1,4,2/ L’histoire humaine lue dans son génome

1/ Histoire du séquençage du génôme humain

http://www.genoscope.cns.fr/externe/Francais/Sequencage/#tableau1

https://binf.snipcademy.com/lessons/dna-sequencing-techniques/maxam-gilbert

- Rechercher et exploiter des documents montrant comment a été déterminée la première séquence du génome humain.

- Explorer quelques stratégies et outils informatiques de comparaisons de séquences entre génomes individuels.

Histoire	Équipe	Pays	matériel	methode	Taille	Nb de gènes
1971	Arber, Smith, Nathans	Suisse, USA	Haemophilus influenzae, virus SV40	Enzymes de restriction
1977	Sanger	UK	Virus ΦX174	synthèse enzymatique sélective	5 kb
1977	Gilbert	USA	Bactérie	dégradation chimique sélective
1980	Messing		phage M13	vecteurs de séquençage
1984	Jeffreys	USA	Homo sapiens	Empreinte génétique
1995			Haemophilus influenzae		1,8 kb
1996			Saccharomyces cerevisiae		12 Mb	6 200
1996			Caenorhadbitis elegans		100 Mb	19 100
2000			Arabidopsis thaliana		125 Mb	25 500
2001			Homo sapiens		3,3 Gb	30 000
2002			Oryza sativa		289 Mb

Sanger	Gilbert
synthèse enzymatique sélective	dégradation chimique sélective
Extraction ADN
Amplification de l’échantillon
Séparation des deux brins par la chaleur
Amorçage	Marquage*/Isolement/électrophorèse/Séparation
Incubation +ADNpol +dNTP +amorces +ddNTP*	Coupures chimiques spécifiques des 4 bases
Analyse par électrophorèse

Sanger method in video : https://youtu.be/-QIMkQ4E_wE

Au cours des 25 dernières années, la méthode de Sanger a été largement développée grâce à plusieurs avancées technologiques importantes :

• la mise au point de vecteurs de séquençage adaptés, comme le phage M13 développé par Joachim Messing au début des années 19802 ;
• le développement de la synthèse chimique automatisée des oligonucléotides qui sont utilisés comme amorces dans la synthèse ;
• l'introduction de traceurs fluorescents à la place des marqueurs radioactifs utilisés initialement. Ce progrès a permis de sortir le séquençage des pièces confinées nécessaires à l'usage de radio-isotopes ;
• l'adaptation de la technique PCR pour le séquençage ;
• l'utilisation de séquenceurs automatiques de gènes ;
• l'utilisation de l'électrophorèse capillaire pour la séparation et l'analyse.

La méthode de Maxam et Gilbert nécessite des réactifs chimiques toxiques et reste limitée quant à la taille des fragments d'ADN qu'elle permet d'analyser (< 250 nucléotides). Moins facile à robotiser, son usage est devenu aujourd'hui confidentiel.

2/ Calculs généalogiques

- Calculer le nombre de générations humaines successives en mille, dix mille et cent mille ans et en déduire le nombre théorique d’ancêtres de chacun d’entre nous à ces dates. Conclure.