Consignes
Choisir une séquence et prendre place dans le tableau partagé en ligne : https://lite.framacalc.org/ozy810bsvn-abaa
Identifier des sequences inconnues (ci-dessous) en utilisant le logiciel en ligne Blast (Basic Local Alignment Search Tool) : https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi et en suivant le protocole “tutoriel-blast”. Noter le nom de l’organisme planctonique identifié.
Faire une recherche internet sur le plancton identifié et réaliser une fiche d’identite du plancton en y figurant : nom, Genre, espece, taxon (phyto/ zooplancton…) et photo.
Calculer la taille du plancton.
Compléter votre ligne dans le tableau partagé
Production attendue
inscription sur tableau partagé en ligne : https://lite.framacalc.org/ozy810bsvn-abaa
identification du plancton grâce au logiciel en ligne : https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
mise en commun des organismes identifies : depot des fiches d’identite sur tableau partagé.
Par la suite, il est possible de quantifier la biodiversite et d’établir un lien entre la presence de certains types de plancton et les caracteristiques physico-chimiques du milieu
Numéros |
Séquences ADN à identifier |
1 |
CGGGAAGTTGTCCAAACCTTATCATTGAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGG |
2 |
CGGCTGGAGAACCAGCTGCGGCGCCGCAGTCCGGGGGCCTCACCGGATCATTCAATCGGTAGGAGCGACGGGCGGTGTGTACAA |
3 |
CCTTCCGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACACCTTCTCCTTCCTCTAGATGATAAGGATTGGGTGACTTCCCGGCGCAGC |
4 |
CCTTCTGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACGGCTTCTCCCTCCTTTAAATGATAAGGTTCGGACAGCCTCCCGCGGCGTCGCGG |
5 |
CGCGGCTGGAGAACCAGCTGCGGCGCCGCAGTCCGGGGGCCTCACCGGATGATTCAATCGGTAGGAGCGACGGGCGGTGTGTACAA |
6 |
TTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGATTGCACCAGAAGTGGATAGTCTAACCTTCGGGAGGACGTTCACCACGGTGTGGTTCATGACTGGGTTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCCGAAGG |
7 |
TTTTCCACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGATTGCACCAGAAGTGGTTAGTCTAACCTTCGGGAGGACGATCACCACGGTGTGGTTCATGACTGGGGTGAAGTTGTAACAAGGTAGCCGTAGGTGAACCTGCAGAAGG |
8 |
CCTTCTGCAGGTTCACCTACGGCTACCTTGTTACACCCTCACCCCAGTTGCTGAGCTCACC |
9 |
CTACCTTGTTACGACTTCCCCCCAGTCGCTGAGCTCACCGTGGTCCGCTGCCTCCTCGAAA |
10 |
CCTCCCGCAGGTTCACCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCCCCCCAGTCATGAACCACACC |
11 |
CCTTCTGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTAC |
12 |
TTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAGTGTTTTAGTGAGGTCCTCGGATTGCCTTCCTGGCGGTTAACCCTGCCTCGTTGGCGAAAAGACGACCAAACTGTAGCACTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCAGAAGG |
13 |
CCTTCCACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAAAGTATTAGTCCGGTCCTCGGACTGTTT |
14 |
GATTGAACGTTGTAGTGAGGTCCTCGGACTGTTTGCCTGGCGGATTACTCTGCCTGGCTGGCGGGAAGACGACCAAACTGTAGCGTTTAGAGGAAGTGAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGG |
15 |
GAGCGGTCGAACCGTTGGATTATTCCTCCGATCGCCGTTTGGAAAGATCGCCGAGCTCGACCGTTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTATCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGG |
16 |
CCTTCTGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACGACTTCACCTTCCTCTAAATGATAAGGTTTAGACAAGATCTCGCGACAAACTCCCAATAAAGGGAACTCGCCACAATCCCGAGGCTTCACCGGACCATTCAATCGGTAGGTGCGACGGGCGGTGTGTACAA |
17 |
GAGTGTTCCGGTGAAGCCTCGGGATTGTAGTTGGGTTCCTTTATTGGATCCTGACCGCGA |
18 |
CCTTCCGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACAACATCACCTTCCTCTAAATGATAAGGTTTAGACAAGTTCTCGCGACAAACTCCCAATAAAGGGAACTCGCCACAATCCCGAGGCTTCACCGGACGTTTCAATCGGTAGGTGCGACGGGCGGTGTGTACAA |
