samedi 18 décembre 2021

BAC : épreuve TP, précisions

Une note de service organise l'évaluation des compétences citées en objet pour toutes les académies de métropole, des Drom et COM et les lycées français des pays étrangers.

Les candidats tirent au sort une situation d'évaluation parmi celles retenues par les professeurs de l'établissement.

Les professeurs examinateurs renseignent une fiche individuelle d'évaluation au nom de chaque candidat. Cette fiche porte la note qui est attribuée au candidat sur 20 points, exprimée en point entier, et un commentaire qualitatif. Ce document ainsi que la (ou les) feuille(s) réponse rédigée(s) par l'élève, qui ont le même statut juridique que la copie d'écrit, sont agrafés ensemble et remis à l'issue de la correction au chef d'établissement.

Les épreuves se dérouleront dans chaque établissement, sur au plus 3 jours consécutifs pendant les périodes définies ci-dessous :

  • du 22 au 25 mars 2022 pour la métropole, Mayotte, les Antilles, la Guyane, l'Amérique centrale, la Polynésie française, et les pays étrangers du groupe 1 dont les épreuves écrites se déroulent du 14 au 16 mars ;

vendredi 17 décembre 2021

Listen : The Moon's birth

In the early 1970s, Dr William K Hartmann proposed that the early Earth collided with a planet the size of Mars, sending debris into the battered Earth's orbit. He theorised that the Moon formed from this debris. This clip refers to the Moon as being dry. In recent years new studies have resulted in conflicting conclusions about the Moon's water content.02 December 2010, 3 minutes : https://www.bbc.co.uk/programmes/p0063x4x

The moon’s violent birth may have given Earth the ingredients of life : https://www.newscientist.com/article/2191615-the-moons-violent-birth-may-have-given-earth-the-ingredients-of-life/

Genetics

mercredi 15 décembre 2021

 correc

1- 3- Le climat du futur

Activité 2 : Le changement climatique et ses conséquences.

D’ici la fin du XXIième siècle, les modèles s’accordent à prévoir une augmentation de 1 à 5°C de la température moyenne mondiale. Ce réchauffement a déjà des conséquences sur les milieux de vie et la biodiversité. Quelles sont les conséquences du changement climatique sur les écosystèmes ?

mercredi 8 décembre 2021

 

Questions : (justifiez en citant les documents)

1- Que devient le CO2 lorsqu’il est en excédent dans l’atmosphère ?

2- Quelle en sera la conséquence au niveau des propriétés chimiques de l’eau des océans ?

3- Quelle incertitude concerne la quantité de CO2 pouvant se dissoudre dans les océans ?

4- Expliquer pourquoi les coraux sont doublement touchés par le réchauffement climatique ?

5- Pourquoi le réchauffement climatique favorise-t-il le développement des chenilles processionnaires ?

6- Montrer que le réchauffement climatique accentue la crise de la biodiversité.

1.3 Le climat du futur

Activité 1 : Les modèles climatiques face aux observations.

Un modèle climatique a pour fonction de rendre accessible un système complexe en permettant de le décrire , de l’expliquer, de le tester afin de voir la réponse aux variations apportées : par exemple les émissions anthropiques de GES, les changements d’utilisation des terres, le volcanisme, … Ces éléments perturbent le climat en modifiant le bilan radiatif de la Terre et les réponses des modèles le montrent.

Comment estimer le changement climatique ? Quelle est la fiabilité des modèles climatiques ?

Manuel pages 66 à 70. Réponses :

1- 3- Le climat du futur

Activité 1 : Les modèles climatiques face aux observations.

Un modèle climatique a pour fonction de rendre accessible un système complexe en permettant de le décrire , de l’expliquer, de le tester afin de voir la réponse aux variations apportées : par exemple les émissions anthropiques de GES, les changements d’utilisation des terres, le volcanisme, … Ces éléments perturbent le climat en modifiant le bilan radiatif de la Terre et les réponses des modèles le montrent.

