Le microbiote à la croisée de l’humain et de la biodiversité
Pages 221 à 225
mercredi 8 juillet 2026
Les non-dits de l’excrétion
Professeur du Muséum national d’histoire naturelle, Institut de
systématique, évolution, biodiversité, membre de l’Institut
universitaire de France
Vignette (© Marc Selosse).
L’excrétion élimine les déchets du métabolisme d’un organisme : de nombreux lecteurs se souviennent sans doute de leurs cours de physiologie animale à ce sujet… Rien en physiologie végétale, car les autotrophes ne produisent pas de déchets métaboliques (nous verrons que c’est faux, mais c’est, en creux, l’image souvent laissée par nos études).
samedi 27 juin 2026
Le GIEC abandonne son pire scénario sur le climat
extrait de https://www.laselectiondujour.com/giec-abandonne-pire-scenario-climat-mea-culpa
Par Martin Dousse. Synthèse n°2707, Publiée le 17/06/2026
Le principal bouleversement, officiellement mis à jour en mai dernier, réside dans l'abandon du scénario de trajectoire d'émissions le plus sombre, baptisé RCP 8.5. Ce modèle, qui prédisait une hausse des températures de l'ordre de 5 °C (notamment popularisé en France par le climatologue Jean Jouzel), a servi de base pendant deux décennies à la quasi-totalité des choix réglementaires et budgétaires occidentaux. Le GIEC reconnaît désormais que ce scénario est hautement improbable. Le modèle RCP 8.5 reposait en effet sur des postulats appliqués à l'horizon 2100 jugés aujourd'hui irréalistes :
- Une absence totale de déploiement des énergies renouvelables ;
- Un recours mondial massif et exponentiel au charbon ;
- Une explosion démographique projetant la population mondiale à 13 milliards d'habitants.
Aujourd'hui, les projections démographiques montrent que le développement économique s'accompagne d'une dénatalité globale et d'une stabilisation de la population. En intégrant ces réalités démographiques dans l'équation de Kaya (qui régit les émissions de CO₂), les prévisions les plus catastrophiques perdent leur crédibilité scientifique sans qu'il soit nécessaire d'imposer une décroissance énergétique. Les mouvements écologistes les plus politisés observent un silence notable face à cette révision, le catastrophisme constituant leur principal levier d'action.
vendredi 26 juin 2026
mardi 16 juin 2026
Sujet du bac spé SVT - Jour 1, 16 juin
Le sujet de SVT du bac 2026 est composé de deux exercices obligatoires :
Exercice 1 (question scientifique notée sur 7 points) : Stress et fuite
Expliquer comment l’intervention du système nerveux dans la réaction de stress et dans le mouvement volontaire permet à l’organisme de prendre la fuite de manière efficace.
Exercice 2 (rédaction appuyée sur un dossier documentaire, notée sur 8 points) : Effets d’éruptions volcaniques majeures sur la température atmosphérique
Expliquer comment des éruptions volcaniques majeures ont pu provoquer des variations de la température atmosphérique à différentes échelles de temps.
.https://www.letudiant.fr/bac/corriges-du-bac/article/sujets-et-corriges-du-bac-svt-2026.html#partage
mercredi 3 juin 2026
Tests de séropositivité
- Concevoir et réaliser des expériences permettant de mettre en évidence les immunoglobulines lors de la réaction immunitaire, de caractériser la spécificité́ des molécules intervenant dans l'immunité́ adaptative.
Le test de dépistage du SIDA comme du Corona se fait en différentes étapes, de plus en plus complexes donc précises mais chères, donc que l’on effectue en cas de séropositivité suspectée : Ouchterlony → ELISA → WESTERN BLOT
méthode d' Ouchterlony
schématisez
si le test d’Ouchterlony est positif on effectue le test ELISA :
Mettre en contact le serum (sang sans globules) du patient à tester avec les antigènes (morceaux de VIH, de COV2…)
Rincer pour éliminer tout ce qui n’est pas fixé, si le serum à tester contient des anticorps contre l’antigène, ces anticorps vont se fixer à l’antigène et donner des complexes immuns, invisibles à l’oeil nu, d’où la suite du test :
Ajouter des anticorps-traceurs reconnaissant les complexes immuns
Rincer pour éliminer tout ce qui n’est pas fixé, si les complexes immuns se sont formés, les anticorps-traceurs restent fixés
Ajouter le révélateur : les anticorps-traceurs sont des anticorps sur lesquels on a fixé une enzyme, le révélateur est un substrat de l’enzyme, la réaction est colorée. Si l’enzyme rencontre son substrat une couleur apparaît : on peut donc voir qu’il y a eu réaction
protocole du test : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/ATP/immu6el1.htm
pour en savoir plus : https://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_immuno-enzymatique_ELISA
Logiciel ELISA de Fusin :
TP à effectuer virtuellement en cliquant à la souris
si ELISA positif avec le sérum du patient => Ac dans sérum = séropositivité
si ELISA est positif on effectue le WESTERN BLOT
Logiciel VIH de Perez à télécharger : https://disciplines.ac-toulouse.fr/svt/les-logiciels-de-pierre-perez
4,2,3/ Bilan cellulaire du métabolisme
1/ Deux types de métabolismes
Schématiser des flux de matière et d’énergie au sein d’un organisme, entre les organismes et avec le milieu.
