§ Comment fait-on bouger un membre ?

© 2 EV QCM

2.4- Moteurs de l'effort

A1 : Observation de coupes de muscles / microscope

prélèvement de muscle et observation au microscope

Observer et dessiner les coupes de muscle au microscope

ne pas oublier titre : matériel, organisme, grossissement) et légende

Observation (ac Rennes) : http://espace-svt.ac-rennes.fr/applic/muscle/muscle.htm

muscle sq/card sur Jussieu : http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/muscles/muscles.htm

cours collègue : http://blog.crdp-versailles.fr/svtsecondepelletier/index.php/post/09/12/2010/Jeudi-2-d%C3%A9cembre

myocyte, membrane plasmique, noyau(x), (myo)fibrilles, stries

A2 : Dissection de pattes de grenouille

chez l'humain : http://www.zygotebody.com/#nav=0.1,97.58,57.3

dissection en diapo : http://youtu.be/u1qfg9LehzM

fiche TP à télécharger : http://www.cndp.fr/ecole/sciences/classeurs/fiches_eleves/ch_word/ch60.doc

Patte rat : http://biodidac.bio.uottawa.ca/Thumbnails/searchresults.htm?maxrows_old=&StartRow=1&maxrows=64&sujet=&formattype=diagbw&auteur=&keyword=muscle&phylum=mammalia&datesoumis

schéma imprimable (gif) : http://pst.perso.libertysurf.fr/svtiufm/crpe/crpe1996.htm

mots clefs : muscle, os, cartilage, tendon, ligament

à lire pour la prochaine fois :

A5 : Réflexion sur le dopage

un oeuf cassé dans le compartiment où il y 2 mâles ????

test

Acanthostega vivait il y a 360 Ma (millions d'années). C'est le plus ancien vertébré tetrapode connu. Cet animal aquatique était incapable de se déplacer sur le sol mais pouvait se hisser hors de l'eau avec ses membres antérieurs en forme de pagaie qui lui permettaient surtout de nager.
1. Reproduire le membre antérieur d'acanthostega et de l'humain et colorier les os en utilisant le même code de couleur, de façon à faire apparaitre le plan d'organisation
2. Quelles ressemblances et quelles différences y a-t-il entre ces deux mains ?
3. Que peut-on dire à propos du plan d'organisation de ces deux membres et de de leur origine ?

§ comment l'organisme reconnaît-il les cellules du soi ? Les antigènes à abattre ?

A1 : Modélisation des anticorps / Logiciel Rastop

TS SVT TP mise en évidence de la zone de contact entre anticorps et antigène

Matériel

Logiciel Rastop + Fiche technique.
Fichiers « anticorps_gp24.pdb » + « IGG_total.pdb ».

Principe

Visualisation de modèle de molécule et ici la zone de contact entre un anticorps et son antigène, pour cela Modifier l’affichage d’un modèle 3D d’un anticorps (seulement le fragment Fab) et de l’antigène fixé, pour mettre en évidence la zone de contact. Donc sélectionner l’antigène puis colorer en partant de là...

Protocole

Attention si on vous propose un fichier .zip, enregistrez le, renommez-le en .pdb, le format de Rastop.

Pour identifier les différentes parties de l’anticorps (partie Fab + Fc) :

1. Ouvrir le fichier, IGGTOTAL.pdb
2. Afficher en sphères
3. Dans le menu « Atomes », choisir l’option « Colorer par » puis « Chaînes ». Combien y’a-t-il de chaines ?
4. Schématisez (dessinez, simplifiez) la structure d’un anticorps sur le papier.

