jeudi 10 novembre 2016

§ Comment une information génétique se traduit-elle au niveau d'un organisme ? Qu'est-ce qu'un phénotype ?

§ le zèbre est-il rayé noir sur blanc ou blanc sur noir ?
Explication du Pr Burp / Gotlib
Diaporama : gene-rayures2.odp
Phénotype [phen : paraître ; typ : signe] = caractère observable d'un être vivant
Phénotype [φαινω : paraître ;  τυπος : signe, marque, empreinte] est l'état d'un caractère observable (caractère anatomique, morphologique, moléculaire, physiologique, ou éthologique) chez un organisme vivant.

§ Comment une information génétique se traduit-elle au niveau d'un organisme ? Qu'est-ce qu'un phénotype ?

1,3/ Des gènes à la réalisation des phénotypes

1,3,1/ Un caractère à différentes échelles

A1 : Cas de l'albinisme

Diap albinisme
manuel p.66
Pigment = molécule colorée
mélanine = pigment protéique
albinisme = génétique / défaut de pigment
expression d'un gène = protéine

A2 : Cas des groupes sanguins

manuel p.67 
Règles de transfusion sanguine : http://www.soins-infirmiers.com/groupes_sanguins.php
hématies marquées : A, B et/ou O = antigène
grp <= molécule enzymatique qui construit des marqueurs à la surface des cellules
les enzymes sont de nature protéique
génotypes : (A//A) ou (A//O) ; (B//B) ou (B//O) ; (A//B) ; (O//O)
phénotypes : [A] ; [B] ; [AB] ; [O]
(génotype) => [phénotype]
génotype = combinaison d'allèles pour un gène donné, pour une cellule , donc un individu

A3 : Cas de la drépanocytose

Diap drepanocytose
manuel p.62 à 65
différentes échelles d’un phénotype : mol, micro, macroscopique
Le phénotype peut se définir à différentes échelles : de l'organisme à la molécule.
Les caractères héréditaires observables à l'échelle de l'individu constituent le phénotype macroscopique (ex : couleur de peau, symptômes d'une maladie, ...). Ces caractères macroscopiques dépendent d'un phénotype microscopique, à l'échelle cellulaire (ex : couleur ou forme des cellules, ...). Le phénotype microscopique est lui-même déterminé par le phénotype moléculaire correspondant à une protéine (mélanine, hémoglobine, ...).

Evaluation

Exercice type bac

mardi 8 novembre 2016

§ comment la glycémie est-elle régulée ?

§ comment la glycémie est-elle régulée ?

Diap / homéostasie.odp
Rappel modélisation cybernétique : pour la régulation d'un système il faut un capteur, un transmetteur et un effecteur qui forment un système réglant un système réglé à une valeur de consigne, ici la glycémie à 1g de glucose / L de sang, ou + précisément 0,9 g/L de plasma.

1,2 : La glycémie est une variable régulée

1,2,1 : Capteurs de glycémie

A1 : observation de coupes foie et pancréas / µscop

acinus (pl. acini) = ensemble de cellules autour d'un canal (pancréatique) sécrétant une substance dans le milieu extérieur (tube digestif) = cellules exocrines.

îlots de Langerhans = ensemble de cellules sécrétant dans le milieu intérieur (sang + lymphe + liquide intersticiel) = cellules endocrines.

cellules alpha, en périphérie, productrices de glucagon,
cellules béta au centre, productrices d'insuline,

lundi 7 novembre 2016

vendredi 4 novembre 2016

1S1 Evaluation SVT 50' du 4/11/2016
Expression, stabilité et variation du patrimoine génétique
Exercice d'analyse de document avec restitution de connaissances / 10 pts

A partir de l'exploitation rigoureuse de tous les documents proposés et de vos connaissances, rédigez une synthèse sur le rôle de l'ARN dans l'expression du patrimoine génétique.
Aide à la résolution : 1/ Lire tout le sujet pour comprendre ce qui est attendu. 2/ Ecrire au brouillon ce que chaque document vous révèle et les mots à définir. 3/ Rédigez une introduction avec explicitation du sujet, problématique et plan à développer en réponse aux différents problèmes. 4/ Rédigez un développement utilisant chaque document (citer le numéro de chaque document auquel vous faites référence, dites ce que le document contient et ce qu'il démontre) et vos connaissances (définition des mots importants, explication des données). 5/ Rédigez une conclusion en réponse à la problématique.

