TP Genigen : https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/geniegen2/
comparez les gènes des syncytines humaines et virale : chargez les séquences puis alignez puis affichez le tableau de comparaison
http://vandenschrick.free.fr/LYCEE/3TermSPE/T1/T1/Chap2/1A-7 (TP) Syncytines 2.pdf
http://m.pourcher.free.fr/2018/TermSPE/THEME1A/TP4-Complexification-genomes.pdf
http://langevin.svt.free.fr/Site_SVT/genome_TP5_files/TP5b.pdf
correction DS
1. Expliquer les symptômes de la drépanocytose aussi appelée anémie falciforme.
Dans le doc. 1, on peut voir que, dans le cas de la drépanocytose, les hématies sont déformées en faucille (falciforme) et peuvent boucher les vaisseau sanguins, ce qui engendre les problème de manque de sang (anémie).
2. Calculer la fréquence "p" de l'allèle S et la fréquence "q" de l'allèle A au Congo.
f(S) = p = nb allèles S / nb total d'allèles = 838+96x2 / 3182x2+838x2+96x2 = 1030 / 8232 = 0,125
f(A) = q = nb allèles A / nb total d'allèles = 838+3182x2 / 3182x2+838x2+96x2 = 7202 / 8232 = 0,875
3. Calculer les fréquence p², 2pq et q² des trois génotypes possibles (A//A), (A//S), (S//S)
f(A//A) = q2 = 0,77
f(A//S) = 2pq = 0,22
f(S//S) = p2 = 0,016
4. Utiliser l'équilibre de Hardy-Weinberg pour prédire le nombre théorique d'enfants de chaque génotype dans les 350 000 naissances par an. Selon l'équilibre de Hardy‐Weinberg, il y a conservation des fréquences d'une génération à l'autre. Le nombre d'enfant s'obtient en multipliant la fréquence par le nombre de naissances.
Nombre d'enfants (A//A) = f(A//A) × 350 000 = q2 × 350 000 = 267 969
Nombre d'enfants (A//S) = f(A//S) × 350 000 = 2pq × 350 000 = 76 563
Nombre d'enfants (S//S) = f(S//S) × 350 000 = p2 × 350 000 = 5 468
Génotype |
A//A |
A//S |
S//S |
tot |
|---|---|---|---|---|
Nombre d'individus |
3 182 |
838 |
96 |
|
nombre d'allèles |
6 364 |
1 676 |
192 |
8 232 |
fréquence génotypique |
0,77 |
0,22 |
0,02 |
|
nombre théorique |
267 969 |
76 563 |
5 469 |
|
5. Comparer le nombre d'enfants réellement malades à la prédiction calculée précédemment. Proposer une explication à la fréquence plus élevée d'individus (A//S) dans certaines régions.
Génotype |
A//A |
A//S |
S//S |
tot |
|---|---|---|---|---|
Nombre de naissances observées |
270 550 |
71 400 |
8 050 |
350 000 |
nombre théorique |
267 969 |
76 563 |
5 469 |
|
différence |
2 581 |
-5 163 |
2 581 |
|
Le nombre d'enfants réellement malades (S//S) est de 8 050 au lieu de 5 469, soit près de 1,5 fois le nombre prédit par le modèle de Hardy‐Weinberg.
Les individus (A//S) ne sont pas malades, mais sont plus résistants contre le paludisme. Or cette maladie est justement présente dans les régions citées. Aussi, les individus (A//S) sont avantagés dans cet environnement, c'est un cas de sélection naturelle. Cela explique que l'allèle S y soit si répandu. Provoquant de fait un écart entre les prédictions du modèle et la réalité.
suppl : Répartition des génotypes des naissances au Bahreïn en 1992 et en 2012.
Génotype |
A//A |
A//S |
S//S |
|---|---|---|---|
Nombre d'individus en 1992 |
8 954 |
1 157 |
217 |
Fréquence en 1992 |
0,867 |
0,112 |
0,021 |
Nombre d'individus en 2012 |
33 512 |
5 247 |
228 |
Fréquence en 2012 |
0,860 |
0,134 |
0,006 |
1. Calculer la fréquence de l'allèle S au Bahreïn en 1992 et en 2012.
2. Déterminer la fréquence attendue d'enfants malades (S//S) en 1992 et en 2012.
3. Comparer les fréquences attendues et observées d'enfants malades en 1992 et 2012. Proposer une explication aux différences observées.