Pour mettre en évidence la zone de contact entre antigène et anticorps

1. Sans fermer, Ouvrir anticorps-gp24.pdb, recommencer les étapes 1,2 et 3. En bleue, l’antigène (GP24), en vert chaine légère (L) et en rouge chaine lourde (H). Pour voir les 2 fenêtres, menu fenêtres>mosaïque verticale. comparez IGGTOTAL et anticorps-GP24.pdb. (Fragment Fab)
2. Tout sélectionner
3. Afficher le modèle en sphères (pour la suite prendre la fiche technique, ou site pour aide de Rastop)
4. Activer la palette de couleur
5. Choisir une couleur pour le modèle
6. Cliquer sur la chaîne correspondant à l’antigène afin de la sélectionner, ou fenetre d’édition et taper *A
7. Dans le menu « Éditer », choisir l’option « Sélectionner… », puis « Distant de… »
8. Taper une distance de 2000
9. Choisir une couleur pour débuter le dégradé (marron)
10. Revenir à la sélection précédente
11. Répéter les étapes 6 à 9 pour des distances de 1750, 1500, 1250, 1000, 750, 500 (rouge, rouge clair, rose, orange, jaune, jaune très clair…)
12. Sélectionner l’Ag (P24) en tapant *A dans la fenetre d’édition. Cliquer sur le bouton fil de fer pour afficher le P24 (l’antigène) en fils de fer et choisir une autre couleur pour celui-ci. Colorer le fond en blanc.

Pour mettre en évidence la Zone de contact entre anticorps et antigène (=site antigénique). Il faut un modèle raccourci, l’anticorps anti GP24, présente le fragment Fab de cet anticorps lié avec son antigène (P24).

Rastop ne possède pas la capacité d’afficher une surface, ni de colorer automatiquement en fonction de la distance à un groupe d’atomes. On peut toutefois approcher le même effet en réalisant un traitement récursif de coloration par une sélection des atomes à des distances de plus en plus proches de l’antigène.

aux dubitatifs, douteux et suspicieux : résultat:

 

§ comment l'organisme reconnaît-il les cellules du soi ? Les antigènes à abattre ?

3,2,2/ Modélisation de l'immunité adaptative

§ comment l'organisme reconnaît-il les cellules du soi ? Les antigènes à abattre ?

A1 : Modélisation des anticorps / Logiciel Rastop

\TS TP anticorps rastop.odt

\immuno_molécules.odg©

http://www.chatquipeche.fr/svt/spip.php?article89

aide Rastop : http://www.librairiedemolecules.education.fr/aide.php?sujet=rastop_9

librairie de molécules : http://www.librairiedemolecules.education.fr/recherche.php?typeclassification=chimique&theme=mol&idcat=immunite

FT fournies au TP de Bac (ECE) : Rastop (version 05/01/2016) : (doc, odt, pdf)

quels atomes ? Combien de parties ? Quelle nature ? Quelle forme globale ?

Anticorps : http://www.svtadam.com/images/igganim2.gif ; http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article437 ; http://www.premiumwanadoo.com/renard/revisions/SVT/LexBio_fichier/anticorps.gif

Résultat TP : manuel p301

Manuel doc 2 p 281

Immunoglobulines en Y : parties variable / fixes ; lourdes / légères

A2 : Schématisation des complexes immuns

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article1914

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article737

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article1932

neutralisation de l'Ag / destruction ou “emprisonnement”
facilitation de la phagocytose de l'Ag

bagage et déménagement

Intro MontyPython : https://youtu.be/sFBOQzSk14c

Quelles sont les différences Homme / Femme ?

3,1 : Phénotypes sexuels

3,1,1 : Phénotypes sexuels macroscopiques

A1 : Anatomie des appareils ♀ & ♂ / schémas©

faites un schéma de l'appareil reproducteur ♀ & ♂ de face + profil

© \sex-anatomie.odt

diap\anatomie HF.odp

Schémas :

schémAnimés : http://www.biologieenflash.net/sommaire.html

testicule, prostate, vésicule séminale, canal déférent = spermiducte+épididyme
ovaire, vagin, utérus, col, trompe = oviducte+pavillon,
rein → uretère → vessie → urètre

A2 : Dissections virtuelles des appareils ♀ & ♂/ souris, humain www

TP dissection souris mâles et femelles : http://espace-svt.ac-rennes.fr/applic/dissect/souris/souris17.htm

sex_dissection souris.odp : http://www5.ac-lille.fr/~svt/telechargements/diss_app_uro/diss_app_uro_gen_souris.pps

Corpus : http://www.reseau-canope.fr/corpus/

Zygote body (s'inscrire pour consulter) : http://www.zygotebody.com/

Visible human (s'inscrire pour consulter) : http://visiblehuman.epfl.ch/index.php

§ Comment la théorie de la tectonique des plaques est-elle maintenant confortée ?

