vendredi 1 janvier 2016

 2015, une année en images


Retour en images sur une année riche en actualités scientifiques

Tout au long de l'année 2015, sur le terrain ou dans les laboratoires, les équipes de CNRS Images ont rendu compte en images de la recherche en train de se faire. Présentes sur tous les écrans, aussi bien sur le web qu’à la télévision et au cinéma, ces images reflètent, de manière non exhaustive, la diversité des recherches menées par le CNRS et ses partenaires, l'excellence des équipes scientifiques et leur volonté de répondre aux grands enjeux de la connaissance et aux questions que se pose la société.
Cette année a également été marquée par le lancement des tout nouveaux sites de la Photothèque et de la Vidéothèque du CNRS. Ils donnent une plus grande place aux images et offrent de nouvelles fonctionnalités. Partez à la découverte !
Les films et diaporamas de l'année
Talents
Médaille d’or 2015
Médaille de l’innovation
Médaille de l’innovation
Médaille de l’innovation
Médaille de l’innovation
Au cinéma
La glace et le ciel, présenté en clôture du Festival de Cannes et en salle à partir du 21 octobre 2015
Sur le web
CNRS Eduthèque
(accès réservé)
 

Les 10 articles de 2015 que vous avez préférés

Les 10 articles de 2015 que vous avez préférés

Intelligence de la poule, méditation, tombe de Philippe de Macédoine, métissage sapiens-neandertal, etc. Découvrez ou retrouvez les 10 articles parus cette année qui vous ont le plus intéressé !

poule
© Carlton Davis, Trunk Archive

1. L'intelligence de la poule

Loin de mériter leur réputation d'oiseaux stupides, les poules ont des capacités cognitives étonnantes...
Pour la Science N°454 - août 2015.

2. Méditation : comment elle modifie le cerveau

Les neurosciences explorent le cerveau des méditants. Et confirment les effets bénéfiques de ces très anciennes pratiques méditatives.
Pour la Science N°448 - février 2015.

3. La vraie tombe de Philippe II de Macédoine identifiée

La « Tombe de Philippe » de la nécropole royale d'Aigéai, la capitale macédonnienne, était censée être celle de Philippe II. Mais une tombe voisine, où est inhumé un personnage boiteux, semble être la véritable sépulture du père d'Alexandre le Grand.
Juillet 2015.

4. Un métissage tardif entre sapiens et néandertal en Europe

Le génome d'un homo sapiens découvert en Roumanie suggère que la première vague de peuplement de l'homme moderne en Europe s'est métissée avec les néandertaliens, mais sans que cela laisse de traces notables dans nos gènes…
Juillet 2015.

 

5. Faut-il prendre des notes à la main ou sur ordinateur ?

Des études indiquent qu'en prenant les notes à la main, la mémorisation des informations et leur compréhension sont favorisées.
Pour la Science N°448 - février 2015.

6. L’intrication quantique confirmée par une expérience de Bell sans faille

De nombreuses expériences ont testé la réalité de l’intrication quantique et de la non localité. Mais jusqu’à présent, toutes souffraient de failles subtiles. Une nouvelle expérience évite ces écueils et confirme la réalité de l’intrication quantique.
Octobre 2015.

7. La maîtrise de soi

On vit mieux quand on sait se contrôler dès l'enfance. C'est ce que suggère le suivi de milliers de personnes depuis la naissance. Faut-il alors entraîner les enfants à la maîtrise de soi dès leur plus jeune âge ?
Pour la Science N°450 - avril 2015.

8. Proton et neutron : une différence de masse enfin expliquée par le calcul

En utilisant des supercalculateurs parmi les plus puissants au monde, des physiciens ont réussi à expliquer la différence de masse entre neutron et proton directement à partir du modèle standard de la physique des particules.
Avril 2015.

9. Stephen Hawking, le mythe du génie solitaire

Chercheur brillant mais lourdement paralysé, le théoricien britannique est, contrairement à l'image qu'on se plaît à donner de lui, l'antithèse du savant solitaire armé de la seule puissance de son cerveau.
Pour la Science N°448 - février 2015.

10. L'argent fait-il le bonheur ?

Le bonheur augmente avec la richesse, mais seulement jusqu'à un certain seuil. Au-delà, on ne constate plus d'effet global : tout dépend de la façon d'utiliser son argent.
Pour la Science N°454 - août 2015.

