SVTR: § Génétique ou environnement ?

vendredi 8 janvier 2016

§ Génétique ou environnement ?

A3/ Exercices sur lapins himalayens / documents

Diap gene_lapin_himmalaya.odp

© gene_lapin-himmalaya.odt

http://lewebpedagogique.com/chezmoiplusdesvt/files/2008/02/exercice-lapin-himalayen.doc

http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=424

http://svtndgautier.free.fr/ps/geno/lapinhima.pdf

rôles de l’environnement et du génotype dans l’expression d’un phénotype.

Question : A partir des informations et de vos connaissances, expliquez les rôles du gène de la tyrosinase et de l’environnement sur la couleur des lapins himalayens.
Analyse de la question :
A partir des informations et de vos connaissances :
Cette expression rappelle la manière de travailler :
 utiliser les données apportées par les documents
 utiliser les connaissances pour répondre à la question.
Expliquez : le verbe indique l’activité à produire :
 retrouver la ou les causes.
 formuler l’enchaînement des mécanismes à l’origine du phénomène.
Les rôles du gène de la tyrosinase et de l’environnement sur la couleur des lapins himalayens : notions à utiliser et limites du sujet
 fonctionnement d’un gène, gène de la tyrosinase à lier à la couleur du poil.
 influence de l’environnement, température, à lier à la couleur du poil.
 Limite du sujet : lapins himalayens, pas lapins sauvages.
Dans l’exercice II.2, sur / 5 points, les barèmes tiennent compte de :
 la saisie des informations des documents /1 à 2
 la mise en relation des informations des documents / 1 à 2
 l’utilisation des connaissances / 1.5
Analyse partielle du texte : informations à relever dans le texte
La couleur sombre du pelage est due à la présence de mélanine dans le poil.
La couleur blanche correspond à l’absence de mélanine dans le poil.
La chaîne de biosynthèse de la mélanine débute par la transformation de tyrosine par l’enzyme « Tyrosinase ».
Le gène de la Tyrosinase est le même pour les lapins sauvage et himalayen.
Par contre les séquences alléliques de ce gène diffèrent au codon 422 pour les lapins sauvage et himalayen.
Le texte indique que :
 la couleur du pelage vient de la présence de mélanine
 la mélanine vient de la transformation de tyrosine par la tyrosinase au sein d’une chaîne de biosynthèse.
 le gène de la tyrosinase possède 2 allèles, différentes au codon 422
On sait que les phénotypes dépendent des protéines, qui elles mêmes résultent de l’expression de gènes.
La couleur du poil dépend de la présence de mélanine dans les cellules de poil, qui provient de la transformation de la tyrosine par une chaîne de biosynthèse, dont la tyrosinase est le premier enzyme.
On sait qu’il suffit d’une seule étape absente dans une chaîne de biosynthèse pour le produit final ne se fabrique pas.
Donc, la couleur blanche du poil peut résulter de la présence d’une tyrosinase non fonctionnelle, empêchant la production finale de mélanine.
Analyse du document 1 : données à relever de l’électrophorèse
TS TH
Sens de migration
Zone de dépôt des gouttes de tyrosinases
TS = Tyrosinase du lapin Sauvage
TH = Tyrosinase du lapin Himalayen
On voit que les 2 tyrosinases ont de vitesses de migration différentes : ce qui signifie qu’elles ont une composition différente.
On sait que les enzymes sont des protéines et que les protéines sont constituées d’acides aminés.
Le texte indique que les 2 allèles diffèrent au codon 422.
On sait qu’un codon du code génétique ne correspond à un seul acide aminé.
La différence de migration résulte de différence de l’acide aminé 422.
L’enzyme tyrosinase des lapins himalayens diffère d’un acide aminé de celle des lapins sauvages.
Analyse du document 2 : données relevées de l’activité des tyrosinases
Transformation de la Tyrosine par la Tyrosinase, à 30°C et 36°C.
% de Tyrosine transformée par la Tyrosinase
100%
TS à 30° et 36°C
TH à 30°C
TH à 36°C
0%
60 min
Temps d’action de la Tyrosinase
30°C : température des extrémités du lapin (oreilles, pattes, …)
36°C : température centrale des lapins (ventre, dos…)
Action de la Tyrosinase S
Action de la Tyrosinase H
La légende indique que :
 les extrémités du corps sont à 30°C
 les parties centrales du corps sont à 36°C
Le graphique indique que :
 à 30°C, la tyrosinase est transformée à 80% par la tyrosinase H, en moins d’une heure.
 à 36°C la tyrosine est peu transformée, 10%, par la tyrosinase H,
en une heure.
L’activité de la tyrosinase est rapide à 30°C et très lente à 36°C.
On sait que le site actif peut être modifié par la température.
On peut penser que la variation d’activité de la tyrosinase résulte de la modification de son site actif.
Dernières informations relevées du texte :
Les lapins sauvages ont un pelage entièrement sombre.
Les lapins « himalayens » ont un pelage :
 blanc sur le ventre, le dos, la tête, la plus grande partie des pattes
 noirs sur leurs extrémités : bout des pattes, queue, museau, oreilles.
Lien avec le document 2 :
Les extrémités sombres sont à 30°C ; cette température correspond à la température ou la tyrosinase H transforme la tyrosine rapidement : les poils des extrémités contiennent donc de la mélanine.
Les extrémités claires sont à 36°C ; cette température correspond à la température ou la tyrosinase H transforme la tyrosine très lentement : les poils des extrémités ne contiennent donc pas de la mélanine.
Exemple de synthèse / bilan de la réponse :
D’abord relecture de la question : A partir des informations et de vos connaissances, expliquez les rôles du gène de la tyrosinase et de l’environnement sur la couleur des lapins himalayens.
Puis regroupement de l’essentiel en ciblant par rapport à l’énoncé.
Chez les lapins, la couleur sombre des extrémités des oreilles ou de la queue ou des pattes, vient de la présence de mélanine dans les cellules des poils.
Cette mélanine est fabriquée par une chaîne de biosynthèse dont la première étape est déterminée par le gène de la tyrosinase.
Si l’allèle de la tyrosinase, présent dans ces cellules, n’est pas fonctionnel, la tyrosine ne sera pas transformée et la mélanine non fabriquée : le pelage sera blanc.
Les lapins himalayens portent l’allèle TH du gène de la tyrosine, qui diffère au codon 422 : l’enzyme TH diffère de l’enzyme TS par un acide aminé en position 422. Cette différence modifie le site actif de TH, qui fonctionne très lentement dans les températures élevées, par exemple 36°C.
Or chez les lapins himalayens, les extrémités sont plus froides, 30°C, que les parties centrales, 36°C : l’expérience montre qu’à 30°C l’enzyme TH est très active et peut transformer rapidement la tyrosine, permettant ainsi la fabrication de mélanine dans les poils. Tandis qu’à 36°C, elle est très peu active, ce qui aboutit à l’absence de mélanine dans les poils.
La variation de couleur du poil chez les lapins himalayens résulte donc de l’existence d’un allèle TH, déterminant une tyrosinase différente par un acide aminé au niveau du site actif, ce qui le rend inactif à 36°C. La variation de température au niveau des parties centrales et des extrémités est ensuite responsable des variations de pigmentation par la mélanine.