3/ modélisation moléculaire de l’ADN / logiciel Rastop
? utiliser un logiciel pour synthétiser/simplifier/construire/schématiser une molécule d'ADN
Objectifs : Exprimer et exploiter des résultats à l’écrit en utilisant les technologies de l’informatique
Principe : les logiciels Rastop, Rasmol, Raswin, Jmol, … sont des banques de données permettant de manipuler des modèles moléculaires.
Protocole :
Ouvrez le fichier « ADN » : https://libmol.org/?libmol=158
Admirez la molécule en la manipulant à la souris.
Changer (commande) la représentation des atomes et des liaisons.
Colorez la molécule par « atomes » : quels sont les atomes composant l’ADN ?
Colorez la molécule par « chaines » : combien de parties lui trouvez-vous ?
Affichez les « rubans » puis « squelette » : quelle est la forme globale de la molécule ?
Dessinez la forme globale de la molécule
Colorez la molécule par « résidus» : combien de nucléotides différents existe-t-il ?
quels sont leurs noms (passez la souris dessus) ?
Quelle est la composition, la structure d'un nucléotide ? Utilisez les informations du logiciel pour comprendre.
Schématisez la structure d'un nucléotide en utilisant différents symboles et couleurs de votre choix.
En 1951 Chargaff démontre que [A] = [T] et [C] = [G] pour toute cellule. Que signifie l'expression « bases complémentaires » ?
En utilisant les symboles précédents schématisez la structure de la molécule à plat, sans tenir compte de la forme dans l'espace.
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