Les 10 découvertes qui ont marqué l'année 2015

Les 10 découvertes qui ont marqué l'année 2015

Quelles ont été les 10 découvertes qui ont changé la science en 2015 ? Des premières images surprenantes de la planète naine Pluton à l'inventaire des arbres de la planète, découvrez la sélection de La Recherche, à retrouver en intégralité dans le nouveau numéro du magazine.

1) Les surprises de Pluton
La couleur du terrain de Pluton témoigne du dynamisme des interactions entre le sol et l'atmosphère. Crédit : NASA/JHUAPL/SWRI
Après 9 ans de voyage et 5 milliards de kilomètres parcourus, la sonde Horizons a renvoyé sur la Terre les premières images de la planète Pluton. S'il faudra un an pour collecter l'ensemble des données obtenues par la sonde, les premiers résultats sont surprenants et ont déjà révolutionné la vision des scientifiques sur l'ex-neuvième planète du système solaire. Des montagnes de glaces d'eau, culminant à 3 300 mètres d'altitude, témoignent de mouvements telluriques et la couleur très blanche de la glace, non assombrie par les poussières gravitants au dessus de Pluton, prouve une activité géologique récente. Les sols de Pluton sont très variés et mettent en évidence, de par leur constitution, des interactions fortes avec l'atmosphère. Autre surprise : une calotte polaire présente au niveau de l'équateur. Les scientifiques l'attendaient plus aux pôles, comme sur notre planète.
Prochaine étape : placer une sonde en orbite autour de la planète naine, à la manière de Rosetta, et obtenir des résultats encore meilleurs.

2) Manipulation trop facile du génome humain
En avril dernier, des biologistes chinois révèlent la manipulation génétique qu'ils ont menée sur des embryons humains. Leur but : supprimer la mutation génétique responsable d'une maladie du sang à l'aide de la technologie CRISPR-Cas9.
CRISPR-Cas9 est un outil élaboré à partir de petits ARN -molécules servants de guide- et de la protéine Cas9 pour couper et remplacer des séquences ADN. L'équipe chinoise a donc voulu utiliser ce « réparateur d’ADN », jusqu'alors testé uniquement sur des cellules somatiques, afin de modifier, in vitro, l'ADN d'embryons issus de parents porteurs de l'anomalie génétique. Sur 86 embryons testés, 7 seulement ont eu des gènes correctement réparés.
Au delà des questions éthiques qu'elles soulèvent, ces manipulations du génome sont extrêmement risquées et ne peuvent être réalisées sans la certitude d’obtenir d’excellents résultats. Dans ce but, une enzyme appelée Cpf1 a été découverte cette année et permettrait des coupes plus précises de l'ADN. La manipulation du génome constitue une réelle avancée biologique mais les applications médicales sont encore loin.

3) Ebola : enfin un vaccin prometteur
Le 10 mars 2015, une femme se fait vacciner contre le virus Ebola à Conakry, en Guinée. Crédit : Cellou Binani/AFP Photo
Après une terrible course contre la montre, un vaccin contre Ebola a prouvé son efficacité. Ses résultats préliminaires ont été publiés le 31 juillet dernier : une bonne protection et aucun effet secondaire important.
En 2014, parmi les candidats-vaccins mis au point par les laboratoires, trois se détachaient. Ils reposaient sur la même stratégie : insérer dans le génome d’un virus inoffensif pour l'homme un gène codant une protéine de surface du virus Ebola. Le système immunitaire développe ainsi des anticorps spécifiques qui serviront à repousser le véritable virus en cas d’infection. Mais, en 2015, l'épidémie Ebola n'était plus assez importante pour tester les vaccins dans tous les pays prévus. Seul un candidat, le rVSV-Zebov élaboré par la firme Merck, a réellement été testé. 7 500 personnes en Guinée ont reçu ce vaccin.
Ses très bons résultats présentent tout de même une limite : les tests ont été faits sur une population potentiellement exposée au virus et possédant donc sûrement déjà des défenses immunitaires.

4) Tara Oceans : un échantillonnage exceptionnel de la diversité planctonique
Ce mollusque ptéropode (à droite) et ces deux crustacés copépodes (à gauche) proviennent du zooplancton collecté dans l'océan Indien. Ils ne mesurent que quelques millimètres. Crédit : Christian Sardet/CNRS/Tara Oceans
35 000 échantillons prélevés dans les océans et 40 millions de gènes bactériens identifiés : ce sont les chiffres de la mission Tara Oceans. Pendant quatre ans, une équipe a étudié la biodiversité planctonique de huit régions océaniques.
La température et la profondeur se sont révélées être deux paramètres déterminants dans la composition des écosystèmes marins. Ces recherches vont permettre de réaliser des modèles pour notamment évaluer la réponse des océans au réchauffement climatique.

