3/ modélisation moléculaire de l’ADN / logiciel

? Faire un compte-rendu individuel sur feuille :

 utiliser un logiciel pour synthétiser/simplifier/construire/schématiser une molécule d'ADN

Objectifs : Exprimer et exploiter des résultats à l’écrit en utilisant les technologies de l’informatique

Principe : les logiciels Rastop, Rasmol, Raswin, Jmol, … sont des banques de données permettant de manipuler des modèles moléculaires.

Protocole :

1. Ouvrez le fichier « ADN » : https://libmol.org/?libmol=158

2. Admirez la molécule en la manipulant à la souris.

3. Changer (commande) la représentation des atomes et des liaisons.

4. Colorez la molécule par « atomes » : quels sont les atomes composant l’ADN ?

5. Colorez la molécule par « chaines » : combien de parties lui trouvez-vous ?

6. Affichez les « rubans » puis « squelette » : quelle est la forme globale de la molécule ?

7. Dessinez la forme globale de la molécule

8. Colorez la molécule par « résidus» : combien de nucléotides différents existe-t-il ? quels sont leurs noms (passez la souris dessus) ?

9. Quelle est la composition, la structure d'un nucléotide ? Utilisez vos notes et les informations du logiciel pour comprendre.

10. Schématisez la structure d'un nucléotide en utilisant différents symboles et couleurs de votre choix.

11. En 1951 Chargaff démontre que [A] = [T] et [C] = [G] pour toute cellule. Que signifie l'expression « bases complémentaires » ?

12. En utilisant les symboles précédents schématisez la structure de la molécule à plat, sans tenir compte de la forme dans l'espace.

6/ Phylogénétique des hominidés

sites :

https://www.hominides.com/

http://eanthro.org/labs/home

https://humanorigins.si.edu/education/introduction-human-evolution

https://australian.museum/learn/science/human-evolution/

logiciels :

phylogène : http://acces.ens-lyon.fr/acces/thematiques/evolution/logiciels/phylogene

hominines : https://svt.ac-versailles.fr/spip.php?article762

lignee_humaine : https://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/les-logiciels-de-pierre-perez

becoming a human : http://www.becominghuman.org/node/interactive-documentary

quelques arbres phylogénétiques :

https://www.onezoom.org/life.html/@biota=93302?img=best_any&anim=flight#x415,y761,w0.6859

https://itol.embl.de/itol.cgi

http://tolweb.org/tree/

http://timetree.org/

Des arguments scientifiques issus de l’analyse comparée de fossiles permettent de reconstituer l’histoire de nos origines.

L’étude de fossiles datés de 3 à 7 millions d’années montre des innovations caractéristiques de la lignée humaine (bipédie prolongée, forme de la mandibule).

Le genre Homo regroupe l’espèce humaine actuelle et des espèces fossiles qui se caractérisent notamment par le développement de la capacité crânienne. Plusieurs espèces humaines ont cohabité sur Terre.

Juliette Nourredine - Lucy : https://youtu.be/U50mfGyq8HM

Bilan : L’évolution humaine

Analyser des matrices de comparaison de caractères morpho-anatomiques résultant d’innovations évolutives afin d’établir des liens de parenté et de construire un arbre phylogénétique.

Mettre en relation la ressemblance génétique entre les espèces de primates et leur degré de parenté.

L’espèce humaine actuelle (Homo sapiens) fait partie du groupe des primates et est plus particulièrement apparentée aux grands singes avec lesquels elle partage des caractères morpho-anatomiques et des similitudes génétiques.

C’est avec le chimpanzé qu’elle partage le plus récent ancêtre commun.

Certains caractères sont transmis de manière non génétique : microbiote, comportements appris dont la langue, les habitudes alimentaires, l’utilisation d’outils…

Positionner quelques espèces fossiles dans un arbre phylogénétique, à partir de l'étude de caractères.

Analyser des arguments scientifiques qui ont permis de préciser la parenté de Homo sapiens avec les autres Homo, et notamment la parenté éventuelle avec les Néandertaliens ou les Dénisoviens.

