jeudi 7 décembre 2017

drépanocytose : fichier → thèmes d'étude → relation pheno-génotype → phénotype drépanocytaire → comparer les séquences → comparaison simple → noter les différences
albinisme : fichier → banque de séquences → tyrosinase → tyrcod1 & tyralba1 → comparer → comparaison simple → noter les différences
groupes sanguins : fichier → banque de séquences → système ABO des groupes sanguins

Charger des séquences - « acod.adn », « bcod.adn » et « ocod.adn » sont les allèles du gène des groupes sanguins [« .cod.adn » = ADN, « .pro » = protéine]

Comparer (alignement avec discontinuité) - combien de bases (nucléotides) en commun ? Différents ?

gène, allèles, génotype

allèle, géne, génotype, homo/hétérozygote

Bilan : Gènes et environnement

L’ensemble des protéines qui se trouvent dans une cellule (phénotype moléculaire) dépend :

- du patrimoine génétique de la cellule (une mutation allélique peut être à l’origine d’une protéine différente ou de l’absence d’une protéine) ;

- de la zygotie (composition allélique des cellules)

- de la nature des gènes qui s’expriment sous l’influence de facteurs internes et externes variés.

Bilan : Gènes et environnement/ schéma ©

Mots clefs : Phénotype moléculaire, microscopique, macroscopique, expression génétique, protéine, facteurs d'expression, variabilité

lexique : http://www.premiumwanadoo.com/renard/revisions/SVT/lexBio.htm

glossaire : http://www.nature.ca/genome/02/022_f.cfm

gene-rayures3.odp

d'où viennent les rayures ? : http://bigbrowser.blog.lemonde.fr/2012/02/09/zzz-dou-viennent-les-rayures-du-zebre/

Énigme résolue ? Les rayures des zèbres éloignent les taons ! : http://www.futura-sciences.com/fr/news/t/zoologie/d/enigme-resolue-les-rayures-des-zebres-eloignent-les-taons_36632/

Les hotes de la glossine et la transmission de la maladie : http://www.fao.org/docrep/009/p5178f/P5178F07.htm

Repartition geographique des glossines : http://www.fao.org/docrep/009/p5178f/P5178F06.htm

différents Zèbres : http://www.docudharma.com/diary/27953/pique-the-geek-20111023-all-about-zebras

Quand les bateaux font le zèbre : http://www.pourlascience.fr/ewb_pages/a/article-quand-les-bateaux-font-le-zebre-38952.php#.WhiSO0zDi-o.blogger

§ Comment les variantes de gènes (allèles) sont elles nées ?

§ Quelles sont les causes des mutations ?

1,4/ Mutations et naissance de nouveaux allèles

1,4,1/ Agents mutagènes et causes des mutations

Rappel : Différents types de mutations / logiciel Anagène

1S_TP_phénylcétonurie_anagene.odt

Manuel p85

fichier → banque de séquences → hémoglobine → béta → comparer les différentes mutations

rappel ex phénylcétonurie; albinisme, groupes sg, XP

modification de Séquence, un ou plusieurs nucléotides

substitution, délétion , addition=insertion,

neutre=silencieuse, faux-sens, non-sens,

décalante ou non

cellule somatique [soma = corps], cellule germinale = reproductrice=gamète

une mutation dans une ¢ germinale peut être neutre, handicapante, létale=mortelle ou avantageuse

A2 : Revue de presse sur l’influence d’agents mutagènes / articles

D\agents mutagènes.odp

Séléctionner un article – lire & relever les mots clefs – construire un tableau :

agent mutagène / cible / action moléculaire / effets secondaires / preuves / modifications observées

http://www.futura-sciences.com/fr/news/t/medecine/d/implants-mammaires-pip-nouvelles-recommandations_29527/

http://www.futura-sciences.com/fr/news/t/medecine/d/les-tapis-puzzle-retires-de-la-vente_26627/

http://www.futura-sciences.com/fr/question-reponse/t/thermique/d/traitement-de-la-laine-de-mouton-mitin-et-sel-de-bore-dangereux_312/

http://www.techno-science.net/forum/viewtopic.php?t=21057

http://www.techno-science.net/forum/viewtopic.php?t=20913

http://www.inrp.fr/Acces/biotic/genetic/mutation/html/mutagen.htm

Comprendre la mutagenèse somatique grâce à la cartographie des dommages à l’ADN : http://www.medecinesciences.org/index.php?Itemid=129&option=com_article&access=doi&doi=10.1051/medsci/2010262193&type=pdf

agents mutagènes : chimiques ou radiation

chimiques : imitent ou modifient la structure de l'ADN

radiation : rupture de brin, mutation, enchevêtrement de l'ADN

§ Quelle est l'origine du volcanisme continental ?