5) Un exploit en physique quantique : les inégalités de Bell définitivement prouvées
L'équipe de Ronald Hanson, de l'université de technologie de Delft, aux Pays-Bas, a définitivement prouvé les inégalités de Bell. Crédit : Mark David/Tu Delft
L'intrication quantique est un principe selon lequel deux particules peuvent être liées l'une à l'autre de telle sorte que modifier les propriétés de l'une modifie instantanément celles de l'autre. En faisant interagir des électrons enfermés dans des diamants situés à 1280 mètres de distance, des scientifiques viennent définitivement de le prouver. Une étape de plus vers la télécommunication quantique, un nouveau moyen de transmission de l'information qui pourrait voir le jour dans un futur proche.

6) Les plus vieux outils du monde
Le site d'industrie lithique d'où proviennent ces outils a été découvert en juillet 2011 par Sonia Harmand et son équipe. Crédit MPK/WTAP

Le genre Homo n'est pas l'inventeur des premiers outils. C'est ce qu'atteste une découverte faite au Kenya par une équipe de chercheurs. 149 outils de pierre provenant de roches dont la strate géologique a été estimée à 3,3 millions d’années, ont été mis au jour. A cette époque, le genre Homo n'était pas encore apparu. Ces outils pourraient avoir été fabriqués par des australopithèques ou une espèce voisine. D'autres découvertes ont été faites sur ce site et une autre révélation est attendue au printemps prochain.

7) Le retour des réseaux de neurones
Les travaux de l'équipe de Yoshua Bengio, directeur de l'Institut des algorithmes d'apprentissage de Montréal (photo) et de celle de Yann LeCun, directeur du laboratoire d'intelligence artificielle de Facebook, ont permis l'avénement d'une nouvelle ère pour les réseaux de neurones. Crédit : Josh Valcarel/Wired
Les réseaux de neurones sont des types d’algorithmes très utiles pour la reconnaissance visuelle et vocale. A la manière du cerveau humain, ils mémorisent puis agissent en tenant compte de ce qu’ils ont vu. C'est l'apprentissage. Grâce aux travaux des équipes de Yoshua Bengio, directeur de l'Institut des algorithmes d'apprentissage de Montréal et de Yann LeCun, directeur du laboratoire d'intelligence artificielle de Facebook, les problèmes rencontrés précédemment dans le développement de ces algorithmes ont été complètement résolus. Le début d'une nouvelle ère pour ces réseaux qui avaient été abandonnés, à tort, dans les années 90.

8) L’inventaire des arbres de la planète
3040 milliards d'arbres sur notre planète et non pas 400 milliards : c'est la correction apportée par une équipe américaine en combinant les habituelles données satellitaires avec des relevés sur le terrain. Ces données ont ensuite été intégrées dans un modèle permettant de calculer le nombre d'arbres mais aussi de connaître leur répartition en nombre et en densité sur l'ensemble du globe. L'Europe, avec 26,8% des arbres de la planète, est le continent le plus boisé suivi par l'Amérique du Sud.

9) Le neutron plus massif que le proton
Représentation de protons et de neutrons renfermant chacun trois quarks. Image d'artiste. Crédit : Brian Green
Le neutron est légèrement plus massif que le proton, de 0,14%. L'existence d’un écart de masse était connue mais pour la première fois, il a été quantifié par une équipe de physiciens. Cette différence, ayant un rôle capital dans la composition de notre univers, serait en partie due au fait que le proton soit chargé, contrairement au neutron. La marge d’erreur de 20% est assez élevée mais elle se réduit peu à peu avec le développement de supercalculateurs de plus en plus puissants.

10) Les prix Nobel de médecine, physique et chimie
Médecine : la lutte contre les parasitoses
Physique : Le poids des neutrinos dans l'histoire de l'Univers
Chimie : La réparation de l'ADN élucidée

Par Donovan Thiebaudhttp://www.larecherche.fr/actualite/evenement/10-decouvertes-qui-ont-marque-annee-2015-08-01-2016-203127

vendredi 18 décembre 2015

§ Comment les êtres vivants se sont-ils diversifiés au cours de l'évolution ?