Comment estimer le changement climatique ? Quelle est la fiabilité des modèles climatiques ?

Manuel pages 66 à 70. Réponses :

mardi 7 décembre 2021

3,1/ L’origine du génotype des individus

Comment notre patrimoine héréditaire individuel évlolue-t-il ?

3,1,2/ Evolution du patrimoine génétique

1/ La mitose engendre des clones

 

Les zones de subduction sont le siège d'importantes activités métamorphique et magmatique.

Expliquez comment le plongement d'une lithosphère océanique dans le manteau supérieur est à l'origine des changements minéralogiques au sein de cette lithosphère et du magmatisme associé.

Votre exposé sera structuré et illustré d'un schéma récapitulatif. 

Session 2009 - Pondichéry Corrigé officiel (8 points)

3,1,1/ Genèse de génômes uniques

3/ Les brassages chromosomiques apportent de nouvelles combinaisons

vendredi 3 décembre 2021

3,1/ L’origine du génotype des individus

3,1,1/ Genèse de génômes uniques

Le brassage des génomes par La reproduction sexuée des eucaryotes

Earth’s atmosphere reacted in surprising ways to the lowering of emissions during the pandemic, showing how closely climate warming and air pollution are linked.

Emission Reductions From Pandemic Had Unexpected Effects on Atmosphere : https://climate.nasa.gov/news/3129/emission-reductions-from-pandemic-had-unexpected-effects-on-atmosphere/

 cours en visio

The DNA molecule is shaped like a twisted ladder. : http://www.dnaftb.org/19/index.html

you can visit this website by any concept you wish but I selected the one I think the most understandable for you : get to the animation and then ou can visit the historical photo gallery, video, bio, … proposed by this website called « DNA from the begining »

jeudi 2 décembre 2021

3,1,1/ Genèse de génômes uniques

2/ La méiose mélange les combinaisons d’allèles


il n'y a plus qu'à appliquer : en TP on vous donne une plaque contenant les mouches résultant d'un croisement (test cross), on les compte, on en déduit les pourcentages de chaque phénotypes, on en conclue la carte génétique... fastoche hein ?

test cross = croisement d’un hétérozygote avec un homozygote récessif dans le but de déterminer le génotype et la place des gènes sur les chromosomes

Schématiser les conséquences de la méiose pour deux paires d’allèles portés par deux chromosomes différents ou par un même chromosome.

Interpréter des résultats de croisements avec transmission de deux paires d’allèles (liés ou non entre eux), portés ou pas par les chromosomes sexuels.

Brassage interchromosomique

En fin de méiose, chaque cellule produite reçoit un seul des deux allèles de chaque paire avec une probabilité équivalente.

Pour deux paires d’allèles, quatre combinaisons d’allèles sont possibles, équiprobables ou non en cas de gènes liés.


L’Assemblée nationale adopte l’allongement du délai d’avortement

 Les députés ont voté en première lecture jeudi 8 octobre l’extension du délai légal de l’avortement de 12 à 14 semaines de grossesse dans un climat tendu. Le texte, qui prévoyait entre autres la suppression de la clause de conscience spécifique à l’IVG, inquiète militants pro-vie et gynécologues.

https://www.famillechretienne.fr/35350/article/2020-10-09/allongement-du-delai-divg-nouvelle-etape-dans-la-banalisation-de-lavortement 

mercredi 1 décembre 2021

1.3 - Une structure complexe : la cellule vivante

2/ les membranes cellulaires


Modélisation de la membrane cytoplasmique / Rastop :

http://www.librairiedemolecules.education.fr/recherche.php?typeclassification=chimique&theme=mol&idcat=bicouche

Schématiser la membrane plasmique à partir de molécules dont les parties hydrophile/lipophile sont identifiées.