text 987 words : https://www.birdsofparadiseproject.org/evolution-in-isolation/
video 5'37 : https://youtu.be/YTR21os8gTA : Birds-of-Paradise Project IntroductionExplore more: http://www.birdsofparadiseproject.org The Birds-of-Paradise Project reveals the astounding beauty of 39 of the most exquisitely specialized animals on earth. After 8 years and 18 expeditions to New Guinea, Australia, and nearby islands, Cornell Lab scientist Ed Scholes and National Geographic photojournalist Tim Laman succeeded in capturing images of all 39 species in the bird-of-paradise family for the first time ever. This trailer gives a sense of their monumental undertaking and the spectacular footage that resulted. Filmed by Tim Laman, Ed Scholes, and Eric Liner. Produced and Edited by Eric Liner.
video 8'28 : https://youtu.be/RxHdzw7E0wU : Natural Selection & Sexual Selection: An Illustrated IntroductionHow does evolution happen? Through a gradual process called selection. Individuals that are better equipped to survive and reproduce pass those traits to their offspring. These "selected" changes accumulate over thousands of years. We tend to think of natural selection—"survival of the fittest"—but sexual selection works the same way and can be just as strong in shaping how species look and act.
video 8'25 : https://www.birdsofparadiseproject.org/evolution-in-isolation/ : Speciation: An Illustrated IntroductionThere is a dizzying diversity of species on our planet. From genetic evidence we know that all of those species evolved from a single ancient ancestor. But how does one species split in to many? Through the evolutionary process of speciation — which begins when populations become isolated by changes in geography or by shifts in behavior so that they no longer interbreed. This video illustrates the speciation process in birds to help you understand the basis of earth's biodiversity.
video 3'18 : https://youtu.be/ZjejoT1gFOc?si=Ndpbl23n2gmbj3Ou From human hands to now-extinct animals, cave art gives us a glimpse into prehistoric life. Who created cave art, and what was its initial purpose? Explore the paintings of Chauvet-Pont d'Arc and Lascaux Grotto, and learn what prehistoric art can tell us about our world thousands of years ago.
practical work : try to collect some pigments in the garden and stick them on piece of paper with brushes
video 5'38 : https://youtu.be/zmKODf10y5c?si=kAE-FG8gtzq9mzHy Clues from the lives of prehistoric humans can help us to understand our past and comprehend our future. So what can we find piece together from what they left behind?
Video 27' : https://vimeo.com/222375882 The Final Passage (VENG)
Ce thème est abordé par une approche comportementale. Le comportement est défini comme un ensemble de réactions observables chez un animal en réponse à des stimulations. Il est souvent lié à la notion de mouvement, qu’il soit réflexe ou volontaire (fuite, défense, agression, équilibre, prise d’objet…). On s’intéresse ici aux mécanismes physiologiques sous-jacents.
L’étude d’un réflexe puis du mouvement volontaire montre la mise en jeu des systèmes articulo-musculaires et nerveux dans l’organisme, et permet d’aborder la plasticité cérébrale.
Les besoins en énergie pour la contraction musculaire sont identifiés, mettant en évidence les flux de glucose et leurs contrôles par le système endocrinien.
Les modifications de l’environnement, notamment la présence d’agents stresseurs, influencent les comportements d’un organisme. L’étude des mécanismes physiologiques du stress met en évidence l’intégration des différents systèmes en jeu, et enrichit la notion de rétrocontrôle, dans le prolongement des acquis de la classe de seconde sur la régulation (axe hypothalamo-hypophysaire). Ce thème aboutit à une vision intégrée des systèmes physiologiques qui permettent de maintenir des équilibres dans l’organisme.
Ce thème amène à interroger les enjeux de santé individuelle et collective soulevés par les comportements évoqués. Les éléments abordés s’inscrivent dans la progressivité des apprentissages du collège, de la classe de seconde et des enseignements de la classe de première (enseignement de spécialité de SVT et enseignement scientifique).
Posez toutes les questions qui vous viennent à l’esprit, on triera ensuite :
les réflexes sont-ils musculaires ou passent-ils par le cerveau ?
qu'est-ce que la plasticité cérébrale ? moulable ?
comment fonctionne le stress ?
d'où vient la force du muscle ? est-ce la pression du sang ?
comment évolue un muscle au cours de la vie ?
est-ce que le muscle peut se régénérer ?
comment se répare une déchirure ? un claquage ?
pourquoi un bras ne peut-il se régénérer ?
pourquoi opeut-on avoir mal sans blessure ? qu'est-ce que la douleur ?
qu'est-ce qu'une douleur fantôme ?
combien de muscle dans corps ?
