A5 : Comparaison de densités lithosphériques / sujet BAC

1- Quels constats peut-on faire en comparant les densités des croûtes // manteau ?

2- Que se passe-t-il lorsque le métamorphisme des gabbros atteint le niveau 3 (du point de vue densité) ?

sujets BAC 2008 : http://www.sujetdebac.fr/annales-pdf/2008/s-svt-obligatoire-2008-metropole-sujet-officiel.pdf

sujet ECE BAC 2013 n°30 : comparaison densité et minéralogie éclogite et métagabbro

cause de la subduction : différence de densité

§ quelles sont les étapes de la fabrication d'une protéine ?

1,2,2/ Etapes de la fabrication d'une protéine dans la cellule

FT/ Autoradiographie

faire une fiche technique à partir du site : http://svt.ac-creteil.fr/?Technique-d-autoradiographie

A1 : Localisation des étapes / autoradiographie et MET

electronographie pancréas : http://www.uni-mainz.de/FB/Medizin/Anatomie/workshop/EM/externes/Wartenberg/Pankreas3.jpg

http://www.uni-mainz.de/FB/Medizin/Anatomie/workshop/EM/externes/Wartenberg/Pankreas3E.html

http://medcell.med.yale.edu/histology/digestive_organs_lab/pancreatic_acinar_cells_em.php

http://www.visualphotos.com/image/1x9083319/exocrine_pancreas_cells_tem

autoradiographie sur acinus pancréatique avec Leucine radioactive ou avec Uridine radioactive : http://svt.ac-creteil.fr/archives/Media/Med1S/Autoradiographie/Cel_panc_WEB.htm

source : http://svt.ac-creteil.fr/archives/tp/Tp1S/biosynprot.htm

Uracile* à 0' hors de la cell - 1' dans noyau - 2' ds réticulum endoplasmique

Leucine* à 0' hors de la cellule - 3' ds réticulum endoplasmique - 7' ds appareil de Golgi - 30' ds vésicules - 120' dans lumière du canal pancréatique

Noyau, cytoplasme, organites : réticulum [réseau] endoplasmique, appareil de Golgi, vésicules

A2 : Electronographie du phénomène in vitro / MET

transcription et phénomène d'amplification. (manuel p.41)

transcription : fabrication d'ARN à partir d'ADN

http://www.sciencephoto.com/media/210576/enlarge ;

3 étapes : initiation - élongation – terminaison

http://www.sciencephoto.com/media/415768/enlarge

amplification

traduction et phénomène d'amplification. (manuel p.45) :

traduction : fabrication de polypeptide à partir d'ARN

en 3 étapes : initiation - élongation – terminaison

http://ead.univ-angers.fr/~jaspard/Page2/COURS/7RelStructFonction/2Biochimie/1SyntheseProteines/3Figures/4Organites/2Ribosomes/6Polysome.gif ;

http://www.incertae-sedis.fr/gl/docu1090_566_interpretation_electronographie_synthese_proteique.htm#renvoi00 ;

amplification

http://www.incertae-sedis.fr/gl/docu1090_563_ribosomes.htm ;

http://www.incertae-sedis.fr/gl/docu1090_564_relation_ribosomes_arnm.htm ;

http://www.dematice.org/ressources/PCEM1/Histologie/P1_histo_009/Web/res/Figure%208.png

ribosomes, poly(ribo)somes

autres photos :

http://raymond.rodriguez1.free.fr/Textes/1s13.htm

maturation

épissage alternatif

§ Quelles preuves de terrain ?

A3 : Des traces de subduction dans les montagnes

D \traces subduction ds montagnes.odp

facies métamorphiques :

http://christian.nicollet.free.fr/page/CO/PTCO.html

http://christian.nicollet.free.fr/page/Figures/facies.html

trajet d'un gabbro de la croûte oc (Nicollet) : http://christian.nicollet.free.fr/page/Figures/phototeque.html#TrajetCO

Collection de roches subduites dans les Alpes : éclogite et métagabbro : http://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/ress/geologie/metagabbro/metagabbro.html

métagabbros, éclogite

A4 : Des traces d'océan dans les montagnes

D/ traces ocean ds montagnes.odp

• Pillows de la pointe de la Houssaye à Erquy
• Pillows de la carrière de Pierre Bisé
• http://christian.nicollet.free.fr/page/Alpes/chenaillet/chenaillet.html
• http://fr.wikipedia.org/wiki/Mont_Chenaillet
• sujet bac pour situer le massif du chenaillet : sept. 2008 Martinique

pillows lavas, sédiments, fossiles, failles normales / marges passives, ophiolites

§ quelles sont les étapes de la fabrication d'une protéine in vivo ?