La cellule est un espace séparé de l’extérieur par une membrane plasmique. Cette membrane est constituée d’une bicouche lipidique et de protéines. La structure membranaire est stabilisée par le caractère hydrophile ou lipophile de certaines parties des molécules constitutives.

1.2 La complexité du système climatique

Bilan : 

1,2,3/ Effets de rétroactions sur le climat

CORRECTION

mardi 30 novembre 2021

Documentaire: Il Était Une Fois Notre Planète (FR HD)

Earth evolution

Volcans assoupis : des geants sous haute surveillance

3/ Génétique et évolution

3/ Génétique et évolution

Cette partie s’inscrit dans une logique d’approfondissement des acquis des années précédentes, notamment des concepts de biodiversité et d’évolution. Dès la classe de seconde, la diversité génétique et les processus évolutifs ont été abordés dans le contexte de la biodiversité. En classe de première, les mécanismes à l’origine des mutations ont été identifiés, ainsi que leurs effets sur la santé humaine. En classe terminale, il s’agit de comprendre comment la reproduction sexuée forme des génomes individuels et contribue à la diversification du vivant, aux côtés d’autres processus génétiques et non génétiques. Consolider ses acquis en génétique et découvrir les techniques qui aboutissent à la connaissance du génome de chaque individu. Comprendre que l’hérédité n’est pas exclusivement liée à l’ADN.

  • notez les mots clefs

Comment évolue notre génôme ?

lundi 29 novembre 2021

goelogy& art

Natural Pigments: Scott Sutton the pigment hunter. Scott Hunter uses organic pigments from his natural surroundings to produce his artwork. He states that we purchase art materials from suppliers without knowing where the materials are sourced. Scott painted a salmon using pigments found in the river, thus, connects his art materials with the natural environment.

Watch 3’42 : https://youtu.be/cRNUx9Sc8lU

website : http://www.scottsuttonart.com/natural…

read : https://www.lostincolours.com/foraging-for-pigments-from-local-rocks/

samedi 27 novembre 2021

Complétez les tableaux suivant pour réviser

Trois processus ont été étudiés en 1eS :

sujet du DM :

Les zones de subduction sont le siège d'importantes activités métamorphique et magmatique.

Expliquez comment le plongement d'une lithosphère océanique dans le manteau supérieur est à l'origine des changements minéralogiques au sein de cette lithosphère et du magmatisme associé.

Votre exposé sera structuré et illustré d'un schéma récapitulatif. 

Prg officiel de spécialité de 1ère en génétique pour réviser : 

vendredi 26 novembre 2021

correction du qcm : 

Evolution of Earth

Listen : The Moon's birth

In the early 1970s, Dr William K Hartmann proposed that the early Earth collided with a planet the size of Mars, sending debris into the battered Earth's orbit. He theorised that the Moon formed from this debris. This clip refers to the Moon as being dry. In recent years new studies have resulted in conflicting conclusions about the Moon's water content.02 December 2010, 3 minutes : https://www.bbc.co.uk/programmes/p0063x4x

The moon’s violent birth may have given Earth the ingredients of life : https://www.newscientist.com/article/2191615-the-moons-violent-birth-may-have-given-earth-the-ingredients-of-life/

Genetic history

Genetic history

watch : https://youtu.be/v8tJGlicgp8

Genetics 101 | National Geographic

What is a genome, and how are traits passed from generation to generation? Learn how pea plants helped launch the study of genetics and how the field of genetics research has evolved over time.

Explore a historical timeline on the web : https://unlockinglifescode.org/timeline?tid=4

take some notes of dates / names / discoveries about genetic

to get some more details : https://www.bioexplorer.net/history_of_biology/genetics/

mercredi 24 novembre 2021

1.3 - Une structure complexe : la cellule vivante

Dans le monde, la matière s’organise en structure d’ordre supérieur à l’échelle moléculaire. Un exemple est ici proposé : la structure cellulaire

1/La microscopie et la théorie cellulaire

1,2,3/ Effets de rétroactions sur le climat

 

Un modèle climatique a pour fonction de rendre accessible un système complexe en permettant de le décrire , de l’expliquer, de le tester afin de voir la réponse aux variations apportées : par exemple les émissions anthropiques de GES, les changements d’utilisation des terres, le volcanisme, … Ces éléments perturbent le climat en modifiant le bilan radiatif de la Terre et les réponses des modèles le montrent. Comment estimer le changement climatique ? Quelle est la fiabilité des modèles climatiques ?