A2 : Découverte des membracides / diaporama

© gene membracides.odg
1Diapo gene_membracides
Modification des gènes de développement et apparition d’une troisième paire d’ailes chez les membracidés : http://www2.cnrs.fr/presse/communique/2173.htm
Des insectes à 3 paires d'ailes : http://www2.cnrs.fr/presse/communique/2173.htm
Body plan innovation in treehoppers through the evolution of an extra wing-like appendage : http://www.nature.com/nature/journal/v473/n7345/abs/nature09977.html
Membracidés : un nouveau plan d'organisation chez les insectes : http://www.pedagogie.ac-nantes.fr/35540154/0/fiche___ressourcepedagogique/&RH=1160729734281
la Famille des Membracides: http://aramel.free.fr/INSECTES10-8'.shtml
Gènes de développement
chronologie et intensité d'expression
autres exemples :
  • Modification des gènes hox et disparition des membres chez les serpents

A3 : Transgénèse naturelle entre virus et eucaryotes / article CNRS ©

© gene_transfert.odt
Échange de gènes entre une microalgue et un virus géant : http://www2.cnrs.fr/presse/communique/1648.htm
Transgénèse
Transfert viral
plasmide bactérien
transferts horizontaux de gènes
autres exemples de transferts horizontaux de gènes :
  • Les ascidies dont la paroi contient de la cellulose
  • L’origine symbiotique des chloroplastes et des mitochondries
  • Les Gènes Volants : mise en évidence de la dissémination à grande échelle des éléments transposables par transferts horizontaux chez les plantes : http://www2.cnrs.fr/presse/communique/3427.htm

jeudi 17 décembre 2015

Où la vie est-elle possible ?

EV / évolution

© \2 EV QCM évolution.odt

Où la vie est-elle possible ?

1.7 - Les conditions de la vie

Activité 1 : Voyage virtuel dans l'univers / logiciels

présentation des planètes avec Celestia : http://www.ikiru.ch/celestia/index.php?menu=divers&ssmenu=educatif
prendre en note -> tableau de comparaison des planètes : rayon
4X2=8 planètes : MeVeTeMa JuSaUrNe

Activité 2 : Comparaison des planètes de notre système solaire / tableau

Logiciel Planète 3D / Perez : http://svtolog.free.fr/article.php3?id_article=274
compléter tableau de comparaison des planètes : distance au soleil / température de surface / présence d'atmosphère / composition, ...
explore solar system : http://www.bbc.co.uk/solarsystem/
Système solaire, étoile, planète gazeuse ext, planète rocheuse int, ceinture d'astéroïdes, comète.

Activité 3 : Classement des planètes de notre système solaire / Schéma

sur une feuille A4 (blanche c'est mieux !) et à l'aide de votre tableau de comparaison ou celui de la p.15 du manuel : 
  1. Tracer une droite en diagonale (= distance au soleil) à l'échelle 1 cm = 140 Mkm ou 1 cm = 1 Unité Astronomique (voir manuel p.15)
  2. Représentez les planètes de part et d'autre de la droite à l’échelle 1mm = 2 000 km donc 1 cm = 20 000 km
  3. Complétez le schéma avec le nom de chaque planète, coloriez les planètes telluriques en rouge, les planètes gazeuses en vert, l’atmosphère en bleu, précisez la température au sol, les états de l’eau et la présence de vie.
  4. A partir de toutes ces informations, comparez la Terre avec les autres planètes telluriques afin d’indiquer ses particularités.
Diamètre des planètes // distance au soleil : http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=612
Diamètre des planètes # distance au soleil
Particularités de la terre : atmosphere, roche, eau liquide, vie,

Bilan : les conditions de la vie : une particularité de la terre dans le système solaire

L’histoire de la Terre s’inscrit dans celle de l’Univers. Le développement de la vie sur Terre est lié à des particularités de la planète. La vie émerge de la nature minérale. La Terre est une planète rocheuse du système solaire. Les conditions physico-chimiques qui y règnent permettent l’existence d’eau liquide et d’une atmosphère compatible avec la vie. Ces particularités sont liées à la taille de la planète et à sa position dans le système solaire. Ces conditions peuvent exister sur d’autres planètes (autres systèmes) qui posséderaient des caractéristiques voisines, sans pour autant que la présence de vie y soit certaine.
The Earth is a rocky planet in the solar system. The physicochemical conditions prevailing there allow the existence of liquid water and an atmosphere compatible with life. These features are related to the size of the planet and its position in the solar system. These conditions may exist on other planets (other systems) that would possess similar characteristics, but without the presence of life there is certain.
Solar System, stars, gaseous planet, rocky planet, asteroid, comet.