Des arguments scientifiques issus de l’analyse comparée de fossiles permettent de reconstituer l’histoire de nos origines.

L’étude de fossiles datés de 3 à 7 millions d’années montre des innovations caractéristiques de la lignée humaine (bipédie prolongée, forme de la mandibule).

Le genre Homo regroupe l’espèce humaine actuelle et des espèces fossiles qui se caractérisent notamment par le développement de la capacité crânienne. Plusieurs espèces humaines ont cohabité sur Terre.

Prérequis et limites

L’objectif n’est pas de conduire une approche exhaustive des fossiles et de leurs caractères biologiques, mais de présenter la démarche scientifique permettant de construire une histoire raisonnée de l’évolution humaine. Les notions de liens de parenté, étudiées au collège, sont mobilisées ; un accent particulier est mis sur l’importance de l’identification d’innovations évolutives communes.

Évaluation au prochain cours

QCM / ED :

T2 le vendredi 29 mai de 10h25 à 11h20

T1 le mercredi 27 mai de 11h20 à 12h15

ex1p234 : vrai ou faux ?

1. l'être humain ne descend pas du singe ils sont cousins, ils ont un ancètre commun,

2. le chimpanzé est l'espèce la plus proche de l'humain

3. Homo sapiens ne peut descendre de Neandertal puisqu'ils ont vécu en même temps, ils ont un ancètre commun, peut-être y a-t-il eu hybridation puisque sapiens a des gènes néandertaliens

4. plus les espèces partagent des caractères à l'état dérivé et non pas ancestral plus elles sont apparentées

ex2p234 : lecture d'arbre

1. narines rapprochées et pas de queue : humain, gorille, chimpanzé

2. humain, gorille, chimpanzé forment le groupe des hominidés

3. le chimpanzé est l'espèce la plus proche de l'humain : innovations évolutives = caractères dérivés communs, => Ancètre commun caractères génétique, morpho-anatomiques

Misensituation

Perles :

• « Pour aider les enfants à aller aux toilettes, on leur met des suppositoires de nitroglycérines. » Séverine , 20 ans, Ecole de soins infirmiers

• « La plus contagieuse des maladies est la vermicelle. »

• « A l'école le médecin est venu pour le vaccin anti-titanic »

• « Dans les écoles, les médecins vaccinent contre le BCBG »

video : Immunologie - Tu mourras moins bête – ARTE video 3’14 : https://youtu.be/vfHMGPbbxvs

1tro /Antigènes

Sida, Ebola, Zika, Corona… font fémir chaque année la planète alors qu’il n’y a pas plus petit organisme sur terre, si l’on admet que les virus sont vivants, ce qui est encore en débat entre les scientifiques. Qu’est-ce qu’un virus ? Voici quelques infos qui provoqueront sans doute des questions que j’attend par mail ou commentaire avec impatience !

1/ Coronavirus

https://prezi.com/view/PuWIC6cDfne6TJz8TddA/

C’est quoi ?

• Le SRAS-CoV2 (SARS, in English), pour Syndrôme Respiratoire Aigü Sévère au CoronaVirus 2 est l’agent de la maladie COVID19 ou 2019-nCoV pour Coronavirus infection disease 2019, littéralement « maladie infectieuse à coronavirus de 2019 ».

• Les coronavirus humains comptent parmi les agents du rhume, derrière les rhinovirus. Ce sont des virus à ARN, enveloppés, avec certaines particularités : le génome le plus long des virus à ARN (30 kb) ; de très larges spicules d’enveloppe, donnant à la particule virale un aspect en couronne ; une relative résistance dans l’environnement et la présence dans les selles (en rapport avec cette enveloppe particulière ?).

• Enveloped, spherical, about 120 nm in diameter. The RNA genome is associated with the N protein to form the nucleocapsid. see Neuman BW et al. for virion cryo-electron microscopy analysis. Monopartite, linear ssRNA(+) genome of 27-32kb in size (the largest of all RNA virus genomes). Capped, and polyadenylated. The leader RNA (65-89 bp) at the 5' end of the genome is also present at the end of each subgenomic RNAs.