Respiration : C6H12O6 + 6O2 → 6CO2 + 6H2O
Fermentation : C6H12O6 → 2C2H6O + 2CO2
Photosynthèse : 6CO2 + 6H2O → C6H12O6 + 6O2
Les êtres vivants échangent de la matière et de l’énergie avec leur environnement (milieu, autre organisme) pour assurer les besoins de leur métabolisme (autotrophe, hétérotrophe).
autotrophe : se nourrit [trofein] tout seul [auto], sans matière organique produite par un autre [etero] être vivant
hétérotrophe : se nourrit [trofein] de matière organique, donc de matière produite par un autre [etero] être vivant
2/ Organites spécialisées, les plastes
Organites spécialisées |
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Métabolisme type |
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type trophique |
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ex d'organisme |
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le type de métabolisme dépend de l’équipement spécialisé de chaque cellule (organites)
Les voies métaboliques sont interconnectées par les molécules intermédiaires des métabolismes. Une voie métabolique est une succession de réactions biochimiques transformant une réaction en une autre. Celui-ci dépend de l’équipement spécialisé de chaque cellule (macromolécules dont les enzymes)
netotheque
bilan video et doc à compléter : https://youtu.be/HPsTGfgFYvE?si=CQ1VMnvCDFwUefqN
B/Le métabolisme des cellules
Expérimenter des réactions du métabolisme pour les caractériser.
Mettre en oeuvre des expériences pour identifier les substrats et produits du métabolisme.
Schématiser des flux de matière et d’énergie au sein d’un organisme, entre les organismes et avec le milieu.
métabolisme, autotrophe, hétérotrophe, organites, enzymes, photosynthèse
Pour assurer les besoins fonctionnels d’une cellule, de nombreuses transformations biochimiques s’y déroulent : elles constituent son métabolisme. Une voie métabolique est une succession de réactions biochimiques transformant une réaction en une autre. Celui-ci dépend de l’équipement spécialisé de chaque cellule (organites, macromolécules dont les enzymes). Les êtres vivants échangent de la matière et de l’énergie avec leur environnement (milieu, autre organisme). Les voies métaboliques sont interconnectées par les molécules intermédiaires des métabolismes.
vendredi 29 mai 2026
2,2,3/ Acquisition d’un répertoire immunitaire
1/ Tolérance immunitaire
- Recenser, extraire et exploiter des informations, y compris expérimentales, sur les cellules et les molécules intervenant dans l'immunité́ adaptative.
C’est dans les organes lymphoïdes primaires que la plus grande partie des lymphocytes capables de percevoir le soi (autoréactifs) sont éliminés par apoptose
Les organes lymphoïdes doivent donc posséder un échantillon des signaux du soi Les cellules présentatrices d’antigène (et en particulier les cellules dendritiques) jouent un rôle fondamental dans le maintien ou la rupture de la tolérance immunitaire
Un lymphocyte en contact ligand-récepteur avec une cellule présentatrice de l'antigène (dendritique ou macrophage) va être mis en
anergie ou
apoptose ou
prolifération
La nature du problème :
Les lymphocytes T et les lymphocytes B perçoivent constamment des signaux antigéniques auxquels il serait in/opportun de répondre
Un système de filtrage actif des signaux doit donc être mis en place.
L’effet de ce filtrage, c’est la tolérance immunitaire
coopération entre immunité innée et adapative
cellules dendritiques
éliminer les cellules autoréactives
garder des cellules tolérantes au soi et intolérantes à un antigène
lymphocytes B → plasmocytes sécrétant des Immunoglobulines
lymphocytes cytotoxiques : LT CD8 → LTcytotoxique
lymphocytes T CD4 → lymphocytes T auxiliaire sécrétant des Interleukines
IL = Interleukines [entre - globules blancs]
Les cellules activées (LTc, LTa, Plasmo¢) prolifèrent dans les ganglions lymphoïdes
complexe majeur d’histocompatibilité (CMH)
Dans la diversité produite, une première sélection élimine ce qui est incompatible avec le soi, évitant des réactions immunitaires qui se déclencheraient contre des parties saines de l'organisme. Les cellules restantes de l'immunité adaptative circulent dans un état dormant dans le sang et dans la lymphe.
Elle assure une action spécifique contre des motifs moléculaires portés par des agents infectieux ou des cellules anormales.
