jeudi 8 janvier 2015

A2/ Comparaison d'allèles phénylcétonuriques / Anagène

différents niveaux de phénotypes :
macroscopique : troubles digestifs, lésions cutanées et retard mental important
microscopique : cytotoxicité
moléculaire : PAH non fonctionnelle
  • => excés de Phe => phénylcétone toxique dans le sang et l'urine,
  • => manque de Tyr => de Mélanine => pâleurs
individus homozygotes :
Homozygote : [identique ; oeuf] se dit d'une cellule qui possède deux allèles identiques pour un gène, opposé de hétérozygote.

Anagène → fichier → banque de séquences → la phenylalanine hydroxylase
remplir la première colonne du tableau (attention avec bases complémentaires)

 
Allèle ADN transcrit : nucléotides
phenorm Référence
phe1 A 165 Ø
phe2 TAG 284-286Ø
phe3 G 331 A
phe4 C 473 T
phe5 CT 663+664 Ø
phe6 T 696 C
phe7 G 727 A
Phe8 C 735 T
phe9 C 782 T
phe10 C 814 A
phe11 C 838 T
phe12 A 896 G
phe13 G 1038 Ø
phe14 GAG 1093-1095 Ø
phe15 C 1223 T
phe16 G 1222 A
phe17 T 1241 C
rôle de l'alimentation sur le génotype

A3/ Comparaison de gènes sur banque de séquences / logiciel anagène

Protocole / Manuel p 64
  • drépanocytose : fichier → thèmes d'étude → relation pheno-génotype → phénotype drépanocytaire → comparer les séquences → comparaison simple → noter les différences
  • albinisme : fichier → banque de séquences → tyrosinase → tyrcod1 & tyralba1 → comparer → comparaison simple → noter les différences
  • groupes sanguins : fichier → banque de séquences → système ABO des groupes sanguins
Charger des séquences - « acod.adn », « bcod.adn » et « ocod.adn » sont les allèles du gène des groupes sanguins [« .cod.adn » = ADN, « .pro » = protéine]
Comparer (alignement avec discontinuité) - combien de bases (nucléotides) en commun ? Différents ?
gène, allèles, génotype
allèle, géne, génotype, homo/hétérozygote

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