A1/ Mesure de l'activité cérébrale par imagerie médicale / logiciel Eduanatomist

Manuel p.357

logiciel « Eduanatomist » téléchargeable : http://acces.ens-lyon.fr/acces/ressources/neurosciences/Banquedonnees_logicielneuroimagerie/eduanatomist

fiche technique logiciel : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/bankact/index.php?

IRM = imagerie par résonance magnétique permet de reconstruire une image en deux dimensions puis en trois dimensions de la composition chimique et donc de la nature des tissus biologiques explorés.

IRMf = imagerie par résonance magnétique fonctionnelle permet d'enregistrer des variations hémodynamiques (variation des propriétés du flux sanguin) cérébrales locales minimes, lorsque ces zones sont stimulées.

Formation médicale en ligne pour les professionnels de santé : http://www.imaios.com/fr/e-Cours/e-MRI

imagerie cérébrale : http://lecerveau.mcgill.ca/flash/capsules/outil_bleu13.htm

cartographier le cerveau : http://www.scientificamerican.com/slideshow.cfm?id=mapping-the-mind&photo_id=62717E3C-FD41-1F31-09A66AA69B572AA9

imagerie fonctionnelle

Le logiciel EduAnatomist est une banque d'images du cerveau réalisées par IRM (l'imagerie par résonance magnétique permet de reconstruire une image en deux dimensions puis en trois dimensions de la composition chimique et donc de la nature des tissus biologiques explorés). Le logiciel permet aussi de visualiser les parties du cerveau qui s'activent lors de différents protocoles de stimulation sensorielle (l'IRM fonctionnelle permet d'enregistrer des variations hémodynamiques, variation des propriétés du flux sanguin, cérébrales locales minimes, lorsque ces zones sont stimulées).

1) Lancer le logiciel EduAnatomist, Charger depuis neuropeda

2) Ouvrir l’image anatomique : taper  le n° du sujet (131321) cliquer sur « rechercher » ou chercher dans la liste le fichier « IRMsujet131321anat »

Prendre note des informations sur les conditions de réalisation du fichier pour pouvoir l'interpréter par la suite.

3) L’image s’affiche (où l'onglet « tête 3D » apparaît : cliquer dessus)

On peut alors se déplacer dans chaque plan de coupe (curseur à droite des plans) et modifier la palette et le contraste de l’image en faisant varier les seuils de sensibilité inférieur et supérieur au niveau de l’interface. Les différents plans de coupe sont corrélés entre eux (le déplacement dans un plan entraîne un déplacement dans les autres plans). Cette corrélation est matérialisée par la croix rouge. On peut repérer les principales structures cérébrales : hémisphères gauche / droit, cervelet, tronc, substance blanche, substance grise... On peut également localiser les lobes frontaux, occipitaux, pariétaux et temporaux.

4) Ouvrir pour superposition (répéter l’étape 2) l’image fonctionnelle correspondante en sélectionnant « fonction vision mouvement ».

On peut alors faire varier la couleur de l’image dans l’interface ainsi que son opacité (curseurs correspondants). Avec une souris à roulette on peut, en se plaçant sur un plan de coupe donné et en maintenant la roulette enfoncée puis en déplaçant la souris faire varier le plan de visualisation. L’image de volume restant fixe, on peut alors aller sur le curseur à droite du plan de coupe pour déplacer ce dernier. Ceci permet de visualiser, pour chaque plan de coupe, sa position dans le volume 3D de l’encéphale.

5) Faire défiler les coupes de façon à localiser la zone la plus activée du cerveau du sujet 131 321 à qui on présentait une spirale blanche en rotation.

6) Répéter l'opération pour le sujet 131 331 à qui on présentait des formes et des couleurs mais sans aucun mouvement.

7) Exporter les données après traitement sous forme d’image (format JPG) ce qui permet de consigner les observations (avec orientation des différentes coupes selon les axes Antero-postérieur, Droite-gauche, Dorso-ventral) dans un document Word ou Libre office

8) Exploiter les données expérimentales : quelles sont les zones impliquées dans la vision des images, mouvement, couleur, forme … ?

9) Imprimer le compte-rendu.