2,4 : Modélisation globale

A1 : Modélisation numérique / logiciel

Cf TP précédents sur logiciels Educarte, Sismolog, tectoglob

\tectonique.exe

Educarte : http://www.edusismo.org/docs/res_peda/educarte/index.htm

Sismolog : http://extranet.saintjosephtoulouse.org/labo/science_de_la_vie_et_de_la_terre_033.htm

Tectoglob : http://svt.ac-amiens.fr/040-vue-d-ensemble-des-logiciels-de-m-madre

SeismicWaves : http://www.edusismo.org/outil1.php?ref=33&typoutil=0

FT fournies au TP de Bac (ECE) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/bankact/index.php?m=1&sm=1

FT Educarte (version 09/12/2014) : (doc, odt, pdf)

FT Sismolog (version 24/10/2009) : (doc, odt, pdf) Avancé (doc, odt, pdf)

FT Sismolog, sismogrammes (version 17/01/2017) : (doc, odt, pdf)

FT Tectoglob (version 09/12/2014) : (doc, odt, pdf)

A2 : Modélisation en laboratoire / maquettes

Diap histoire modelisation maquettes.odp

les matériaux : http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/objets/Images/model-processus-tectoniques/model-processus-tectoniques-fig01.jpg

lien CNRS subduction : http://www.cnrs.fr/cw/dossiers/dosgeol/01_decouvrir/02_subduction/04_subduction_plaques/03_pedago/01a.htm

lien CNRS extension : http://www.cnrs.fr/cw/dossiers/dosgeol/01_decouvrir/01_extension/03_pedago/00.htm

résultats : http://www.geosciences.univ-rennes1.fr/spip.php?rubrique544

histoire de la modélisation : http://www.cnrs.fr/cw/dossiers/dosgeol/01_decouvrir/06_pionniers/00_intro.htm

A3 : Paléotectonique

Bilan \Decouverte de la theorie de la tectonique des plaques.kmz

Diap \Terre paleotectonique.odp

\paleotectonique.odp

paléotectonique animée :

https://youtu.be/GNmUd43pabg

https://youtu.be/Cm5giPd5Uro

https://youtu.be/uLahVJNnoZ4

http://www.scotese.com/newpage13.htm

Bilan : modèle de synthèse actuel : PREM [Preliminary Reference Earth Model]

En permanence, de la lithosphère océanique est détruite dans les zones de subduction et produite dans les dorsales.
La divergence des plaques de part et d’autre de la dorsale permet la mise en place d’une lithosphère nouvelle à partir de matériaux d’origine mantélique. Dans les zones de subduction, convergence, les matériaux de la vieille lithosphère océanique s’incorporent au manteau.

B/Schéma © : du modèle actuel

Mots clefs : représentation graphique synthétique du modèle global, fonctionnement d’une dorsale type, subduction / accrétion,

Diapo \bilan tectonique.odp

sch'bilan 6©

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=152

http://www.tulane.edu/~sanelson/eens211/earths_interior.htm

Glossaire : http://www.premiumwanadoo.com/renard/revisions/SVT/lexGeol.htm#S

glossaire : http://operabaroque.fr/magmatiques.htm

Conclusion : notion de modèle scientifique et son mode d’élaboration.

A1 : Discussion sur le statut du mot hypothèse en sciences

Définir selon vous le mot hypothèse

Demander une déf° au prof de

• maths : conjecture d'un resultat, point de départ à infirmer, peu importe qu'elle soit vraie ou fausse ce qui compte c'est le raisonnement fait ensuite
• physique : prévision sur résultat d'une expérience
• français : analyse ce que l'auteur aurait voulu dire
• SVT : réponse provisoire au problème posé
• Philo : du grec : hypo = dessous => sous thèse pas encore validée

A2 : Suivit pour prédiction des évènements géologiques

Séismes / Rénass : http://renass.u-strasbg.fr/

Manuel p.126 : utilisation des données avec sismologue

radioactivité / IRSN : http://sws.irsn.fr/sws/mesure/index

séisme au Japon prévu depuis 2005 : http://www2.cnrs.fr/presse/thema/751.htm

Tectonique des plaques : un pas en avant vers la reconstitution du passé et la prédiction de l'avenir : http://www2.cnrs.fr/presse/communique/2585.htm

Bilan : La notion de modèle scientifique et son mode d’élaboration

Un modèle est une construction intellectuelle hypothétique et modifiable. Au cours du temps, la communauté scientifique l’affine et le précise en le confrontant en permanence au réel. Il a une valeur prédictive et c’est souvent l’une de ces prédictions qui conduit à la recherche d’un fait nouveau qui, suivant qu’il est ou non découvert, conduit à étayer ou modifier le modèle. La solidité du modèle est peu à peu acquise par l’accumulation d’observations en accord avec lui. Les progrès techniques accompagnent le perfectionnement du modèle tout autant que des débats et controverses.