1.4 : Le magmatisme en zone de subduction

1,4,1 : Des roches magmatiques continentales

A1 : Les conditions pour produire un magma / diagrammes de phases

© origin magma.odg

à partir des diagrammes de phases de la péridotite et magmatisme : http://www.tulane.edu/~sanelson/eens211/earths_interior.htm

http://tperoches.free.fr/facteurs-influents.htm#haut

=> globalement peu de fusion dans le manteau

-> fusion partielle par hydratation du manteau au dessus des plaques en subduction

A2 : modélisation moléculaire des minéraux

http://www.librairiedemolecules.education.fr/outils/minusc/app/minusc.htm

modélisation structures moléculaires minérales par Merkel : http://www.le.ac.uk/eg/spg3/atomic.html bn

modélisation des formes cristallines: http://webmineral.com/crystall.shtml

glaucophane : http://webmineral.com/jmol/structure.php?id=Glaucophane

calcite : http://webmineral.com/jmol/structure.php?id=Calcite

librairie de molécules :

quartz : http://www.librairiedemolecules.education.fr/molecule.php?idmol=242

aragonite : http://www.librairiedemolecules.education.fr/molecule.php?idmol=246

feldspath : http://www.librairiedemolecules.education.fr/molecule.php?idmol=245

olivine : http://www.librairiedemolecules.education.fr/molecule.php?idmol=244

atlas de cristallologie : http://www.mineralogie.org/base-de-donnees-p1-2.htm

structure cristalline

minéral = cristal

A3 : Observation de lames minces roches magmatiques / µscopes

http://prezi.com/aanufhjcxh-p/?utm_campaign=share&utm_medium=copy

TP_roches.odg©

FT fournies au TP de Bac (ECE) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/bankact/index.php?m=1&sm=1

http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/bankact/ressources/Planches_mineraux.pdf

http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/bankact/ressources/Planches_mineraux_couleurs.pdf

granitoïdes (=granodiorite), rhyolite, andésite, …

laves enrichies en Si => visqueuses => gaz + éruptions explosives

volcanisme / plutonisme

pour apprendre à reconnaître les minéraux et roches : manuel p.402 à 405

tableau récapitulatif Dijon (doc) : http://svt.ac-dijon.fr/dyn/article.php3?id_article=261

collection de roches : http://geoeco.ifrance.com/g%E9ologie/collec.html

collection de lames minces : http://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/photossql/photos.php?TopicID=Lames

clef de détermination Tlse (html) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/lycee/segui/mineralogie/fiche.htm

clef de détermination Grbl : http://www.ac-grenoble.fr/svt/SITE/prof/outiensei.htm

atlas rocks & minerals / Ratajeski : http://www.geolab.unc.edu/Petunia/IgMetAtlas/mainmenu.html

atlas minerals / Siddall, London : http://www.ucl.ac.uk/~ucfbrxs/PLM/PLMhome.html

atlas de roches et minéraux webminéral BRGM :

atlas de minéraux : http://www.brocku.ca/earthsciences/people/gfinn/minerals/database.htm

atlas de lames minces Minéraux et roches / Aubry, Caen : http://www.discip.crdp.ac-caen.fr/svt/cgaulsvt/travaux/Micropol/index.html

article de minéralogie au microscope polarisant : http://www.svt-monde.org/spip.php?article26

Attention : Evaluation TP roches le 7/12/17

A4 : expériences de cristallisation / microscope

Échantillons évaporites CuSO4, FeSO4, NaCl cristallisés à différentes vitessse / évaporation différenciée