Pour quoi ?

• C’est la première menace de pandémie du troisième millénaire. Cette pneumonie sévère, apparue en novembre 2002 dans la province de Guangdong (ex Canton) en Chine, a diffusé jusqu’en avril 2003, touchant plus de 8000 personnes. Elle est due à un virus nouveau, d’origine très probablement animale (la civette), les coronavirus humains déjà connus ne donnant que des rhumes. L’implication de ce nouveau virus comme agent du SRAS a été démontrée par la reproduction de la maladie chez le singe (cynomolgus).

• Physiopathologie : Le SRAS diffère de la grippe par les caractères suivants : mortalité plus élevée (10 %) ; incubation plus longue (six jours, avec des extrêmes de 14 jours) ; caractère généralisé de l’infection (le virus est présent dans les sécrétions respiratoires, mais aussi dans les urines, les selles, le sang) ; pic de multiplication virale relativement tardif (10 jours après le début des signes cliniques) ; rareté des affections asymptomatiques ; fréquence de la pneumonie plus grande chez l’adulte que chez l’enfant (comme pour la pneumonie de la varicelle) ; contagiosité limitée (deux à quatre cas secondaires par cas index, mais exceptionnellement beaucoup plus ; pour la grippe, c’est 5 à 10 cas, voire 15 en cas de pandémie) ; diffusion nosocomiale importante parmi le personnel (« maladie des blouses blanches ») ; enfin contrôle possible de l’épidémie par des mesures d’hygiène (isolement, quarantaine, bannissement des aérosols) dès que les cas sont reconnus.

• Diagnotic virologique : La difficulté de leur isolement en culture de cellules, la bénignité du rhume et l’absence de traitement antiviral font que le diagnostic virologique, hors enquêtes spécifiques, n’en est pas fait. En phase aiguë, on recherche le génome viral par RT-PCR en temps réel sur les sécrétions respiratoires, les urines, les selles. Le diagnostic rétrospectif peut se faire par la recherche d’une séroconversion sur deux prélèvements sériques, précoce et tardif (IF ou ELISA… si le patient survit).

• Traitement : Il n’y a actuellement pas de traitement antiviral validé. La question : cette épidémie liée à une zoonose [du grec ζῷον : zôion : animal + νόσος : nósos : maladie] peut-elle reprendre tous les ans ? Importance de la surveillance en Chine de la civette et autres animaux sauvages vendus sur les marchés et utilisés en plats cuisinés.

Comment ?

• REPLICATION CYTOPLASMIC :

1. Attachement of the viral S protein (maybe also HE if present) to host receptors mediates endocytosis of the virus into the host cell.

2. Fusion of virus membrane with the endosomal membrane (probably mediated by S2), ssRNA(+) genome is released into the cytoplasm.

3. Synthesis and proteolytic cleavage of the replicase polyprotein.

4. Replication occurs in viral factories. A dsRNA genome is synthesized from the genomic ssRNA(+).

5. The dsRNA genome is transcribed/replicated thereby providing viral mRNAs/new ssRNA(+) genomes. GENE EXPRESSION : The virion RNA is infectious and serves as both the genome and viral messenger RNA. Genomic RNA encodes ORF1a, as for ORF1b, it is translated by ribosomal frameshifting. Resulting polyproteins pp1a and pp1ab are processed into the viral polymerase (RdRp) and other non-structural proteins involved in RNA synthesis. Structural proteins are expressed as subgenomic RNAs.

6. Synthesis of structural proteins encoded by subgenomic mRNAs.

7. Assembly and budding at membranes of the endoplasmic reticulum (ER), the intermediate compartments, and/or the Golgi complex.

8. Release of new virions by exocytosis. A SARS-CoV-infected cell with virus particles in vesicles, which appear to migrate toward the cell surface and fuse with the plasma membrane, releasing the viral particles. Many of the particles adhere to the plasma membrane, creating a characteristic knob-like appearance on the surface of the cell.

