jeudi 16 janvier 2014

A3/ Confrontation de deux allèles / doc www

Pression du milieu, concurrence, survie, descendants

A4/ Histoire du concept d'évolution /diaporama

concept, histoire, sélection naturelle, évolution, espèce
, taxon
Effet mutagène des Ultra-violets sur levure ade2 / expérience in vitro
Manuel p86 à 89

mardi 14 janvier 2014

A5/ Comparaison de séquences nucléiques et peptidiques / logiciel Anagène → diaporama

code Morse international, fait avec 2 signes : « ti » ou « ta » : http://www.lexilogos.com/clavier/morse.htm
code ASCII = American Standard Code for Information Interchange : http://www.tableascii.com/ ; http://fr.wikipedia.org/wiki/American_Standard_Code_for_Information_Interchange
ARN, portions codantes de l’ADN, Séquence, gène, code génétique, codon, anticodon

B231/ Polymères séquencés dans la cellule

molécule
ADN
ARN
protéine
Monomères
Phospho-désoxyribo-nucléotides (bases T+A+G+C)
Phospho-ribo-nucléotides (bases U+A+G+C)
Acides aminés (20 différents)
nombre de brins
bicaténaire
Monocaténaire en général
Très variable
structure spatiale
double hélice
variable
hélices+feuillets+boucles
types
un seul
ARN m, t, r, ni, mi, ..
Très nombreuses molécules de structures (cytosquelette) ou enzymatiques (métabolisme)

Acides nucléiques polymères de


Bases
Nucléoside = sucre + base
Nucléotide = sucre + base + phosphate
A
Adénine
Adénosine
Adénosine monophosphate = AMP
Adénosine diphosphate = ADP
Adénosine triphosphate = ATP
T
Thymine
Thymidine
Thymidine monophosphate
G
Guanine
Guanidine
GMP, GDP, GTP
C
Cytosine
Cytidine
Cytidine monophosphate
U
Uracile
Uridine
UMP, UDP, UTP
structure I, II, III, IV d'une protéine :
Structure primaire
Structure secondaire
Structure tertiaire
Structure quaternaire
séquence d'acides aminés
= polypeptide
configuration spatiale simple = hélices, feuillets, boucles
configuration spatiale globale
= enchaînement des hélices, feuillets et boucles
assemblage de sous-unités
= complexe protéique

§ les gènes codent pour des protéines : comment ça se fait in vivo ?

§ Comment la biodiversité a-t-elle pu être modifiée au cours de l'évolution ?

2,3/ L'évolution de la biodiversité / Évolution des espèces

La biodiversité a été définie et présentée comme produit et étape de l'évolution. Dans les classes précédentes, il a été montré que des individus porteurs de diverses combinaisons génétiques peuvent différer par leurs potentiels reproducteurs (plus grande attirance sexuelle exercée sur le partenaire ; meilleure résistance à un facteur du milieu, aux prédateurs ; meilleur accès à la nourriture, etc.). Cette influence, associée à la dérive génétique, conduit à une modification de la diversité génétique des populations au cours du temps.

Bilan des acquis

  • notion de biodiversité à différentes échelles, et relations de cause à effet entre la biodiversité à l’échelle des organismes et la biodiversité génétique
  • le phénotype macroscopique dépend du phénotype cellulaire, lui-même induit par le phénotype moléculaire
  • le phénotype moléculaire dépend du patrimoine génétique de la cellule et de la nature des gènes qui s’expriment sous l’effet de l’influence de facteurs internes et externes variés
  • l’expression d’un phénotype dépend donc du génotype et de l’environnement
  • les mutations sont la source aléatoire de la diversité des allèles, fondement de la biodiversité
  • notion de caractères héréditaires, transmis lors de la reproduction sexuée, et modalités de cette transmission
  • possibilité de survenues d’anomalies lors du déroulement de la méiose, conséquences de ces anomalies, pour l’individu, mais aussi dans un contexte d’évolution du vivant
  • notion de plan d’organisation (des vertébrés)
  • notion d’homologie moléculaire (utilisées pour établir des relations de parentés)

A1/ Définition de quatre forces évolutives / rappel de 2nde

Mechanisms : the processes of evolution : http://evolution.berkeley.edu/evolibrary/article/0_0_0/evo_14
Film du CNRS : http://www.cnrs.fr/biodiversite2010/spip.php?article5 → multimedia → video → « groupes humains, homogénéité et diverstité »
  • Migration = changement de lieu d'un organisme provoquant l'isolement de certains génômes, donc une évolution différente et éventuellement un croisement avec une nouvelle population et dans ce cas l'apport de nouveaux gènes pour la population.
  • Mutation = provoque l'apparition de nouveaux allèles par modification de gènes c'est-à-dire d'une séquence de nucléotides (bases) dans l'ADN.
  • Sélection = filtre à allèles par l'intermédiaire du milieu, de la reproduction, de l'alimentation, de la prédation, ...
  • Dérive = modification aléatoire de la fréquence des allèles dans une population

A2/ Simulation de la dérive génétique / logiciels

dérive génétique

lundi 13 janvier 2014

A3/ Séparation des composants d'une protéine / chromatographie

séparation des acides aminés par chromatographie d'une protéine hydrolysée par un suc : http://www.didier-pol.net/2FTCCMAA.html
Chromatographie sur couche mince des acides amines d'un polypeptide : http://www.didier-pol.net/2CCMRES.htm
=> protéines = polypeptide = polymère d'acides aminés

A4/ Découpage d'une protéine à différentes échelles / schémas

formule chimique des acides aminés puis de la liaison peptidique : http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/acideamine/acideamine.htm
structure I, II, III, IV d'une protéine :
Structure primaire
Structure secondaire
Structure tertiaire
Structure quaternaire
séquence d'acides aminés
= polypeptide
configuration spatiale simple = hélices, feuillets, boucles
configuration spatiale globale
= enchaînement des hélices, feuillets et boucles
assemblage de sous-unités
= complexe protéique

§ Acides nucléiques et protéines sont deux types de macromolécules contenant une séquence : quel est le lien ?