A5 : découverte historique de la relation gène-protéine / logiciels Anagène & Rastop

® 1S TP anagene rastop gène-protéine.odt

© 20 acides aminés.odt

© code genetique tab.odt

acides nucléiques : ADN, ARN

Différents types d'acides nucléiques :

molécule	ADN	ARN
acide	phosphorique
sucre	désoxyribose	ribose
bases	Thymine+A+G+C	Uracile+A+G+C
nombre de brins	bicaténaire	Monocaténaire en général
structure spatiale	double hélice	variable

19 octobre

Bilan : Polymères séquencés dans la cellule

Diapo : synthese_proteines_anagene

code Morse international, fait avec 2 signes : « ti » ou « ta » : http://www.lexilogos.com/clavier/morse.htm

code ASCII = American Standard Code for Information Interchange : http://www.tableascii.com/ ; http://fr.wikipedia.org/wiki/American_Standard_Code_for_Information_Interchange

animation code génétique : http://www.snv.jussieu.fr/vie/documents/codegenet/index.htm#anim

tableau code génétique : http://www.monde-solidaire.org/spip/IMG/jpg/UniversalGeneticCode.jpg

tableaux autrement : http://pst.chez-alice.fr/codgenet.htm

ARN, portions codantes de l’ADN, Séquence, gène, code génétique, codon, anticodon

La séquence des acides aminés des protéines est imposée par l'information génétique située dans la molécule d'ADN.

Un gène est donc défini par la séquence d'un polynucléotide (ADN, ARN) déterminant la séquence d'un polypeptide.

La séquence des acides aminés est gouvernée par celle des nucléotides suivant un système de correspondance, le code génétique.

Chaque acide aminé correspond à un triplet de nucléotides appelé codon.

Certains codons, dits redondants, correspondent au même acide aminé.

Il existe des codons dits "d'initiation", d'autres de "terminaison".

Le code génétique est identique pour toutes les espèces vivantes connues : il est universel et dégénéré (le doublet initial peut être seul déterminant, la nature dégénérée du code a pour conséquence sa redondance).

molécule	ADN	ARN	protéine
Atomes	C-H-O-N-P	C-H-O-N-P	C-H-O-N-(S)
Monomères	Phospho-désoxyribo-nucléotides (bases T+A+G+C)	Phospho-ribo-nucléotides (bases U+A+G+C)	Acides aminés (20 différents)
Polymère	Polynucléotide	Polynucléotide	Polypeptide
nombre de brins	bicaténaire	Monocaténaire en général	Très variable
structure spatiale	double hélice	variable	variable

Acides nucléiques polymères de

	Bases	Nucléoside = sucre + base	Nucléotide = sucre + base + phosphate
A	Adénine	Adénosine	Adénosine monophosphate = AMP
T	Thymine	Thymidine	TMP
G	Guanine	Guanidine	GMP
C	Cytosine	Cytidine	CMP
U	Uracile	Uridine	UMP

structure I, II, III, IV d'une protéine :

Structure primaire	Structure secondaire	Structure tertiaire	Structure quaternaire
séquence d'acides aminés = polypeptide	configuration spatiale simple = hélices, feuillets, boucles	configuration spatiale globale = enchaînement des hélices, feuillets et boucles	assemblage de sous-unités = complexe protéique

§ les gènes codent pour des protéines : comment ça se fait in vivo ?

§ quelles sont les étapes de la fabrication d'une protéine in vivo ?

1,2,2/ Etapes de la fabrication d'une protéine dans la cellule

FT/ Autoradiographie

faire une fiche technique à partir du site : http://svt.ac-creteil.fr/?Technique-d-autoradiographie

A1 : Localisation des étapes / autoradiographie et MET

© autoradiographies pancréas

electronographie pancréas : http://www.uni-mainz.de/FB/Medizin/Anatomie/workshop/EM/externes/Wartenberg/Pankreas3.jpg

http://www.uni-mainz.de/FB/Medizin/Anatomie/workshop/EM/externes/Wartenberg/Pankreas3E.html

http://medcell.med.yale.edu/histology/digestive_organs_lab/pancreatic_acinar_cells_em.php

http://www.visualphotos.com/image/1x9083319/exocrine_pancreas_cells_tem

autoradiographie sur acinus pancréatique avec Leucine radioactive ou avec Uridine radioactive : http://svt.ac-creteil.fr/archives/Media/Med1S/Autoradiographie/Cel_panc_WEB.htm

source : http://svt.ac-creteil.fr/archives/tp/Tp1S/biosynprot.htm

Uracile* à 0' hors de la cell - 1' dans noyau - 2' ds réticulum endoplasmique

Leucine* à 0' hors de la cellule - 3' ds réticulum endoplasmique - 7' ds appareil de Golgi - 30' ds vésicules - 120' dans lumière du canal pancréatique

Noyau, cytoplasme, organites : réticulum [réseau] endoplasmique, appareil de Golgi, vésicules

§ Comment reconstituer l'histoire d'une chaîne de montagnes ?