Modifié d’après https://viralzone.expasy.org/764?outline=all_by_species et http://www.chups.jussieu.fr/polys/viro/oldpoly/POLY.Chp.8.html

https://fr.wikipedia.org/wiki/Coronavirus

https://youtu.be/PWzbArPgo-o

https://evolution.berkeley.edu/evolibrary/news/200409_coronavirus

sitographie

https://www.gouvernement.fr/info-coronavirus/carte-et-donnees

https://nextstrain.org/ncov/gisaid/global/6m

https://www.sentiweb.fr/france/fr/?

https://informationisbeautiful.net/visualizations/covid-19-coronavirus-infographic-datapack/#treatments

2/ Classification des virus

Virus en 3D : http://www.pbs.org/spillover-zika-ebola-beyond/about-viruses/virus-explorer/

Classification des virus => particularités structurales et fonctionnelles des virus

https://fr.wikipedia.org/wiki/Classification_des_virus

cours destiné aux étudiants en pharmacie : http://unt-ori2.crihan.fr/unspf/2010_Lille_Goffard_Virologie/co/03_classification_virale.html

fac médecine Jussieu : http://www.chups.jussieu.fr/polys/viro/oldpoly/POLY.Chp.1.html

Univ microbio Nantes : http://www.microbiologybook.org/French-virology/virol-french1.htm

universalis : https://www.universalis.fr/classification/sciences-de-la-vie/microbiologie/virologie/classification-des-virus/

virology : http://www.virology.wisc.edu/virusworld/viruslist.php

viralzone : https://viralzone.expasy.org/

dossier virus de l'INSERM : https://my.visme.co/view/kkyo6erk-exposition-inserm-des-virus-emergents-et-des-epidemies-3

vivants ou pas ? + Organique et non minéral, nait, se reproduit, meurt, - ne peut se faire sans la cellule hôte, pas d’exitence propre,

3/ Chasse aux microbes

antibiotiques : http://www.futura-sciences.com/fr/definition/t/medecine-2/d/antibiotique_2992/

Chikungunya virus loves warm New York winters : http://www.newscientist.com/article/dn21816-chikungunya-virus-loves-warm-new-york-winters.html

Public bathrooms house thousands of kinds of bacteria : http://blogs.scientificamerican.com/guest-blog/2011/11/23/public-bathrooms-house-thousands-of-kinds-of-bacteria/

MAIS :

Drug-Resistant Genes Spread among Bacteria : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=resistant-bacteria-genes

Sequencing Staph: New Genetic Analysis Tracks MRSA Mutations : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=mrsa-genome-sequencing

WHO demands action on drug-resistant gonorrhoea : http://www.newscientist.com/article/dn21910-who-demands-action-on-drugresistant-gonorrhoea.html

ET : rappels de 2° sur microbiote

How Bacteria in Our Bodies Protect Our Health : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=ultimate-social-network-bacteria-protects-health

Explore the Human Microbiome : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=microbiome-graphic-explore-human-microbiome#

Humans Carry More Bacterial Cells than Human Ones : http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=strange-but-true-humans-carry-more-bacterial-cells-than-human-ones

exploring biodiversity that live on us : http://www.yourwildlife.org/

§ comment l'organisme se défend-t-il contre une infection ?

2/ LE FONCTIONNEMENT DU SYSTÈME IMMUNITAIRE HUMAIN

Le système immunitaire est constitué d'organes, de cellules et de molécules qui coopèrent pour assurer l’immunité de l'organisme et contribuer ainsi à sa santé. L’immunité est un ensemble de mécanismes intégrés visant à protéger l’organisme des agents infectieux, des cellules cancéreuses ou des dommages tissulaires. Tous les êtres vivants ont des systèmes de défense adaptés à leurs caractéristiques et leurs besoins. Chez les animaux, ces systèmes comprennent des dispositifs de surveillance qui fonctionnent sans relâche et qui patrouillent dans tout l’organisme, ainsi que des mécanismes de réaction déclenchés par la perception d’un élément étranger ou la modification d’une cellule de l’organisme.