§ Comment reconstituer l'histoire d'une chaîne de montagnes ?

SVT TP TS : Tracé d'un plan de Wadati-Benioff (subduction) avec un logiciel tableur 
Principe
Afin de comparer le plan de subduction de deux zones de subduction du Chili et de Tonga-kermadec, construire deux graphes avec les foyers des séismes.
Matériel /poste
·         Ordinateurs
·         Logiciel Excel ou libre office calc
·         Logiciel Word ou libre office draw ou writter
·         Fiche technique Excel
·         Fichier de données au format xls ou ods sur les séismes de différentes zones
·         Imprimante


Protocole
1ère étape : sélectionner le lieu
- Sélectionnez la colonne des lieux, au complet.
- Cliquez sur « données », puis « filtre »  et « filtre automatique »
- Un menu déroulant apparaît. Cliquez sur ce menu déroulant et aller à « Personnalisé ». Dans la rubrique « lieu » proposée, remplacez « égal » par « contient » et tapez « chil » ou « CHIL » ou « chile ». Tous les foyers sismiques concernant la région du Chili seront sélectionnés.
2ème étape : Construire un graphe
- Choisissez les données utiles pour construire un graphe représentant la localisation des séismes de cette région en coupe : le plan de WB devrait-il être parallèle ou perpendiculaire à la fosse ? Dans ce cas faut-il faire un graphe en fonction de la longitude ou de la latitude ?
- Réalisez ce graphe à l’aide de l’assistant graphique d’Excel, pour cette zone.
- Choisissez le type de graphe adéquat en réfléchissant à la nature des données
- Cliquez sur « série » pour choisir les séries de données à utiliser : cliquez sur l’icône dans la case « valeurs de  X » ; Sélectionnez les valeurs de « X » et déroulez jusqu’à la dernière valeur de « X ». Cliquez ensuite sur l’icône pour passer aux valeurs de « Y » .
- Rédigez une légende et un titre.
- Répétez les mêmes opérations pour la région des îles Tonga de telle sorte que les graphes soient comparables, attention à l'échelle.
- Tracer les courbes tendances pour avoir les coefficients directeurs qui correspondents aux pentes des droites donc à l'inclinaison des plans de WB (appliquer un deuxième filtre pour éviter les séismes peu profonds qui faussent les valeurs des coefficients directeurs)


Production attendue : un page contenant deux graphes comparables et correctement mis en page, avec titres, légendes et interprétation.
CORRECTION
prendre les données en fonction de la longitude
modifier une valeur pour Tonga en -175
coef dir Chili : 25
coef dir Tonga : 80

vendredi 14 octobre 2016

Long-Forgotten Research Unearths New Mystery About Lyme Disease

Discovery sparks questions about factors that may make ailment harder to cure or lead to misdiagnosis
A deer tick. Credit: U.S. DEPARTMENT OF AGRICULTURE Flickr
ev µscop roches

jeudi 13 octobre 2016

§ Quelle est l'origine du volcanisme continental ?

Attention : Evaluation le 10/11/16

FT/ épreuve du Bac/ doc

© FT_BAC.odt

§ Quelle est l'origine du volcanisme continental ?

1.4/ Le magmatisme en zone de subduction : une production de nouveaux matériaux continentaux

1,4,1/ Des roches magmatiques continentales

A1 : Les conditions pour produire un magma / diagrammes de phases

© origin magma.odg
à partir des diagrammes de phases de la péridotite et magmatisme : http://www.tulane.edu/~sanelson/eens211/earths_interior.htm
=> globalement peu de fusion dans le manteau
-> fusion partielle par hydratation du manteau au dessus des plaques en subduction

A2 : modélisation moléculaire des minéraux

modélisation structures moléculaires minérales par Merkel : http://www.le.ac.uk/eg/spg3/atomic.html bn
modélisation des formes cristallines: http://webmineral.com/crystall.shtml
librairie de molécules :
structure cristalline