Bilan / La caractérisation du domaine continental : lithosphère continentale, reliefs et épaisseur crustale

La croûte continentale affleure dans les régions émergées. L'examen de données géologiques permet à la fois d'expliquer cette situation et de nuancer cette vision rapide car les mécanismes de formation des montagnes sont complexes. On se limite au cas des reliefs liés à un épaississement crustal dont les indices peuvent être retrouvés sur le terrain ou en laboratoire.

Les différences d'altitude moyenne entre les continents et les océans s'expliquent par des différences crustales.

La croûte continentale, principalement formée de roches voisines du granite, est d'une épaisseur plus grande et d'une densité plus faible que la croûte océanique. L'âge de la croûte océanique n'excède pas 200 Ma, alors que la croûte continentale date par endroit de plus de 4 Ga. Cet âge est déterminé par radiochronologie. La radiochronologie des roches est fondée sur la décroissance radioactive naturelle de certains éléments chimiques présents dans les minéraux qui les constituent.

Au relief positif qu'est la chaîne de montagnes, répond, en profondeur, une importante racine crustale. L'épaississement de la croûte résulte d'un raccourcissement et un empilement. On trouve des indices tectoniques (plis, failles, nappes) et des indices pétrographiques (métamorphisme, traces de fusion partielle) du raccourcissement. Les résultats conjugués des études tectoniques et minéralogiques permettent de reconstituer un scénario de l'histoire de la chaîne.

C/ Poursuivre

Lexique :

• http://www.ac-nice.fr/svt/sorties/roya/textes/glossaire.html ;
• http://www.premiumwanadoo.com/renard/revisions/SVT/lexGeol.htm#S ;

Pour en savoir plus :

• http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/XML/db/planetterre/metadata/LOM-datation-rubidium-strontium.xml

§ Comment reconstituer l'histoire d'une chaîne de montagnes ?

1.3 : Métamorphisme de subduction

Si les dorsales océaniques sont le lieu de la divergence des plaques et les failles transformantes une situation de coulissage, les zones de subductions sont les domaines de la convergence à l'échelle lithosphérique. Ces régions, déjà présentées en classe de première S, sont étudiées ici pour comprendre une situation privilégiée de raccourcissement et d'empilement et donc de formation de chaînes de montagnes.

1,3,1 : Des roches métamorphiques

A1 : Etude du métamorphisme / graphe des faciés

© TP_roches.odg

D\facies métamorphiques.odp

Dans les ensembles de minéraux, plusieurs représentants voisins :

Micas : {biotite, muscovite, ...}

Feldspaths : {plagioclase, alcalin, ..}

Amphiboles : {horblende, glaucophane, actinote, ...}

Pyroxènes : {jadéite, ...}

Des transformations possibles :

Plagioclase+ pyroxène + eau →hornblende

plagioclase + hornblende + eau →chlorite + actinote

plagioclase + chlorite →glaucophane + eau.

facies métamorphiques :

http://christian.nicollet.free.fr/page/CO/PTCO.html

http://christian.nicollet.free.fr/page/Figures/facies.html

trajet d'un gabbro de la croûte oc (Nicollet) : http://christian.nicollet.free.fr/page/Figures/phototeque.html#TrajetCO

Collection de roches subduites dans les Alpes : éclogite et métagabbro : http://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/ress/geologie/metagabbro/metagabbro.html

Diagramme des faciès métamorphiques : http://www.cnrs.fr/cw/dossiers/dosgeol/01_decouvrir/02_subduction/04_subduction_plaques/01_terrain/img/grandes/06a/03a/03a.htm

http://tristan.ferroir.fr/index.php/2011/12/29/les-facies-metamorphiques-deskola-et-lutilisation-dune-grille-petrogenetique/

diagramme de phase, T°/P°,

solidus // liquidus,

magmatisme // métamorphisme

faciés métamorphiques

A2 : Observation de lames minces de roches / µscope polarisant et analysant

http://prezi.com/aanufhjcxh-p/?utm_campaign=share&utm_medium=copy

1. observer à l'oeil nu : aspect général : minéraux, couleurs, structure
2. observer les lames minces au microscope en LPnA puis LPA: structure de la roche : grenue, microlithique et minéraux en présence
3. réaliser un dessin d'observation légendé

pour apprendre à reconnaître les minéraux et roches : manuel p.398-399

tableau récapitulatif Dijon (doc) : http://svt.ac-dijon.fr/dyn/article.php3?id_article=261

clef de détermination Tlse (html) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/lycee/segui/mineralogie/fiche.htm