Ce système comprend deux étages de défenses aux stratégies différentes :

 l’immunité́ innée, la première à s’être mise en place aux cours de l’évolution, chez l’ancêtre commun des animaux ;

 l’immunité́ adaptative qui apparaît chez les vertébrés, s’ajoute et se combine à l’immunité innée.

Les capacités immunitaires d’un individu évoluent au cours de sa vie suite au contact avec différents antigènes. Elles faiblissent chez les personnes âgées. Elles peuvent être enrichies dès l’enfance et pendant toute la vie grâce à l'aide de vaccins, de sérums, de transplantations et autres interventions médicales préventives ou curatives.

2,1/ L’IMMUNITÉ INNÉE

Objectifs : le déclenchement d'une réaction immunitaire et l'importance de la réaction inflammatoire.

2,1,1/ Importance de la réaction inflammatoire.

1/ Réaction inflammatoire

Bd : Dr j’ai mal

Le quadrilatère de Celsus¹ : tumor, rubor, calor, dolor

symptômes stéréotypés (gonflement, rougeur, chaleur, douleur)

La réaction inflammatoire est essentielle. Elle traduit l’accumulation de molécules et de cellules immunitaires au lieu d’infection ou de lésion. Aigüe, elle présente des symptômes stéréotypés (rougeur, chaleur, gonflement, douleur). Elle prépare le déclenchement de l'immunité adaptative.

2/ cellules sanguines

- Observer et comparer une coupe histologique ou des documents en microscopie avant et lors d'une réaction inflammatoire aiguë.

1. Quelle différence observez-vous entre les deux frottis sanguins ? Entre les deux personnes ?

2. En vous aidant des dessins, légendez chaque cellule avec son initiale sur les photos.

3. Coloriez et légendez les dessins : membrane, noyau, cytoplasme.

4. Ecrivez en deux mots quel est le rôle de chaque type cellulaire.

- Recenser, extraire et exploiter des informations, sur les cellules impliquées dans la réaction inflammatoire aiguë.

Photos :

http://library.med.utah.edu/WebPath/jpeg5/HEME100.jpg

http://umvf.univ-nantes.fr/hematologie/enseignement/hematologie_166/site/html/images/figure_3.JPG

http://www.jle.com/e-docs/00/04/12/2C/texte_alt_jleabc00134_gr1.jpg

http://www.chups.jussieu.fr/polys/histo/histoP1/celllibres.html#ID-130

http://fr.academic.ru/dic.nsf/frwiki/1630808

https://cytologie-sanguine.com/html/sangnormal.php

schémas :

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article433

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article642&var_recherche=cellules+sang

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article734

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article2025

http://histoblog.viabloga.com/images/plasmo_t.800.jpg

globules = cellules = _cytes [κυτος : creux, vase, corps, cavité]

blanc = leuco_ [λευκος : blanc]

• thrombocytes = plaquettes [θρόμβωσις : coagulé]

• érythrocytes → globules rouges = hématies [ἐρυθρός : rouge][αίμα : sang]

• leucocytes = globules blancs

Organes lymphoïdes : rate, appendice, ganglions …

cellules immunitaires = leucocytes = globules blancs : macrophage [φάγος : glouton] , monocyte [μόνος : seul, unique], granulocyte [granulum : petit grain], phagocyte [μακρος : gros], mastocyte [all : gros], lymphocyte [νύμφη : nymphe]

3/ Molécules (anti)inflammatoires

COX = cyclooxygénase

- Recenser, extraire et exploiter des informations, sur les molécules impliquées dans la réaction inflammatoire aiguë.

- Recenser, extraire et exploiter des informations, y compris expérimentales, sur les effets de médicaments antalgiques et anti-inflammatoires.

réaction inflammatoire, médiateurs chimiques de l'inflammation, médicaments anti-inflammatoires

effet de l'aspirine sur la COX : http://www.takween.com/biotechnologies/prostaglandines-cyclooxygenase-aspirine.html

L’aspirine en prévention du cancer ? : http://www.futura-sciences.com/fr/news/t/medecine/d/laspirine-en-prevention-du-cancer_26515/