comment se fait un réflexe ?
comment marche la mémoire musculaire ?
comment le corps donne-t-il un ordre ?
comment la volonté se traduit en signal nerveux ?
pourquoi le rélfexe du genou ?
pourquoi qd on tape un nerf on ne peut plus forcer ensuite ?
comment on a des émotions ? tristesse et pleur ?
pourquoi courbatures ?
peut-on décider d'un geste ?
comment fonctionnent les gilis ?
d'où vient la peur ?
comment perçoit-on la présence de "gens" ?
pourquoi les chats ont une bosse qfd ils ont peur ?
pourquoi moins de sensibilité dans le bas du dos ?
comment un os se répare ?
pourquoi on ne sent pas la peau de notre coude ?
Manuel p.194-195
https://www.lelivrescolaire.fr/page/11095665
Analyser des documents pour comprendre les mesures de protection de populations à faibles effectifs.
Les activités humaines (pollution, destruction des écosystèmes, combustions et leurs impacts climatiques, surexploitation d’espèces…) ont des conséquences sur la biodiversité et ses composantes (dont la variation d’abondance) et conduisent à l’extinction d’espèces.
Utiliser un modèle géométrique simple (quadrillage) pour calculer l’impact d’une fragmentation sur la surface disponible pour une espèce.
La fragmentation d’une population en plusieurs échantillons de plus faibles effectifs entraîne par dérive génétique un appauvrissement de la diversité génétique d’une population.
Identifier des critères de gestion durable d’un écosystème. Envisager des solutions pour un environnement proche.
La connaissance et la gestion d’un écosystème permettent d’y préserver la biodiversité.
oiseaux de paradis :
5'37 : https://youtu.be/YTR21os8gTA?si=FJ7nXEhUZaIe8q6e
video 1'06 : https://youtu.be/KIYkpwyKEhY?si=P6FNwrfDwqpdNGn5
5'12 : https://youtu.be/zb89F41zAxc?si=Ve7eqzpb7YhUuHz0
4'25 : https://youtu.be/rX40mBb8bkU?si=Ak5REVxF616DhXtD
correction DS
Partie 1 : restitution organisée de connaissances 11 points
qualité du schéma
euglène autotrophe
levure hétérotrophee
membrane, cytoplasme, noyau
paroi levure
flagelle euglènes
mitochondries
respiration
chloroplastes,
photosynthèse
énergie, lumière
matière organique, glucose, nutriments
matière minérale, eau H2O
O2, CO2
Partie 2 : pratique de raisonnement scientifique (9 points)
quantité de glucide diminue,
acide lactique augmente
bactéries augmente dans le lait non stérilisé.
Fermentation (lactique)
équation chimique équilibrée
C6H12O6 → 2 C3H6O3
devient acide
à cause de la transformation de glucose en acide lactique par les bactéries,
stérilisation détruit les bactéries donc cette réaction
video : https://youtu.be/kVD6PP61A28 Carl Linnaeus’s Systema Naturae
Clever Collections highlights the most important scientific artefacts owned by The Linnean Society of London. This video series shows how these priceless artefacts are still relevant to this very day. In this episode we learn about how Carl Linnaeus organised the natural world.
Have you ever watched a child playing with Smarties? Very often the child will sort them out into colours. This might seem an obvious and natural thing to do, but it tells us something very interesting about the human brain. The child is indulging in an activity which can be described as classification. Suppose you were designing a website for a large company or supermarket. One of your tasks would be to sort out the products into a logical system. More complicated than Smarties, but not really different in essence.
Through this worksheet, students will cover the topics of classification and binomial nomenclature.
Worksheet 01 : Student Worksheet : What's in a name?
Objectifs : il s’agit de comprendre, en s’appuyant sur des exemples variés dans le monde vivant, que la diversification des êtres vivants n’est pas toujours liée à une diversification génétique ou à une transmission d’ADN.
Liens : SVT – enseignement de spécialité de la classe terminale : de la plante sauvage à la plante domestiquée.
Docs p109
la guêpe Dinocampus coccinellae, et son hôte, la coccinelle Coleomegilla maculata.
Le cycle de vie de la guêpe parasite permet de comprendre comment elle détourne le comportement de la coccinelle en sa faveur en provoquant la paralysie de cette dernière afin qu’elle « monte la garde » au-dessus de la nymphe, après avoir nourri involontairement la larve qui s’est développée dans son abdomen. Les études présentées permettent de comprendre le mécanisme complexe permettant le contrôle du système nerveux de l’hôte par l’intermédiaire d’un virus qui est inoculé avec l’oeuf et migre progressivement de l’abdomen à la tête pour entraîner la paralysie au moment même de la métamorphose de la nymphe. De plus, des études ont montré que la ponte de l’oeuf dans l’abdomen s’accompagnait d’une suppression de la réponse immunitaire de la coccinelle, favorisant à la fois le développement de la larve parasite et la réplication du virus inoculé.