Elle met en jeu des molécules et des cellules particulières, notamment les anticorps et les cellules qui les produisent.
2/ Liens immuns entre mère et fœtus
molécules du CMH (complexe majeur d'histocompatibilité) chez les vertébrés
= molécules HLA (human leucocytes antigen)
Le CMH humain est dénommé HLA
3/ Mémoire immunitaire
https://prezi.com/view/fKHo0RA5WMawOyXlyvgw/
http://www.larousse.fr/encyclopedie/medical/m%C3%A9moire_immunitaire/14492
2e rencontre avec antigène : amplification, mémoire immunitaire
sélection (activation), amplification (expansion) et différenciation clonale
Lors d’une deuxième phase de sélection, quelques-unes sont activées après une première rencontre avec un antigène particulier. Les phénomènes de sélection, d'amplification et de différenciation clonales qui s’ensuivent expliquent le délai de la réaction adaptative (plusieurs jours chez l’être humain).
Video INSERM 3’49 : https://youtu.be/m5SprSTxWfQ
L’immunité adaptative met en place des cellules mémoire à longue durée de vie. Ces cellules permettent une réponse secondaire à l'antigène plus rapide et quantitativement plus importante qui assure une protection de l'organisme vis-à-vis de cet antigène. C’est le fondement de la vaccination.
4/ Adaptative car acquise
Video INSERM 6’29 : https://youtu.be/TVoqiqwtbsA
Le système immunitaire n’est pas un organe isolé dans l’organisme ; il est diffus et interagit avec les différentes parties du corps (cerveau, intestins, etc.). L'immunité adaptative complète l’immunité innée chez les vertébrés. Associée à l’immunité innée, elle réussit le plus souvent à éliminer la cause du déclenchement de la réaction immunitaire.
webographie / L'immunité adaptative
Video 6'49 :https://www.khanacademy.org/science/high-school-biology/hs-cells/hs-prokaryotes-and-eukaryotes/v/prokaryotic-and-eukaryotic-cells Prokaryotic and eukaryotic cells : Eukaryotic cells contain membrane-bound organelles (such as the nucleus and mitochondria), while prokaryotic cells do not. DNA in eukaryotic cells is found inside the nucleus, while DNA in prokaryotic cells is located in the cytoplasm. Eukaryotic cells are generally larger and more complex than prokaryotic cells. Eukaryotic organisms include animals, plants, fungi, and paramecia. Prokaryotic organisms include bacteria and archaea.
Video 2'58 : https://youtu.be/M1wdIdCOk-Y
video 4'59 : https://youtu.be/ApvxVtBJxd0?si=Dg-UVvKUl1OZ2LxL
mercredi 27 mai 2026
2,2,2/ Collaboration avec les défenses innées
1/ Expérience historique
En 1966 Claman a montré qu’une souris privée de thymus et de moelle osseuse par irradiation à la naissance ne produit plus d’anticorps. Cependant dans certaines conditions, la production d’anticorps peut être rétablie.
2/ Cellules en coopération
- Estimer le nombre et la diversité des cellules et des molécules nécessaires à l’immunité adaptative, notion de combinatoire.
Réalisez un schéma de synthèse des différentes expériences
coopération cellulaire → activation anergie ou apoptose
activation = différentiation de cellules dites « naïves » → en cellules compétentes
lymphocytes LT(CD)8 → LT cytotoxiques
lymphocytes LT(CD)4 → LT régulateurs = auxiliaire
lymphocyte B → Plasmocyte
3/ Molécules de reconnaissance entre cellules
CPA, LT/B, CMH, TCR, BCR, CD
coopération cellulaire
cellules présentatrices de l'antigène
activation des lymphocytes naïfs
lymphocytes LTCD4
CMH = complexe majeur d'histocompatibilité
CD = cluster of differentiation
bilan video duplos https://youtu.be/QQPfQMg4wgY?si=HKLT6rpe6h2uoKUv
correction TP et bilan
Bilan/ L’organisme pluricellulaire, un ensemble de cellules spécialisées
Réaliser et /ou observer des préparations microscopiques montrant des cellules animales ou végétales.
Observer et analyser des images de microscopie électronique.
Distinguer les différentes échelles du vivant (molécules, cellules, tissus, organes, organisme) en donnant l’ordre de grandeur de leur taille.
cellule, matrice extracellulaire/paroi, tissu, organe ; organite, spécialisation cellulaire, ADN, double hélice, nucléotides (adénine, thymine, cytosine, guanine), complémentarité, gène, séquence.
Les cellules spécialisées ont une fonction particulière dans l’organisme, en lien avec leur organisation et la structure moléculaire l’ADN lui permet de porter une information.
La matrice extracellulaire est constituée de différentes molécules qui, dans leur grande majorité, permettent l’adhérence cellulaire.