C/ Pour aller plus loin

différentes sources de photos et missions : http://eduscol.education.fr/planeto/res/default.htm
NASA (Planet Quest) :
Sites dédié à l’exploration de Mars :
CNES :
Revue Ciel et Espace : http://www.cieletespace.fr/
Educnet / Météorologie et enseignement : http://www.educnet.education.fr/meteo/
Société française d’exobiologie : http://www.exobiologie.fr/

mardi 15 décembre 2015

Penguins

Penguins

§ Comment les êtres vivants se sont-ils diversifiés au cours de l'évolution ?

§ Comment les êtres vivants se sont-ils diversifiés au cours de l'évolution ?

2,2/ L'évolution des individus / diversification du vivant

Il s'agit ici de donner une idée de l'existence de la diversité des processus impliqués, sans chercher une étude exhaustive. En outre, nous montrerons qu'une diversification des êtres vivants n'est pas toujours liée à une diversification génétique. La variété des mécanismes de diversification à l'oeuvre et l'apport de la connaissance des mécanismes du développement ont permis de faire des progrès dans la compréhension des mécanismes évolutifs.

A1 : Comparaison de gènes homéotiques / logiciel Anagène

manuel p.38 : ouvrir le logiciel Anangène – dossier « boxthm » ou « TerminalesS » - ouvrir les fichiers « .adn » des gènes homéotiques– comparer les séquences - prendre les informations « i » pour avoir les % d'identité – construire un tableau des identités, appelé matrice en phylogénèse.
Historique des gènes homéotiques
différents mutants homéotiques : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/ATP/gen-dros.htm
Développement embryonnaire et gènes sélecteurs : http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/homeotique/index.html
© schémas de comparaison hoxb6/Antp
gènes homéotiques, homologies moléculaires de séquences

A2 : Découverte des membracides / diaporama

Diapo gene_membracides
Modification des gènes de développement et apparition d’une troisième paire d’ailes chez les membracidés (cf ressource sur le site svt de nantes ) : http://www.blogg.org/blog-50595-billet-des_ailes_brisent_un_dogme_scientifique-1320793.html#.UOFdOeS88dV
Des insectes à 3 paires d'ailes : http://www2.cnrs.fr/presse/communique/2173.htm
Body plan innovation in treehoppers through the evolution of an extra wing-like appendage : http://www.nature.com/nature/journal/v473/n7345/abs/nature09977.html
Membracidés : un nouveau plan d'organisation chez les insectes : http://www.pedagogie.ac-nantes.fr/35540154/0/fiche___ressourcepedagogique/&RH=1160729734281
la Famille des Membracides: http://aramel.free.fr/INSECTES10-8'.shtml
Gènes de développement
chronologie et intensité d'expression
autres exemples :
  • Modification des gènes hox et disparition des membres chez les serpents

Comment expliquer la diversité des allèles et des gènes ?

A5 : Etude de la famille des gènes des globines / do©

© globines.odg

B213/ Le brassage génétique et sa contribution à la diversité génétique / évolution des génômes

Des anomalies au cours de la méiose peuvent survenir. Un crossing-over inégal aboutit parfois à une duplication de gène. Un mouvement anormal de chromosomes produit une cellule présentant un nombre inhabituel de chromosomes [polysomie]. Ces mécanismes, souvent sources de troubles, sont aussi parfois sources de diversification du vivant (par exemple à l'origine des familles multigéniques).
Mots clefs : Brassage génétique inter et intrachromosomique au cours de la méiose. Diversité des gamètes. Stabilité des caryotypes.
Lexiques :

C/ Poursuivre

Comment fonctionne la cellule musculaire ?

Evaluation : ex2,2

© TSS EV EX22 respiration levures.odt

§ crampes & courbatures

Production d'acide lactique

Comment fonctionne la cellule musculaire ?

1.4 : Energie musculaire

A1 : observation de coupes de muscles au microscope

Lames muscle : faire un dessin
stries noires & blanches

A2 : ultrastructure et composition des muscles

© muscle.odg
muscle.odp

A3 : trois métabolismes musculaires

B : Energie et mécanique musculaire

- La fibre musculaire utilise l'ATP fourni, selon les circonstances, par la fermentation lactique ou la respiration. L'hydrolyse de l'ATP fournit l'énergie nécessaire aux glissements de protéines les unes sur les autres qui constituent le mécanisme moléculaire à la base de la contraction musculaire.
- L'ATP joue un rôle majeur dans les couplages énergétiques nécessaires au fonctionnement des cellules.