clef de détermination Oehmichen (pdf) : http://www.google.fr/url?sa=t&rct=j&q=identification+min%C3%A9raux+microscope&source=web&cd=1&ved=0CCUQFjAA&url=http%3A%2F%2Fwww.lyc-oehmichen.ac-reims.fr%2Fcontenu%2Fdiscipline%2Fsvt%2F01_Pour_Observation2%2FIdentification_des_mineraux.pdf&ei=ih9kUP_rKorM0AWbjoCoCg&usg=AFQjCNHuA10fkEWvcu9xBWoHpXz13EnO9Q

clef de détermination Grbl : http://www.ac-grenoble.fr/svt/SITE/prof/outiensei.htm

collection de roches : http://geoeco.ifrance.com/g%E9ologie/collec.html

collection de lames minces : http://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/photossql/photos.php?TopicID=Lames

atlas rocks & minerals / Ratajeski : http://www.geolab.unc.edu/Petunia/IgMetAtlas/mainmenu.html

atlas minerals / Siddall, London : http://www.ucl.ac.uk/~ucfbrxs/PLM/PLMhome.html

atlas de roches et minéraux webminéral BRGM :

atlas de minéraux : http://www.brocku.ca/earthsciences/people/gfinn/minerals/database.htm

atlas de lames minces Minéraux et roches / Aubry, Caen : http://www.etab.ac-caen.fr/discip/geologie/Micropol/index.html

FT fournies au TP de Bac (ECE) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/bankact/index.php?m=1&sm=1

article de minéralogie au microscope polarisant : http://www.svt-monde.org/spip.php?article26

Examples de lames minces : http://www.lame-mince.com/examples-lame-mince.html

Le CRPG (Centre de Recherches Pétrographiques et Géochimiques, : http://www.crpg.cnrs-nancy.fr/Science/Collection/index.html

un site sur la classification des roches : http://pst.chez-alice.fr/svtiufm/roches.htm

 

§ Quelles preuves de parenté à l'échelle moléculaire ?

A3 : Classement des molécules de la vie

réaliser un tableau en 4 colonnes / 5 lignes pour comparer les différents types de molécules organiques : types d'atomes, grosses ou petites molécules, poly ou monomères ...

Molécules de la vie font partie de la matière organique

4 catégories de molécules organiques :	MACROMOLÉCULE = Polymère = molécule complexe exemple	Monomère = molécule simple exemple	atomes
GLUCIDES = SUCRES	Polyosides Amidon, cellulose, lactose, saccharose	Oses Glucose, Galactose, Fructose,	C+H+O C6H12O6
LIPIDES = GRAISSES	Polyglycérides beurre, huile	Acides gras acide oléique, arachidonique, linoléique,	C+H+O
PROTIDES = PROTEINES	Protéines Albumine, gluten, pepsine	Acides aminés acide glutamique, aspartique, cystéine	C+H+O+N (+S)
ACIDES NUCLEIQUES	Polynucléotides ADN	Nucléotides	C+H+O+N+P

molecules of life are classified in :

3 categories of organic molecules	MACROMOLECULE	Monomere	atoms
CARBOHYDRATES = SUGAR	Polysaccharids Starch	Monosacharids Glucose	C H O
LIPIDS = FAT	Lipids Oil	Fatty acid Oleic Acid	C H O
PROTIDES	protein Albumin	Amino acid Glutamic Acid	C H O N
NUCLEIC ACIDS	DNA, RNA	Nucleotids	C H O N P

Bilan : Les molécules de la vie

Les êtres vivants sont constitués d’éléments chimiques C, H, O, (N, P, S) disponibles sur le globe terrestre. Leurs proportions sont différentes dans le monde inerte et dans le monde vivant. Ces éléments chimiques se répartissent dans les diverses molécules constitutives des êtres vivants : les glucides, lipides, protides et acides nucléiques. Les êtres vivants se caractérisent par leur matière organique (=carbonée) et leur richesse en eau. L’unité chimique des êtres vivants est un indice de leur parenté.

Life is composed of chemical elements CHO(NPS) found on earth. Their proportions are different in the inanimate world and the living world. These chemicals are divided into various constituent molecules of life. Living beings are characterized by their carbon material and water. The chemical unit of living things is an indication of their parentage.

C : Pour aller plus loin

RCSB Protein data bank : http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

WWPDB : http://www.wwpdb.org/

Librairie de molécules : http://www.librairiedemolecules.education.fr/

SNV : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/

Site de Didier Pol : http://www.didier-pol.net/

RASTOP : http://acces.inrp.fr/acces/logiciels/externes/rastop

JMOL : http://jmol.sourceforge.net/websites/

Herbiers à rendre

Attention : ds à la rentrée