vendredi 11 septembre 2020

Découverte d'une nouvelle espèce de singe en Inde

C'est ce qu'on appelle la sérendipité, le fait de faire une découverte scientifique par hasard. Des archéologues de l'université de l'Arizona ont découvert une nouvelle espèce de singe du Miocène au détour d'une promenade en Inde.

1,1,1/ Les enzymes, des biomolécules aux propriétés catalytiques

 

3/ Modélisation moléculaire de la relation enzyme-substrat

Modélisation moléculaire / logiciel Rastop

carboxypeptidase : Structure de la carboxypeptidase :

Enzyme hydrolase (C-TERMINAL PEPTIDASE), c'est à dire qu'elle hydrolyse les chaînes polypeptidiques à partir de leur extrémité C-terminale (celle qui porte la fonction acide carboxylique). La carboxypeptidase est produite par le pancréas sous la forme de procarboxypeptidase, complexée avec le chymotrypsinogène et la proprotéinase E. Ce complexe est appelé zymogène. L'enzyme a une forme globuleuse. La structure spatiale est maintenue par des liaisons hydrogène (liaisons faibles) et des ponts disulfure (liaisons covalentes). Le site actif possède un hétéro-atome de zinc et il met en jeu 6 résidus : His69, Glu72, His196, Arg145, Tyr248 et Glu270.

  • Étudier les relations enzyme-substrat au niveau du site actif par un logiciel de modélisation moléculaire.

  • Schématisez la molécule enzymatique et son substrat + titre + légende

le site actif

permet

  • la spécificité de l’enzyme

  • la vitesse de réaction selon son encombrement

  • le mode d’action (cata ou anabolisme) : la peroxydase est dans la construction et on pas l’hydrolyse comme la lactase, l’amylase ou la saccharase

La structure tridimensionnelle de l’enzyme lui permet d’interagir avec ses substrats et explique ses spécificités en en termes de substrat et de réaction catalytique.

quand les ordi fonctionneront :

Modélisation de la réaction enzymatique / logiciel lactase

Modélisation graphique de la réaction enzymatique / logiciel lactase


4/ Comparaison de métabolismes cellulaires

articles scientifiques :

  • - Étudier des profils d’expression de cellules différenciées montrant leur équipement enzymatique.

  • Sur ou soulignez dans les textes les mots que vous ne comprenez pas, à définir.

  • Schématisez les étapes chimiques décrites dans ces articles.

  • Quelle spécificité les enzymes donnent-elles à l’individu qui en est porteur ?

Lire et répondre aux questions pour vendredi 18

 

Listen : https://youtu.be/M1wdIdCOk-Y

So cells come in all shapes and forms and have all sorts of jobs, but they are all fundamental building blocks of all living organisms.

Read : https://www.bioexplorer.net/parts-of-cell-theory.html/

1,1,1/ Les enzymes, des biomolécules aux propriétés catalytiques

 à préparer pour lundi :

2/ Expérimentation sur la spécificité des enzymes

  • Concevoir et réaliser des expériences utilisant des enzymes et permettant d’identifier leurs spécificités.

  • Rédiger un compte-rendu des expériences

Comparaison de deux enzymes : amylase et saccharase

Problème : les enzymes sont-elles spécifiques d’un type de molécule ?

Hypothèse : une enzyme est spécifique d’un substrat.

Écrire les conséquences vérifiables de l’hypothèse

Matériel : levure Saccharomyces cerevisiae, bescher, entonnoir, filtre, amidon, saccharose, eau, pipettes, tubes à essai, salive, levure fraiche

Méthode : L’être humain Homo sapiens se nourrit d’amidon et possède une enzyme appelée amylase produite par les glandes salivaires et sécrétée dans la bouche. La levure Saccharomyces cerevisiae se nourrit de saccharose et possède une enzyme saccharase, sécrétée dans le milieu extérieur. La digestion de l’amidon donne du maltose, puis du glucose, celle du saccharose donne du glucose et du fructose.

Ecrire littéralement les équations chimiques correspondantes.

Protocole d’extraction de la saccharase de levure

-délayer 1 g de levure dans 10ml d’eau.

-laisser reposer ¼ d’heure puis filtrer.

Protocole expérimental

-tester l’absence de glucose dans le filtrat et dans la salive.

-préparer le bain-marie à 37°C.

-écrire un schéma du montage expérimental et un tableau de résultats.

-introduire l’amidon ou le saccharose selon les tubes prévus.

-tester avant d’ajouter les enzymes la présence ou non du glucose (t=0)

-mettre l’enzyme et tester la présence de glucose (t=0’).

-faire un test de mise en évidence du glucose toutes les 2'

-compléter le tableau de résultats

-comparer et conclure

Mythical Creatures and How to Make Them

The Curious Cases of Carl Linnaeus tells funny stories about his journey of scientific exploration. In this episode we learn about how the dragon, phoenix and even the hydra were once real, that was until at least Carl Linnaeus had something to say about it. We also learn about the ways in which we classify the natural world.

Listen : https://youtu.be/lmQVnEMWtFc

 

What’s in a name?

 

Have you ever watched a child playing with Smarties? Very often the child will sort them out into colours. This might seem an obvious and natural thing to do, but it tells us something very interesting about the human brain. The child is indulging in an activity which can be described as classification. Suppose you were designing a website for a large company or supermarket. One of your tasks would be to sort out the products into a logical system. More complicated than Smarties, but not really different in essence.

Through this worksheet, students will cover the topics of classification and binomial nomenclature. 