Dinocampus coccinellae est une guêpe de la famille des braconides. C’est un parasitoïde de Coccinellidae, en particulier de la coccinelle maculée. Lors de la pupaison, qui se produit à l’extérieur de la coccinelle, la larve manipule son hôte pour que celui-ci la protège. Cette relation parasitique est majoritairement mortelle, mais environ 25 % des coccinelles récupèrent malgré tout après l’éclosion et le départ du parasitoïde.
Par son comportement inné (ponte de l’oeuf dans l’abdomen), la guêpe modifie le comportement de la coccinelle. On peut alors considérer le comportement de « garde du corps » de la coccinelle comme faisant partie du phénotype étendu de la guêpe
Les expressions vernaculaires « guêpe maçonne » et « guêpe potière » désignent diverses espèces de guêpes solitaires qui façonnent des nids en boue afin d'y loger leur larves.
Parasites spécifiques de leur hôte :
parmi les Sphecidae, les genres Sceliphron, Sphex, etc. qui nourrissent leurs larves avec des chenilles Lépidoptères ou des Orthoptères.
parmi les Vespidae, la sous-famille des Eumeninae (Eumenes, Delta, etc.), également carnassières et quelques genres de la sous-famille Masarinae qui nourrissent leurs larve avec du pain d'abeille.
parmi les Crabronidae, quelques espèces du genre Trypoxylon, spécialisé dans les Arachnides
Ichneumon (les ichneumons en français) est un genre d'insectes hyménoptères de la famille des Ichneumonidae, famille qui comprend environ 25 000 espèces décrites (on estime que la famille pourrait en compter de 60 000 à 100 000), soit plus que toute autre famille d'hyménoptères. De nombreuses espèces sont présentes en Europe.
Les ichneumons, qui sont des guêpes parasitoïdes, sont d'importants régulateurs d’insectes ravageurs de cultures. Utilisés dans la lutte biologique, ils jouent un rôle clé de régulation dans leurs écosystèmes.
Mesurant quelques millimètres de long, leur tête est ornée d'antennes ramifiées. Juste derrière, le prothorax est compact et trapu. La partie postérieure du corps de l'insecte (appelé aussi mégastome) est relié à l'avant par un pétiole particulièrement fin.
Leur cible ? Le couvain des fourmis tropicales. Les larves de ces guêpes s'accrochent aux fourmis fourragères qui rentrent dans le nid de la colonie.
Une fois à l'intérieur, elles se nourrissent des pupes de ces dernières, puis quand leur transformation est terminée, ce sont les fourmis elles-mêmes qui continuent à les nourrir.
Une fois adulte, la guêpe parasite quitte la colonie pour se reproduire
Un parasitoïde utilise un virus pour modifier le comportement de son hôte : http://vminfotron-dev.mpl.ird.fr:8080/cbgp-gas/archives/20160621-Gourbal.pdf
La diversification phénotypique des êtres vivants n’est pas uniquement due à la diversification génétique : d’autres mécanismes interviennent comme par exemple les associations non héréditaires entre parasite et leur hôte, le parasite est adapté à une proie très spécifique.