Chez les organismes unicellulaires, toutes les fonctions sont assurées par une seule cellule. Chez les organismes pluricellulaires, les organes sont constitués de cellules spécialisées formant des tissus, et assurant des fonctions particulières.
Toutes les cellules d’un organisme sont issues d’une cellule unique à l’origine de cet organisme. Elles possèdent toutes initialement la même information génétique organisée en gènes constitués d’ADN (acide désoxyribonucléique). Cependant, les cellules spécialisées n’expriment qu’une partie de l’ADN.
netographie
https://www.thinglink.com/scene/781537682185519105
https://989723745328449866.weebly.com/cours-1.html#
https://989723745328449866.weebly.com/uploads/5/3/3/2/53321233/cours_1.pdf
http://www.medecine.unige.ch/enseignement/dnaftb/
http://www.genoscope.cns.fr/externe/HistoireBM/
https://www.timetoast.com/timelines/genetics-timeline--15
DNA from the begining : http://www.dnaftb.org/
Lettre de Crick à son fils Mickael du 19/03/1953 : https://planet-vie.ens.fr/article/2459/lettre-francis-crick-son-fils-1953#telechargements
frise interactive : https://www.timetoast.com/timelines/dna-17486a4b-a390-4854-8b8b-89fe8efabeb1
évaluation
pour s'entrainer : https://www.qcm-svt.fr/QCM/public-seconde.php
QCM en ligne : https://www.assistancescolaire.com/eleve/2nde/svt/reviser-le-cours/2_svt_01#exercicet2
4,2/ LE MÉTABOLISME DES CELLULES, UN ENSEMBLE DE REACTIONS CHIMIQUES
métabolisme = transformations biochimiques = ensemble des réactions chimiques dans une cellule, un individu
4,2,1/Transformations biochimiques de matière organique
matière organique = contient C-H, molécules du vivant
le pain, le vin, le cidre et la bière sont produits grâce à un champignon, la levure Saccaromyces cerevisiae.
Comment cet organisme vivant permet-il les transformations utilisées par l’homme depuis des millénaires ?
? Écrivez les recettes, sous forme d’équations chimiques, de ces transformations biologiques
: farine + eau + levure → → pain (bulles gaz)
: raisin + levure → vin (alcool (éthanol))
: pomme + levure → cidre (alcool (éthanol) + gaz (mousse))
: malt + houblon + eau + levure → bière (alcool (éthanol) + gaz (mousse))
1/ Observation de levures au microscope
Observation au microscope photonique puis éléctronique (document)
organites : mitochondries, vacuole, ...
cytoplasme = cytosol + organites
2/ Mesures du métabolisme des levures
? Mettre en oeuvre des expériences pour identifier les substrats et produits du métabolisme.
Expérience avec rouge de crésol : dessinez le montage expérimental
2KOH + CO2 → K2CO3 + H2O
Le rouge de crésol a la propriété de changer de coloration lorsque le pH varie (jaune en milieu acide, violet en milieu basique). C'est ce qu'on appelle un indicateur coloré de pH.
Expérience avec eau de chaux
L’eau de chaux est une solution saturée d’hydroxyde de calcium Ca(OH)2, produite en mélangeant de la chaux aérienne à de l’eau. La chaux se dissout (faiblement) dans l’eau et le filtrat obtenu constitue l’eau de chaux.
L'eau de chaux se trouble en présence de dioxyde de carbone CO2, qu'elle met en évidence. Le précipité blanc ainsi formé est du carbonate de calcium CaCO3. La réaction est la suivante :
Ca(OH)2 + CO2 → CaCO3 + H2O
ou, en écrivant les espèces sous forme ionique :
Ca2+ + 2 HO− + CO2 → CaCO3 + H2O
vendredi 22 mai 2026
§ Ckoa l’immunité adaptative ?
2,2/ L'IMMUNITÉ ADAPTATIVE
Objectifs : Par l’étude d’un cas d'une infection virale (par exemple la grippe), comment se mettent en place les défenses adaptatives et comment, en collaboration avec les défenses innées, elles parviennent à l'élimination du virus.
2,2,1/ Mise en place des défenses adaptatives
1/ Expérience historique
en 1890 Von Behring montre que les antitoxines produites par un animal pourraient immuniser un autre animal
schématisez l’expérience
immunité acquise, adaptative, spécifique
2/ Réponse à médiation humorale : Anticorps
Humeurs → La théorie des humeurs est l'une des bases de la médecine antique européenne. Elle a été popularisée par Hippocrate en particulier dans De la nature de l'homme : « Le corps de l’homme a en lui sang, pituite, bile jaune et noire ; c’est là ce qui en constitue la nature et ce qui y crée la maladie et la santé. Il y a essentiellement santé quand ces principes sont dans un juste rapport de crase, de force et de quantité… »
humeurs => substance => molécule par opposition à cellule => La réponse immunitaire humorale désigne l'ensemble des processus menant à la production d'anticorps suite à une stimulation du système immunitaire.