Student Worksheet
Worksheet 01: What's in a name?

read and write : https://www.linnean.org/learning/content/worksheets/whats-in-a-name

jeudi 10 septembre 2020

1,1/ L’origine du génotype des individus

Comment notre patrimoine héréditaire individuel est-il conservé ?

1,1,2/ L’évolution d’un patrimoine individuel

1/ Histoire de la découverte du génôme

  • 1865 (Autriche) Mendel démontre l'existence de "facteurs génétiques"

  • 1868 (Suisse) Miescher trouve une substance spécifique du noyau qu'il nomme la "nucléine"

  • 1883 (Allemagne) Weismann utilise le terme "matériel génétique"

  • 1880 - 1890 - Walter Flemming, Edouard van Beneden, & Eduard Strasburger dessinent les chromosomes lors de la division cellulaire.

  • 1883 (Allemagne) Weismann utilise le terme "matériel génétique"

  • 1903 - Walter Sutton, American physician and geneticist,  hypothesized that chromosomes are hereditary units.

  • 1905 - William Bateson coined the term “genetics”.

  • 1909 - Johannsen propose le mot gène pour remplacer celui de facteur utilisé par Mendel

  • 1909 Phoebus Levene discovered ribose, a sugar present in genetic material.

  • 1910 (Amérique) Morgan montre que les gènes sont portés par les chromosomes

  • 1913 - Alfred Sturtevant made the first genetic map of a chromosome.

  • 1928 - Frederick Griffith made a revolutionary discovery from an experiment: dead bacteria can have genetic material incorporated by living bacteria

  • 1929 Phoebus Levene discovered deoxyribose and nucleotides (adenine, guanine, cytosine, and thymine), recognizing the significance of phosphate-sugar bases in the structure of DNA.

  • 1933 - Jean Brachet was able to show that DNA was found in chromosomes and that RNA was found in the cytoplasm of all cells.

  • 1941 - George Wells Beadle & Edward Lawrie Tatum made an extremely important fundamental discovery: genes code for proteins.

  • 1944 (Amérique) Avery, Mc Leod & Mc Carty montrent que l'ADN est le support des gènes, Le rôle de l’ADN comme support de l’information génétique fut confirmé par les expériences de Hershey et Chase sur la reproduction de bactériophage.

  • 1951 ( Amérique ) Chargaff établit sa règle : [A] = [T] et [C] = [G] pour toute cellule. Exemple chez l'homme : A= T=30% ; C=G=19%.

  • 1953 (Angleterre) Franklin & Wilkins montrent que la molécule a la forme d'une double hélice, puis Watson & Crick établissent le modèle moléculaire de l'ADN

  • 1958 Meselson & Stahl montrent comment se réplique l'ADN

  • 1960 Crick & Brenner découvrent le codon.

  • 1961, Monod & Jacob découvrent l’ARNm.

  • 1962 Wilkins, Watson & Crick obtiennent le prix Nobel de Médecine pour la structure de l'ADN

  • 1965 Nirenberg & Mattéi découvrent le code génétique

  • 1967 Nirenberg & Khorana complètent les travaux de Monod & Jacob sur la transcription et la traduction

compléter avec :

http://www.medecine.unige.ch/enseignement/dnaftb/

http://www.genoscope.cns.fr/externe/HistoireBM/

https://www.timetoast.com/timelines/genetics-timeline--15

https://www.timetoast.com/search/timelines?cx=partner-pub-3637961829875093%3Aehixnl-dg1y&cof=FORID%3A9&ie=UTF-8&q=genetics&sa=Search&siteurl=localhost%2F&ref=localhost%2Fcategories&ss=

 

2/ la mitose engendre des clones

TP révision sur la mitose / extrémités racinaires de Jacinthe : http://svtotriolo.free.fr/photos/mitose/lame_mitose.htm

observez – dessinez – légendez

pour lundi :


  • Réalisez un schéma de mitose

  • à 2n=6

  • différencier les pairs par la forme (taille et position du centromère)

  • différencier les homologues (chromosomes paternel & maternels) par la couleur,

  • marquer deux gènes sur 2 chs différents, ex : groupe sg (A//B) et (+//-)

Volcan effusif et volcan explosif - comparaison

volcans effusifs et explosifs

Mexique : sous un aéroport en cours de construction, des mammouths

 volcans

 dinosaures p.30-31

mercredi 9 septembre 2020

4.4 - Entendre la musique

4 - Son et musique, porteurs d’information


https://www.reseau-canope.fr/corpus/video/les-cinq-sens-38.html

tableau de classifIcation des sens

Le sens d...

handicap

recepteur

stimulus

nature

vue


visuel

image

lumière





onde


anosmie



molécule


aguesie



molécule

Toucher

Hypoesthésie

Tactile

Pression, chaleur, douleur

Pression, température,


L’être humain perçoit le monde à l’aide de signaux dont certains sont de nature sonore. De l’Antiquité jusqu’à nos jours, il a combiné les sons de manière harmonieuse pour en faire un art, la musique, qui entretient des liens privilégiés avec les mathématiques. L’informatique permet aujourd’hui de numériser les sons et la musique.

La compréhension des mécanismes auditifs s’inscrit dans une perspective d’éducation à la santé.

4.1 - Le son, phénomène vibratoire (PC)

4.2 - La musique ou l’art de faire entendre les nombres (PC)

4.3 - Le son, une information à coder (PC)

4.4 - Entendre la musique (SVT)

1/ anatomie auditive