19 |
TTGTACACACCGCCCGTCGCACCTACCGATTGAATGGTCCGGTGAGGAGTCGAGATTGTGGCTTGGTTCCTTTATTGGGACTTGGCCGCGAAAACTTTTCCGAACCTTATCATTTAGAGGAAGGTGAAGGCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCAGAAGG |
20 |
CCACAATCCCGACGCCTCACCGGACCATCCAATCGGTAGGTGCGACGGGCGGTGTGTACAA |
21 |
CCTTCTGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACGCCTTCTCCTTCCTCTAAGTGTCAAGATTCACCAAACTTTCCGCAGCAATATTCAGGAACTGAAAATTGCAGCAGTCCGAATTATTCATCGGGACACTCAATCGGTAGGAGCGACGGGCGGTGTGTACAA |
22 |
CCTTCCGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACGACTTCACCTTCCTCTAGAT |
23 |
CATTTAGAGGAAGTGGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCAGAAGG |
24 |
TTGTACGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTATA |
25 |
TTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGC |
26 |
CCTTCTGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTCCACCATCCCCTTCCTCTAAACGATGAGGATTCCACAAGATCCCACGGAAGCGCATCCAATCAAGGACGCGCAGCCACGGTC |
27 |
TTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGAT |
28 |
TTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTG |
29 |
GTTGCGAGAAGTTGAGTGAACCTTATCACTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGG |
30 |
CCTTCCGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACGACTTCACCTTCCTCTAAATGATGAGGTTTAAATAACTTCCCACTGTCTAGTCGCCCGAAGGTGTCTTGACTGCGGTCCGAGAGTTTCACCGAATCATTCAATCGGTAGGTGCGACGGGCGGTGTGTACAA |
31 |
CCTTCTGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACGACTTCTCCTTCCTCTAGGTGGGAGGGTTTAATGAACTTCTCGACAGCCAAGGGCGGAAACCGCCCAAAGCCGCCAATCCGAGCATTTCACCAGCACACCCAATCGGTAGGAGCGACGGGCGGTGTGTACAA |
32 |
ATCCAATCGGTAGGAGCGACGGGCGGTGTGTACAA |
33 |
TTTTCCACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAATGGTCCGGTGAAATCTTCGGATTGCTGACCTTTGCATTCACGTGCTTTGGTTGCGAGAAGTTGATTGAACCTTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGG |
34 |
TGTTCCACACCGCCCGTCGCTCCTACCAATTGATTCGACCGTTGCAATCTTCGGATTGCTGACCTTTGCATTCACGTGCTTTGGTTGCGAGAAGTTGATTGAACCTTATCATTTAGAGGAAGGAG |
35 |
GATTGCTGAACTTTGCAGTGACGTGTGTTGGGTGCGAGAAGTTGGTTGAACCTTATCATGTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCAGAAGG |
36 |
TCTTCCACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGATACGACCCGTCAAATCTTCGGATTGCTGACCTTTGCATACACGTGCTTTGGTTGCGAGACGTTGATTGAACCTTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGT |
37 |
CCTTCTGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACGACTTCTCCTTCCTCTAAATGTTAAGGTTCAATCAACTTCTCGCAACCAAAGCACGTGAATGCAAAGGTCAGCAATCCGAAGATTTCACAGGACCATTCAATAGGTAGGAGCGACGGGCGGTGTGTACAA |
38 |
CGCCCGTCGCTACTACCGATTGGATGGTCCGGTGAGAACTCTGGATTGCGGTTGATGTGCCGGTCTCCGGTGCATGACTGCGAGAAGTTGATCGAACCTTATCATCTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGG |
39 |
CCTTCTGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACACCATCACCTTCCTCTAGATGATAAGGTTCAGACAAGATCTCGCGGCCACGCCCCAATAAAGCAGC |
40 |
TCACCAGCTCATCCAATCGGTAGGAGCGACGGGCGGTGTGTACAA |
41 |
CCTTCCGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTACAACTTCTCCTTCCTCTAAATAATCTAGTTTGCAAATTTTAATCGTAATGTTGTCTATCAGTAAGTTAACTCCTCATCTAATTCAATCACTAACTTATCCGATCGGTAGGAGCGACGGGCGGTGTGTACAA |
42 |
CCTTCCGCAGGTTCACCTACGGAAACCTTGTTATGACATCTCCTTCCTCTAAGTGATAAGGTTCACTAAACATTCCGCTGCAACTTCCAGAATCTGAAAAATGCATCAGTCCGAGTTATTCACCGGATCACTCACTCGGTAGGAGCGACGGGCGGTGTGTACAA |
https://fondationtaraocean.org/education/kit-de-donnee-biogeographie-du-plancton/
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