évaporation sel entre lame et lamelle :

solubilité : 357 g·L^-1 (eau, 0 °C),

358,5 g·L^-1 (eau, 20 °C),
380,5 g·L^-1 (eau, 80 °C),
391,2 g·L^-1 (eau, 100 °C),
0,65 g·kg-1 (éthanol, 25 °C),

donc combien¹ faut-il de sel pour faire 1L d'eau saturée en sel à 20°C ?

cristallisation vanilline :

http://www.didiersvt.com/cd_1s/html/c4/c4a4p2.htm

http://pst.chez-alice.fr/svtiufm/roches.htm

https://vimeo.com/66512685

EV/ TP roches / µscopes

1,4,2 : Modélisation globale

A1 : Répartition mondiale du volcanisme de subduction / site CNRS

http://www.cnrs.fr/cw/dossiers/dosgeol/01_decouvrir/02_subduction/02_carte/carteok.htm

A2 : Schématisation des étapes pétrograhiques / logiciel & animations

logiciel subduction (Perez) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/lycee/perez/subduction/subduction.htm

prg → SVT → Subduction

métabasalte+métagabbros contiennent des minéraux hydratés

éclogite faite de minéraux anhydres / déshydratation de métabasalte+métagabbros

=>déshydratation croûte océanique

=> hydratation manteau lithosphérique continental susjacent

=> baisse du solidus (point du fusion)

=> fusion partielle des péridotites du manteau continental

=> plutonisme (granitoïdes, diorite) + volcanisme (rhyolite, andésites) continentaux = Accrétion continentale

Glossaire : http://www.premiumwanadoo.com/renard/revisions/SVT/lexGeol.htm#S

glossaire : http://operabaroque.fr/magmatiques.htm

schéma-bilan : http://www.biologieenflash.net/sommaire.html → géologie interne → subduction

Bilan / Le magmatisme en zone de subduction : une production de nouveaux matériaux continentaux

Les zones de subduction sont le siège d'une importante activité magmatique qui aboutit à une production de croûte continentale.

Dans les zones de subduction, des volcans émettent des laves souvent visqueuses associées à des gaz et leurs éruptions sont fréquemment explosives. La déshydratation des matériaux de la croûte océanique subduite libère de l'eau qu'elle a emmagasiné au cours de son histoire, ce qui provoque la fusion partielle des péridotites du manteau sus-jacent (de la lithosphère chevauchante). Si une fraction des magmas arrive en surface (volcanisme), la plus grande partie cristallise en profondeur et donne des roches à structure grenue de type granitoïde. Un magma, d'origine mantellique, aboutit ainsi à la création de nouveau matériau continental.

Bilan / schéma-bilan

C poursuivre

http://www.geowiki.fr/index.php?title=%C3%89volution_chimique_des_magmas

http://geolvar.free.fr/textes/Le%20magmatisme.html

13,58g

mardi 28 novembre 2017

Comment se fait l'évolution ?

un lexique bilingue français/anglais de génétique : http://www.dr-belair.com/dic/Medicine/Genetics/Genetics-eng-fr.htm

18 Things You Should Know About Genetics : http://youtu.be/bVk0twJYL6Y

C : Pour aller plus loin

un article sur le clonage animal : http://biotechbuddy.googlepages.com/animal_cloning.html

des articles d'actualité sur le clonage : http://news.bbc.co.uk/2/hi/science/nature/377046.stm

un article sur le clonage d'un faon au Texas : http://www.innovations-report.de/html/berichte/biowissenschaften_chemie/bericht-24409.html

construction schématique d'une molécule d'ADN : http://learn.genetics.utah.edu/units/basics/builddna/

schéma molécule : http://fr.wikipedia.org/wiki/Fichier:ADN.jpg

extraction ADN : http://www.pedagogie.ac-nantes.fr/1169107087593/0/fiche___ressourcepedagogique/&RH=1160729734281
DNA learning center : http://www.dnaftb.org/dnaftb/

Transgenic Fly lab : http://www.hhmi.org/biointeractive/vlabs/transgenic_fly/index.html