Anticorps = Immunoglobulines = agglutinines
modèle moléculaire en 3D : Ig humaine antiGP120 complète ou modèle suivant https://libmol.org/?libmol=222
1/ admirez
2/ Quels atomes (coloriez-atomes-CPK) ?
3/ Quelle forme globale ?
4/ Combien de parties (chaines) ?
5/ Quelle nature ?
6/ Faites un schéma d’interprétation
Schématisez une Immunoglobuline en Y : 2 parties variable / fixes ; lourdes / légères
Substance protectrice, molécule capable de se fixer à un antigène. . Antikörper a été utilisé pour la première fois par le médecin allemand Paul Ehrlich (Strehlen 1854 - Bad Homburg vor der Höhe 1915) dans un article publié en octobre 1891, intitulé "Experimentelle Untersuchungen über Immunität". Les lymphocytes B activés par l’antigène se transforment en plasmocytes fabricants d’anticorps à partir d’un assemblage de 2 protéines légères (25 kDa) et 2 protéines lourdes (50 kDa) elles mêmes construites à partir de multiples gènes, la multitude de combinaison permet une adaptation des anticorps à différents antigènes nouveaux. On les classe en 5 catégories : M, G, A, D, E. Les gènes codant pour les anticorps sont situés sur les chromosomes 14 et 2 ou 22. Chaque gène (V, D, J, C) présente plusieurs variantes (numéros). Une multitude d’anticorps différents est donc possible par l’association des différentes variantes des différents gènes. Ainsi l’immunité peut s’adapter à une multitude d’antigènes.
séropositivité = production d’anticorps,
complexe immun = Ac+Ag
neutralisation de l'Ag :
agglutination : emprisonnement de l’Ag et limitation de sa propagation
neutralisation : destruction de l’Ag ou pertubation de son cycle infectieux
destruction : facilitation de la phagocytose de l'Ag / phagocytes
immunoglobulines (anticorps)
La réaction immunitaire adaptative doit prendre en compte une grande diversité d’agents pathogènes, leur variabilité et leur évolution. Cela soulève un paradoxe : pour lutter contre cette immense diversité d’agents immunogènes, elle devrait mettre en jeu beaucoup plus de gènes que n’en porte le génome humain. Des mécanismes particuliers engendrent des combinatoires immenses de gènes et de protéines composites notamment dans le cas des anticorps :
recombinaison de segments de gènes exprimant les parties constantes et variables des chaînes lourdes et légères des immunoglobulines ;
assemblage des chaînes lourdes et légères.
Ces mécanismes aléatoires engendrent une diversité telle que tous les antigènes possibles sont en principe reconnaissables.
3/ Réponse à médiation cellulaire : Cytotoxicité
Photos et schémas à compléter
lymphocytes T cytotoxiques
jeudi 21 mai 2026
cells
Text 475 words : hommage to the onion skin : https://www.microscopy-uk.org.uk/mag/artnov03/wdonion.html
Questions about cells : https://www.evolvingsciences.com/Cells yr 10 .html
Cells And Cell Theory Quiz : https://www.proprofs.com/quiz-school/story.php?title=cells-and-cell-theory-quiz
human body temperature
text 154 words : Decreasing human body temperature in the United States since the Industrial Revolution
https://elifesciences.org/articles/49555
comprehension test about
video 1'09 : https://youtu.be/Q4f4z2vUO8Q?si=h6_N1L35vzZczPQb For more than 100 years, the general assumption has been that 98.6 degrees is the normal average body temperature. But studies show it has decreased in recent years. -----
video 5'43 : https://youtu.be/1Scf7ZJcPUY?si=0d_KVoTXCobnig5p In 1851 a German doctor named Carl Wunderlich conducted a yearslong study. He went room to room in his hospital with a thermometer, taking the temperatures of some 25,000 different patients to try and pin down the average human body temperature. And he did, seventeen years later, when he published a paper with that well-known metric of 37 degrees! He also gave us the first quantitative measurement for determining if someone has a fever. 38 degrees and above. And then for the next 140 years, we just accepted this number as correct. Despite the fact that Dr. Wunderlich collected this data using a comically large, foot-long thermometer that had to be held in a patient’s armpit for 20 minutes. Because believe it or not, portable thermometers small enough fit under your tongue weren’t invented until 1866. So it wasn’t until the 1990s that another doctor decided to revisit this question using more modern equipment. And he found that yeah, the average human body temperature is ACTUALLY around 36.8 degrees Celsius.
mercredi 20 mai 2026
Antigène
Générateur d’anticorps, Antibody generating, serait la source de ce mot utilisé pour la première fois dans une publication en fançais en 1903 par le microbiologiste hongrois Laszlo Detre (Nagysurány 1874 - Washington 1939). Substance, molécule, cellule ou même organisme reconnu comme ennemi par le notre. En réaction notre système de défense fabrique des anticorps. Parfois notre défense exagère, elle reconnaît comme ennemi des innocents comme acariens, pollen, poussières, gluten, lactose … que l’on appelle alors allergènes. Dans l’autre sens certaines molécules ne peuvent à elles seules provoquer la fabrication d’anticorps, elles doivent s’associer pour devenir immunogène et on les appelle alors haptène.