Prg TS :

1-B - Le domaine continental et sa dynamique

1-B-1 La caractérisation du domaine continental : lithosphère continentale, reliefs et épaisseur crustale

1-B-2 La convergence lithosphérique : contexte de la formation des chaînes de montagnes

1-B-3 Le magmatisme en zone de subduction : une production de nouveaux matériaux continentaux

1-B-4 La disparition des reliefs

Sitographie

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=2695

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=2721

A.Wegener institute : http://www.awi.de/en/home/

Réseau de surveillance sismique Strasbourg : http://renass.u-strasbg.fr/

http://www.cnrs.fr/cw/dossiers/dosgeol/01_decouvrir/02_subduction/00_intro.htm

http://svt.tice.ac-orleans-tours.fr/php5/publis/faure/faure1.htm#Intro

http://planet-terre.ens-lyon.fr/article/modeliser-processus-tectoniques.xml

Forage profond au large de Fukushima : http://www.larecherche.fr/content/actualite-terre/article?id=31622

§ Comment la théorie de la tectonique des plaques est-elle maintenant confortée ?

2.3.4 : vecteurs GPS

A1 : principe du GPS

http://eduscol.education.fr/orbito/system/navstar/gps1.htm

https://couleur-science.eu/?d=2016/06/02/17/54/23-quel-est-le-principe-de-fonctionnement-du-gps

https://www.futura-sciences.com/sciences/dossiers/physique-topographie-decouvrir-fonctionnement-gps-504/page/8/

GPS = Global Positioning System

A2 : Exploitation des données GPS / logiciel Tectoglob

1S TP tectoglob GPS.doc

Logiciel Tectoglob : http://svt.ac-amiens.fr/040-vue-d-ensemble-des-logiciels-de-m-madre

Affichage des vecteurs GPS / NASA : http://sideshow.jpl.nasa.gov/mbh/series.html

explication des données : http://www.pedagogie.ac-nantes.fr/html/peda/svt/gps_2/donnees.htm

TP divergence / Google Earth : http://eduterre.ens-lyon.fr/eduterre-usages/ressources_gge/divergence/divergenc

Bilan : les données GPS permettent de suivre les déplacements

Le modèle prévoit des vitesses de déplacements des plaques d’après le paléomagnétisme et les alignements de volcans intraplaques. Avec l’utilisation des techniques de positionnement par satellites (GPS), à la fin du XXème siècle, les mouvements des plaques deviennent directement observables et leurs vitesses sont confirmées.

B/schéma © : Cartographie, points chauds, forages et GPS

Mots clefs : Failles transformantes, modèle, alignements volcaniques, point chaud, Âges des sédiments, forage, JOIDES, paléomagnétisme, alignements volcaniques, GPS,

Glossaire : http://www.premiumwanadoo.com/renard/revisions/SVT/lexGeol.htm#S

glossaire : http://operabaroque.fr/magmatiques.htm

http://en.wikipedia.org/wiki/File:Tectonic_plate_boundaries.png ; http://ircamera.as.arizona.edu/NatSci102/NatSci102/images/plateboundariesa.jpg ; http://www.earth.northwestern.edu/people/seth/202/nasa_plate_map.jpg

schéma animé : http://www.biologieenflash.net/animation.php?ref=geo-0024-1

§ Comment la théorie de la tectonique des plaques est-elle maintenant confortée ?