1Aulus Cornelius Celsus, francisé en Celse, est un polygraphe (auteur non spécialiste qui écrit sur des sujets variés) de l'Antiquité. il semble cependant certain qu'il ait vécu au temps de l'empereur Auguste (de la fin du I^er siècle av. J.-C.. au début du I^er siècle). né à Vérone, il écrivit le De Artibus, ouvrage aujourd'hui disparu, une vaste encyclopédie couvrant des domaines aussi variés que l'agriculture, l'art militaire, la rhétorique, la philosophie, la jurisprudence et la médecine. Celse était un encyclopédiste. Selon le jugement de Quintilien (XII, c ri), il traitait avec un intérêt égal l'agriculture, l'art militaire et la médecine ….

3/ modélisation moléculaire de l’ADN / logiciel

? Faire un compte-rendu individuel sur feuille :

 utiliser un logiciel pour synthétiser/simplifier/construire/schématiser une molécule d'ADN

Objectifs : Exprimer et exploiter des résultats à l’écrit en utilisant les technologies de l’informatique

Principe : les logiciels Rastop, Rasmol, Raswin, Jmol, … sont des banques de données permettant de manipuler des modèles moléculaires.

Protocole :

1. Ouvrez le fichier « ADN » : https://libmol.org/?libmol=158

2. Admirez la molécule en la manipulant à la souris.

3. Changer (commande) la représentation des atomes et des liaisons.

4. Colorez la molécule par « atomes » : quels sont les atomes composant l’ADN ?

5. Colorez la molécule par « chaines » : combien de parties lui trouvez-vous ?

6. Affichez les « rubans » puis « squelette » : quelle est la forme globale de la molécule ?

7. Dessinez la forme globale de la molécule

8. Colorez la molécule par « résidus» : combien de nucléotides différents existe-t-il ? quels sont leurs noms (passez la souris dessus) ?

9. Quelle est la composition, la structure d'un nucléotide ? Utilisez vos notes et les informations du logiciel pour comprendre.

10. Schématisez la structure d'un nucléotide en utilisant différents symboles et couleurs de votre choix.

11. En 1951 Chargaff démontre que [A] = [T] et [C] = [G] pour toute cellule. Que signifie l'expression « bases complémentaires » ?

12. En utilisant les symboles précédents schématisez la structure de la molécule à plat, sans tenir compte de la forme dans l'espace.

Logiciels anatomie en 3D :

https://www.zygotebody.com/

https://cosphilog.fr/oscar3d/

Pancréas humain :

Tissu	ilôt endocrine	acinus exocrine
cellule	cellules A&B	cellule acineuse
organite	vésicules	vésicules
molécule	Hormones (glucagon, insuline, ...)	Enzymes (lipase, amylase, ...)
fonction	RÉGULATION GLYCÉMIE	DIGESTION ALIMENTS

spécialisation cellulaire,

Les cellules spécialisées ont une fonction particulière dans l’organisme, en lien avec leur organisation

Toutes les cellules d’un organisme sont issues d’une cellule unique (zygote) à l’origine de cet organisme.

Elles possèdent toutes initialement le même ADN mais n’expriment qu’une partie de l’information génétique.

§ qu’est-ce que l’ADN ?

2/ Histoire de la découverte de l’ADN

Quelle est l'histoire de la pensée humaine en matière de génétique ?

? notez les découvertes progressives

Réalisez une frise chronologique pour comprendre l’histoire des idées, le cheminement de la pensée humaine

• 1865 (Autriche) Mendel démontre l'existence de "facteurs génétiques"

• 1868 (Suisse) Miescher trouve une substance spécifique du noyau qu'il nomme la "nucléine"

• 1882 (Allemagne) Flemming, van Beneden & Strasburger dessinent les chromosomes lors de la division cellulaire.