épitope n.m. Partie d'une molécule capable de stimuler la production d'un anticorps.
Un épitope, aussi appelé déterminant antigénique, est une molécule qui peut être reconnue par un paratope, pour déterminer si elle appartient au domaine du soi ou au domaine du non-soi.
selon Wikipédia
2,1,2/ Déclenchement d'une réaction immunitaire
Petit jeu : Version web “en ligne” : https://www.pedagogie.ac-nice.fr/wp-content/uploads/sites/5/productions/leucowar/
1/ Phagocytose
- Observer la phagocytose par des cellules immunitaires (macrophages).
monocytes & granulocytes peuvent devenir phagocytes
Phagocytose (= macro-endocytose) :
Reconnaissance – adhésion (= opsonisation)
Internalisation / puits membranaire → phagosome
Fusion phagosome / lysosome → phagolysosome
Digestion cellulaire / enzymes lysosomales
Evacuation des déchets / exocytose
Phagocytose,
macrophages = phagocyte [φάγος : glouton] [μακρος : gros]
2/ les recepteurs de l’immunité innée car génétique
À l'occasion d'une lésion, des pathogènes peuvent s'introduire dans l'organisme par l'intermédiaire de la peau ou des muqueuses. Différentes cellules de l'immunité innée présentes dans ces tissus, souvent qualifiées de cellules résidentes, reconnaissent ces pathogènes dès leur entrée dans l'organisme. Il s'agit des cellules dendritiques, des macrophages et des mastocytes.
L'identification des pathogènes par ces cellules se fait au moyen de récepteurs qui reconnaissent des motifs moléculaires caractéristiques des micro-organismes. On parle de PRR (Pattern Recognition Receptor, Le terme fut proposé par l'immunologiste Charles Janeway en 1989) pour désigner ces récepteurs cellulaires capables de reconnaître des motifs moléculaires caractéristiques des pathogènes, motifs appelés PAMP (Pathogen Associated Molecular Patterns).
Les PRRs sont exprimés par toutes les cellules de l'immunité innée. Certains PRRs sont membranaires, d'autres sont cytoplasmiques, ce qui permet un repérage efficace du pathogène.
La reconnaissance d'un PAMP par un PRR peut en particulier :
- déclencher la phagocytose
- déclencher l'activation de la cellule et la mise en place de mécanismes effecteurs.
récepteurs de surface
L'immunité innée existe chez tous les animaux. Elle est génétiquement déterminée et présente dès la naissance. Elle opère sans apprentissage préalable. Elle repose sur des mécanismes de reconnaissance et d'action (phagocytose) très conservés au cours de l'évolution : une dizaine de types cellulaires différents (récepteurs de surface pour la reconnaissance de motifs étrangers partagés par de nombreux intrus) et une centaine de molécules circulantes (interleukines pour la communication entre cellules).
3/ Première ligne
Video INSERM 3’40 : https://youtu.be/phYppRaLCOY
Très rapidement mise en œuvre et présente en tout point de l’organisme, l'immunité innée est la première à intervenir lors de situations variées (atteintes des tissus, infection, cancérisation). C'est une première ligne de défense immunitaire qui agit d'abord seule puis se prolonge pendant toute la réaction immunitaire.
Sitographie / la réaction inflammatoire
http://www.medecine.ups-tlse.fr/DCEM2/module8/item112/indexI1.htm
http://www.chups.jussieu.fr/polys/anapath/Cours/POLY.Chp.3.html
http://umvf.univ-nantes.fr/anatomie-pathologique/enseignement/anapath_3/chap3_ensavoirplus.pdf
http://www.cours-pharmacie.com/immunologie/les-cellules-immunitaires-et-les-organes-lymphoides.html
dossier virus de l'INSERM : https://my.visme.co/view/kkyo6erk-exposition-inserm-des-virus-emergents-et-des-epidemies-3
Bilan / L’immunité innée
Connaissances
L'immunité innée existe chez tous les animaux. Elle opère sans apprentissage préalable. Elle est génétiquement déterminée et présente dès la naissance.
Elle repose sur des mécanismes de reconnaissance et d'action très conservés au cours de l'évolution : une dizaine de types cellulaires différents (récepteurs de surface pour la reconnaissance de motifs étrangers partagés par de nombreux intrus) et une centaine de molécules circulantes (interleukines pour la communication entre cellules).
