb/

http://www.dnajunction.com/history/discovery-of-dna.php

http://www.snv.jussieu.fr/vie/documents/decouverteadn/index.htm

http://genmed.yolasite.com/history.php

http://www.genoscope.cns.fr/externe/HistoireBM/

publication

Watson & Crick : http://www.exploratorium.edu/origins/coldspring/ideas/printit.html ; http://www.nature.com/nature/dna50/archive.html

B/ Information et matériel génétique / Schéma ©

Gène, allèle, information génétique
séquence des bases (nucléotides)
ADN, caryotype, locus (loci), chromosome, chromatide, nucléotide, Adénine, Thymine, Cytosine, Guanine, complémentarité
mutation, transgénèse, brassage génétique.
homo/hétérozygote, [phenotype], (génotype), génôme
interphase : G1, S, G2, dupli, réplication semi-conservative, mitose, pro, méta, ana, télophase

jeudi 27 novembre 2014

Publication by Chada FM.

EV/ prétest sur acquis de 1eS en génétique

A1/ Etablissement d'une carte génétique / tests cross drosophiles + loupe binoculaire

TP1 avec gènes [eb + vg] ; TP2 avec gènes [bl + vg]

TP drosophile : http://svtlgb.fr/tp_ts_specifique/tp2/tp2.html ; http://www.statistix.fr/spip.php?article3

photos des différents mutants : http://criantdrosophiles.blogspot.fr/2010_07_16_archive.html ; http://carroll.molbio.wisc.edu/images.html

le cycle de reproduction de la drosophile : http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=378

comment élever des drosophiles : http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/drosoelevage/dros-elv.htm ; http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/labo/elevage/droselev.html

croisements drosophiles sur net : http://lyrumill.edres74.ac-grenoble.fr/droso/

brassage inter et intrachromosomique

A3/ Observation de cellules de racines d'oignon en divisions / microscope optique

Diapo de Photos de racines

– de cellules racines identiques => multiplication → observation → dessins de différentes phases

TP Réalisation de préparations et observation microscopique de cellules en mitose / racine d'oignon

http://www.didiersvt.com/cd_1s/html/index12.html ;

http://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/ress/reproduction/mit_veg.html ;

http://www.didier-pol.net/3mitose.htm

POUR LE 28 novembre

A4/ Classement des phases de la mitose / photographies

© mitose photos.odg

http://www.didiersvt.com/cd_1s/html/index12.html cliquer sur chap 2

http://bio.m2osw.com/gcartable/mitose.JPG

http://www.cnrs.fr/cw/dossiers/doscel/decouv/ximg/cycell/mito/mito1.jpg

résultats : http://back.ac-rennes.fr/pedagogie/svt/cartelec/cartelec_lyc/premiere_s/vegetal/racine/racine.htm

ou : http://www.inrp.fr/Acces/biotic/morpho/html/photomeri.htm

http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/Mitose/51mit-fluo.htm#

http://www.ascb.org/ascbpost/index.php/ascbpost-home/item/82-too-many-centrosomes-cause-microcephaly

http://www.frontiers-in-genetics.org/page.php?id=hp-2012_fr

mercredi 26 novembre 2014

§ Comment expliquer la diversité des allèles et des gènes ?

2.1.3/ Brassage par duplication, transposition et mutation

A1/ Etablissement d'une carte génétique / tests cross drosophiles + loupe binoculaire

TP1 avec gènes [eb + vg] ; TP2 avec gènes [bl + vg]

TP drosophile : http://svtlgb.fr/tp_ts_specifique/tp2/tp2.html ; http://www.statistix.fr/spip.php?article3

photos des différents mutants : http://criantdrosophiles.blogspot.fr/2010_07_16_archive.html ; http://carroll.molbio.wisc.edu/images.html

le cycle de reproduction de la drosophile : http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=378

comment élever des drosophiles : http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/drosoelevage/dros-elv.htm ; http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/labo/elevage/droselev.html

croisements drosophiles sur net : http://lyrumill.edres74.ac-grenoble.fr/droso/

brassage inter et intrachromosomique

lundi 24 novembre 2014

§ chaque bilan précédent se termine par « indice de la parenté des êtres vivants. »

§ Quelles sont les preuves de la parenté des êtres vivants ?

13 - Evolution of life

131 - Relationship between living beings, homologies

A1/ Comparaison de différents vertébrés / dissections

Du point de vue morphologique, deux vertébrés aussi différents que la grenouille et la souris ont quand même des similitudes fondamentales : les axes de polarité (droite-gauche, antéro-postérieur, dorso-ventral). Nous allons disséquer ces animaux pour voir s'ils possèdent des similitudes anatomiques.

http://www.ac-rennes.fr/pedagogie/svt/cartelec/cartelec_lyc/dissect/dissect.htm

http://frog.edschool.virginia.edu/Frog2/home.html

http://www.svt.ac-aix-marseille.fr/labosvt/spip.php?article115

Manuel p. 76-77 pour dissection du système nerveux

Cerveau
Cervelet
Moelle épinière
Cœur
Gonades = glandes sexuelles (ovaires ; testicules)
Tractus génital = Utérus
Foie
Orifice buccal
Oesophage
Estomac
Intestin grêle
Colon = gros intestin
Rectum
Trachée ou bronche
Poumons ou branchies
Reins
Vessie
Orifices urogénital+fécal

A2/ Schématisation anatomique / diagramme de polarité

Placer les couleurs sur schémas anatomiques : :

RESPIRATION en bleu clair = 14+15+8

DIGESTION en bleu foncé = 7 à 13+18+8

EXCRETION en jaune = 16+17+18

COMMUNICATION en vert = 1+2+3

REPRODUCTION en rose = 5+6+18

CIRCULATION en rouge = 4

diagramme des polarités : construire dans un rectangle, l'axe horizontal = antéro-postérieur, l'axe vertical = axe dorso ventral, les différentes fonctions.

exemple : http://www.inrp.fr/Acces/biotic/develop/controle/html/axepole.htm ; http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/rubrique.php3?id_rubrique=70

B131/ Relations entre êtres vivants, homologies

Au sein de la biodiversité, des parentés existent qui fondent les groupes d’êtres vivants. Ainsi, les vertébrés ont une organisation commune. Les parentés d’organisation des espèces d’un groupe suggèrent qu’elles partagent toutes un ancêtre commun.

In biodiversity, kindships exist and establish groups of living beings. Thus, vertebrates have a common organization. The relationships of organization of the spiecies of a group suggest they share a common ancestor.

Polarity, symmetry, bone skeleton , vertebrae.

Polarité, symétrie, squelette osseux, vertèbre.