1.2 La complexité du système climatique

1,2,2/ Réchauffement climatique

dimanche 21 novembre 2021

Black Friday : des promos aussi sur la GPA

A l’occasion du « Black Friday », la société BioTexCom (cf. GPA : malgré la pandémie, le marché prospère ; Bébés bloqués en Ukraine : pas à cause de la Covid-19 mais de la GPA), le leader du marché de la gestation par autrui en Ukraine, propose une « offre unique » à ses « clients » : 3% de remise sur tous les « packages » GPA proposés. Une offre re-twittée par le Collectif pour le Respect de la Personne (CoRP) pour la dénoncer, alors que la Conférence de la Haye se réunit actuellement pour harmoniser la réglementation en la matière (cf. GPA : « C’est comme si vous demandiez à un propriétaire d’esclaves s’ils sont pour l’esclavage ou contre »).

Les offres s’affichent sur internet comme elles s’affichent par ailleurs dans des salons de Bruxelles ou de Paris (cf. GPA : Une nouvelle édition du salon « vente d’enfants »PMA et GPA : Le Salon « Désir d’enfant » de retour à Paris ). Sans complexe. Comme s’affichent également dans les médias, les commanditaires qui ont eu recours à une pratique interdite par la loi (cf. GPA dans les médias : le coup de gueule !). Des commanditaires qui parfois n’hésitent pas à réclamer une prime de quelques centaines d’euros à la CAF quand ils ont pu en débourser plusieurs milliers pour obtenir cet enfant (cf. GPA, prime à la naissance et discrimination). Il n’y a pas de petites économies…

vendredi 19 novembre 2021

Chronic Cocaine Use Triggers Changes in Brain's Neuron Structure

 Super Powers for the Blind and Deaf

2/ De la plante sauvage à la plante domestiquée

2,3/ Reproduction de la plante entre vie fixée et mobilité

Objectifs : il s’agit de présenter les éléments fondamentaux de la reproduction asexuée et sexuée des plantes angiospermes. L’étude de la fleur puis de la graine est opportunément liée à celle de la plante domestiquée

 presentation Hippo

lundi 15 novembre 2021

Steve Chien interview: Why NASA is inventing curious AI for deep space

Space probes will be the first to explore the furthest reaches of our solar system and beyond. To make discoveries like finding alien life, they will need to think more like humans, says NASA’s Steve Chien

Space 20 October 2021

mardi 9 novembre 2021

2/ De la plante sauvage à la plante domestiquée

2,2/ La plante, productrice de matière organique

Objectifs : on s’intéresse ici avant tout au bilan et aux produits de la photosynthèse, à leur diversité et à leur fonction dans les plantes.

Liens : enseignement de SVT en classe de seconde : métabolisme des cellules, classe de première : enseignement scientifique, respiration et apports d’énergie.

2,2,1/ Production de matière organique par Photosynthèse

vendredi 5 novembre 2021

Ces découvertes scientifiques majeures confirment l’existence de Dieu

<p>Image de synthèse d'une onde gravitationnelle, oscillation dans la courbure de l'espace-temps. </p>

Image de synthèse d'une onde gravitationnelle, oscillation dans la courbure de l'espace-temps. 