Très rapidement mise en oeuvre et présente en tout point de l’organisme, l'immunité innée est la première à intervenir lors de situations variées (atteintes des tissus, infection, cancérisation). C'est une première ligne de défense immunitaire qui agit d'abord seule puis se prolonge pendant toute la réaction immunitaire.
La réaction inflammatoire est essentielle. Elle traduit l’accumulation de molécules et de cellules immunitaires au lieu d’infection ou de lésion. Aigüe, elle présente des symptômes stéréotypés (rougeur, chaleur, gonflement, douleur). Elle prépare le déclenchement de l'immunité adaptative.
Notions fondamentales : organes lymphoïdes, macrophages, phagocytose, médiateurs chimiques de l'inflammation, interleukines, récepteurs de surface, réaction inflammatoire, médicaments anti-inflammatoires.
Précisions : la description des récepteurs de l'immunité innée (PRR), des signaux de dangers et la connaissance des signatures des pathogènes (PAMP) sont hors programme. La mise en perspective évolutive du système immunitaire est signalée ; elle lie à cette thématique de sciences fondamentales une réflexion sur la santé, mais elle ne fait pas l'objet d'une argumentation particulière.
Capacités
- Recenser, extraire et exploiter des informations, sur les cellules et les molécules impliquées dans la réaction inflammatoire aiguë.
- Observer et comparer une coupe histologique ou des documents en microscopie avant et lors d'une réaction inflammatoire aiguë.
- Observer la phagocytose par des cellules immunitaires (macrophages).
- Recenser, extraire et exploiter des informations, y compris expérimentales, sur les effets de médicaments antalgiques et anti-inflammatoires.
ADN = Acide désoxyribo nucléique
nucléotides = Acide phosphorique - sucre désoxyribose - base azotée
bases : adénine, thymine, cytosine, guanine
complémentarité, double hélice
4/ Comparaison de séquences / logiciel
utiliser un logiciel pour définir les mots gène, allèle, mutation
Objectifs : Exprimer et exploiter des résultats à l’écrit en utilisant les technologies de l’informatique
Principe : les logiciels Anagène, Genigen sont des banques de données « database » permettant de manipuler des séquences d’ADN. Il suffit d’ouvrir les « tiroirs » pour trouver des séquences d’ADN puis de les comparer...
-Comparer des séquences de nucléotides de différents gènes différents pour donner une définition du mot gène.
-Comparer des séquences de nucléotides de différents allèles d’un même gène pour donner une définition du mot allèle et du mot mutation
Protocole :
Charger les allèles A,B et O du gène des groupes sanguins : https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/geniegen2/?load=PAC-ABO
Manipuler les différentes fonctions proposées (curseur, taille de police, couleurs, cases à cocher, ...) pour faire connaissance avec le logiciel
Observer attentivement pour faire connaissance avec les trois molécules proposées... comment ces molécules peuvent-elles porter un message ? Utilisez le mot "séquence" désigner l'ordre des bases.
La numérotation correspond au nombre de bases (donc de nucléotides). Quelle est la taille de ces 3 allèles, combien de bases (nucléotides) contiennent-ils ?
Réaliser un alignement des séquences (menu action) permet de mettre en évidence les différences entre les séquences en alignant toutes les parties identiques des molécules. Quelles sont les différences entre A et B ? A et O ? B et O ?
Ouvrir une nouvelle séquence de la banque (Alt B) pour comparer avec un autre gène.
Choisir un gène dans la banque de séquences (décochez protéines et ARN qui sont des molécules de nature differente)
Comparez le gène chargé avec celui des groupes sanguins : longeur, séquence. Quelle est la différence entre le gène que vous avez choisi et celui des groupes sanguins ?
Rédiger une définition du mot « gène » grâce à la comparaison de deux gènes différents
Rédiger une définition du mot « allèle » grâce à la comparaison de deux allèles différents
Les allèles d'un gène sont apparus dans l'histoire par mutations. Rédiger une définition du mot « mutation ».
gène, allèle, mutation, séquence.
la structure moléculaire de l’ADN lui permet de porter une information.
mardi 19 mai 2026
3/ modélisation moléculaire de l’ADN / logiciel
? Faire un compte-rendu individuel sur feuille :
utiliser un logiciel pour synthétiser/simplifier/construire/schématiser une molécule d'ADN
Objectifs : Exprimer et exploiter des résultats à l’écrit en utilisant les technologies de l’informatique
Principe : les logiciels Rastop, Rasmol, Raswin, Jmol, … sont des banques de données permettant de manipuler des modèles moléculaires.
Protocole :
Ouvrez le fichier « ADN » : https://libmol.org/?libmol=158
Admirez la molécule en la manipulant à la souris.
Changer (commande) la représentation des atomes et des liaisons.
Colorez la molécule par « atomes » : quels sont les atomes composant l’ADN ?
Colorez la molécule par « chaines » : combien de parties lui trouvez-vous ?