• 1883 (Allemagne) Weismann utilise le terme "matériel génétique"

• 1900 (Hollande, Allemagne, Autriche) DeVries, von Tschermak et Correns redécouvrent le travail de Mendel

• 1901 (Allemagne) Kossel découvre les quatre bases nucléiques : Adénine, Guanine, Thymine et Cytosine

• 1903 (Amérique) Sutton fait l’hypothèse que les chormosomes sont le support de l’hérédité

• 1905 (Angleterre) Bateson utilise le terme “genetics” pour l'étude des caractères héréditaires

• 1909 (Danemark) Johannsen propose le mot gène pour remplacer celui de facteur utilisé par Mendel

• 1910 (Amérique) Morgan montre que les gènes sont portés par les chromosomes

• 1919 (Russie) Levene décrit la structure des nucléotides : phosphate-sucre-base

• 1928 (Amérique) Griffith démontre que l’hérédité est donnée par une molécule

• 1933 (France) Brachet démontre que l’ADN est dans les chromosomes

• 1937 (Angleterre) Astbury démontre que l’ADN a une structure en long filament

• 1944 (Amérique) Avery, Mc Leod & Mc Carty montrent que l'ADN est le support des gènes

• 1951 (Amérique) Chargaff établit la règle : [A] = [T] et [C] = [G] pour toute cellule

• 1953 (Angleterre) Franklin & Wilkins montrent que la molécule a la forme d'une double hélice

• 1953 (Amérique, Angleterre) Watson & Crick établissent le modèle moléculaire de l'ADN

• ...

compléter avec :

http://www.medecine.unige.ch/enseignement/dnaftb/

http://www.genoscope.cns.fr/externe/HistoireBM/

https://www.timetoast.com/timelines/genetics-timeline--15

https://www.timetoast.com/search/timelines?cx=partner-pub-3637961829875093%3Aehixnl-dg1y&cof=FORID%3A9&ie=UTF-8&q=genetics&sa=Search&siteurl=localhost%2F&ref=localhost%2Fcategories&ss=

DNA from the begining : http://www.dnaftb.org/

Lettre de Crick à son fils Mickael du 19/03/1953 : https://planet-vie.ens.fr/article/2459/lettre-francis-crick-son-fils-1953#telechargements

frise interactive : https://www.timetoast.com/timelines/dna-17486a4b-a390-4854-8b8b-89fe8efabeb1

ADN, double hélice,

nucléotides (adénine, thymine, cytosine, guanine), complémentarité,

l’information génétique est organisée en gènes constitués d’ADN (acide désoxyribonucléique).

CORRECTION

Exercice 1 Bac Spécialité SVT Métropole 11 septembre 2024 (session de remplacement): Génétique et contraction musculaire

	logique & organisée		complète & exacte		claire & correcte
	Introduction définitions problématique plan Organisation faits & idées 2 à 4 § transitions Conclusion bilan ouverture		MYH7 code une chaîne de la myosine un allèle dominant suffit à provoquer la maladie risque de transmission (≈ 50 %) mutation → myosine anormale → contraction perturbée structure/fonction de la myosine (tête, activité ATPasique, interaction actine-myosine) mécanisme de contraction myosine anormale : mauvaise fixation à l’actine, défaut d’ATPase, force réduite désorganisation des sarcomères / accumulation de myosine anormale effet dominant négatif (la protéine mutée perturbe la normale) Conséquences physiologiques : faiblesse musculaire, myopathie génotype : présence d’un allèle muté dominant phénotype moléculaire : myosine anormale phénotype cellulaire : dysfonctionnement des fibres musculaires phénotype macroscopique : faiblesse musculaire, troubles de la contraction		syntaxe, orthographe, présentation, propreté, soin, illustration vocabulaire	7 6 5 4 3 2 1 0

Exercice 2 deuxième proposition bac Spécialité SVT 15 mars 2021 Métropole - Les climats de la Terre : comprendre le passé pour agir aujourd'hui et demain