- SAKKMESTERKE / SCIENCE PHOTO LIBRA / AAT / SCIENCE PHOTO LIBRARY VIA AFP

vendredi 8 octobre 2021

mardi 5 octobre 2021

4/ De la plante sauvage à la plante domestiquée

L’objectif de cette partie est d’étudier l’organisation fonctionnelle des plantes, leurs interactions avec le milieu et la manière dont elles se reproduisent par voie sexuée et/ou asexuée en assurant à cette occasion leur dissémination. L’étude de la morphogenèse des plantes (on se limite aux Angiospermes) montre l’existence d’un contrôle hormonal et d’une influence environnementale. On étudie ensuite comment les plantes produisent leur matière organique et une diversité de métabolites nécessaires à leurs fonctions biologiques. Dans un second temps, cette partie s’intéresse aux plantes cultivées, un enjeu majeur pour l’humanité qui utilise les plantes comme base de son alimentation et dans des domaines variés. Sans chercher l’exhaustivité, il s’agit de comprendre comment l’humanité agit sur le génome et le phénotype des plantes cultivées, et d’appréhender les conséquences de ces actions sur la biodiversité végétale ainsi que sur l’évolution des populations humaines.

vendredi 1 octobre 2021

misensituation

Qu’est-ce qu’une plante ?

  • Pour vous qui suis-je ? Pour vous qu'est-ce qu'un végétal ? Faites un petit brain storming pour « planter » le décor

envoyez vos réponses par mail pour que je les poste sur le blog

mercredi 29 septembre 2021

sortie Géologique

les site consacré au site de Baroude :

http://cirquedebarrosa.free.fr/geologiebarroude.htm

http://cirquedebarrosa.free.fr/phvalleegela.htm

http://cirquedebarrosa.free.fr/phlbrietmurrbarr.htm

http://cirquedebarrosa.free.fr/phnappecharr.htm

http://cirquedebarrosa.free.fr/

la lherzolite de Moncaup : http://cirquedebarrosa.free.fr/montchauve.htm

 

1.1/ L’atmosphère terrestre et la vie

1,1,3/ Le cycle de l’oxygène

Manuel p.34-35

https://www.lelivrescolaire.fr/page/3502582

http://www.jpboseret.eu/biologie/index.php?option=com_content&view=article&id=34&Itemid=145

https://sciencepost.fr/le-trou-dozone-de-2019-est-le-plus-petit-jamais-observe-depuis-sa-decouverte-en-1985/

Interpréter des spectres d’absorption de l’ozone et de l’ADN dans le domaine ultraviolet.

Sous l’effet du rayonnement ultraviolet solaire, le dioxygène stratosphérique peut se dissocier, initiant une transformation chimique qui aboutit à la formation d’ozone. Celui-ci constitue une couche permanente de concentration maximale située à une altitude d’environ 30 km. La couche d’ozone absorbe une partie du rayonnement ultraviolet solaire et protège les êtres vivants de ses effets mutagènes.

1.1 - Un niveau d’organisation : les éléments chimiques

3/ Quatre catégories de molécules organiques

mardi 28 septembre 2021

1,2/ Les traces du passé mouvementé de la Terre

1,2,3/ Les marques de la fragmentation continentale et de l’ouverture océanique : marges continentales

lundi 27 septembre 2021

next : evaluation by groups : for the next lecture, each of you chooses an article about scientific news : http://www.newscientist.com/ or https://www.the-scientist.com/ and prepare an oral presentation of 10' wich will be marqued.

Sex genetic determination

Read : https://medlineplus.gov/genetics/gene/sry/

Sex Differentiation

mardi 21 septembre 2021

1/ A la recherche du passé géologique de notre planète

 

1,2/ Les traces du passé mouvementé de la Terre

Objectifs : mobiliser les acquis de la classe de première sur la tectonique globale actuelle (notamment les marqueurs de collision ou d’extension) pour reconstituer l’histoire géologique de la Terre et notamment sa paléogéographie.

Notions fondamentales : cycle orogénique, ophiolites, paléogéographie.