2.3.3 : Forages JOIDES

A1 : inforages

D\forages.odp

Comment fait-on un forage ? → diaporama sur http://www.iodp.org/

site de données sur les forages : http://www.isteem.univ-montp2.fr/IODP-France/

forages pour trouver le Moho : http://www.blogg.org/blog-50595-billet-541651.html

forages

IODP : http://www.iodp.org/

ECORD : http://www.ecord.org/

JOIDES (Joint Oceanic Institution for Deep Earth Sampling)

IPOD (International Phase of Ocean Drilling), puis ODP (Ocean Drilling Project)

ECORD (European Consortium for Ocean Drilling Research)

IODP (Integrated Ocean Drilling Program)

DSDP (Deep Sea Drilling Projet)

A2 : Ages de fonds océaniques / cartographie

© forages schemas.odg

NOAA : http://www.ngdc.noaa.gov/mgg/image/crustalimages.html

http://www.didiersvt.com/cd_1s/medias/c3/atlanticage.jpg

http://www.iodp.org/about-iodp/history

http://raymond.rodriguez1.free.fr/Textes/1s23.htm

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article158

A3 : Exploitation de données de forages / logiciels

fichiers sur serveur « commun » → SVT → 1S → forages

® TP forage Google Earth et Excel.odt

® TP forage Google Erth et excel données.xlsx

® Divergence.kmz

© EV TP forage google earth et excel.odt

TP forage Google Earth et excel correction.xlsx

→ dessiner un profil topographique avec des courbes de niveau = profil d'élévation sous Google earth

TP divergence / Google Earth : http://eduterre.ens-lyon.fr/eduterre-usages/ressources_gge/divergence/divergence

http://eduterre.ens-lyon.fr/eduterre-usages/ressources_gge/divergence-1

Bilan : les forages confirment l'hypothèse

Le modèle prévoit que la croûte océanique est d’autant plus vieille qu’on s’éloigne de la dorsale. Les âges des sédiments en contact avec le plancher océanique (programme de forage sous-marins JOIDES) confirment cette prédiction et les vitesses prévues par le modèle de la tectonique des plaques.

§ que se passe-t-il si l'infection persiste ? Comment l'immunité innée est-elle enrichie au cours de la vie ?

3,2/ L'immunité adaptative, prolongement de l'immunité innée

3,2,1/ Mise en évidence d'une immunité acquise

A5 : Liens immuns entre mère et fœtus / article scientifique

© pourquoi la mère ne rejette pas le foetus.odt

Pourquoi la mère ne rejette pas le fœtus : http://www.larecherche.fr/savoirs/dossier/4-pourquoi-mere-ne-rejette-pas-foetus-01-10-2012-91710

Comment le foetus échappe aux défenses de sa mère : http://www.larecherche.fr/actualite/aussi/comment-foetus-echappe-aux-defenses-sa-mere-01-03-1998-89033

molécules du CMH (complexe majeur d'histocompatibilité) chez les vertébrés
= molécules HLA (human leucocyte antigen) chez l'humain
Le CMH humain est dénommé HLA
différentiation de cellules dites « naïves » :

• lymphocytes → cellules "tueuses" = NKC (natural killer cell) = lymphocytes NK (niT niB)
  
• lymphocytes LT8 → LT cytotoxiques
  
• lymphocytes LT4 → LT régulateurs
  
• lymphocyte B → Plasmocyte
  

A4 : Mise en évidence d'un complexe immun / méthode d'Ouchterlony

TS_TP_Ouchterlony.odt

Logiciel :

Ouchterlony II.exe

http://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/ress/immuno/dif_imm.html

http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/ATP/immu2.htm

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/spip.php?article995

FT fournies au TP de Bac (ECE) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/bankact/index.php?

Résultat TP : manuel p300

séropositivité => Immunoglobulines = anticorps,
complexe immun = Ac+Ag
réaction spécifique => sélection clonale

Bilan : L'immunité adaptative s'ajoute à l'immunité innée

Elle s'ajoute à l'immunité innée et assure une action plus spécifique contre des molécules, ou partie de molécules. Les cellules de l'immunité adaptative ne deviennent effectrices qu'après une première rencontre avec un antigène grâce aux phénomènes de sélection, d'amplification et de différenciation clonales.
Les défenses adaptatives associées avec les défenses innées permettent normalement d'éliminer la cause du déclenchement de la réaction immunitaire.
Mots-clés : immunoglobulines (anticorps), séropositivité, lymphocytes T CD4, lymphocytes T auxiliaire,lymphocytes T CD8, lymphocytes T cytotoxiques ; sélection, amplification, différenciation clonales.