TP Dissection lichens p106
[mycos (grec) = fungus (latin) = champignon]
Symbiose [syn (grec) : ensemble + bio (grec) : vie] = association à bénéfice réciproque
[ecto (grec) = ext // endo (grec) = int]
http://biopathe.fr/articles.php?lng=fr&pg=331
lexique : http://labopathe.free.fr/symbioses.html
en fait il ya plus d’un champignon : https://www.the-scientist.com/news-opinion/not-one--not-two--but-three-fungi-present-in-lichen-65333?utm_content=83103983&utm_medium=social&utm_source=facebook&hss_channel=fbp-212009668822281
autres ex de symbiose :
mycorhizes : http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article1794
nodosités
lichens
Oophila & Ambistoma
Nostoc
endosymbiose cnidaires / Dinoflagellés
Les planaires (Convoluta roscoffensis) qui hébergent des chlorelles dans leur mésoderme)
Le ver géant Riftia et des bactéries autotrophiques – exemple d’endosymbiose
Origine symbiotique des chloroplastes et des mitochondries
tique et Lyme : http://www.pourlascience.fr/ewb_pages/a/actualite-tiques-et-bacteries-de-lyme-un-benefice-reciproque-32073.php
Évolution d’une symbiose obligatoire : les fourmis agricultrices de Fidji : https://planet-vie.ens.fr/thematiques/ecologie/relations-interspecifiques/evolution-d-une-symbiose-obligatoire-les-fourmis
hôte et symbiote subissent une évolution contingente, en même temps, on parle de coévolution
Exo p122-123
Microbiote: des bactéries qui nous veulent du bien : https://lejournal.cnrs.fr/articles/microbiote-des-bacteries-qui-nous-veulent-du-bien
Faecal bacteria cocktail treats superbug infection : https://www.newscientist.com/article/dn23061-faecal-bacteria-cocktail-treats-superbug-infection
Des mécanismes non génétiques (non héréditaires) interviennent dans l'évolution et la construction du phénotype comme les associations hétérospécifiques : pathogènes ou symbiotes. L'etude du microbiote acquis montre toute sortes de relations entre hôte et symbiote.
Extraire, organiser et exploiter des informations pour appréhender la notion de phénotype étendu ;
p108-109
Le phénotype étendu est un concept imaginé par Richard Dawkins et présenté dans un ouvrage éponyme [gr. ε ̓πω ́νυμος « attribué comme surnom », composé de επι ́ « sur » et de ο ́νομα « nom »], The Extended Phenotype, 1982, selon lequel le phénotype ne doit pas être limité au résultat de l'expression des gènes par les processus biologiques (synthèse des protéines, la croissance des tissus) mais étendu à toutes les manifestations qui en découlent, y compris celles qui passent par l'activité du système nerveux central et plus généralement par le comportement de l'animal dans son environnement.
La diversification phénotypique des êtres vivants n’est pas uniquement due à la diversification génétique, la notion de phenotype (trait, caractère) doit être étendue au delà de la génétique, de ce qui est inné.
Extraire, organiser et exploiter des informations pour appréhender la notion d’évolution culturelle et ses liens avec celle d’évolution biologique.
Manuel p110
Konrad Lorenz : Ethologie : étude du comportement animal
Quelques cas de diversifications comportementales
Des singes lavent des patates
Diversification de populations d’oiseaux en fonction du chant : notamment chez les oiseaux-chanteurs ou oiseaux oscines (des études ont été réalisées chez la Paruline à sourcils blancs ou encore chez le Diamant mandarin)
Chez certains animaux, les comportements acquis peuvent être transmis d’une génération à l’autre et constituer une source de diversité : ainsi
du chant des oiseaux,
de l’utilisation d’outils dans des populations animales,
le recrutement de composants inertes du milieu qui modulent le phénotype (constructions, parures…).
de la culture notamment dans les sociétés humaines.
Ces traits (caractère phenotype) sont transmis entre contemporains et de génération en génération, et subissent une évolution (apparition de nouveaux traits, qui peuvent être sélectionnés, contre-sélectionnés ou perdus par hasard).
Qui était Darwin /Tu mourras moins bête -/ARTE 3'14 : https://youtu.be/X91tEaZgnwU
Aymone : 324 words : https://www.nationalgeographic.co.uk/environment-and-conservation/2021/03/oceans-need-protection-now-a-new-blueprint-may-help-countries Oceans need protection now. A new blueprint may help countries reach their goals.
text 472 w & practical work : tps://edu.rsc.org/resources/analysis-of-cave-paintings/1586.article : Analysis of cave paintings
https://www.bradshawfoundation.com/clottes/index.php
site |
i |
age before present |
culture |
Le Portel |
11.600 ± 150 BP |
Magdalenian |
|
Trois-Freres |
13.000 ± BP |
||
Rouffignac |
13.000 ± BP |
||
Niaux |
14.000 ± 11.500 BP |
||
Le Cap Blanc |
15.000 ± 14.000 BP |
||
Altamira |
17.000 ± 13.000 BP |
||
Cosquer (Phase 2) |
19.000 ± BP |
Solutrean |
|
Lascaux |
20.000 ± BP |
||
Le Placard |
21.000 ± 20.000 BP |
||
Cougnac |
25.000 ± 14.000 BP |
Gravettian |
|
Pech-Merle |
25.000 ± 16.000 BP |
||
Gargas |
27.000 ± BP |
||
Cosquer |
27.000 ± BP |
||
Chauvet |
32.000 ± 30.000 BP |
Aurignacian |