Liens : enseignement de spécialité de SVT en classe de première : dynamique de la lithosphère.

vendredi 17 septembre 2021

1,1,2/ La chronologie absolue

4/ Observation de lames minces de roches au microscope

Zircon Crystal: Oldest Rock on Earth | When did life begin on Earth?

Carl Linnaeus’s Herbarium Cabinet

Clever Collections highlights the most important scientific artefacts owned by The Linnean Society of London. This video series shows how these priceless artefacts are still relevant to this very day. In this episode we learn about how Carl Linnaeus stored his plant specimens and their significance to modern science.

https://youtu.be/JA6dMDzUE1c

why don’t you make your own Herbarium ?

What’s in a name?

Have you ever watched a child playing with Smarties? Very often the child will sort them out into colours. This might seem an obvious and natural thing to do, but it tells us something very interesting about the human brain. The child is indulging in an activity which can be described as classification. Suppose you were designing a website for a large company or supermarket. One of your tasks would be to sort out the products into a logical system. More complicated than Smarties, but not really different in essence.

Through this worksheet, students will cover the topics of classification and binomial nomenclature. 

Worksheet 01: What's in a name? : Student Worksheet

read and write : https://www.linnean.org/learning/content/worksheets/whats-in-a-name

Carl Linnaeus’s Herbarium Cabinet

mercredi 15 septembre 2021

Les creusets stellaires

[Conférence] Origine de la matière [1/7]

Voir la vidéo Comment s'est créée la matière ? sur http://www.cea.fr/multimedia/Pages/videos/culture-scientifique/terre-univers/origine-creation-matiere.aspx

Thème 1 : Science, climat et société

Thème 1 : Science, climat et société

Intro : qu’est-ce que la science ?

Corrigé Sujet 3

Intro : qu’est-ce que la science ?

À la limite, la vie, c'est ce qui est capable d'erreur. Et c'est peut-être à cette donnée ou plutôt à cette éventualité fondamentale qu'il faut demander compte du fait que la question de l'anomalie traverse de part en part toute la biologie. À elle aussi qu'il faut demander compte des mutations et des processus évolutifs qu'elle induit. À elle qu'il faut demander compte de cette mutation singulière, de cette « erreur héréditaire » qui fait que la vie a abouti avec l'homme à un vivant qui ne se trouve jamais tout à fait à sa place, à un vivant voué à « errer » et destiné finalement à l'« erreur ». Et si on admet que le concept, c'est la réponse que la vie elle-même donne à cet aléa, il faut convenir que l'erreur est à la racine de ce qui fait la pensée humaine et son histoire. L'opposition du vrai et du faux, les valeurs qu'on prête à l'un et à l'autre, les effets de pouvoir que les différentes sociétés et les différentes institutions lient à ce partage, tout cela même n'est peut-être que la réponse la plus tardive à cette possibilité d'erreur intrinsèque à la vie. Si l'histoire des sciences est discontinue, c'est-à-dire si on ne peut l'analyser que comme une série de « corrections », comme une distribution nouvelle du vrai et du faux qui ne libère jamais enfin et pour toujours la vérité, c'est que, là encore, l' « erreur » constitue non pas l'oubli ou le retard d'une vérité, mais la dimension propre à la vie des hommes et au temps de l'espèce.

Sujet 3 du Bac 2017 Philo Série S (Coef. 3) : Expliquer le texte suivant : Extrait de FOUCAULT, Dits et Ecrits (1978).

jeudi 2 septembre 2021

1troduction

 sortie géol de rafraichissement mnémonique

datation des roches, radioactivité

trois types de roches

 

1 - Une longue histoire de la matière


1.1 - Un niveau d’organisation : les éléments chimiques

1/ Les éléments chimiques de l'Univers

L'Univers est principalement constitué d'hydrogène et d'hélium. 