§ Comment une information génétique se traduit-elle au niveau d'un organisme ? Qu'est-ce qu'un phénotype ?

Evaluation : Test génétique

© 1S-EV_QCM_gene.odt

§ le zèbre est-il rayé noir sur blanc ou blanc sur noir ?
Explication du Pr Burp / Gotlib
Diaporama : gene-rayures2.odp
Phénotype [phen : paraître ; typ : signe] = caractère observable d'un être vivant

§ Comment une information génétique se traduit-elle au niveau d'un organisme ? Qu'est-ce qu'un phénotype ?

2.2/ Des gènes à la réalisation des phénotypes

2.2.1/ Un caractère à différentes échelles

A1 : Cas de l'albinisme

Diap albinisme
manuel p.66
Pigment = molécule colorée
albinisme = génétique / défaut de pigment
mélanine = pigment protéique
expression d'un gène = protéine

A2 : Cas des groupes sanguins

manuel p.67 
Règles de transfusion sanguine : http://www.soins-infirmiers.com/groupes_sanguins.php
hématies marquées : A, B et/ou O = antigène
grp <= molécule enzymatique qui construit des marqueurs à la surface des cellules
les enzymes sont de nature protéique
génotypes : (A//A) ou (A//O) ; (B//B) ou (B//O) ; (A//B) ; (O//O)
phénotypes : [A] ; [B] ; [AB] ; [O]
(génotype) => [phénotype]
génotype = combinaison d'allèles pour un gène donné, pour une cellule , donc un individu
Phénotype [φαινω : paraître ;  τυπος : signe, marque, empreinte] est l'état d'un caractère observable (caractère anatomique, morphologique, moléculaire, physiologique, ou éthologique) chez un organisme vivant.

A3 : Cas de la drépanocytose

Diap drepanocytose
manuel p.62 à 65
différentes échelles d’un phénotype : mol, micro, macroscopique

lundi 14 décembre 2015

Qui a saboté la méiose ?

Film : http://www.universcience-vod.fr/media/4321/mais-qui-donc-a-sabote-la-meiose--.html

Comment expliquer la diversité des allèles et des gènes ?

FT : logiciels banques de séquences moléculaires

On dispose de plusieurs logiciels pour le traitement des séquences des gènes :
- SeqaidII : ce logiciel gratuit est déjà assez ancien ; il comporte néanmoins de multiples fonctions d'analyse, de conversion et de comparaison des séquences : http://www.inrp.fr/Acces/biogeo//genemol/seqaid.htm ; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC321006/
- Anagène : logiciel sous windows diffusé par le CNDP. Version de démonstration téléchargeable.
- Genigen

A4 : Comparaison des gènes des globines / logiciel Anagène

Ouvrir le logiciel Anagène
  • Ouvrir les fichiers « béta », « alpha 1 », « gammaA » et « delta » des « gènes de globines »
  • Sélectionner « béta » comme séquence de référence
  • Réaliser une « comparaison avec discontinuité » avec « alpha 1 », « gammaA » et « delta ».
  • Afficher le pourcentage d’identité des différentes globines (bouton « i »)
  • Recommencer en choisissant une autre globine comme référence.
  • Présenter vos résultats dans un tableau à double entrée
Qd vous avez fini :
  • Comparez les genes homéotiques : comparer les séquences « .adn » des gènes homéotiques « boxB4 » - prendre les informations « i » pour avoir les % d'identité – construire un tableau des identités, appelé matrice en phylogénèse.
  • Comparez les genes des opsines
→ matrice [tableau] des différences ou des identités selon choix de comparaison simple ou avec discontinuité sous Anagène :
Tableau de comparaison des identités des globines obtenu par alignements avec discontinuité :
  % identités
Béta
Alpha1
Delta
GammaA
Béta
 100
59.4
92.6
75.9
Alpha1

 100
59.7
58.3
Delta


 100
76.1
GammaA



 100
Tableau de comparaison des différences des globines obtenu avec comparaison simple :
  % différences
Béta
Alpha1
Delta
GammaA
Béta
 0
40,6
7.4
24.1
Alpha1
68.9
 0
70.0
70.7
Delta
7
69.0
 0
23.9
GammaA
24.1
69.7
23.9
 0
→ groupes emboîtés
manuel p.23


A5 : Etude de la famille des gènes des globines / do©

© globines.odg