	démarche		documents		connaissances		rédaction
	cohérente complète pertinente rigoureuse Introduction définitions problématique plan Organisation faits & idées 2 à 4 § transitions Conclusion bilan ouverture		doc.1 : graphe données niveau marin diminue de ~ 60 m ↓T°C δ18O augmente de ~ 1‰ ↓T°C [CO2] diminue de ~ 300 ppm ↓Effet serre [CO2] seuil glaciation antarctique doc.2 : carte courants antarctique ouverture passage de Tasmanie <86Ma ouverture passage de Drake <34Ma création du courant froid circumpolaire doc.3 : tableau albédo glace et neige > sable, mer, .... doc.4+5 : équations/log stratigraphique Eocène : sédimentation détritique forte = libère CO2 volcanisme = libère du CO2 Oligocène : altération des roches = piège à CO2 photosynth. mat.orga.pélites = piège CO2 discordance		phosphatières Valdro baisse de température augmentation glaces pôles baisse effet serre courant froid polaire circulation circumpolaire boucles de rétroactions amplification albédo Orogénèse alpine Importante altération des reliefs Consommation de CO2 baisse du CO2 atmosphérique Diminution de l'effet de serre Refroidissement global Mécanismes amplificateurs (albédo, solubilité du CO2)		syntaxe, orthographe, présentation, propreté, soin, illustration vocabulaire	8 7 6 5 4 3 2 1 0

text read 6'56 : https://www.nationalgeographic.com/history/article/neanderthal-fetus-bottleneck What a 55,000-year-old fetus reveals about the decline of Neanderthals

By sequencing ancient DNA from the fetus, scientists revealed a severe genetic bottleneck that reshaped Neanderthal history long before they vanished. ByTom Metcalfe Published March 23, 2026

video 4'20 : https://youtu.be/FMc81qpCQ3g?si=jmUPyxxXDsTJRbhw Who were the neanderthals? Do humans really share some of their DNA? Learn facts about Neanderthal man, the traits and tools of Homo neanderthalensis, and how the species fits into our evolution story.

Fossil fuels

video 4'40: https://youtu.be/e9wiM_mUbXU What is oil even made of? Here's how fossil fuels form in the ocean and how scientists know where to find it.

text : https://www.livescience.com/9404-mysterious-origin-supply-oil.html

Zero Gravity, Zero Gain: The Genetics Behind Muscle Loss in Space

Simulated microgravity in mice reveals a constellation of genes that may influence muscle weakening during spaceflight.

Kamal Nahas, PhD Jan 29, 2024 | 4 min read

Floating through the weightlessness of space, astronauts seldom need to flex their muscles. Slowly diminishing in size and strength, their wasting muscles struggle to support their weight when they return to Earth.¹ Space travel’s next frontiers require long-haul odysseys, leaving scientists to contend with the toll of prolonged spaceflight on human anatomy. “Some people lose a ton of bone and muscle, and other individuals lose very little, so that suggests that, not surprisingly, genetic diversity plays a role,” said Henry Donahue, a biomedical scientist at Virginia Commonwealth University. Reporting in npj Microgravity, Donahue and his team placed genetically distinct mice in simulated gravity to explore whether genes influence muscle loss.² They found that some mice were more susceptible to muscle loss, but they spotted three genes that showed disrupted expression across all strains.

“Clearly this has implications for spaceflight and any future plans on inhabiting any sort of planets, including Mars,” said Stefan Judex, a biomedical engineer at Stony Brook University who was not involved with the work. However, Judex noted, “It must be viewed as a first step simply because this is a mouse study and not a human study.” 

In a previous animal study, scientists searched for the genetic culprits behind muscle weakening, but they used a single strain in order to limit unexplainable variation in the results.³ “That’s like doing a clinical trial on one person,” Donahue noted. Instead, his team used eight genetically distinct mouse strains to explore muscle loss across a diverse population.

248 words

https://www.the-scientist.com/news/zero-gravity-zero-gain-the-genetics-behind-muscle-loss-in-space-71612

phylogène : collection "Homininés"

1. sélectionner la collection "Homininés"

2. consulter les informations de quelques fossiles

3. comparer les fossiles

4. construire une matrice

5. polariser les états de caractères

6. trouver les états primitifs

7. choisir le taxon extragroupe

8. colorer les états primitifs suivant l'extragroupe

9. coder les états dérivés en colorant les cellules

10. trier la matrice, organiser le tableau

11. établir des parentés pour obtenir un arbre

12. organiser les données paléonthologiques

13. réaliser un compte-rendu