 

1 - Une longue histoire de la matière

1.1 - Un niveau d’organisation : les éléments chimiques

1.2 - Des édifices ordonnés : les cristaux

1.3 - Une structure complexe : la cellule vivante

2 - Le Soleil, notre source d’énergie

2.1 - Le rayonnement solaire

2.2 - Le bilan radiatif terrestre

2.3 - Une conversion biologique de l’énergie solaire : la photosynthèse

2.4 - Le bilan thermique du corps humain

3 - La Terre, un astre singulier

3.1 - La forme de la Terre

3.2 - L’histoire de l’âge de la Terre

3.3 - La Terre dans l’Univers

4 - Son et musique, porteurs d’information

4.1 - Le son, phénomène vibratoire

4.2 - La musique ou l’art de faire entendre les nombres

4.3 - Le son, une information à coder

4.4 - Entendre la musique

5 - Projet expérimental et numérique

samedi 24 juillet 2021

informations sur l’épidémie, qui ne sont pas toujours portées à la connaissance du public

Dans un long communiqué, Mgr Marc Aillet, évêque de Bayonne, pose un certain nombre de questions sur la crise sanitaire, en refusant de dicter une conduite ni de prendre position, de manière dogmatique, pour ou contre le vaccin :

mercredi 14 juillet 2021

Reconciling estimates of global spread and infection fatality rates of COVID-19: An overview of systematic evaluations.

mardi 15 juin 2021

Variants viraux

6 MIN de lecture
Variants viraux

Depuis fin 2020, le terme « variant » autrefois réservé aux spécialistes en virologie est entré dans le langage courant. L’apparition d’un nouveau variant du SARS-CoV-2 au Royaume-Uni a rapidement soulevé des inquiétudes. Sans compter que d’autres formes virales ont peu à peu émergé à d’autres endroits du globe. Que sont exactement ces variants ? Représentent-ils une nouvelle menace ?

lundi 14 juin 2021

 

Sida, Ebola, Zika, Corona… font fémir chaque année la planète alors qu’il n’y a pas plus petit organisme sur terre, si l’on admet que les virus sont vivants, ce qui est encore en débat entre les scientifiques. Qu’est-ce qu’un virus ? Voici quelques infos qui provoqueront sans doute des questions que j’attend par mail ou commentaire avec impatience !

1/ Coronavirus

https://prezi.com/view/PuWIC6cDfne6TJz8TddA/

C’est quoi ?

  • Le SRAS-CoV2 (SARS, in English), pour Syndrôme Respiratoire Aigü Sévère au CoronaVirus 2 est l’agent de la maladie COVID19 ou 2019-nCoV pour Coronavirus infection disease 2019, littéralement « maladie infectieuse à coronavirus de 2019 ».

  • Les coronavirus humains comptent parmi les agents du rhume, derrière les rhinovirus. Ce sont des virus à ARN, enveloppés, avec certaines particularités : le génome le plus long des virus à ARN (30 kb) ; de très larges spicules d’enveloppe, donnant à la particule virale un aspect en couronne ; une relative résistance dans l’environnement et la présence dans les selles (en rapport avec cette enveloppe particulière ?).

  • Enveloped, spherical, about 120 nm in diameter. The RNA genome is associated with the N protein to form the nucleocapsid. see Neuman BW et al. for virion cryo-electron microscopy analysis. Monopartite, linear ssRNA(+) genome of 27-32kb in size (the largest of all RNA virus genomes). Capped, and polyadenylated. The leader RNA (65-89 bp) at the 5' end of the genome is also present at the end of each subgenomic RNAs.

Pour quoi ?

  • C’est la première menace de pandémie du troisième millénaire. Cette pneumonie sévère, apparue en novembre 2002 dans la province de Guangdong (ex Canton) en Chine, a diffusé jusqu’en avril 2003, touchant plus de 8000 personnes. Elle est due à un virus nouveau, d’origine très probablement animale (la civette), les coronavirus humains déjà connus ne donnant que des rhumes. L’implication de ce nouveau virus comme agent du SRAS a été démontrée par la reproduction de la maladie chez le singe (cynomolgus).