Site du prix Nobel : http://nobelprize.org/index.html

DNA interactive : http://www.dnai.org/

BIOTIC INRP : http://www.inrp.fr/Acces/biotic//genetic/adn/accueil.htm

SNV : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/ATP/transgen.htm

Banques de séquences ADN : http://www.ebi.ac.uk/embl/

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=nucleotide

http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/

École de l’ADN : http://www.ecole-adn.fr/WEB_F/home.html

EC : Scientific sources about genetics / www

http://www.dnai.org/a/index

http://learn.genetics.utah.edu/content/begin/tour/

http://www.dnaftb.org/#classical

http://www.dnajunction.com/history/discovery-of-dna.php

http://genmed.yolasite.com/history.php

Watson & Crick : http://www.exploratorium.edu/origins/coldspring/ideas/printit.html ; http://www.nature.com/nature/dna50/archive.html

in french :

http://www.snv.jussieu.fr/vie/documents/decouverteadn/index.htm

http://www.genoscope.cns.fr/externe/HistoireBM/

Comment se fait l'évolution ?

1.7 : Quatre forces évolutives

A1 : Les forces évolutives / Film

Film du CNRS : « groupes humains, homogénéité et diverstité » : http://videotheque.cnrs.fr/video.php?urlaction=visualisation&method=QT&action=visu&id=2242&type=grandPublic

catalogue videos : http://videotheque.cnrs.fr/index.php?urlaction=docListe&cherche=1&domaine=catalogue

prendre des notes : quelles sont les forces qui guident l'évolution ?

sélection naturelle // adaptation
dérive génétique [genetic drift]
migration génétique
mutation génétique

18 Things You Should Know About Genetics

lundi 27 novembre 2017

A Newly Identified Species Represents Its Own Eukaryotic Lineage

A Newly Identified Species Represents Its Own Eukaryotic Lineage: The 10-micrometer-long flagellate cell might have a big story to tell about the evolution of eukaryotes.

le dernier paresseux

Image of the Day: The Last Sloth: An artist’s impression suggests what the Caribbean may have looked like before humans arrived.

Menus

jeudi 7 décembre 2017

mardi 5 décembre 2017

A2 : Modélisation de la dérive génétique et de la sélection naturelle

lundi 4 décembre 2017

De Burgess à Franceville (Gabon) : les plus anciennes traces fossiles de pluricellulaires

vendredi 1 décembre 2017

A3 : Observation de lames minces roches / µscopes

© TS_TP_roches.odg

Attention : Evaluation TP roches le 7/12/17

A2 : Effet mutagène des UV sur levure ade2 / expérience in vitro

A3 : Cas du Xeroderma pigmentosum / docs

© 1S TD xeroderma pigmentosum.odt

jeudi 30 novembre 2017

A4 : Comparaison de gènes sur banque de séquences / logiciel anagène

Bilan : Gènes et environnement

Bilan : Gènes et environnement/ schéma ©

© schéma-bilan

gene-rayures3.odp

§ Comment les variantes de gènes (allèles) sont elles nées ?

§ Quelles sont les causes des mutations ?

1,4/ Mutations et naissance de nouveaux allèles

1,4,1/ Agents mutagènes et causes des mutations

Rappel : Différents types de mutations / logiciel Anagène

A2 : Revue de presse sur l’influence d’agents mutagènes / articles

D\agents mutagènes.odp

1.4 : Le magmatisme en zone de subduction

1,4,1 : Des roches magmatiques continentales

A1 : Les conditions pour produire un magma / diagrammes de phases

© origin magma.odg

A2 : modélisation moléculaire des minéraux

A3 : Observation de lames minces roches magmatiques / µscopes

TP_roches.odg©

Attention : Evaluation TP roches le 7/12/17

A4 : expériences de cristallisation / microscope

EV/ TP roches / µscopes

© TS-EV_TP_roches_microscopie.odt

© \TS EV TP et QCM roches.odt

1,4,2 : Modélisation globale

A1 : Répartition mondiale du volcanisme de subduction / site CNRS

A2 : Schématisation des étapes pétrograhiques / logiciel & animations

Bilan / Le magmatisme en zone de subduction : une production de nouveaux matériaux continentaux

Bilan / schéma-bilan

C poursuivre

mardi 28 novembre 2017

C : Pour aller plus loin

EC : Scientific sources about genetics / www

Comment se fait l'évolution ?

1.7 : Quatre forces évolutives

A1 : Les forces évolutives / Film

lundi 27 novembre 2017