A3 : Observation de lames minces roches magmatiques / µscopes

TP_roches.odg©
granitoïdes (=granodiorite), rhyolite, andésite, …
laves enrichies en Si => visqueuses => gaz + éruptions explosives
volcanisme / plutonisme
pour apprendre à reconnaître les minéraux et roches : manuel p.398-399
atlas minerals / Siddall, London : http://www.ucl.ac.uk/~ucfbrxs/PLM/PLMhome.html
atlas de roches et minéraux webminéral BRGM :
atlas de lames minces Minéraux et roches / Aubry, Caen : http://www.discip.crdp.ac-caen.fr/svt/cgaulsvt/travaux/Micropol/index.html
article de minéralogie au microscope polarisant : http://www.svt-monde.org/spip.php?article26

1,4,2/ Modélisation globale

A4 : Répartition mondiale du volcanisme de subduction / site CNRS

A5 : Schématisation des étapes pétrograhiques / logiciel & animations

métabasalte+métagabbros contiennent des minéraux hydratés
éclogite faite de minéraux anhydres / déshydratation de métabasalte+métagabbros
=>déshydratation croûte océanique
=> hydratation manteau lithosphérique continental susjacent
=> baisse du solidus (point du fusion)
=> fusion partielle des péridotites du manteau continental
=> plutonisme (granitoïdes, diorite) + volcanisme (rhyolite, andésites) continentaux = Accrétion continentale
schéma-bilan : http://www.biologieenflash.net/sommaire.html → géologie interne → subduction

B14 : Magmatisme de subduction

Les zones de subduction sont le siège d'une importante activité magmatique qui aboutit à une production de croûte continentale.
Dans les zones de subduction, des volcans émettent des laves souvent visqueuses associées à des gaz et leurs éruptions sont fréquemment explosives. La déshydratation des matériaux de la croûte océanique subduite libère de l'eau qu'elle a emmagasiné au cours de son histoire, ce qui provoque la fusion partielle des péridotites du manteau sus-jacent (de la lithosphère chevauchante). Si une fraction des magmas arrive en surface (volcanisme), la plus grande partie cristallise en profondeur et donne des roches à structure grenue de type granitoïde. Un magma, d'origine mantellique, aboutit ainsi à la création de nouveau matériau continental.

B1,3+4 : schéma-bilan

D\magmatisme et subduction.odp
© schéma-bilan
Compléter le schéma-bilan

§ quelles sont les étapes de la fabrication d'une protéine in vivo ?

1,2,2/ Etapes de la fabrication d'une protéine dans la cellule

FT/ Autoradiographie

faire une fiche technique
manuel p.397

A1 : Localisation des étapes / autoradiographie et MET

© autoradiographies pancréas
autoradiographie sur acinus pancréatique avec Leucine radioactive ou avec Uridine radioactive : http://svt.ac-creteil.fr/archives/Media/Med1S/Autoradiographie/Cel_panc_WEB.htm
Uracile* à 0' hors de la cell - 1' dans noyau - 2' ds réticulum endoplasmique
Leucine* à 0' hors de la cellule - 3' ds réticulum endoplasmique - 7' ds appareil de Golgi - 30' ds vésicules - 120' dans lumière du canal pancréatique
Noyau, cytoplasme, organites : réticulum [réseau] endoplasmique, appareil de Golgi, vésicules

A2 : Electronographie du phénomène in vitro / MET

© \Synthese proteines MET.odg
Diapo : synthese_proteines_MET.odp
transcription et phénomène d'amplification. (manuel p.41)
transcription : fabrication d'ARN à partir d'ADN
3 étapes : initiation - élongation – terminaison
amplification
traduction et phénomène d'amplification. (manuel p.45) :
traduction : fabrication de polypeptide à partir d'ARN
en 3 étapes : initiation - élongation – terminaison
amplification
ribosomes, poly(ribo)somes
autres photos :
maturation

B122 : schématisation sur la synthèse des protéines

© synthese_proteines_schbil.odg
4 novembre

Test / protéosynthèse