A3/ Comparaison des gènes des globines / logiciel Anagène

Protocole / manuel p.23

TS_TP_globines_anagene.doc

→ matrice [tableau] des différences ou des identités selon choix de comparaison simple ou avec discontinuité sous Anagène :

Tableau de comparaison avec discontinuité en pourcentage des identités des différentes globines obtenu avec comparaison avec alignements :

% identités	Béta	Alpha1	Delta. ADN	GammaA.ADN
Béta	100	59.4	92.6	75.9
Alpha1	59.4	100	57.2	56.3
Delta. ADN	92.6	57.2	100	76.1
GammaA. ADN	75.9	56.3	76.1	100

Tableau de comparaison simple en pourcentage des différences des différentes globines obtenu avec comparaison simple :

% différences	Béta	Alpha1	Delta. ADN	GammaA.ADN
Béta	0	40,6	7.4	24.1
Alpha1	68.9	0	70.0	70.7
Delta. ADN	7.4	69.0	0	23.9
GammaA. ADN	24.1	69.7	23.9	0

→ groupes emboîtés

→ arbre phylogénétique des globines : globines.odg ©

http://librairiedemolecules.education.fr/outils/pevf/pe1_982/classes/cl1l_fm.htm ;

http://www.inrp.fr/Acces/biotic/evolut/mecanismes/globines/html/synthese.htm