vendredi 11 septembre 2020

1,1,1/ Les enzymes, des biomolécules aux propriétés catalytiques

 

3/ Modélisation moléculaire de la relation enzyme-substrat

Modélisation moléculaire / logiciel Rastop

carboxypeptidase : Structure de la carboxypeptidase :

Enzyme hydrolase (C-TERMINAL PEPTIDASE), c'est à dire qu'elle hydrolyse les chaînes polypeptidiques à partir de leur extrémité C-terminale (celle qui porte la fonction acide carboxylique). La carboxypeptidase est produite par le pancréas sous la forme de procarboxypeptidase, complexée avec le chymotrypsinogène et la proprotéinase E. Ce complexe est appelé zymogène. L'enzyme a une forme globuleuse. La structure spatiale est maintenue par des liaisons hydrogène (liaisons faibles) et des ponts disulfure (liaisons covalentes). Le site actif possède un hétéro-atome de zinc et il met en jeu 6 résidus : His69, Glu72, His196, Arg145, Tyr248 et Glu270.

  • Étudier les relations enzyme-substrat au niveau du site actif par un logiciel de modélisation moléculaire.

  • Schématisez la molécule enzymatique et son substrat + titre + légende

le site actif

permet

  • la spécificité de l’enzyme

  • la vitesse de réaction selon son encombrement

  • le mode d’action (cata ou anabolisme) : la peroxydase est dans la construction et on pas l’hydrolyse comme la lactase, l’amylase ou la saccharase

La structure tridimensionnelle de l’enzyme lui permet d’interagir avec ses substrats et explique ses spécificités en en termes de substrat et de réaction catalytique.

quand les ordi fonctionneront :

Modélisation de la réaction enzymatique / logiciel lactase

Modélisation graphique de la réaction enzymatique / logiciel lactase


4/ Comparaison de métabolismes cellulaires

articles scientifiques :

  • - Étudier des profils d’expression de cellules différenciées montrant leur équipement enzymatique.

  • Sur ou soulignez dans les textes les mots que vous ne comprenez pas, à définir.

  • Schématisez les étapes chimiques décrites dans ces articles.

  • Quelle spécificité les enzymes donnent-elles à l’individu qui en est porteur ?

Lire et répondre aux questions pour vendredi 18

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