Affichez les « rubans » puis « squelette » : quelle est la forme globale de la molécule ?
Dessinez la forme globale de la molécule
Colorez la molécule par « résidus» : combien de nucléotides différents existe-t-il ? quels sont leurs noms (passez la souris dessus) ?
Quelle est la composition, la structure d'un nucléotide ? Utilisez vos notes et les informations du logiciel pour comprendre.
Schématisez la structure d'un nucléotide en utilisant différents symboles et couleurs de votre choix.
En 1951 Chargaff démontre que [A] = [T] et [C] = [G] pour toute cellule. Que signifie l'expression « bases complémentaires » ?
En utilisant les symboles précédents schématisez la structure de la molécule à plat, sans tenir compte de la forme dans l'espace.
6/ Phylogénétique des hominidés
sites :
https://humanorigins.si.edu/education/introduction-human-evolution
https://australian.museum/learn/science/human-evolution/
logiciels :
phylogène : http://acces.ens-lyon.fr/acces/thematiques/evolution/logiciels/phylogene
hominines : https://svt.ac-versailles.fr/spip.php?article762
lignee_humaine : https://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/les-logiciels-de-pierre-perez
becoming a human : http://www.becominghuman.org/node/interactive-documentary
quelques arbres phylogénétiques :
https://www.onezoom.org/life.html/@biota=93302?img=best_any&anim=flight#x415,y761,w0.6859
Des arguments scientifiques issus de l’analyse comparée de fossiles permettent de reconstituer l’histoire de nos origines.
L’étude de fossiles datés de 3 à 7 millions d’années montre des innovations caractéristiques de la lignée humaine (bipédie prolongée, forme de la mandibule).
Le genre Homo regroupe l’espèce humaine actuelle et des espèces fossiles qui se caractérisent notamment par le développement de la capacité crânienne. Plusieurs espèces humaines ont cohabité sur Terre.
Juliette Nourredine - Lucy : https://youtu.be/U50mfGyq8HM
Bilan : L’évolution humaine
Analyser des matrices de comparaison de caractères morpho-anatomiques résultant d’innovations évolutives afin d’établir des liens de parenté et de construire un arbre phylogénétique.
Mettre en relation la ressemblance génétique entre les espèces de primates et leur degré de parenté.
L’espèce humaine actuelle (Homo sapiens) fait partie du groupe des primates et est plus particulièrement apparentée aux grands singes avec lesquels elle partage des caractères morpho-anatomiques et des similitudes génétiques.
C’est avec le chimpanzé qu’elle partage le plus récent ancêtre commun.
Certains caractères sont transmis de manière non génétique : microbiote, comportements appris dont la langue, les habitudes alimentaires, l’utilisation d’outils…
Positionner quelques espèces fossiles dans un arbre phylogénétique, à partir de l'étude de caractères.
Analyser des arguments scientifiques qui ont permis de préciser la parenté de Homo sapiens avec les autres Homo, et notamment la parenté éventuelle avec les Néandertaliens ou les Dénisoviens.
Des arguments scientifiques issus de l’analyse comparée de fossiles permettent de reconstituer l’histoire de nos origines.
L’étude de fossiles datés de 3 à 7 millions d’années montre des innovations caractéristiques de la lignée humaine (bipédie prolongée, forme de la mandibule).
Le genre Homo regroupe l’espèce humaine actuelle et des espèces fossiles qui se caractérisent notamment par le développement de la capacité crânienne. Plusieurs espèces humaines ont cohabité sur Terre.
Prérequis et limites
L’objectif n’est pas de conduire une approche exhaustive des fossiles et de leurs caractères biologiques, mais de présenter la démarche scientifique permettant de construire une histoire raisonnée de l’évolution humaine. Les notions de liens de parenté, étudiées au collège, sont mobilisées ; un accent particulier est mis sur l’importance de l’identification d’innovations évolutives communes.
Évaluation au prochain cours
QCM / ED :
T2 le vendredi 29 mai de 10h25 à 11h20
T1 le mercredi 27 mai de 11h20 à 12h15
ex1p234 : vrai ou faux ?
l'être humain ne descend pas du singe ils sont cousins, ils ont un ancètre commun,
le chimpanzé est l'espèce la plus proche de l'humain
Homo sapiens ne peut descendre de Neandertal puisqu'ils ont vécu en même temps, ils ont un ancètre commun, peut-être y a-t-il eu hybridation puisque sapiens a des gènes néandertaliens
plus les espèces partagent des caractères à l'état dérivé et non pas ancestral plus elles sont apparentées
ex2p234 : lecture d'arbre
narines rapprochées et pas de queue : humain, gorille, chimpanzé
humain, gorille, chimpanzé forment le groupe des hominidés
le chimpanzé est l'espèce la plus proche de l'humain : innovations évolutives = caractères dérivés communs, => Ancètre commun caractères génétique, morpho-anatomiques
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