  • Physiopathologie : Le SRAS diffère de la grippe par les caractères suivants : mortalité plus élevée (10 %) ; incubation plus longue (six jours, avec des extrêmes de 14 jours) ; caractère généralisé de l’infection (le virus est présent dans les sécrétions respiratoires, mais aussi dans les urines, les selles, le sang) ; pic de multiplication virale relativement tardif (10 jours après le début des signes cliniques) ; rareté des affections asymptomatiques ; fréquence de la pneumonie plus grande chez l’adulte que chez l’enfant (comme pour la pneumonie de la varicelle) ; contagiosité limitée (deux à quatre cas secondaires par cas index, mais exceptionnellement beaucoup plus ; pour la grippe, c’est 5 à 10 cas, voire 15 en cas de pandémie) ; diffusion nosocomiale importante parmi le personnel (« maladie des blouses blanches ») ; enfin contrôle possible de l’épidémie par des mesures d’hygiène (isolement, quarantaine, bannissement des aérosols) dès que les cas sont reconnus.

  • Diagnotic virologique : La difficulté de leur isolement en culture de cellules, la bénignité du rhume et l’absence de traitement antiviral font que le diagnostic virologique, hors enquêtes spécifiques, n’en est pas fait. En phase aiguë, on recherche le génome viral par RT-PCR en temps réel sur les sécrétions respiratoires, les urines, les selles. Le diagnostic rétrospectif peut se faire par la recherche d’une séroconversion sur deux prélèvements sériques, précoce et tardif (IF ou ELISA… si le patient survit).

  • Traitement : Il n’y a actuellement pas de traitement antiviral validé. La question : cette épidémie liée à une zoonose [du grec ζῷον : zôion : animal + νόσος : nósos : maladie] peut-elle reprendre tous les ans ? Importance de la surveillance en Chine de la civette et autres animaux sauvages vendus sur les marchés et utilisés en plats cuisinés.

Comment ?

  • REPLICATION CYTOPLASMIC :

  1. Attachement of the viral S protein (maybe also HE if present) to host receptors mediates endocytosis of the virus into the host cell.

  2. Fusion of virus membrane with the endosomal membrane (probably mediated by S2), ssRNA(+) genome is released into the cytoplasm.

  3. Synthesis and proteolytic cleavage of the replicase polyprotein.

  4. Replication occurs in viral factories. A dsRNA genome is synthesized from the genomic ssRNA(+).

  5. The dsRNA genome is transcribed/replicated thereby providing viral mRNAs/new ssRNA(+) genomes. GENE EXPRESSION : The virion RNA is infectious and serves as both the genome and viral messenger RNA. Genomic RNA encodes ORF1a, as for ORF1b, it is translated by ribosomal frameshifting. Resulting polyproteins pp1a and pp1ab are processed into the viral polymerase (RdRp) and other non-structural proteins involved in RNA synthesis. Structural proteins are expressed as subgenomic RNAs.

  6. Synthesis of structural proteins encoded by subgenomic mRNAs.

  7. Assembly and budding at membranes of the endoplasmic reticulum (ER), the intermediate compartments, and/or the Golgi complex.

  8. Release of new virions by exocytosis. A SARS-CoV-infected cell with virus particles in vesicles, which appear to migrate toward the cell surface and fuse with the plasma membrane, releasing the viral particles. Many of the particles adhere to the plasma membrane, creating a characteristic knob-like appearance on the surface of the cell.

Modifié d’après https://viralzone.expasy.org/764?outline=all_by_species et http://www.chups.jussieu.fr/polys/viro/oldpoly/POLY.Chp.8.html

https://fr.wikipedia.org/wiki/Coronavirus

https://youtu.be/PWzbArPgo-o

https://evolution.berkeley.edu/evolibrary/news/200409_coronavirus